Zoznam národných projektov SAV
Chemický ústav SAV, v. v. i.
„Matching“ granty ku zdrojom získaným od súkromného sektora v rámci výskumnej spolupráce Chemický ústav SAV, v. v. i. - 2023
-
Analýza exozómov ako komplementárna diagnostická metóda
EXosome Analysis Complementary To Diagnostic eXaminations
| Doba trvania: |
1.9.2025 - 31.8.2028 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Ing. Bertók Tomáš DrSc., MBA |
| Anotácia: |
Rakovina je jednou z hlavných príčin úmrtí na celom svete s incidenciou 20 miliónov v roku 2022. Odhaduje sa, že v roku 2045 incidencia ešte porastie na 32,6 miliónov (údaje Globocan-u). Tkanivová biopsia zvyšuje náklady na starostlivosť o pacienta a v niektorých prípadoch aj čas potrebný na získanie výsledkov, preto boli vyvinuté nové prístupy využívajúce telesné tekutiny – tzv. tekutá biopsia. Spomedzi autoimunitných ochorení je reumatoidná artritída jedna z najbežnejších s incidenciou približne 150 000 až 200 000 nových prípadov len v Európe. Rovnako ako pri progresii rakoviny hrajú glykány dôležitú úlohu pri definovaní protizápalovej alebo prozápalovej podstaty protilátok. Takzvaná séronegatívna artritída - kategória zápalových ochorení kĺbov bez detegovateľných autoprotilátok, zahŕňa asi 15% všetkých pacientov s reumatoidnou artritídou. Keďže ~ 70+ % všetkých diagnóz závisí od výsledkov laboratórnych testov (podľa CDC), dôležitosť implementácie nových biomarkerov je veľkou medicínskou potrebou. V našej predchádzajúcej práci sme vyvinuli bioanalytické zariadenia s nízkymi detekčnými limitmi na analýzu glykoproteínov až vo femtomolárnych koncentráciách a aplikovali sme tieto platformy na analýzu reálnych ľudských vzoriek pomocou nanoštruktúrovaných rozhraní eliminujúcich nešpecifické interakcie. V tomto projekte sa zameriavame na aplikáciu týchto poznatkov v oblasti analýzy exozómov, ktoré sú ťažšie analyzovateľné pre ich heterogénnosť a relatívne nízku stabilitu. Dlhodobým cieľom v glykomických analýzach nie je možnosť glykoprofilovať ľubovoľné biomarkery pomocou náročnej prístrojovej techniky (LC-MS), ale získať najdôležitejšie informácie o prítomnosti/neprítomnosti nádorovo-špecifických glykánových epitopov, ktoré podporujú napr. invazívnosť buniek, ľahko použiteľným a nenákladným spôsobom pomocou jednoduchých, spoľahlivých a výkonných platforiem pre využitie aj v bežnom laboratóriu (ako sú imunotesty založené na lektínoch). |
Mapovanie glykómu a glykozylácie proteínov spojených s Alzheimerovou chorobu
Mapping the Glycome and Glycosylated Proteins in Alzheimer's disease
| Doba trvania: |
1.9.2025 - 31.8.2028 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Ing. Ďatková Anna PhD. |
| Anotácia: | V súčasnosti je na celom svete 55 miliónov pacientov s demenciou a so starnutím obyvateľstva sa očakáva prudký nárast výskytu tohto ochorenia. Skorá diagnostika je kľúčovým aspektom pri liečbe akéhokoľvek ochorenia. Súčasná diagnostika Alzheimerovej choroby (AD) sa vykonáva analýzou proteínov/peptidov v cerebrospinálnom moku (CSF) alebo krvi. AD možno diagnostikovať aj pomocou zobrazovacích techník mozgu, no takéto techniky sú drahé a môžu sa vykonávať iba v špecializovaných nemocniciach s vyškoleným personálom. Mnohé štúdie naznačujú, že zmeny v glykozylácii môžu hrať kľúčovú úlohu v patogenéze a progresii ochorenia. Predložený projekt sa zameriava na sledovanie zmien v glykóme a glykozylácii vybraných glykoproteínov asociovaných s AD. Hlavným cieľom projektu je identifikovať zmeny v glykoprofile rôznych vzoriek, zmenenú glykozyláciu proteínov a využiť tieto poznatky na zlepšenie metód na diagnostiku AD. Metodológia projektu zahŕňa pokročilé techniky analýzy glykozylácie, glykomické analýzy a bioinformatické nástroje na analýzu a interpretáciu dát. Očakávame, že výsledky tohto projektu prispejú k lepšiemu pochopeniu molekulárnych mechanizmov AD a otvoria nové možnosti pre diagnostiku a potenciálnu liečbu. Význam projektu spočíva v jeho potenciáli identifikovať nové biomarkery pre včasnú diagnostiku AD, čo by mohlo zásadne zlepšiť prognózu a kvalitu života pacientov. |
„Matching“ granty ku zdrojom získaným od súkromného sektora v rámci výskumnej spolupráce Chemický ústav SAV, v. v. i. - 2020 - 2022
-
Aberantná glykozylácia - dôsledky a príčiny v rámci vrodených porúch glykozylácie
Aberrant glycosylation - consequences and causes within congenital glycosylation disorders.
Antivirálne liečivá proti COVID-19: Dizajn, syntéza a testovanie aktivity špecifických inhibítorov virálnych proteáz koronavírusu SARS-CoV-2
Antiviral drugs against COVID-19: Design, synthesis and biological activity testing of specific inhibitors of viral proteases of coronavirus SARS-CoV-2
Dizajn, syntéza a biochemické testovanie selektívnych inhibítorov Golgiho α-manozidázy II
Design, synthesis and biochemical evaluation of Golgi α-mannosidase II inhibitors
Enzymológia sacharidov a rozpoznávanie glykánov proteínmi
Enzymology of saccharides and glycan-protein recognition
| Doba trvania: |
1.7.2025 - 30.6.2026 |
| Program: |
Návratová projektová schéma |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Palenčárová Klaudia PhD. |
| Anotácia: | Projekt je zameraný na multienzýmovú syntézu kyseliny hyalurónovej. Tento polysacharid, všeobecne rozšírený v živých organizmoch, plní vďaka svojim unikátnym vlastnostiam rôzne funkcie. Z toho vyplýva aj jej využitie v medicíne a kozmetickom priemysle. Vytvorená koncepcia syntézy in vitro zahŕňa enzýmy s agregačným modulom na N-konci, v dôsledku čoho zostávajú vo forme nerozpustných inklúznych teliesok. V tejto forme majú dobré biologické aj procesné vlastnosti a sú prirodzene imobilizované, takže môžu byť opakovane použité vo viacerých reakčných cykloch. Zosúladenie viacerých enzýmov do kaskádovej reakcie umožňuje použitie lacných východiskových substrátov. Súčasťou projektu je aj štúdium rozpoznávania glykánov proteínmi. Táto časť sa venuje inozitolkináze. Cieľom je špecifickými mutáciami v aminokyselinovej sekvencii zmeniť akceptorovú špecifickosť z inozitolu na hexózu. Produkt sa môže využiť v ďalších reakciách a zároveň to umožní lepšie pochopiť vplyv usporiadania aminokyselín na rozpoznávanie glykánov. |
Fenomény vírusovej imunológie: CMV - TRIK či LIEK?
Phenomena of viral immunology: CMV for TRICKs or TREAT?
Glykozidhydrolázy rodín 16,28 a 72 - ich charakterizácia, štruktúra a funkcia v bunkových stenách rastlín a húb
-
Imunotoxikologická a imunobiologická charkterizácia izolovaných exoglykoproteínov Candidy albicans - perspektívne imunomodulačné imunobiologiká
Immunotoxicological and immnunobiological characterization of isolated Candida albicans exoglycoproteins- perspectíve immnomodulatory immunobiologicals
Inovatívne 2D nanomateriálmi vylepšené biosenzory a enzymatické platformy: Budúcnosť výroby špeciálnych chemikálií
Innovative 2D Nanomaterial-Enhanced Biosensors And Enzymatic Platforms: The Future of Specialty Chemical Production
| Doba trvania: |
1.1.2026 - 31.12.2029 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Ing. Hrončeková Štefánia PhD. |
| Anotácia: | Tento projekt sa zameriava na vývoj zlaténu, inovatívneho nanomateriálu, spolu s ďalšími 2D nanomateriálmi ako sú MXény pre návrh ultracitlivých elektrochemických nanobiosenzorov. Tie umožnia pokročilú analýzu multienzýmových kaskádových reakcií na výrobu chemických špecialít, najmä epsilon-kaprolaktónu. V porovnaní s konvenčnými metódami ponúknu nové biosenzory rýchlejšie monitorovanie, flexibilné riadenie procesu a nižšiu spotrebu rozpúšťadiel. Projekt zahŕňa syntézu zlaténu, elektrochemické štúdie, vývoj biosenzorov a bioelektrochemické testovanie, po ktorom bude nasledovať validácia na reálnych biotransformačných vzorkách. Výskum bude pokračovať aj v oblasti produkcie epsilon-kaprolaktónu s využitím voľných aj imobilizovaných rekombinantných buniek E. coli BL21 (DE3) s koexprimovanými enzýmovými kaskádami. Integrácia nových 2D nanomateriálov, pokročilých elektrochemických/charakterizačných metód, bioreaktorového inžinierstva a imobilizácie pomôže optimalizovať výkon biosenzorov. |
Inovované imobilizované biokatalyzátory na báze Baeyer-Villigerových monooxygenáz, enzýmových kaskád a hydroláz epoxidov pre ekologickú prípravu chemických špecialít
-
Integrácia teoretických a experimentálnych prístupov pri riešení moderných výziev molekulárnej biológie.
Joint theoretical and experimental approaches to address modern challenges of molecular biology.
Interakcie sacharidovývh epitopov epidemiologicky zaujímavých druhov Candida s lektínmi typu C
Interaction of saccharide epitopes of epidemiologically interesting Candida species with C-type lectins
Katiónové polysacharidy ako potenciálne antibakteriálne agensy pre priamu a kombinovanú terapiu infekcií spôsobených rezistentnými patogénmi
Cationic polysaccharides as potential antibacterial agents for direct and combination therapies of infections caused by resistant pathogens
Kvasinky - perspektívny biostimulant pre pšenicu vystavenú suchu
Yeasts - promising biostimulant for wheat exposed to drought
Modifikácia povrchov ako bariéra pre adsorpciu proteínov
Modification of surfaces as barrier to protein adsorption
Nahliadnutie do imunobiologických vlastností obsahu extracelulárnychvezikúl (EVs) Candidaalbicans so zameraním na aktívne molekuly sacharidov dôležité pre interakciu hostiteľ-patogén
Insight into the immunobiological properties of Candida albicans extracellular vesicles (EVs) cargo with a focus on active carbohydrate molecules important for host-pathogen interaction
Nezmapovaná komplexnosť glykozylácie: Výskum jej dynamických mechanizmov a glykobiomarkerov relevantných pre ochorenia
Uncharted Glycosylation Complexity: Investigation of its Dynamic Mechanisms and Disease-Relevant Glycobiomarkers
Nové kvasinkové enzýmy na biokonverziu rastlinnej biomasy
Novel yeast enzymes for bioconversion of plant biomass
Nové prístupy na zlepšenie microarray detekčnej technológie pre vysokovýkonnú glykotypizáciu
-
Pokročilé 2D nanorozmerné "MXénové" rozhrania ako perspektívne imobilizačné platformy pre návrh (bio)senzorov na detekciu biomarkerov rakoviny a obohatenie glykánov
Advanced 2D nanoscaled "MXene" interfaces as perspective immobilisation platforms for design of (bio)sensors for cancer biomarkers detection and glycan enrichment
Pôvod a funkcia nových meningeálnych Lyve1 pozitívnych makrofágov v zdraví a chorobe
Origin and function of novel meningeal subpopulation of Lyve1 macrophages in health and disease
Príprava nových biologicky aktívnych látok u streptomycét genetickými zásahmi do genómu a metódami syntetickej biológie
Preparation of new biologically active substances in streptomycetes by genetic interventions in the genome and methods of synthetic biology
| Doba trvania: |
1.9.2025 - 31.8.2029 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Ing. Šoral Michal PhD. |
| Anotácia: | Baktérie rodu Streptomyces patria k významným producentom biologicky aktívnych látok so širokým spektrom aktivít. Gény pre tieto sekundárne metabolity sú fyzicky zoskupené v tzv. biosyntetických génových klastroch (BGC). Zámerom tohto projektu je príprava a charakterizácia nových biologicky aktívnych látok aktiváciou silentných BGC genetickými zásahmi do genómu a metódami syntetickej biológie. Projekt nadväzuje na predchádzajúci projekt APVV, kde sme u nášho kmeňa S. lavendulae subsp. lavendulae CCM 3239 identifikovali 30 BGC pre potenciálne nové sekundárne metabolity silentné pri laboratórnych podmienkach. V tomto kmeni sme optimalizovali systém aktivácie týchto BGC inzerciou rezistenčnej antibiotickej kazety so silným promótorom pred gény troch vybraných BGC a identifikovali sme nové biologicky aktívne sekundárne metabolity. Cieľom projektu bude pomocou tohto systému aktivácia ďalších BGC. Ďalším cieľom bude aktivácia BGC pre neznáme sekundárne metabolity v modelovom kmeni S. venezuelae ATCC 10712, v ktorom bolo identifikovaných 34 BGC. Väčšina týchto BGC je silentná a zodpovedná za produkciu neznámych sekundárnych metabolitov. V prípade tohto kmeňa pripravíme nový a účinný systém aktivácie bezmarkerovým zavedením silného promótora pred viaceré gény v týchto BGC. V predchádzajúcom projekte APVV sme úspešne zaviedli nový systém syntetickej biológie založený na tvorbe arteficiálnych BGC postupným spájaním monocistronických jednotiek, ktorý sme verifikovali pre antibiotiká landomycín a mitramycín. Cieľom projektu bude využitie tohto systému pre produkciu účinnejšieho medziproduktu mitramycínu SK, ako aj jadomycínových derivátov a nových aromatických polyketidov kombináciou biosyntetických génov iných polyketidových antibiotík. Naše výsledky prispejú k poznaniu biosyntézy týchto sekundárnych metabolitov a môžu odhaliť nové biologicky aktívne látky s účinnými terapeutickými vlastnosťami. |
Rodina GH72: Reakčný mechanizmus a inhibičné stratégie
Targeting the GH72 Family: Mechanisms of Action and Inhibition Strategies
Štipendiá pre excelentných PhD. študentov a študentky (R1) / Vývoj a aplikácia moderných metód pre detekciu glykánových biomarkerov
-
Účinok patologických mutácií a posttranslačných modifikácií na funkcie mitochondriálnej procesujúcej peptidázy nevyhnutnej pre transport do mitochondrií
The effect of pathologic mutations and post-translational modifications onthe functions of mitochondrial pocessing peptidase essential for transport to mitochondria
Umelá inteligencia pre pokročilú výpočtovú techniku V ZDRAVOTNÍCTVE
Artificial Intelligence for aDvanced computing IN HEALTHCARE
| Doba trvania: |
1.1.2025 - 31.8.2026 |
| Program: |
Plán obnovy EÚ |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Ing. Tkáč Ján DrSc. |
Výskum látok a faktorov s potenciálnym vplyvom na patogenicitu rôznych kmeňov baktérie Paenibacillus larvae spôsobujúcej mor včelieho plodu
Investigation of substances and factors with a potential effect on the pathogenicity of various strains of bacterium Paenibacillus larvae causing American foulbrood
Zlatý prístup: Nová generácia 2D pokročilých biosenzorov s podporou nanomateriálov a imobilizované systémy využívajúce enzýmy a viabilné celé bunky s enzýmovými kaskádami na produkciu chemických špecialít
Golden(e) approach: Next-generation of 2D nanomaterial-enabled advanced biosensors and immobilised systems using enzymes and viable whole cells with enzyme cascades for use in production of chemical specialties
| Doba trvania: |
1.9.2025 - 31.8.2029 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Ing. Hrončeková Štefánia PhD. |
| Anotácia: | Riešenie projektu je zamerané na získanie nových poznatkov z hľadiska prípravy inovatívneho nanomateriálu zlaténu, využitia nanomateriálov na báze MXénov a ďalších na dizajnovanie ultracitlivých ampérometrických biosenzorov a ich použitia pre pokročilú analýzu multienzýmových kaskádových reakcií pre produkciu chemických špecialít. Použitie nových biosenzorov umožní oproti konvenčným analytickým postupom zrýchlenie monitorovania, pružnejšie riadenie kaskádových reakcií a potenciálne a environmentálne priaznivé zníženie spotreby škodlivých rozpúšťadiel. Biofunkcionalizácia povrchu biosenzorov s vysokou hustotou buniek/kofaktorov/enzýmov zabezpečí vysokú citlivosť vyvíjaných biosenzorov. Charakterizácia vývoja biosenzorov step-by-step a testovanie ich bioelektrochemickej aktivity bude predchádzať validácii s použitím reálnych vzoriek z biotransformácií. Súčasťou projektu bude pokračovanie výskumu a vývoja nových imobilizačných postupov rekombinantných buniek E. coli s koexprimovanými enzýmovými kaskádami ako aj jednotlivými enzýmami kaskád. Pri riešení projektu sa využijú v spolupráci so špičkovými partnermi metódy bioreaktorového inžinierstva, pokročilé biopolymérne materiály a najmodernejšie metódy fotoniky na charakterizáciu a nastavenie optimálnych biokatalytických parametrov kaskádových reakcií pre modelovú produkciu chemických špecialít. |
Celkový počet projektov: 31
Databáza národných projektov