Centrum biovied SAV, v. v. i.
Názov témy
Biomarkery včasnej diagnostiky onkologických ochorení: vývoj aptamérových biosenzorov a ich klinická validácia
Program DŠ
Biochémia
Rok prijímania
2026
Meno školiteľa/-ky
Ing. Alexandra Poturnayová, PhD.
Kontakt:
Prijímajúca škola
Fakulta chemickej a potravinárskej technológie STU
Stručná anotácia
Včasná diagnostika onkologických ochorení predstavuje jeden z kľúčových faktorov zlepšenia prognózy a prežívania pacientov. Napriek intenzívnemu výskumu však stále chýbajú spoľahlivé, vysoko citlivé a neinvazívne biomarkery vhodné pre rutinnú klinickú prax. Dizertačná práca sa zameria na identifikáciu a experimentálnu validáciu potenciálnych biomarkerov včasnej diagnostiky rakoviny, predovšetkým cirkulujúcich mikroRNA a exozómov, prostredníctvom vývoja moderných aptamérových biosenzorov.
Hlavným cieľom práce bude návrh, optimalizácia a charakterizácia elektrochemických a QCM biosenzorových platforiem založených na špecifických DNA aptaméroch, umožňujúcich vysoko selektívnu a citlivú detekciu cieľových biomolekúl v biologických vzorkách. Súčasťou práce bude detailná analýza väzbových interakcií medzi aptamérmi a biomarkermi, hodnotenie analytických parametrov biosenzorov (limit detekcie, lineárny rozsah, selektivita a reprodukovateľnosť) a ich systematické porovnanie s konvenčnými diagnostickými metódami. Vyvinuté biosenzory budú testované na klinicky relevantných vzorkách krvi v spolupráci s klinickými pracoviskami, čím sa zabezpečí ich klinická validácia a posúdenie aplikačného potenciálu.
Výsledky dizertačnej práce majú potenciál prispieť k rozvoju neinvazívnych diagnostických nástrojov, podporiť implementáciu tekutých biopsií do klinickej praxe a rozšíriť možnosti personalizovanej onkologickej diagnostiky.
Hlavným cieľom práce bude návrh, optimalizácia a charakterizácia elektrochemických a QCM biosenzorových platforiem založených na špecifických DNA aptaméroch, umožňujúcich vysoko selektívnu a citlivú detekciu cieľových biomolekúl v biologických vzorkách. Súčasťou práce bude detailná analýza väzbových interakcií medzi aptamérmi a biomarkermi, hodnotenie analytických parametrov biosenzorov (limit detekcie, lineárny rozsah, selektivita a reprodukovateľnosť) a ich systematické porovnanie s konvenčnými diagnostickými metódami. Vyvinuté biosenzory budú testované na klinicky relevantných vzorkách krvi v spolupráci s klinickými pracoviskami, čím sa zabezpečí ich klinická validácia a posúdenie aplikačného potenciálu.
Výsledky dizertačnej práce majú potenciál prispieť k rozvoju neinvazívnych diagnostických nástrojov, podporiť implementáciu tekutých biopsií do klinickej praxe a rozšíriť možnosti personalizovanej onkologickej diagnostiky.