Biomedicínske centrum SAV, v. v. i.
Názov témy
Subtypizácia a detekcia mutácií herpetických vírusov prostredníctvom PCR a sekvenovania
Program DŠ
mikrobiológia a virológia
Rok prijímania
2026
Meno školiteľa/-ky
RNDr. Katarína Lopušná, PhD.
Kontakt:
Prijímajúca škola
Prírodovedecká fakulta UK
Stručná anotácia
Pacienti s nádormi trpia imunodeficienciami, ktoré narúšajú funkciu jednej alebo viacerých zložiek imunitného systému. Veľké riziko v tomto ohľade predstavujú predovšetkým vírusové infekcie. Predložená téma sa zameriava na diferenciálnu diagnostiku nešpecificky identifikovateľných herpesvírusov vo vzorkách pacientov, ako aj na identifikáciu mutácií asociovaných s rezistenciou na antivirotiká. Cieľom predkladaného projektu je:
1. detekcia HCMV, HHV-6 a EBV z krvných vzoriek a nechtov pacientov prostredníctvom PCR a kvantitatívnej PCR (qPCR)
2. identifikácia mutácií HCMV, HHV-6 a EBV, ktoré by mohli súvisieť s rezistenciou
3. experimentálne potvrdenie novo identifikovaných mutácií pomocou Sangerovho sekvenovania.
1. detekcia HCMV, HHV-6 a EBV z krvných vzoriek a nechtov pacientov prostredníctvom PCR a kvantitatívnej PCR (qPCR)
2. identifikácia mutácií HCMV, HHV-6 a EBV, ktoré by mohli súvisieť s rezistenciou
3. experimentálne potvrdenie novo identifikovaných mutácií pomocou Sangerovho sekvenovania.