Facebook Instagram Twitter RSS Feed PodBean Back to top on side

Zoznam národných projektov SAV

Lock Databáza národných projektov

Biomedicínske centrum SAV, v. v. i.

„Matching“ granty ku zdrojom získaným od súkromného sektora v rámci výskumnej spolupráce

„Matching" grants to resources obtained from the private sector in the framework of research cooperation

Doba trvania: 1.1.2025 - 31.3.2026
Program: Plán obnovy EÚ
Zodpovedný riešiteľ: prof. RNDr. Pastoreková Silvia DrSc.

„Matching“ granty ku zdrojom získaným od súkromného sektora v rámci výskumnej spolupráce

„Matching" grants to resources obtained from the private sector in the framework of research cooperation

Doba trvania: 1.1.2025 - 31.3.2026
Program: Plán obnovy EÚ
Zodpovedný riešiteľ: prof. RNDr. Pastoreková Silvia DrSc.

Analýza exozómov ako komplementárna diagnostická metóda

EXosome Analysis Complementary To Diagnostic eXaminations

Doba trvania: 1.9.2025 - 31.8.2028
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Kozics Katarína PhD.
Anotácia:Rakovina je jednou z hlavných príčin úmrtí na celom svete s incidenciou 20 miliónov v roku 2022. Odhaduje sa, že v roku 2045 incidencia ešte porastie na 32,6 miliónov (údaje Globocan-u). Tkanivová biopsia zvyšuje náklady na starostlivosť o pacienta a v niektorých prípadoch aj čas potrebný na získanie výsledkov, preto boli vyvinuté nové prístupy využívajúce telesné tekutiny – tzv. tekutá biopsia. Spomedzi autoimunitných ochorení je reumatoidná artritída jedna z najbežnejších s incidenciou približne 150 000 až 200 000 nových prípadov len v Európe. Rovnako ako pri progresii rakoviny hrajú glykány dôležitú úlohu pri definovaní protizápalovej alebo prozápalovej podstaty protilátok. Takzvaná séronegatívna artritída - kategória zápalových ochorení kĺbov bez detegovateľných autoprotilátok, zahŕňa asi 15% všetkých pacientov s reumatoidnou artritídou. Keďže ~ 70+ % všetkých diagnóz závisí od výsledkov laboratórnych testov (podľa CDC), dôležitosť implementácie nových biomarkerov je veľkou medicínskou potrebou. V našej predchádzajúcej práci sme vyvinuli bioanalytické zariadenia s nízkymi detekčnými limitmi na analýzu glykoproteínov až vo femtomolárnych koncentráciách a aplikovali sme tieto platformy na analýzu reálnych ľudských vzoriek pomocou nanoštruktúrovaných rozhraní eliminujúcich nešpecifické interakcie. V tomto projekte sa zameriavame na aplikáciu týchto poznatkov v oblasti analýzy exozómov, ktoré sú ťažšie analyzovateľné pre ich heterogénnosť a relatívne nízku stabilitu. Dlhodobým cieľom v glykomických analýzach nie je možnosť glykoprofilovať ľubovoľné biomarkery pomocou náročnej prístrojovej techniky (LC-MS), ale získať najdôležitejšie informácie o prítomnosti/neprítomnosti nádorovo-špecifických glykánových epitopov, ktoré podporujú napr. invazívnosť buniek, ľahko použiteľným a nenákladným spôsobom pomocou jednoduchých, spoľahlivých a výkonných platforiem pre využitie aj v bežnom laboratóriu (ako sú imunotesty založené na lektínoch).

Analýza molekulárnych mechanizmov imunitného úniku HCMV ako základ pre vývoj nových terapeutických stratégií

Uncovering HCMV immune evasion mechanisms as a source of inspiration for novel therapeutic strategies

Doba trvania: 1.1.2026 - 31.12.2029
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Nemčovičová Ivana PhD.
Anotácia:Tento projekt si kladie za cieľ objasniť mechanizmy, ktorými ľudský cytomegalovírus (HCMV) prostredníctvom dôležitých virálnych glykoproteínov UL141 a UL144 narúša imunitnú odpoveď hostiteľa. Analýzou ich úlohy v regulácii imunitných kontrolných bodov na povrchu buniek, ako aj ich funkcie pri vstupe vírusu sprostredkovanom obalovými glykoproteínmi viriónu, plánujeme identifikovať nové molekulárne interakcie, ktoré sú rozhodujúce pre pretrvávanie HCMV v organizme. Využitím integrácie štruktúrnej biológie, imunológie a dizajnu liečiv sa zameriame na vývoj nových bioterapeutických látok zameraných na rozhranie vírus-hostiteľ. Získané poznatky o vírusovej mimikry prispejú nielen k pokroku v oblasti antivírusových stratégií, ale majú potenciál ovplyvniť aj vývoj imunoterapeutických prístupov v liečbe nádorov. Inovatívny interdisciplinárny prístup sa opiera o skúsený tím, zavedené medzinárodné spolupráce a unikátne molekulárne nástroje s cieľom posunúť hranice poznania vírusovej imunológie a vývoja bioterapeutík.

Analýza úlohy G-patch proteínov pri regulácii RNA helikáz zapojených do zostrihu pre-mRNA kvasinky Schizosaccharomyces pombe

Analysis of the role of G-patch proteins in regulating RNA helicases involved in pre-mRNA splicing in Schizosaccharomyces pombe

Doba trvania: 1.9.2024 - 30.6.2027
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: Ing. Čipák Ľuboš PhD.

Analýza úlohy novoidentifikovaných faktorov viažucich sa na komplex zostrihu pre-mRNA pri zostavovaní a prestavbe skorých komplexov zostrihu pre-mRNA a aktivácii komplexu zostrihu pre-mRNA v kvasinke Schizosaccharomyces pombe

Analysis of the role of newly identified spliceosome-associated factors in the assembly and remodeling of early splicing complexes and the activation of the spliceosome in the fission yeast Schizosaccharomyces pombe

Doba trvania: 1.8.2024 - 30.6.2026
Program: Plán obnovy EÚ
Zodpovedný riešiteľ: Ing. Čipák Ľuboš PhD.

Antivirálne liečivá proti COVID-19: Dizajn, syntéza a testovanie aktivity špecifických inhibítorov virálnych proteáz koronavírusu SARS-CoV-2

Antiviral drugs against COVID-19: Design, synthesis and biological activity testing of specific inhibitors of viral proteases of coronavirus SARS-CoV-2

Doba trvania: 1.7.2022 - 30.6.2026
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Nemčovičová Ivana PhD.
Anotácia:Pandémia nového koronavírusu SARS-CoV-2, ktorá spôsobuje závažné ochorenia respiračného traktu (COVID- 19), predstavuje dlhodobé ohrozenie zdravia populácie. Zaočkovanosť populácie dostupnými vakcínami na Slovensku je nízka a v súčasnosti je na liečbu COVID-19 schválené len jedno širokospektrálne antivirotikum – remdesivir, ktorý je zacielený na virálnu RNA polymerázu. Náš tím, na základe mnohoročných skúseností v oblasti navrhovania nových antivirálnych látok (napr. proti HIV-1, HCV, Dengue, chrípka typu A), sa od začiatku pandémie COVID-19 intenzívne venuje výskumu inhibítorov virálnych proteáz: hlavnej proteázy Mpro a papaínovej proteázy PLpro vírusu SARS-CoV-2, ktoré patria medzi kľúčové farmakologické targety pre antivirálnu terapiu. Predkladaný projekt nadväzuje na naše predchádzajúce výsledky, v ktorých sa kombinujú kompetencie z piatich skúsených skupín riešiteľov z dvoch univerzít (FaF a PriF UK, UCM), spolu s CHÚ SAV a VÚ BMV SAV. Stratégia projektu sa opiera o nasledovný integrovaný prístup výskumu liečiv. • Počítačový dizajn a optimalizáciu špecifických peptidomimetických α-ketoamidov, ktoré inhibujú proteolytickú aktivitu Mpro; optimalizáciu sérií bis-benzylidéncyklohexanónov a benzamidov, ktoré inhibujú proteolytickú a deubiquitinačnú aktivitu PLpro koronavírusu SARS-CoV-2. • Vývoj syntetických ciest a syntézu peptidomimetických α-ketoamidov, benzamidov a bis- benzylidéncyklohexanónov. • Testovanie inhibície enzymatickej aktivity troch skupín látok na rekombinantne pripravených enzýmoch Mpro a PLpro a vývoj nových metód testovania inhibičnej aktivity na virálnych enzýmoch. • Testovanie antivirálnej aktivity in vitro troch skupín látok na úrovni inhibície humánnych bunkových línií infikovaných vírusom SARS-CoV-2. • Výskum interakcií nových inhibítorov s biologickými membránami a optimalizácia absorpcie a biodostupnosti v tkanivách respiračného traktu.

Bakteriálna Lon proteáza ako perspektívny nástroj na liečbu mnohopočetného myelómu

Bacterial Lon protease as an emerging tool for multiple myeloma treatment

Doba trvania: 1.7.2022 - 30.6.2026
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Jakubíková Jana PhD.

Biologicky relevantné zmesi endokrinných disruptorov: účinky na in vitro modeloch ovariálnych intrafolikulárnych procesov a ovariálnych nádorových líniách

Biologically relevant mixtures of endocrine disruptors: effects on in vitro models of ovarian intrafollicular processes and ovarian cancer cell lines

Doba trvania: 1.1.2023 - 31.12.2026
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Bujňáková Mlynarčíková Alžbeta PhD.

Cielená modulácia chromatínovej štruktúry v liečbe malígneho melanómu uvey so zlou prognózou

Targeting high-order chromatin regulation for the treatment of poor prognosis uveal melanoma

Doba trvania: 1.7.2024 - 30.6.2028
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Smolková Božena PhD.
Anotácia:Pokrok v liečbe nádorových ochorení bol v posledných desaťročiach dosiahnutý hlavne vďaka úspechom cielených terapií, inhibítorov opravy DNA a využitiu imunoterapie. Pre značnú časť pacientov, vrátane pacientov s malígnym melanómom uvey (UM), však tieto prístupy neprinášajú požadovaný efekt, preto sa pri liečbe zvažujú alternatívne mechanizmy. Hoci bolo dokázané, že v nádorových tkanivách vysoko rizikových UM pacientov dochádza k rozsiahlemu preprogramovaniu metylácie DNA, aberácie na vyššej úrovni epigenetickej regulácie neboli doteraz študované. Na základe našich predbežných výsledkov, ktoré ukázali dereguláciu veľkého počtu epigenetických enzýmov, zodpovedných za modifikácie histónov a remodeláciu chromatínu, sa však domnievame, že tieto zohrávajú v progresii UM významnejšiu úlohu ako samotná metylácia DNA. Pochopenie týchto zmien by mohlo byť prínosné predovšetkým pre liečbu pacientov s UM. Úspech epigenetických liečiv tretej generácie, špecificky zacielených na tieto modifikácie, je však možný iba s využitím prístupov personalizovanej medicíny, založených na molekulárnej charakterizácii nádorov a poznaní mechanizmov účinku vybraných inhibítorov. V predkladanom projekte plánujeme využiť najnovšie technológie, ktoré prinášajú prevrat v chápaní nádorovej heterogenity a úloh jednotlivých bunkových populácií. Metóda scATAC-seq (Single cell Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing) sa využíva na stanovenie dostupnosti chromatínu. V kombinácii s scRNA-seq (Single cell RNA sequencing) umožňuje identifikáciu regulačných oblastí. Ich použitie nám umožní posúdiť doteraz málo preskúmanú heterogenitu tkaniva UM, rozsah preprogramovania v jednotlivých bunkových populáciách a ich úlohu v progresii ochorenia. Na základe získaných údajov vyberieme prostredníctvom in silico nástrojov najrelevantnejšie terapeutické ciele pre validáciu in vitro a in vivo, s použitím nami vyvinutých a na celogenómovej úrovni charakterizovaných modelov nádorových xenograftov.

Cirkulácia vírusu kliešťovej encefalitídy v blízkosti poľnohospodárskych fariem a lesných lokalitách na Slovensku

Circulation of tick-borne encephalitis virus in foci close to agricultural farms and in sylvatic sites of Slovakia

Doba trvania: 1.7.2024 - 30.6.2028
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Ličková Martina PhD.
Anotácia:Kliešťová encefalitída (KE) je vírusové ochorenie centrálneho nervového systému, ktoré je spôsobené vírusom KE. Hlavným zdrojom nákazy u ľudí sú v koži prichytené infekčné kliešte, najmä druh Ixodes ricinus. Okrem toho existuje aj alimentárna nákaza prostredníctvom konzumácie nepasterizovaného mlieka a mliečnych výrobkov z nakazených hospodárskych zvierat (ovce, kozy, hovädzí dobytok). V rámci Európy sa Slovensko vyznačuje relatívne vysokým podielom alimentárnych nákaz na celkovom počte prípadov KE. V posledných desaťročiach má chorobnosť KE vrátane alimentárnych infekcií stúpajúci trend a boli identifikované nové ohniská v severnejších oblastiach Slovenska a vo vyšších nadmorských výškach. Vírus KE koluje v prírodných ohniskách, prenášačmi sú kliešte, rezervoárovými hostiteľmi sú drobné zemné cicavce, najmä hlodavce. Napriek tomu, že existuje veľa poznatkov o ohniskách KE na Slovensku z druhej polovice 20. storočia, v súčasnej ére globálnych zmien a nárastu chorobnosti KE sa výskumu ohnísk KE venuje relatívne malá pozornosť. V navrhova nom projekte sa bude uplatňovať prístup „One Health“. Hlavným cieľom projektu je charakterizovať osobitosti cirkulácie a šírenia vírusu KE v novo objavených ohniskách v blízkosti poľnohospodárskych fariem na Slovensku. Okrem toho sa bude sledovať úloha drobných hlodavcov v udržiavaní vírusu KE v mikro-ohniskách a rozdiel v cirkulácii vírusu medzi vidieckymi ohniskami a prírodnými ohniskami v lesnom ekosystéme. Projekt má charakter základného výskumu s možnosťou využitia výstupov projektu farmármi v eliminácii rizík nákazy KE u voľne pasúcich sa domácich hospodárskych zvierat a v epidemiologickom informačnom systéme Úradu verejného zdravotníctva SR.

Cvičenie moduluje náklad cirkulujúcich extracelulárnych vezikúl u ľudí v zdraví a chorobe

Exercise modulates cargo of circulating extracellular vesicles in humans in health and disease

Doba trvania: 1.9.2024 - 30.6.2026
Program: Plán obnovy EÚ
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Alchus Laiferová Nikoleta PhD.

Digitalizácia personalizovaného manažmentu zdravotných rizík v rizikových skupinách s cielom zlepšiť zdravotné výsledky integráciou technologickej a spoločenskej inovácie

Digitalization of Personalized Health Risk Management in At-Risk Groups to Improve Health Outcomes through Integration of Technological and Social Innovation

Doba trvania: 1.1.2025 - 30.6.2026
Program: Plán obnovy EÚ
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Ukropec Jozef DrSc.

DNA metylácia ako nástroj pre implemetáciu tekutej biopsie u melanómu uvey

DNA methylation biomarkers as a tool for the implementation of liquid biopsy in uveal melanoma

Doba trvania: 1.1.2024 - 31.12.2027
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Horváthová Kajabová Viera PhD.
Anotácia:Melanóm uvey (MU) predstavuje agresívny typ nádoru pochádzajúci z pigmentových vrstiev oka. Klinické rozhodovanie pri UM sa rutinne opiera o hodnotenie rizika metastázovania na základe klinicko-patologických vlastností nádoru. Avšak predikcia prognózy u pacientov, ktorí podstúpia oko zachovávajúcu terapiu, je možná len prostredníctvom invazívnej biopsie tkaniva, čo nesie riziko uvoľnenia a šírenia nádorových buniek. Neinvazívna tekutá biopsia, ktorá u MU zahŕňa detekciu nádorovo asociovaných genetických aberácií v krvi, má však viacero limitácií. Nedávny výskum odhalil, že významnou črtou vysoko rizikových MU je zmenený profil metylácie DNA. Preto predpokladáme, že nádorovo špecifické zmeny metylácie DNA, identifikované v periférnej krvi, by mohli slúžiť ako spoľahlivé prognostické markery. Ich senzitivita a špecificita bude testovaná a validovaná v starostlivo vybranej kohorte pacientov s MU. Implementácia tekutej biopsie u MU má potenciál podporiť klinické rozhodovanie a zlepšiť starostlivosť o pacienta.

Eliminácia kliešťami prenášaných infekcií bez použitia antibiotík

Non-antibiotic approach for the treatment of tick-borne infections

Doba trvania: 1.7.2024 - 30.6.2028
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Špitalská Eva DrSc.

Epigenetická regulácia účinku circRNA na radiačne-indukované poškodenie

Epigenetic regulation effect of circRNA on radiation-induced damage

Doba trvania: 1.7.2024 - 30.6.2026
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: doc. Ing. Beliaev Igor DrSc.
Anotácia:Pľúcna fibróza spôsobená ožiarením je bežnou komplikáciou u pacientov podstupujúcich rádioterapiu. Vzhľadom na nedostatok účinnej prevencie a liekov v klinickej praxinie je poškodenie pľúc fibrózou kontrolovaným a reverzibilným procesom. Predchádzajúce štúdie zistili, že epiteliálno-mezenchymálna transformácia (EMT) je kľúčovým hnacím faktorom a dôležitým článkom v procese pľúcnej fibrózy. Okrem toho je proces EMT sprevádzaný významnou zmenou v profile expresie cirkulárnej RNA (circRNA), ktorá sa teraz považuje za kľúčový prvok mechanizmu regulácie pľúcnej fibrózy. Skríning vykonaný čínskym tímom ukázal, že circRNA0085439 reaguje na žiarenie. Nadmerná expresia circRNA0085439 môže účinne zvrátiť žiarením indukované zníženie expresie epitelového markera E -kadherínu a zvýšenie expresie intesticiálneho markera N-kadherínu. Slovenský výskumný tím bude testovať dve nezávislé metódy kvantifikácie circRNA0085439 vo vybraných pľúcnych epitelových bunkových líniách. Tento prístup sa použije na validáciu qPCR dát. V navrhovanom projekte sme predpokladali, že circRNA0085439 môže aktivovať Hippo signálnu dráhu pomocou SAV1, čím inhibuje výskyt a rozvoj rádioaktívnej pľúcnej fibrózy. Plánujeme uskutočniť cielenú syntézu nanočastíc na báze zlata, platiny a paládia, a študovať ich fyzikálno-chemické a biologické vlastnosti na bunkových a animálnych modeloch. Predpokladáme, že veľkosť, koncentrácia, doba inkubácie s nanočasticami, dávka a typ žiarenia budú mať vplyv na expresiu circRNA0085439. Na základe uvedeného plánujeme vybrať a vyvinúť nanonosič funkcionalizovaný pomocou spektroskopických a termogravimetrických metód z hľadiska jeho funkčnosti a stability, aby sme určili schopnosť indukovať nadmernú expresiu circRNA0085439.

Eradikácia multirezistentných mikroorganizmov vrátane nosných kmeňov u pacientov pomocou personalizovaného prístupu

Eradication of multiresistant microorganisms including carrier strains in patients using the personalised approach

Doba trvania: 1.7.2024 - 30.6.2028
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Zelník Vladimír CSc.
Anotácia:V súčasnosti rozsah šírenia multirezistentných mikroorganizmov (MDR) je globálnym problémom. Prevalencia rezistencie na antibiotiká znižuje účinnosť liečby, vedie k objaveniu sa ťažko liečiteľných infekcií a zvýšenej úmrtnosti. Prevažovanie MDR má negatívny vplyv aj na životné prostredie vrátane poľnohospodárstva, ktoré je hrozbou pre potravinovú bezpečnosť. Podľa WHO cirkulácia cefalosporín-rezistentných E. coli v roku 2022 dosiahla 42 % v 76 krajinách sveta, meticilín-rezistentných S. aureus – 35 %. Vývoj nových terapeutických riešení, vrátane alternatívnych, zlepšenie existujúcich, ktoré znížia používanie antimikrobiálnych liekov a šírenie antimikrobiálnej rezistencie je veľmi dôležitý. Autovakcinácia jedná zo známych alternatívnych metód, využívaných na liečbu chronických recidivujúcich ochorení. Napriek rozsiahlym skúsenostiam s používaním autovakcín nie sú mechanizmy ich účinku dostatočne preštudované, neexistujú štandardizované metódy, čo obmedzuje ich široké použitie. Využitie možností modernej imunológie a mikrobiológie umožní prehĺbiť poznatky o imunitných mechanizmoch účinku autovakcín a zmodernizovať spôsob výroby autovakcín s cieľom zvýšiť bezpečnosť autovakcíny a zachovať jej imunogenicitu, čo bude mať pozitívny sociálny a ekonomický efekt.

Extracelulárne vezikuly ako nástroj integrovanej adaptačnej odpovede na cvičenie: štúdie in vitro a in vivo

Extracellular vesicles a tool integrating adaptive response to exercise: in vitro and in vivo studies

Doba trvania: 1.1.2024 - 31.12.2027
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Ukropec Jozef DrSc.
Anotácia:Obezita je patofyziologickým podhubím mnohých chronických ochorení. Pravidelné cvičenie prispieva k prevencii obezity a jej komorbidít. Adaptácia na cvičenie so sebou prináša významné zmeny, ktorých dôsledkom je integrácia energetického metabolizmu na systémovej úrovni. Exerkíny, signálne molekuly, ktoré sa uvoľňujú do krvi pri cvičení, sa podieľajú na integrácii energetického metabolizmu, a kvôli lepšej biologickej dostupnosti môžu byť prenášané pomocou extracelulárnych vezikúl (EV). Primárnym cieľom práce je skúmať moleukové zloženie a schopnosť EV, uvoľňovaných do krvi pri cvičení (i) napodobniť metabolicky významné účinky cvičenia v bunkách ľudského kostrového svalu a tukového tkaniva, a (ii) vyvolať multiorgánové zmeny energetického metabolizmu u myší. Navrhovaný projekt umožní (i) objasniť úlohu extracelulárnych vezikúl pri akútnej a adaptačnej odpovedi na cvičenie a (ii) identifikovať biologicky významné molekuly obsiahnuté v EVs, ktoré majú potenciál zlepšiť metabolické zdravie pacientov s obezitou.

Fenomény vírusovej imunológie: CMV - TRIK či LIEK?

Phenomena of viral immunology: CMV for TRICKs or TREAT?

Doba trvania: 1.9.2025 - 31.8.2029
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Nemčovičová Ivana PhD.
Anotácia:Ľudský cytomegalovírus (HCMV) je významný patogén známy svojou schopnosťou dlhodobo pretrvávať v hostiteľskom organizme, a to aj napriek silnej humorálnej a bunkovej imunitnej odpovedi. Dosahuje to systematickým vyhýbaním sa imunitnej obrane. HCMV infikuje takmer všetky tkanivá a orgány, pričom v nich prechádza do latentného štádia, čo výrazne komplikuje vývoj účinných terapeutických prístupov. Jednou z hlavných prekážok pri návrhu cielenej liečby je neúplné pochopenie vírusových glykoproteínových komplexov, ktoré zohrávajú kľúčovú úlohu pri imunitnej modulácii a tiež v procese vstupu vírusu do hostiteľských buniek. Nedávne výskumy preukázali, že vírusový glykoproteín UL141 z málo preskúmaného lokusu HCMV UL/b' (prítomný hlavne v klinických kmeňoch) má dvojitú funkciu: podieľa sa na aktivácií povrchu viriónu pre vstup HCMV do bunky a zároveň potláča expresiu imunitných receptorov na povrchu hostiteľských buniek, čím prispieva k úniku vírusu pred imunitnou odpoveďou. Táto jedinečná stratégia robí z UL141 kľúčový 'TRIK', ktorý HCMV využíva na udržanie svojej perzistencie, a zároveň z neho robí perspektívny terapeutický cieľ. Naopak, HCMV UL144 (ortológ HVEM), ktorý taktiež pochádza zo strateného génového lokusu HCMV UL/b', sa vyznačuje selektívnou väzbou na imunitný kontrolný bod BTLA, ktorý tlmí aktivitu T buniek. Na rozdiel od HVEM neinteraguje so stimulujúcimi receptormi, čo poukazuje na jeho jedinečný mechanizmus účinku. Táto špecifická vlastnosť naznačuje, že UL144 môže byť cenným 'LIEKOM' v nádorovej imunoterapii. Cieľom projektu je preto detailne skúmať ako HCMV využíva tieto vírusové 'TRIKY' a 'LIEKY' na manipuláciu imunitnej odpovede na úrovni viriónu aj hostiteľskej bunky; cez funkčné interakčné analýzy, počítačový dizajn a syntézu látok, bunkové a vírusové testy. Výsledky nám poskytnú zásadné poznatky pre vývoj nových bioterapeutík. Tento projekt je logickým pokračovaním nášho vedeckého zámeru a nadväzuje na fungujúcu spoluprácu.

Funkčná analýza necharakterizovaných na komplex zostrihu viažúcich sa faktorov kvasinky Schizosaccharomyces pombe

Functional analysis of uncharacterized spliceosome-associated factors of Schizosaccharomyces pombe

Doba trvania: 1.1.2024 - 31.12.2027
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Kretová Miroslava PhD.
Anotácia:Zostrih pre-mRNA je proces, pri ktorom dohádza k odstráneniu intrónov a spojeniu exónov za vzniku zrelej mRNA. Napriek tomu, že poznáme základné princípy fungovanie zostrihu pre-mRNA ako aj väčšinu zostrihových faktorov, stále existuje množstvo faktorov regulujúcich proces zostrihu pre-mRNA, ktoré zatiaľ nie sú charakterizované. Cieľom tohto projektu je podrobné preskúmanie doteraz necharakterizovaných faktorov SPAC683.02c, SPAC1071.09c, SPAC1952.06c, SPAC30D11.14c a SPBC11C11.01 deliacej kvasinky S. pombe na molekulárnej úrovni, o ktorých predpokladáme, že sa podieľajú na regulácii zostrihu pre-mRNA. Zameriame sa hlavne na ich schopnosť regulácie iných zostrihových faktorov, ako aj na ovplyvnenie procesu zostrihu pre-mRNA v prípade ich nefunkčnosti. Získané vedomosti o fungovaní predpokladaných faktorov zostrihu na molekulárnej úrovni nám pomôže rozšíriť poznatky o komplexnosti mechanizmov podieľajúcich sa na zostrihu pre-mRNA.

Genetické príčiny vzácnych metabolických ochorení s dôrazom na funkčné štúdie nových génových variantov.

Genetic causes of rare inherited metabolic diseases with emphasis on functional studies of novel variants

Doba trvania: 1.7.2023 - 30.6.2027
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Gašperíková Daniela DrSc.
Anotácia: Dedičné metabolické poruchy sú veľkou skupinou zriedkavých ochorení, kde značná časť pacientov stále nie je diagnostikovaná pre nedostatok súčasných poznatkov alebo pre nejednoznačný klinický obraz. S rastúcou dostupnosťou sekvenovania novej generácie sa identifikuje čoraz viac genetických variantov, ktorých patogenita nie je známa. Genetická diagnostika zriedkavých chorôb si preto vyžaduje vedecký prístup a má predpoklad priniesť nové základné poznatky. Tento projekt sa zameriava na identifikáciu a genetickú diagnostiku pacientov s extrémne zriedkavými metabolickými poruchami. Súčasťou projektu je nielen pokračovanie v rozširovaní DNA a RNA biobanky, ale aj vytvorenie novej biobanky primárnych bunkových línií fibroblastov od pacientov. Osobitné úsilie vynaložíme na skríning pediatrických pacientov s podozrením na Wolframov syndróm. Varianty identifikované sekvenovaním budeme klasifikovať podľa medzinárodných štandardov a u tých kde nebude jasný ich význam vykonáme analýzy s cieľom potvrdiť alebo vylúčiť ich patogenitu. V rámci projektu budeme skúmať aj nové varianty v génoch PSMB5 a ATAD3A, ktoré sme identifikovali v predchádzajúcich štúdiách. Gén PSMB5 zatiaľ nebol spojený s ochorením, preto určíme patogenitu identifikovaných variantov pomocou „rescue“ experimentu, po ktorom budú nasledovať štúdie mechanizmu a vplyvu variantov na mitochondrie. V prípade génu ATAD3A budeme hodnotiť vplyv testovaných variantov na mitochondrie, endoplazmatické retikulum a ich kontakty, ktoré sú sľubným terapeutickým cieľom. Podrobne zdokumentujeme klinický fenotyp pacientov a upravíme liečbu podľa farmakogenetického princípu, v prípade Wolframového syndrómu zmenou liečby diabetu. Projekt má potenciál priniesť nové poznatky o etiopatogenéze metabolických porúch s okamžitou aplikáciou do klinickej praxe.

Genomika pyretroid-rezistentných komárov z rodu Culex infikovaných vírusom západonílskej horúčky v súvislosti s lepším pochopením zmien v citlivosti na vírus

Genomics of pyrethroid-resistant mosquitoes from genus Culex infected by West Nile virus in connection to a better understanding of changes in the viral susceptibility

Doba trvania: 1.8.2024 - 30.6.2026
Program: Plán obnovy EÚ
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Čabanová Viktória PhD.

Glymfatický systém a jeho využitie vo farmakoterapii ochorení CNS

Glymphatic system and its utilization in pharmacotherapy of CNS diseases

Doba trvania: 1.7.2024 - 30.6.2028
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Račeková Enikö CSc.
Anotácia:Glymfatický systém je nedávno objavený systém pozostávajúci z paravaskulárnych priestorov v centrálnom nervovom systéme (CNS), ktorý slúži na drenáž rozpustných proteínov a metabolitov z nervového tkaniva do cerebrospinálneho moku (CSF). Počas starnutia účinnosť glymfatického systému klesá, pričom akumulácia metabolitov a bielkovinových agregátov (napr. tau proteín, beta amyloid) v nervovom tkanive je spájaná s rozvojom neurodegeneratívnych ochorení. Napriek kľúčovej úlohe v udržaní homeostázy nervového tkaniva sú doteraz známe vedomosti o usporiadaní glymfatického systému obmedzené na oblasť mozgu a usporiadanie glymfatického systému miechy ostáva aj naďalej z veľkej miery nepreskúmané. Pochopenie usporiadania a fyziológie glymfatického systému by mohlo mať dopad aj na posun v oblasti farmakoterapie patologických stavov CNS. Predložený projekt je zameraný na výskum glymfatického systému a jeho využitia na podávanie terapeutík pri liečbe ochorení CNS. V prvej časti projektu bude cieľom analyzovať jednotlivé komponenty glymfatického systému počas ontogenézy s ohľadom na charakterizáciu atribútov, ktoré sú dôležité nielen pre udržanie homeostázy, ale aj pre potenciálne využitie pri farmakoterapii. V druhej časti projektu zistíme, či je možné využiť glymfatický systém na intracisternálne podávanie terapeutík naviazaných na biodegradovateľné nanočastice na báze oxidu kremičitého, čím by bolo možné prekonať obmedzenia spojené s podávaním liečiv cez hematoencefalickú bariéru, či konvenčného podávania liečiv intracisternálnou alebo intratekálnou cestou. V tretej časti projektu sa zameriame na možné riziká a dopady nami vyvinutej farmakoterapie na funkcie nervového a glymfatického systému.

Hľadanie nových neurobiologických cieľov súvisiacich so stresovými duševnými poruchami na jedinečných zvieracích modeloch

Searching for new neurobiological targets implicated in stress-related mental disorders in unique animal models

Doba trvania: 1.8.2024 - 30.6.2026
Program: Plán obnovy EÚ
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Hlaváčová Nataša PhD.

Hodnotenie protektívneho pôsobenia vybraných fytochemikálií proti neurotoxickým účinkom kovových nanočastíc pomocou bunkových modelov in vitro

Assessment of protective action of selected phytochemicals against metal nanoparticle-induced neurotoxicity using in vitro cell models

Doba trvania: 1.1.2024 - 31.12.2027
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Scsuková Soňa CSc.
Anotácia:Rýchly rozvoj nanotechnológií vedie k produkcii inovatívnych (nano)produktov a aplikácií, zároveň však vyvoláva obavy z možného vystavenia ľudí nanočasticiam (NČ) a ich nepriaznivých účinkov na ľudské zdravie. Kovové NČ majú širokospektrálne využitie v produktoch dennej spotreby a biomedicínskych aplikáciách. Existujú dôkazy, že po prekročení hematoencefalickej bariéry môžu NČ interagovať s neurálnymi bunkami a vyvolať sériu porúch v nervovom systéme, čím sa zvyšuje potenciálne riziko neurotoxicity. Potenciálne mechanizmy pôsobenia NČ súvisia najmä s oxidačným stresom a zápalom. V poslednej dobe sa venuje veľká pozornosť novým prístupom k zvýšeniu biologickej bezpečnosti nanočastíc. Podávanie fytochemikálií s antioxidačnými a protizápalovými vlastnosťami poskytuje sľubný potenciál na zmiernenie nepriaznivých účinkov NČ na biologické systémy. V tomto projekte budeme analyzovať možné protektívne účinky vybraných fytochemikálií proti neurotoxickým účinkom kovových NČ pomocou série testov in vitro.

Hodnotenie zmien mikroglií v animálnom modeli autizmu

Evaluation of microglial changes in an animal model of autism

Doba trvania: 1.1.2025 - 31.12.2027
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Havránek Tomáš PhD.

Charakterizácia nových proteínov podieľajúcich sa na regulácii zostrihu pre-mRNA

Characterization of novel proteins involved in the regulation of pre-mRNA splicing

Doba trvania: 1.1.2023 - 31.12.2026
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: Ing. Čipáková Ingrid PhD.

Charakterizácia solubilnej formy karbonickej anhydrázy IX v molekulárnych podtypoch karcinómu prsníka a jej význam pre prognózu.

Characterization of the soluble form of carbonic anhydrase IX in molecular subtypes of breast cancer and its significance for prognosis.

Doba trvania: 1.1.2024 - 31.12.2027
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Režuchová Ingeborg PhD., MPH
Anotácia:Karbonická anhydráza IX (CAIX) je uznávaným endogénnym markerom nádorovej hypoxie a jej vysoká expresia v tkanive mnohých solídnych nádoroch, vrátane karcinómov prsníka, je považovaná za nepriaznivý prognostický marker. Význam solubilnej formy CAIX, ktorá môže byť detegovaná v telových tekutinách, nie je doteraz spoľahlivo definovaný. Solubilná forma CAIX (sCAIX) obsahuje okrem ektodomény CAIX, odštepovanej z nádorových buniek metaloproteázami, aj CAIX-pozitívne exozómy. Keďže sCAIX cirkuluje v organizme aj po odstránení primárneho nádoru, môže ďalej pôsobiť v autokrinnej a/alebo parakrinnej signalizácii. Sledovanie hladín sCAIX a ich korelácia s expresiou CAIX v nádorovom tkanive a ostatnými klinicko-patologickými parametrami u pacientok s včasným karcinómom prsníka, spolu s detailným poznaním biogenézy CAIX a jej solubilnej formy v jednotlivých podtypoch karcinómu prsníka, zohľadňujúc ich odlišnú molekulovú výbavu a odpoveď na hypoxiu, významne prispejú k pochopeniu úlohy sCAIX v prognóze ochorenia.

Identifikácia génov kontrolujúcich apokrinnú sekréciu.

Identification of genes controling apocrine secretion

Doba trvania: 1.7.2024 - 30.6.2028
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Farkaš Robert CSc.
Anotácia:Na rozdiel od historickej vízie, apokrinnú sekréciu (AS) je možné v súčasnosti označiť za zreteľne definovaný nekanonický a nevezikulárny bunkový transportný a sekretorický mechanizmus. V porovnaní s klasickou a intenzívne študovanou exocytózou (merokrinnou sekréciou), ktorej hlavné komponenty sú už desiatky rokov známe, molekulárno-genetické determinanty AS začínajú byť iba poznávané, najmä kvôli intenzívnemu výskumu slinných žľazách u modelového organizmu Drosophila melanogaster. V predkladanom projekte plánujeme využitím molekulárnych a genetických nástrojov rozšíriť identifikáciu génov regulujúcich proces AS, a súčasne analyzovať ich vzájomné interakcie vrátane interakcií ich proteínových produktov. Naša proteomická analýza apokrinných sekrétov poukázala na významnú fylogenetickú konzervovanosť medzi drozofilou a človekom, čo dovoľuje predpokladať, že charakterizovanie signálnej dráhy AS môže významne prispieť k osvetleniu niektorých patologických procesov asociovaných s poruchami AS u človeka.

Identifikácia génov s vrodenou a somatickou mutáciou v hematologických nádoroch a ich funkčná analýza

Identification of genes with germline and somatic mutation in hematologic malignancies and their functional characterization

Doba trvania: 1.1.2025 - 31.12.2028
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Lopušná Katarína PhD.

Identifikácia nových biomarkerov spojených s relapsom metastatického kolorektálneho karcinómu po metastasektómii

Identification of novel biomarkers linked to the relapse of metastatic colorectal cancer after metastasectomy

Doba trvania: 1.7.2022 - 30.6.2026
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Matúšková Miroslava PhD.
Anotácia:Kolorektálny karcinóm (CRC) patrí celosvetovo k najčastejšie diagnostikovaným malignitám. Približne 20% pacientov má v čase diagnózy aj vzdialené pečeňové metastázy. Pečeň je najčastejším miestom metastáz a väčšinou jediným postihnutým orgánom. Po chirurgickom odstránení metastáz pečene (CRLM) dosahuje medián celkového prežitia (OS) 5 rokov len 31-60% pacientov. Lokálna recidíva ochorenia po resekcii je žiaľ stále vysoká a až u 50-75% pacientov sa objaví do dvoch rokov. V časovom horizonte 5 rokov po resekcii CRLM je úmrtnosť pacientov asi 50%. Hľadaniu spoľahlivých indikačných kritérií a prediktívnych biomarkerov, ktoré by dokázali predpovedať úspešnosť metastasektómie, resp. nepriaznivú prognózu bolo venovaných mnoho retrospektívnych štúdií. Predpokladáme, že benefit z chirurgického odstránenia pečeňových metastáz pri CRC veľmi závisí na genetických predispozíciách a expresnom profile nádorového tkaniva. Resekcia pečene je pritom vážna, invazívna operácia, ktorej by malo predchádzať neinvazívne vyšetrenie schopné posúdiť prognózu, ideálne napr. stanovenie špecifických cirkulujúcich nukleových kyselín z periférnej krvi (tzv. liquid biopsy). Cieľom projektu bude identifikovať spoľahlivý biomarker, resp. súbor biomarkerov v plazme pacientov, ktorý koreluje so zvýšeným rizikom relapsu po metastasektómii pečene. Pokročilé metódy sekvenovania DNA a RNA nám umožnia identifikovať nové kandidátne biomarkery a vyhodnotiť ich relevantnosť bioštatistickými metódami. Vybrané najperspektívnejšie markery podrobíme funkčnej analýze in vitro a in vivo na inovatívnych predklinických modeloch CRC – organoidoch a xenograftoch odvodených od pacientskych vzoriek. Tie sú v súčasnej dobe považované za najlepšie modely, ktoré si uchovávajú klinickopatologické črty a genetický profil pôvodného pacientskeho nádorového tkaniva.

Identifikácia nových imunitných terapeutických cieľov pri liečbe refraktérnych testikulárnych nádorov zo zárodočných buniek

Identification of new immune related therapeutic targets in treatment refractory testicular germ cell tumors

Doba trvania: 1.9.2025 - 30.6.2029
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: doc. RNDr. Čierniková Soňa PhD., MPH
Anotácia:Testikulárne germinálne nádory (GCT), pochádzajúce z imunologicky privilegovaného tkaniva, majú unikátne nádorové mikroprostredie (TME), pričom mechanizmy rezistencie na chemoterapiu sú stále nedostatočne preskúmané. Refraktérne prípady GCT majú extrémne nepriaznivú prognózu, s dlhodobou mierou prežitia menej ako 5 %. Tento projekt sa zameriava na pochopenie zmien v TME počas chemoterapie, ktoré môžu prispievať k rezistencii, a predpokladá, že tieto zmeny môžu odhaliť akčné biomarkery pre najnovšie inhibítory kontrolných bodov imunity (IC) a konjugáty protilátok a liečiv. Cieľom projektu je charakterizovať imunitné TME (iTME) pred a po chemoterapii a identifikovať ich súvislosť s klinicko-patologickými charakteristikami, analyzovať imunitné kontrolné body cieľové pre schválené alebo experimentálne imunoonkologické liečivá, vyvinúť nové experimentálne platformy, vrátane fragmentov nádorov odvodených od pacientov (PDTF) a modelov nádorov na čipe, a validovať nové inhibítory kontrolných bodov imunity a konjugáty protilátok a liečiv v existujúcich aj novo vyvinutých experimentálnych modeloch. Použitím pokročilých metód, ako je profilovanie priestorovej expresie, CyTOF, multidimenzionálna imunohistochémia, qRT-PCR, Western blot a kultivačné systémy, budú biomarkery analyzované v súvislosti s klinicko-patologickými údajmi s cieľom odhaliť ich potenciál na včasnú detekciu rezistencie. Očakáva sa, že výsledky projektu prispejú k validácii akčných biomarkerov a vývoju liečebných stratégií pre refraktérne GCT, čím sa zlepší prežitie a kvalita života mladých mužov.

Identifikácia nových proteínov a malých molekúl zapojených do interakcie kliešť-hostiteľ-patogén

Identification of novel proteins and small molecules involved in tick-host-pathogen interaction

Doba trvania: 1.1.2024 - 31.12.2027
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Minichová Lenka PhD.
Anotácia:Kliešte sú vektormi baktérii, vírusov, prvokov aj helmintov, ktoré vyvolávajú závažné ochorenia ľudí i ekonomické straty na hospodársky dôležitých zvieratách. V podávanom projekte sa sústredíme na intracelulárne baktérie. Vytvoríme model interakcie kliešť-patogén (model umelého kŕmenia kliešťov), aby sme vedeli kvantifikovať a následne regulovať množstvo patogénov vstupujúcich do kliešťov spolu s prijímanou krvou. Následne budeme monitorovať priebeh príjmu patogénov, ich distribúciu v orgánoch kliešťa i exkréciu patogénov v čase. Na štúdium a charakterizáciu procesov imunitného systému kliešťov použijeme najmodernejšie omikové metódy. Budeme sledovať, ako imunitný systém reguluje prežívanie patogénov, ich pomnoženie v tele vektora a následne spôsob prenosu do hostiteľa. Zlúčeniny, ktoré identifikujeme ako špecifické pre kliešte modulované patogénmi, môžu byť cennými cieľmi na definovanie účinnej antimikrobiálnej terapie alebo vývoja ochranných antigénov schopných blokovať prenos patogénov.

Imunitný kontrolný bod BTLA ako potenciálny biomarker v terapii difúzneho veľkobunkového B-lymfómu

Immune checkpoint BTLA as a potential biomarker in the therapy of diffuse large B-cell lymphoma

Doba trvania: 1.7.2024 - 30.6.2028
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Lopušná Katarína PhD.

Individuálna rádiosenzitivita onkologických pacientov a využitie Gingko biloba na prevenciu vedľajších účinkov rádioterapie

Individual radiosensitivity of cancer patients and use of Gingko biloba in the prevention of radiotherapy induced side effects

Doba trvania: 1.1.2023 - 31.12.2026
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Durdík Matúš PhD.
Anotácia:U približne 5% onkologických pacientov liečených rádioterapiou (RT) sa prejaví vážna toxicita liečby. Avšak, v klinickej praxi zatiaľ nie je dostupná metóda na stanovenie rádiosenzitivity na individuálnej úrovni. Na odhalenie rádiosenzitívnych (RS) pacientov pred začatím RT a štúdium ich odpovede na ožiarenie budeme analyzovať in vitro radiačne indukovanú apoptózu lymfocytov a in vivo-definované mikrojadrá a chromozomálne aberácie (CA). Následne porovnáme odpoveď na in vitro ožiarenie u RS a normálne odpovedajúcich pacientov pomocou analýzy DNA opravných fokusov, CA a mikrojadier. Gingko biloba je rastlina so silnými antioxidačnými vlastnosťami a jej extrakt môže byť použiteľný k ochrane pred vedľajšími účinkami rádioterapie u pacientiek s rakovinou prsníka. Cieľom tohto projektu je validovať kombináciu metód vhodnú na detekciu individuálnej rádiosenzitivity, overiť potenciálny ochranný efekt extraktu z Gingko biloba, a tiež vplyv prekonania COVID-19 na vedľajšie účinky rádioterapie u onkologických pacientov.

Inovatívne prístupy k diagnostike a liečbe duktálneho adenokarcinómu pankreasu

Innovative approaches to the diagnosis and treatment of pancreatic ductal adenocarcinoma

Doba trvania: 1.9.2024 - 30.6.2026
Program: Plán obnovy EÚ
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Smolková Božena PhD.
Anotácia:Duktálny adenokarcinóm pankreasu (PDA) je jedna z najagresívnejších malignít gastrointestinálneho traktu. 5-ročné prežívanie pacientov je v priemere 8-10%. Jedinou kurabilnou liečebnou metódou je kompletná resekcia tumoru a aj napriek radikálnej liečbe je priemerné 5-ročné prežívanie len približne 20%. Pri stanovení diagnózy má viac ako 80 % chorých lokálne pokročilé alebo metastatické štádium ochorenia. Skorá diagnostika a optimalizácia liečebných postupov s využitím najnovších poznatkov z celogenómových analýz predstavujú aktuálne stratégie na zlepšenie nepriaznivej prognózy pacientov s PDA. Projekt PDAid predstavuje integrovaný prístup k včasnej diagnostike a liečbe, ktorý kombinuje bioinformatiku, molekulárnu biológiu a klinickú transláciu. V centre výskumu je snaha využiť nástroje molekulárnej biológie na zlepšenie manažmentu pacientov s PDA prostredníctvom inovatívnych metodológií. Cieľom proejktu je poskytnúť výkonné nástroje na včasnú detekciu, a monitorovanie priebehu ochorenia u pacientov s PDA. Čiastkovými cieľmi sú: 1. Komplexný skríning verejne dostupných celogenómových dát a identifikácia metylačných markerov pre diagnostiku, a monitorovanie priebehu ochorenia. 2. Analýza metylácie DNA sekvenovaním novej generácie (NGS) v cfDNA z plazmy. 3. Integrácia techník tekutej biopsie. Integrácia dvoch techník tekutej biopsie (kombinácia mutačných a metylačných markerov) umožní prekonať obmedzenia tradičných metód tkanivovej biopsie, a poskytne monitorovanie progresie ochorenia a odpovede na liečbu v reálnom čase. 4. Validácia a prenos do klinickej praxe. Klinickú relevantnosť a diagnostickú presnosť identifikovaných metylačných markerov budeme validovať v relevantných kohortách pacientov s PDA metódou digitálnej kvapôčkovej PCR (ddPCR). 5. In silico analýza prinesie aj poznatky o expresných zmenách v nádoroch. Zameriame sa na dereguláciu expresie epigenetických regulátorov, ktorá otvára možnosti pre cielenú epigenetickú terapiu. 6. Využitie metodológie OTSC na validáciu účinnosti epigenetických inhibítorov v liečbe PDA predstavuje inovatívny prístup k terapii PDA, ktoré sa vyznačujú častou rezistenciou na liečbu, pretože umožní modelovať mikroprostredie PDA a poskytne relevantnejšie testovanie účinnosti liečby.

Integratívne single-cell profilovanie na odhalenie transkriptomickej a imunitnej dysregulácie v neopláziách plazmatických buniek

Integrative single-cell profiling to uncover transcriptomic and immune dysregulation in plasma cell neoplasms

Doba trvania: 1.9.2025 - 31.8.2029
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Jakubíková Jana PhD.

Interakcia medzi červeným mikrobiónom a pohlavnými hormónmi u pacientov s obezitou

Interaction between red microbiont and sex hormones in obese patients

Doba trvania: 1.1.2025 - 31.12.2028
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: doc. MUDr. Penesová Adela PhD.

Interakcia medzi mozgovými monoamínmi a črevnými hormónmi: úloha v nálade a kognícii

Interaction between brain monoamines and gut hormones: role in mood and cognition

Doba trvania: 1.9.2025 - 30.8.2029
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: prof. PharmDr. Ježová Daniela DrSc.

Jedinečnosť genetickej diverzity slovenskej fazule: Inovatívne prístupy pre zvýšenie rezistencie voči fytopatogénym hubám a vírusom

The uniqueness of the genetic diversity of Slovak beans: Innovative approaches to increase resistance to phytopathogenic fungi and viruses

Doba trvania: 1.9.2025 - 31.8.2029
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: doc. Ing. Glasa Miroslav DrSc.

Karbonická anhydráza I a tumorigenicita nádorovej bunky

Carbonic anhydrase I and cancer cell tumorigenicity

Doba trvania: 1.1.2025 - 31.12.2028
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Tyčiaková Silvia PhD.
Anotácia:Tumorigenicita nádorovej bunky a rozvoj nádorovej choroby úzko súvisí s nádorovým mikroprostredím a nádorovou extracelulárnou matrix (ECM). ECM je natoľko dôležitá, že sa o nej uvažuje ako o ďalšom z charakteristických znakov rakoviny (tzv. hallamarks of cancer). Ovplyvňuje architektúru a diferenciáciu tkaniva, schopnosť invadovať, metastázovať, mení sa a je menená nádorovými aj nenádorovými bunkami. Ukazuje sa, že existuje prepojenie syntézy ECM, enzýmu karbonická anhydráza I (CA I) a tumorigenicity nádorovej bunky. CA I doteraz neobjasneným spôsobom môže súvisieť s fenoménom spontánnej regresie nádorovej choroby. Úloha CA I je doposiaľ málo skúmaná, pričom je tento enzým mimoriadne bohato zastúpený v erytrocytoch a v sliznici zdravého čreva. V projekte sa zameriame na štúdium priameho účinku nadexpresie génu CA1 na biológiu nádorovej bunky, jej tumorigenicitu a signálne dráhy. Predkladaný projekt pomôže odhaliť nové súvislosti a úlohy karbonickej anhydrázy I v tumorigenéze.

Karbonická anhydráza IX ako potenciálny biomarker a terapeutický cieľ gliómov s vysokým stupňom malignity

Carbonic anhydrase IX as a potential biomarker and therapeutic target in high-grade gliomas

Doba trvania: 1.1.2025 - 31.12.2028
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Belvončíková Petra PhD.

Kardiovaskulárna ochrana sprostredkovaná alfa1AMPK proti endotelovej dysfunkcii sprostredkovanej metabolickým syndrómom – identifikácia nových rizikových faktorov

CARDIOvascular protection mediated by alfa1AMPK against metabolic syndrome-mediated ENdothelial Dysfunction – identifying new risk factors

Doba trvania: 1.7.2023 - 30.6.2027
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Hlaváčová Nataša PhD.
Anotácia:Narušenie vaskulárnej homeostázy spôsobené zníženou biologickou dostupnosťou oxidu dusnatého v dôsledku oxidačného stresu a zápalu je najzávažnejšou komplikáciou metabolického syndrómu (MetS), ktorá vedie k zvýšenej chorobnosti či úmrtnosti. Je preto dôležité identifikovať a analyzovať kľúčové faktory, ktoré zabraňujú alebo chránia vaskulárny endotel a tým zlepšiť primárnu a sekundárnu prevenciu kardiovaskulárnych ochorení. Zdá sa, že takýmto faktorom môže byť AMP-dependentná proteínkináza (AMPK). Jej ochranné vlastnosti a pozitívny vplyv na funkciu endotelu a oxidačný stres sú už známe. Práve tieto vlastnosti naznačujú, že AMPK sa môže podieľať na zlepšení metabolickej kontroly počas MetS, avšak molekulárne zmeny spôsobené dysreguláciou súvisiacou s a1AMPK počas vývoja MetS nie sú dostatočne pochopené. Projekt sa zameriava na rizikové faktory ovplyvňujúce funkciu endotelu počas MetS a AMPK ako potenciálny nástroj na modifikáciu týchto rizikových faktorov, ktoré vedú k prevencii alebo liečbe MetS. Originalita projektu je založená na komplexnom hodnotení funkčných, molekulárnych a biochemických zmien funkcie endotelu, zápalu a metabolickej senescencie počas MetS s detailným zameraním na cievny endotel - proliferáciu, senescenciu a apoptózu. Dôraz sa bude klásť na rizikové faktory ovplyvňujúce endotelovú funkciu, ako je interakcia/adhézia leukocytov s vaskulárnym endotelom a AMPK-dependentnú úlohu erytrocytov počas rozvoja MetS. Projekt bude obohatený o štúdium fenotypových a molekulárnych zmien na úrovni CNS s dôrazom na neurozápal a zmeny správania. Dôležité je tiež, že projekt má translačný charakter, keďže sa budú vykonávať aj humánne štúdie u pacientov s MetS. Výsledky tejto štúdie predstavujú potenciálny nástroj na zlepšenie zdravotného stavu súčasnej populácie, zvýšenia kvality života a zníženie ekonomickej záťaže spojenej s liečbou tohto kardiometabolického ochorenia.

Klonálne a imunitné interakcie pri high-grade transformácii Bbunkových lymfómov

Clonal and immune interactions in high-grade transformation of B-cell lymphomas

Doba trvania: 1.7.2024 - 30.6.2027
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Cholujová Dana PhD.

Konjugáty protilátky a liečiva ADC v liečbe recidivujúcich refraktérnych testikulárnych nádorov zo zárodočných buniek

Antibody-drug conjugates (ADCs) in the treatment of recurrent refractory germ cell tumors of the testis

Doba trvania: 1.1.2025 - 31.12.2028
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Kučerová Lucia DrSc.
Anotácia:Konjugáty protilátka-liečivo (z. angl. Antibody-Drug Conjugate, ADC) sú protinádorové lieky zložené z monoklonálnej protilátky kovalentne naviazanej na cytotoxické liečivo prostredníctvom chemického linkera. Kombinujú výhodu špecifického zacielenia a silnej cytotoxicity na dosiahnutie presnejšej a účinnejšej eliminácie nádorov. Efektívna liečba prekonávajúca chemorezistenciu u recidivujúcich refraktérnych testikulárnych nádorov zo zárodočných buniek (z. angl. relapsing refractory Testicular Germ Cell Tumors, rrTGCT) chýba v klinickej praxi. Naša štúdia sa zameriava na analýzu molekulárnych cieľov konjugátov ADC u rrTGCT. Budeme hodnotiť cytotoxický efekt ADC schválených na liečbu solídnych nádorov na izogénnych chemorezistentných variantoch TGCT buniek in vitro a v predklinických štúdiách. Vo vzorkách nádorov budeme skúmať expresiu povrchových markerov, voči ktorým sú nasmerované konjugáty ADC, pretože tá je rozhodujúca pre dosiahnutie maximálneho klinického prínosu týchto liečebných modalít u rrTGCT.

Laktát, metabolický signál a zdroj energie pre alternatívne mechanizmy termogenézy

Lactate, a metabolic signal and energy source for alternative thermogenesis mechanisms

Doba trvania: 1.1.2023 - 31.12.2026
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Baláž Miroslav PhD.
Anotácia:Chlad spúšťa v našom tele komplexnú fyziologickú odpoveď vrátane aktivácie termogénnych mechanizmov. Keďže tvorba tepla je energeticky náročný proces, jeho aktivácia je považovaná za veľmi sľubný terapeutický prístup v prevencii a liečbe obezity a pridružených ochorení. K najvýznamnejším zmenám pri akútnej odpovedi na chlad patrí zvýšenie cirkulujúcich hladín voľných mastných kyselín a laktátu. Zatiaľ čo zdrojom mastných kyselín, ktoré sú energetickým substrátom pre termogenézu, sú biele tukové bunky, nie je jasné odkiaľ pochádza laktát, ani aká je jeho fyziologická funkcia počas adaptácie na chlad. Primárnym cieľom práce je preto skúmať pôvod, osud a fyziologickú funkciu laktátu počas chladu. Navrhovaný projekt umožní nielen objasniť úlohu laktátu v odpovedi na chlad, ale zároveň prinesie prvú podrobnú metabolomickú analýzu ľudského hnedého tukového tkaniva, vďaka ktorej identifikujeme a následne overíme účinnosť nových terapeutických cieľov s potenciálom zlepšiť metabolické zdravie pacientov s obezitou.

Lipidomické štúdium bunkovej membrány Rickettsia spp.

Lipidomic study of the cell membrane of Rickettsia spp.

Doba trvania: 1.1.2024 - 31.12.2027
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: MVDr. Csicsay František PhD.
Anotácia:Zástupcovia rodu Rickettsia sú obligátne intracelulárne, gramnegatívne kokobacily, prenášané krv cicajúcimi článkonožcami. Početné ľudské patogény patriace do prechodnej skupiny (TRG), týfusovej skupiny (TG) a do skupiny škvrnitých horúčok (SFG) sú roznášané rôznymi druhmi článkonožcov. Vektormi sú rôzne blchy, vši, kliešte alebo roztoče. Ich povrch pokrýva lipopolysacharidová (LPS) vrstva, ktorá je ukotvená vo vonkajšej membráne pomocou lipidovej domény. Lipid A je bioaktívnou zložkou LPS, indukuje vrodenú imunitnú odpoveď a má endotoxický charakter. Napriek zjavnému významu lipidu A pri udržiavaní integrity vonkajšej membrány baktérií, ako aj jeho zápalového potenciálu počas infekcie, táto molekula je v rickettsiách stále málo prebádaná. Cieľom tohto projektu je odhalenie štrukturálnych rozdielov lipidov vonkajšej membrány rickettsií s využitím lipidomických techník a analýz na báze hmotnostnej spektrometrie, ako aj výskum imunogenicity rickettsiálneho lipidómu.

Mechanizmy poškodenia periférneho nervu pri chemoterapiou-indukovanej periférnej neuropátii.

Mechanisms of peripheral nerve damage in chemotherapy-induced peripheral neuropathy.

Doba trvania: 1.1.2023 - 31.12.2026
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: MVDr. Vanický Ivo CSc.
Anotácia:Chemoterapiou indukovaná periférna neuropatia (CIPN) je nežiadúci vedľajší efekt liečby ktorý vedie k zníženiu dávky alebo k prerušeniu život zachraňujúcej liečby. V predloženom projekte plánujeme testovať hypotézy predpokladaných mechanizmov vzniku periférnej neuropátie na experimentálnych modeloch. V in vivo experimentoch chceme potvrdiť, prípadne vylúčiť degeneráciu axónov pri dávkach Paclitaxelu, ktoré vyvolávajú hypersenzitívne zmeny a zdokumentovať akumuláciu makrofágov v periférnych nervoch a v spinálnych gangliách v rôznych časových obdobiach vzniku CIPN. V kritických fázach CIPN budeme detekovať prítomnosť zápalových mediátorov, (produkcia NO) ktoré môžu spôsobovať hypersenzitivitu. V in vitro experimentoch chceme zaviesť model ko-kultúry explantovaných spinálnych ganglií a makrofágov na sledovanie interakcií neurónov a makrofágov po podaní Paclitaxelu. 

Metabolická dysregulácia ako základný princíp integrovanej patofyziológie chronických ochorení súvisiacich s obezitou: Molekulárna krajina komplexnej úpravy životného štýlu

Metabolic dysregulation as the underlying principle of integrated pathophysiology of obesity-associated chronic diseases: Molecular Landscape of Complex Lifestyle Modification

Doba trvania: 1.8.2024 - 30.6.2026
Program: Plán obnovy EÚ
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Ukropec Jozef DrSc.

Metabolická charakterizácia nádorových buniek semenníkov s cieľom zvýšiť citlivosť rezistentných buniek na cisplatinu

Metabolic profiling of testicular cancer cells to increase the sensitivity of resistant cells to cisplatin

Doba trvania: 1.1.2023 - 31.12.2026
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: PharmDr. Goliaš Tereza PhD.

Mikrokapsuly na báze alginátu so zvýšenou stabilitou a biokompatibilitou pre enkapsuláciu pankreatických ostrovčekov v liečbe cukrovky

Alginate-based microcapsules with enhanced stability and biocompatibility for encapsulation of pancreatic islets in diabetes treatment

Doba trvania: 1.7.2023 - 30.6.2027
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Švastová Eliška PhD.

Mitochondriálne ochorenia a zlyhanie srdca

Mitochondrial disease in heart failure

Doba trvania: 1.7.2022 - 30.6.2026
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Zahradníková, ml. Alexandra PhD.
Anotácia:Niekoľko mutácií v mitochondriálnych génoch proteínov dýchacieho reťazca je spojených so srdcovým zlyhaním (SZ). Rozsah ich príspevku k rozvoju SZ na úrovni kardiomyocytov (CM) nie je známy. Nedávne zistenia naznačujú, že rôzne etiológie SZ zdieľajú podobnú remodeláciu srdcových myocytov (CM), najmä ich membránového systému a vápnikovej signalizácie. Projekt je zameraný na overenie in vitro modelu rozvoja SZ pri genetickej poruche so zníženou funkciou mitochondriálneho dýchacieho reťazca a overenie prevencie rozvoja SZ na bunkovej úrovni metabolickou terapiou výživovými doplnkami. Použijeme bunkovú líniu HL-1 CM s alotopickou expresiou mutantnej formy génu MT-ND5 pre podjednotku 5 respiračného komplexu I (mG13513A), spojenú s ľudskou hypertrofickou kardiomyopatiou, na určenie vplyvu chorých mitochondrií na cytoarchitektúru a kontraktilnú funkciu srdcových myocytov. Metódami elektrónovej a konfokálnej mikroskopie, bunkovej elektrofyziológie, oxygrafie a molekulárnej biológie budeme sledovať expresiu a lokalizáciu dyadických proteínov a zmeny mitochondriálnej štruktúry, lokalizácie a oxidačnej kapacity. Keďže genetickú kardiomyopatiu zatiaľ nemožno riešiť génovou terapiou, budeme skúmať prínosy metabolickej terapie na kompenzáciu zhoršenej mitochondriálnej funkcie. V HL-1 CM porovnáme účinok dedičnej mitochondriálnej insuficiencie s účinkom rozvoja SZ vyvolaného nadmernou stimuláciou. Očakávame, že výživová suplementácia mitochondriálnej funkcie zlepší výkonnosť CM a potlačí rozvoj SZ. Výsledky budú publikované v popredných časopisoch experimentálnej kardiológie a fyziológie a zverejnené na webovej stránke projektu a v médiách. Projektu sa zúčastnia traja doktorandi a niekoľko študentov magisterskej formy štúdia.

Modifikácia proteínov reaktívnymi aldehydmi pochádzajúcimi z metabolizmu polyamídov

Protein modification by reactive aldehydes derived from polyamine metabolism

Doba trvania: 1.7.2025 - 30.6.2027
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: MVDr. Némethová Miroslava PhD.
Anotácia:Tento projekt skúma vplyv aldehydov odvodených od polyamínov na modifikácie proteínov a ich cytotoxické účinky. Aldehydy vznikajúce pri oxidácii polyamínov môžu uvoľňovať akroleín, vysoko reaktívnu zlúčeninu známu tým, že modifikuje proteíny a prispieva k rôznym chorobám, ako je Alzheimerova choroba a ateroskleróza. Vo výskume sa použije hmotnostná spektrometria na analýzu modifikácií proteínov vyvolaných týmito aldehydmi v modelových proteínoch a biologických vzorkách z mikrobiálnych, pečeňových a potkaních mozgových buniek. Cieľom štúdie je identifikovať miesta modifikácie a posúdiť faktory koncentrácie a času inkubácie, ktoré ovplyvňujú tieto zmeny. Okrem toho projekt využije medzinárodnú spoluprácu na zvýšenie kvality výskumu a poskytne cenné skúsenosti mladším výskumným pracovníkom prostredníctvom výmeny odborných znalostí a technológií.

Modifikované regulačné T lymfocyty na liečbu sklerózy multiplex

Modified regulatory T cells for therapy of multiple sclerosis

Doba trvania: 1.7.2024 - 30.6.2028
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: doc. MUDr. Imrich Richard DrSc.

Modulácia metabolickej aktivity tukového tkaniva prostredníctvom lipidov

Targeting lipids to modulate the metabolic activity of adipose tissue

Doba trvania: 1.3.2025 - 31.12.2028
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Bán Petrisková Lívia PhD.

Molekulárne a mechanobiologické mechanizmy konkurenčných a adaptačných stratégií nádorových buniek v odpovedi na nádorové mikroprostredie

Molecular and mechanobiological mechanisms of cancer cell competition and adaptation strategies in response to tumor microenvironment

Doba trvania: 1.9.2025 - 31.8.2029
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: prof. RNDr. Pastoreková Silvia DrSc.

Molekulárne mediátory účinkov komplexnej úpravy životného štýlu u pacientov s obezitou: Regulácia metabolickej flexibility, in vitro and in vivo

Molecular mediators of the response to complex lifestyle intervention in patients with obesity: Regulation of metabolic flexibility in vitro and in vivo

Doba trvania: 1.7.2024 - 30.6.2028
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Ukropec Jozef DrSc.
Anotácia:Výskum molekulárnych mechanizmov, ktoré umožňujú metabolickú adaptáciu spojenú s cvičením môže poskytnúť celé spektrum nových poznatkov o systémových a tkanivo špecifických procesoch potenciálne využiteľných na prevenciu a liečbu metabolických ochorení spojených s obezitou. Našim cieľom je preto študovať kľúčové molekulárne mechanizmy a mediátory celotelovej odpovede na multi-komponentný (cvičenie, výživa, mindfulness) program manažmentu obezity, ktorý vedie k úprave telesného zloženia, metabolickej flexibility, kardiometabolickej zdatnosti a kognitívnych funkcií. Využijeme pritom inovatívne klinicko-fyziologické prístupy, bunkové a zvieracie modely a molekulárne genetické metódy na identifikáciu a validáciu mediátorov adaptačnej odpovede spojenej so zlepšením metabolického zdravia pacientov s obezitou. Najnovší výskum ukázal, že bunkovo-špecifická s cvičením spojená sekrécia proteínov do systémovej cirkulácie je modulovaná cvičením a že extracelulárne vezikuly sú prostriedkom medzi-tkanivovej komunikácie a celotelovej metabolickej integrácie. Navrhovaná randomizovaná klinická štúdia bude obohatená o výskum dynamických zmien metabolickej flexibility pri cvičení. Výsledný obraz účinkov intervencie získame integráciou klinických údajov a paralelných biofyzikálne, biochemicky a molekulárne definovaných zmien v systémovej cirkulácii, vrátane zmien extracelulárnych vezikúl. Charakterizácia zloženia membrány a obsahu extracelulárnych vezikúl umožní odhaliť potenciálne mediátory účinkov intervencie, ktoré budeme (i) funkčne charakterizovať na in vitro modeloch a (ii) následne na myšiach s diétou-vyvolanou obezitou. Tento holistický prístup poskytuje možnosť študovať komplexné procesy, ktoré určujú dynamiku metabolickej odpovede na cvičenie, a umožňuje tak odhaliť (i) biomarkery metabolickej flexibility, (ii) indikátory účinnosti intervencií spojených so zmenou životného štýlu a (iii) bioaktívne látky napodobňujúce účinky cvičenia, vhodné pre manažment obezity.

Molekulárne mechanizmy interakcie signálnych dráh kortikosteroidov a monoamínov v kardio- a neuropatológiách vyvolaných stresom

Molecular mechanisms implicated in corticosteroid-monoamine interaction in stress-related cardio- and neuropathologies

Doba trvania: 1.7.2023 - 30.6.2027
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Cagalinec Michal PhD.
Anotácia:Stres je definovaný ako odpoveď organizmu na vonkajšie stresory, ktoré spôsobujú narušenie homeostázy. Živé organizmy sú vystavené takýmto stresorom počas celého života, pričom k prvej expozícii môže dôjsť ešte pred narodením (napr. v dôsledku infekcie matky počas tehotenstva). Stres nemusí byť iba škodlivý. Regulovaná expozícia môže mať na organizmy aj pozitívny vplyv (napr. kognitívna behaviorálna terapia). Naopak, chronický stres negatívne ovplyvňuje najmä kardiovaskulárny a nervový systém, čo vedie k rozvoju rôznych patológií, ktoré patria k najčastejším príčinám invalidity a smrti. Na základe našich doterajších výsledkov na potkanoch predpokladáme, že interakcia medzi kortikosteroidmi a monoamínmi je významným faktorom, ktorý určuje či reakcia organizmu určitého pohlavia na daný stresor bude pre neho škodlivá, neutrálna alebo dokonca pozitívna. Našim cieľom je detailnejšie preskúmať molekulárne mechanizmy interakcie kortikosteroidov s monoamínmi v potkaňom modeli prenatálneho stresu (prenatálna stimulácia imunitného systému matky aplikovaním LPS) a prepojenie tejto interakcie s Ca2+ signalizáciou, ktorá sa podieľa na dekódovaní rôznych signálov do špecifických bunkových odpovedí. Sústredíme sa predovšetkým na preskúmanie zmien vyvolaných prenatálnym stresom na úrovni kontraktility kardiomyocytov a excitability serotonergných a dopaminergných neurónov v strednom mozgu. Ca2+ signalizácia ako možný vnútrobunkový efektor interakcie kortikosteroidov s monoamímni bude sledovaná na úrovni vnútrobunkových Ca2+ kanálov, ktoré patria k hlavných komponentov Ca2+ signalizácie v kardiomyocytoch ako aj neurónoch. Ďalej otestujeme predpokladaný terapeutický potenciál pyridoindolov v liečbe neurologických ako aj kardiovaskulárnych ochorení vyvolaných prenatálnym stresom. Testovanie bude zahŕňať in silico modelovanie (počítačové simulácie interakcií liečiva) a in vivo aplikáciu.

Molekulárne základy riadiace kompetenciu kliešťov pri prenose patogénov

Molecular fundamentals driving tick competence in pathogen transmission

Doba trvania: 1.9.2024 - 30.6.2028
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Sekeyová Zuzana PhD.
Anotácia:Klimatické zmeny ovplyvňujú prenos vektormi prenášaných ochorení mi a umožňuje ich šírenie do nových oblastí. Keďže sú zodpovedné za viac ako 17 % všetkých infekčných ochorení (spôsobujú viac ako 700 000 úmrtí ročne), kontrola vektorov a prevencia ich výskytu sa stali jednou z priorít WHO. Predkladaný projekt má za úlohu objasniť vektorovú kompetenciu na prenos a opísať molekulárne a funkčné rozhranie medzi patogénnymi baktériami (Rickettsia spp. a Coxiella burnetii) a ich bežnými vektormi kliešťami v Európe (Dermacentor reticulatus a Ixodes ricinus). Oba patogény vyvolávajú závažné ochorenia u ľudí alebo straty na hospodársky významných prežúvavcoch (kozy, ovce, kravy). Patogénne a imunitné dráhy spolu s mechanizmami prežívania patogénu vo vektore a hostiteľovi boli čiastočne charakterizované, ale len niekoľko štúdií sa zameralo na komplexné interakcie vzťahu patogén-vektor počas kŕmenia. Počas riešenia projektu aplikujeme interdisciplinárny prístup a najmodernejšie zobrazovacie techniky na opis toho, ako môže imunitný systém kliešťa kontrolovať prežívanie patogénov a ich prenos. Naším cieľom je (i) vyvinúť nové metódy vizualizácie a kvantifikácie kliešťom prenášaných patogénov pomocou najmodernejších zobrazovacích techník. To nás privedie k (ii) identifikácii biomarkerov (špecifických metabolitov a proteínov) dôležitých pre prenos patogénov, ktoré budú anotované alebo určené de novo. Nakoniec (iii) použijeme unikátne zlúčeniny špecifické pre kliešte modulované bakteriálnymi faktormi ako ciele na definovanie účinnej antimikrobiálnej terapie a vývoj ochranných antigénov schopných blokovať prenos patogénov.

Molekulárno-biologická analýza mechanizmu ischemickej tolerancie pri zmierňovaní následkov cievnej mozgovej príhody formou kondicionovania

Molecular-biological analysis of the mechanism of ischemic tolerance in mitigating the consequences of stroke by conditioning

Doba trvania: 1.1.2024 - 31.12.2027
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Mucha Rastislav PhD.
Anotácia:Z klinickej praxe je známe, že po ischemickom poškodení mozgu je možné formou kondiciovania navodiť toleranciu voči degradácii nervového tkaniva. Komplexné popísanie tohto procesu na molekulárnej úrovni však doposiaľ nebolo realizované. Rozpoznanie mechanizmov aktivácie neuroprotektivity po ischemickom poškodení mozgu na molekulovej úrovni je nevyhnutné pre pochopenie tohto procesu. Vieme, že periférna krv veľmi citlivo a špecificky reflektuje zmeny expresie ako génov, tak aj proteínov v mozgu. Cieľmi predkladaného projektu sú: 1) identifikovať potenciálne markery (génové, proteínové) aktivácie ischemickej tolerancie, 2) zatriedenie a špecifikácia génov aj proteínov v ich signálnych dráhach s vytvorením reakčnej mapy molekulových kaskád špecifickej pre mechanizmus ischemickej tolerancie vo vzorkách krvi človeka a na potkaňom modeli. Splnenie týchto cieľov umožní prispieť k poznaniu procesov neuroprotektivity a zvýšeniu úrovne prežívania neurónov.

Molekulárno-genetická analýza glejového Sgs-sekrétu slinných žliaz Drosophila melanogaster a jeho biologických vlastností

Molecular-genetic analysis of salivary gland Sgs-glue secretion from Drosophila melanogaster and its biological properties

Doba trvania: 1.1.2023 - 31.12.2026
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Farkaš Robert CSc.
Anotácia:Uplynulé dekády sa venovalo nemalé úsilie hľadaniu bioadhezív, ktoré mali primárne slúžiť ako zásadný zdroj inšpirácie na vývoj derivátov a biomimetík pre širokú škálu využitia v medicíne alebo rôznych oblastiach priemyslu vrátane vývoja subkutánnych glejových implantátov, biopolymérov pre ochranu a hojenie kombinovaných epidermálno-neuronálnych štruktúr, liečby idiopatickej pľúcnej fibrózy, kontrole hemostázy a medzitkanivovej adhézie v chirurgii, nových diagnostických postupov alebo úprave biopolymérov pre kontrolované uvoľňovanie liečiv. Medzi nesporne úspešné deriváty tohto snaženia patria semisyntetické adhezíva na báze katecholu. Avšak komplexnejšie multiproteínové bioadhezíva i napriek svojím atraktívnym vlastnostiam nezaznamenali takú mieru aplikácie. V predkladanom projekte navrhujeme na modelovom organizme Drosophila pomocou genetických nástrojov poodhaliť molekulárny mechanizmus tvorby a polymerizácie tzv. Sgs-gleja zo slinných žliaz a tak prispieť k pochopeniu komplexnosti tvorby bioadhezív.

Mutácie asociované s Wolframovým syndrómom: rozdielne signálne dráhy v zmysle metabolizmu vápnika a funkcie mitochondrií

Mutations associated with Wolfram syndrome: alternative signaling pathways for calcium and mitochondrial physiology

Doba trvania: 1.7.2022 - 30.6.2026
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Cagalinec Michal PhD.
Anotácia:Wolframov syndróm (WS), diagnostikovaný na základe diabetes insipidus, diabetes mellitus, atrofie optického nervu a hluchoty, je spôsobený mutáciami v géne WFS1. V súlade s týmito príznakmi, proteín WFS1 je vo vysokej miere produkovaný v mozgu a pankrease. Okrem toho je popísaná jeho vysoká expres ia aj v srdci; prekvapivo však vo veľkej väčšine prípadov príznaky na srdci pozorované neboli. WFS1 predstavuje intergrálny proteín membrány endoplazmatického retikula (ER) s výrazným vplyvom na metabolizmus vápnika, funkciu mitochondrií a stres ER. Otvorenou otázkou však ostáva, prečo sú β-bunky pankreasu a neuróny pri WS silne poškodené a zmeny v myocytoch sú iba minimálne, keď je v nich WFS1 vysoko exprimovaný? Vysvetlením by mohol byť zatiaľ neznámy kompenzačný mechanizmus prítomný v myocytoch a/alebo odlišné signálne dráhy, ktoré nie sú prítomné v neurónoch/β-bunkách. Preto prvá hypotéza znie: Líši sa metabolizmus vápnika a funkcia mitochondrií v srdcových myocytoch v porovnaní s neurónmi a pankreatickými β-bunkami v prípade poškodenia WFS1? Väčšina prípadov WS predstavuje recesívne mutácie; bolo však identifikovaných aj niekoľko dominantných mutácií. Druhá hypotéza preto znie: Líši sa metabolizmus vápnika a mitochondriálna dynamika v bunkách exprimujúcich patogénne dominantné voči recesívnym mutáciám proteínu WFS1? Úplným unikátom projektu je charakterizácia doteraz nepozorovaného heterozygotného delečného variantu WFS1, ktorý bol len nedávno identifikovaný u prvého slovenského pacienta s WS na ústave žiadateľa a jeho funkčné porovnanie s dominantnými a recesívnymi variantmi. Využitie moderných prístupov vrátane metódy CRISPR/Cas9, optogenetických techník, konfokálnej mikroskopie a know-how navrhovaného výskumného tímu pomôže, aspoň čiastočne, objasniť funkciu WFS1, čo v dlhodobom horizonte poslúži pre vývoj včasnej diagnostiky a efektívnej liečby nielen pacientov trpiacich WS, ale aj pacientov s diabetes mellitus a kardiovaskulárnymi ochoreniami s vysokou prevalenciou.

Na stope identity mitochondriálneho chloridového kanálu

On the trace of mitochondrial chloride channel identity

Doba trvania: 1.7.2023 - 30.6.2027
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Polčicová Katarína PhD.
Anotácia: Mitochondriálne chloridové kanály sa spolupodieľajú na regulácii mitochondriálneho membránového potenciálu deltaΨm. V in vitro podmienkach bolo pozorované, že oxidačný stres má za následok oscilácie deltaΨm, čo vedie prostredníctvom produkcie ATP v mitochondriách k skráteniu akčného potenciálu na plazmatickej membráne kardiomyocytov a k vzniku arytmií. Na úrovni celého srdca boli pozorované arytmie ako dôsledok ischémie- reperfúzie. Špecifické ligandy translokátorového proteínu (TSPO) zabraňujú vzniku post-ischemických arytmií. Rovnaký účinok má aj nešpecifický blokátor chloridových kanálov. Ligandy TSPO inhibujú chloridový kanál v mitochondriách pri veľmi nízkych koncentráciách, čo napovedá, že TSPO protein sprostredkúva blokovanie kanálu. Je teda pravedpodobné, že TSPO bude v tesnom kontakte s chloridovým kanálom. Chloridové kanály z mitochondria sú dobre popísané na úrovni elektrofyziológie, avšak ich molekulárna identita ostáva nejasná. Nedávno bolo ukázané, že niektoré izoformy z rodiny chloridových intracelulárnych kanálov (CLIC) sa nachádzajú v mitochondriách. CLIC kanály však boli popísané len v umelom systéme – nadexprimované v hostiteľských bunkách. Predpokladá sa, že mitochondriálne chloridové kanály z natívnych vzoriek budú identické s niektorou z CLIC izoforiem. Cieľom predkladaného projektu je overiť hypotézu, že merané natívne chloridové kanály zo srdcových mitochondrií sú členmi CLIC rodiny a či daná CLIC izoforma a TSPO sú v tesnom fyzickom kontakte. Predpokladáme, že získané výsledky pomôžu objasniť molekulárnu identitu mitochondriálneho chloridového kanálu, ktorý predstavuje významný potenciálny ciel pre odvrátenie vzniku post-ischemických arytmií.

Nanocéria - doplnková liečba pre senzitizáciu testikulárnych karcinómov neodpovedajúcich na cisplatinu

Nanoceria - the complementary treatment to sensitize testicular tumors not responding to platinum agents

Doba trvania: 1.1.2025 - 31.12.2028
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Jurkovičová Dana DrSc.
Anotácia:Terapeutická rezistencia je jedným z kľúčových problémov liečby rakoviny. Pochopenie jej molekulárnych mechanizmov umožňuje skúmať nové terapeutické prístupy. Nanočastice oxidu céru (nanocérie) predstavujú novú technológiu s veľkým potenciálom ako antioxidačné a rádioprotektívne protirakovinové činidlá. Inhibujú progresiu rakoviny, sú toxické pre nádorové bunky, ale netoxické pre stromálne bunky, čo sľubuje aj ich klinické využitie. Nanocérie budú testované na unikátnych in vitro modeloch testikulárnych nádorov (TGCT), voči cisplatine (CDDP) senzitívnych a rezistentných bunkových líniách a z nich generovaných 3D sféroidoch. TGCT sú známe vynikajúcou odpoveďou na liečbu s CDDP, ale malé percento pacientov je rezistentných, recidivujúcich, so zlou prognózou. Nanocérie otestujeme ako potenciálny terapeutický doplnok k CDDP na senzibilizáciu rezistentných TGCT. Vzhľadom na proapoptotické a antiinvazívne vlastnosti by nanocérie aplikované spolu s CDDP mohli zlepšiť výsledky terapie rezistentných pacientov.

Nefarmakologické postupy v prevencii Alzheimerovej choroby na Slovensku

Non-pharmacological strategies in the prevention of Alzheimer's Disease in Slovakia

Doba trvania: 1.7.2024 - 30.6.2026
Program: Plán obnovy EÚ
Zodpovedný riešiteľ: prof. MUDr. Ukropcová Barbara PhD.
Anotácia:Celosvetovo trpí demenciou viac ako 55 miliónov ľudí. Hlavnou príčinou demencie je Alzheimerova choroba (ACh), zatiaľ bez existujúcej efektívnej liečby. Včasná diagnostika a úprava životného štýlu môžu výrazne znížiť prevalenciu ACh aj náklady na liečbu. Cieľom projektu je významne rozšíriť možnosti identifikácie molekúl, regulovaných cvičením a komplexnou úpravou životného štýlu v krvi seniorov so zvýšeným rizikom ACh; a stanoviť efektivitu a udržateľnosť dlhodobej nefarmakologickej intervencie. Ciele nadväzujú na klinickú štúdiu LIBRA-Net (ADDIT-CE). Extracelulárne vezikuly predstavujú atraktívny transportný systém pre molekulárne mediátory integrujúce adaptačné účinky cvičenia na mozog a iné tkanivá, ktoré je možné využiť aj pri včasnej diagnostike a monitorovaní ACh. Dlhodobá udržateľnosť programov založených na komplexnej úprave životného štýlu je predpokladom zníženia prevalencie demencií a zlepšenia zdravia a kvality života starnúcej populácie Slovenska.

Nekódujúca RNA ako biomarker pre diagnostiku a terapiu detskej leukémie

Non-coding RNA as a biomarker for diagnostics and therapy of childhood leukemia

Doba trvania: 1.8.2024 - 30.7.2026
Program: Plán obnovy EÚ
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Jakl Lukáš PhD.
Anotácia:Aktuálne modely terapie sú založené na obmedzených diagnostických nástrojoch založených na prítomnosti leukemických buniek (blastov) pomocou cytometrie a prítomnosti a typu preleukemických fúznych génov v blastoch. Tieto diagnostické nástroje sa používajú na zaradenie pacienta do 3 rôznych rizikových skupín. Pri každej z nich sa používa odlišný liečebný protokol na základe medzinárodnej lekárskej klasifikácie. Stále existujú pacienti so slabou odpoveďou na liečbu a protokol sa musí zmeniť. Súčasné poznatky v oblasti klinického výskumu naznačujú kľúčovú úlohu ncRNA a mohli by slúžiť ako potenciálny biomarker na predikciu zlej odpovede u pacientov a od začiatku terapie by sa dala použiť vhodná silnejšia terapia, ktorá je nevyhnutná. Pacienti s dobrou odpoveďou na liečbu, ktorí dosiahli remisiu, sú stále vystavení riziku relapsu leukémie. NcRNA by sa tiež mohli exprimovať odlišne u pacientov, u ktorých došlo k relapsu, v porovnaní s pacientmi, ktorí dosiahli úplnú remisiu.

Neuroprotektívny a regeneračný potenciál posttraumatickej liečby zacielenej na angiotenzínové receptory

Neuroprotective and regenerative potential of post-traumatic cure targeted to Angiotensin II receptors

Doba trvania: 1.7.2023 - 30.6.2027
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Pavel Jaroslav PhD.
Anotácia:Traumatické poranenie miechy môže spôsobiť vážne celoživotné postihnutie prejavujúce sa rôznymi symptómami vrátane parestézie, spasticity, straty motorickej kontroly a často silnej bolesti. Napriek tomu, že intenzívny výskum patológie SCI v posledných desaťročiach viedol k identifikácii mnohých sľubných cieľov liečby, následné klinické štúdie boli väčšinou negatívne a žiadny z týchto experimentálne sľubných prístupov nebol zatiaľ plne akceptovaný v klinickej praxi. Súčasná liečba akútneho SCI je obmedzená na chirurgickú dekompresiu a intravenóznu aplikáciu vysokých dávok metylprednizolónu, ktorých klinická účinnosť zostáva stále nejasná. Tzv. „brain-machine interfaces“ a epidurálna elektrostimulácia ukázali značný prísľub pre funkčné zotavenie, avšak tieto stratégie využívajú funkciu ušetrených nervových vlákien a obchádzajú miesto poranenia namiesto toho, aby vyvolávali biologickú opravu. Z tohto pohľadu má identifikácia intervencií modifikujúcich poranenie miechy stále vysokú klinickú prioritu. Naše experimentálne výsledky poukázali na prechodné dlhodobé zvýšenie krvného tlaku takmer bezprostredne po vážnej traume miechy a oneskorenú prechodnú expresiu angiotenzínových AT2 receptorov. Návrh projektu predpokladá normalizáciu hypertenzie a obmedzenie fibrózy prostredníctvom blokátorov AT1 receptorov a následnú stimuláciu AT2 receptorov s cieľom obmedzenia rozsahu poškodenia a zvýšenie neuroregeneračnej schopnosti poškodeného nervového tkaniva miechy. Predbežné výsledky poukázali sľubný potenciál stimulácie AT2 receptorov v procesoch spojených s axonálnou regeneráciou a obnovou vaskulárneho systému.

Nová technológia na báze suchej kvapky moču pre detekciu virálnej RNA

New dry urine drop-based technology for viral RNA detection

Doba trvania: 1.1.2025 - 30.6.2026
Program: Plán obnovy EÚ
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Čabanová Viktória PhD.

Nové liečebné postupy cielené na nádorové kmeňové bunky v patogenéze mnohopočetného myelómu

Novel Drug Approaches Targeting Cancer Stem-like Cells in Multiple Myeloma Pathogenesis

Doba trvania: 1.8.2024 - 30.6.2026
Program: Plán obnovy EÚ
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Jakubíková Jana PhD.

Nový prístup v terapii post-traumatickej stresovej poruchy (PTSD): liečba kvetiapínom doplnená o probiotiká

New approach in post-traumatic stress disorder (PTSD) therapy: quetiapine treatment supplemented by probiotics

Doba trvania: 1.9.2025 - 31.8.2029
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Osacká Jana PhD.
Anotácia:Post-traumatická stresová porucha (PTSD) je multifaktoriálne psychiatriacké ochorenie charakterizované zvýšenou mierou strachu, ostražitosti a narušenou stresovou reakciou. Rozvoj PTSD ovplyvňuje rôzne biologické mechanizmy a procesy, vrátane zmien v neurogenéze a neuroplasticite mozgu. Liečba PTSD zahŕňa predovšetkým psychologické intervencie, a až ako druhá možnosť prichádza farmakoterapia. Atypické antipsychotikum kvetiapín (QUE) je v súčasnosti jedným z najsľubnejších používaných liečiv, ktoré však okrem potlačenia negatívnych prejavov PTSD má aj nežiaduce vedľajšie účinky. V poslednej dobe sa viaceré štúdie zameriavajú na úlohu črevnej mikroflóry pri psychiatrických ochoreniach, pričom zmeny v črevnom mikrobióme boli preukázané aj pri PTSD. Avšak, vzájomné prepojenia medzi liečbou antipsychotikami, črevnou mikroflórou a mozgom pri PTSD nie sú doteraz objasnené. Predpokladáme, že liečba atypickým antipsychotikom QUE v kombinácii s probiotikami potlačí disbiózu, ako jeden z nežiaducich vedľajších účinkov QUE, a tiež narušenú črevnú mikroflóru indukovanú PTSD. Kombinovaná liečba navrhnutá v predloženom projekte môže predstavovať nový trend v terapii PTSD. Veríme, že tento liečebný prístup zvýši terapeutický účinok QUE, potlačí negatívne prejavy správania a zmeny v neuroplasticite vyvolané PTSD účinnejšie ako terapia samotným QUE. Predložený projekt prispeje k lepšiemu porozumeniu mechanizmov, ktoré stoja za rozvojom patológie PTSD a môže predstavovať nový perspektívny spôsob liečby PTSD.

Objasnenie mechanizmu vzniku závažnej formy kliešťovej encefalitídy

Elucidating the mechanism behind severe tick-borne encephalitis

Doba trvania: 1.9.2024 - 30.6.2028
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Ličková Martina PhD.
Anotácia:Kliešťová encefalitída (TBE) je závažné vírusové ochorenie človeka, ktoré postihuje centrálny nervový systém. Incidencia v Európe sa zvýšila z 0,4 v roku 2015 na 0,9 prípadu na 100 000 ľudí v roku 2020. Ochorenie sa prejavuje ako meningitída, meningoencefalitída alebo meningoencefalomyelitída a je zodpovedné za viac ako 10 000 hospitalizácií ročne. Z tohto dôvodu predstavuje TBE významný medicínsky problém s vysokými nákladmi pre zdravotnícky systém a spoločnosť. Presné determinanty závažnosti ochorenia nie sú známe; ale existuje niekoľko hypotéz. Ambíciou navrhovanej štúdie je identifikovať faktory ovplyvňujúce závažnosť TBE. U pacientov s kritickou formou COVID-19 a u pacientov s ťažkou infekciou vírusom západonílskej horúčky sa zistili neutralizačné autoprotilátky IgG (auto-Abs) proti IFN typu I. Preto je prvým cieľom navrhovaného projektu testovanie auto-Abs proti IFN typu I v sére pacientov s neurologickými príznakmi diagnostikovanými ako TBE. Niektoré mutácie vo vírusových proteínoch môžu ovplyvniť neuroinvazívnosť infekcie TBEV. Mutácie v géne proteínu E boli spojené s častejším výskytom závažných a smrteľných infekcií TBE. Preto budeme v rámci projektu sekvenovť klinické vzorky pacientov pomocou NGS technológie. Posledným faktorom, ktorý sa podieľa na závažnosti ochorenia, je nesprávne diagnostikovaná infekcia inými flavivírusmi v dôsledku ich skríženej reaktivity počas diagnostiky. Projekt poskytne podrobné informácie o tom, či sú auto-Abs proti IFN typu I spojené s ťažkými prípadmi TBE. Tieto informácie môžu zlepšiť liečbu ochorenia. Okrem toho získané sérologické údaje ponúknu ďalšie epidemiologické dáta o TBEV a príbuzných flavivírusoch. Kompletné sekvencie genómu TBEV zo vzoriek pacientov prinesú poznatky o genetickej diverzite kmeňov TBEV, ktoré v súčasnosti cirkulujú na Slovensku, ako aj potenciálnu identifikáciu molekulárnych faktorov, ktoré prispievajú k patogenite vírusu.

Odhalenie molekulárnych mechanizmov a metabolickej regulácie substrátových cyklov

Elucidating the molecular mechanisms and metabolic regulation of substrate cycles

Doba trvania: 1.7.2023 - 30.6.2027
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Baláž Miroslav PhD.
Anotácia:Obezita predstavuje vážnu hrozbu pre ľudské zdravie keďže je primárnym rizikovým faktorom rozvoja diabetu 2. typu, stukovatenia pečene a srdcovocievnych ochorení. Nakoľko tvorba tepla je energeticky náročný proces, jeho aktivácia je považovaná za sľubný terapeutický prístup v liečbe obezity a metabolických ochorení. Tukové tkanivo produkuje teplo v procese známom ako netriašková termogenéza, ktorý je sprostredkovaný Odpájacím proteínom 1. Avšak myši ktorým chýba táto klasická termogénna dráha si dokážu udržať stabilnú telesnú teplotu ak sú na chlad adaptované postupne, čo poukazuje na existenciu doposiaľ neznámych, avšak účinných alternatívnych mechanizmov tvorby tepla. Na základe našich predbežných výsledkov a existujúcej literatúry navrhujeme existenciu substrátových cyklov v metabolizme sacharidov v hnedom tuku, ktoré prispievajú k udržaniu stabilnej telesnej teploty, a môžu mať terapeutický potenciál v liečbe obezity a metabolických ochorení. Preto špecifickým cieľom nášho projektu je: 1) identifikovať substrátové cykly prebiehajúce v hnedom tukovom tkanive, 2) odhaliť ich molekulárne mechanizmy a reguláciu, a 3) identifikovať terapeutické ciele s potenciálom regulovať ich aktivitu. Komplexné transkriptomické a metabolomické analýzy hnedého a bieleho tukového tkaniva pacientov, C57Bl/6 a Ucp1 KO myší za rôznych teplotných podmienok poskytnú dôležité poznatky o energetike tukového tkaniva a poslúžia ako základ pre identifikáciu substrátových cyklov. V navrhovanom výskume využijeme genetické modely myší, bunkové línie, farmakologické nástroje a najnovšie experimentálne postupy, najmä nukleárnu magnetickú rezonančnú spektroskopiu, metabolické sledovanie 13C-značených substrátov, sekvenovanie RNA novej generácie, infračervenú termografiu a bioenergetické merania na dokázanie existencie, odhalenie molekulárnych mechanizmov a potvrdenie fyziologického významu substrátových cyklov, ako aj na identifikáciu a validáciu nových terapeutických cieľov na liečbu obezity.

Organizácia nádorového a imunitného mikroprostredia v karcinóme obličkových buniek a význam nádorových organoidov v predikcii odpovede na liečbu

Orchestration of tumor and immune microenvironment in renal cell carcinoma and significance of tumor organoids in predicting therapy response

Doba trvania: 1.7.2024 - 30.6.2028
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Baráthová Monika PhD.
Anotácia:Nádory obličiek predstavujú jednu z najagresívnejších urologických malignít. Incidencia nádorov obličiek má stále zvyšujúcu tendenciu najmä v krajinách východnej Európy, pričom Slovensko patrí medzi krajiny s najvyššou incidenciou a mortalitou. Svetlobunkový renálny karcinóm (ccRCC), najčastejší podtyp asociovaný so zlou klinickou odpoveďou, je charakterizovaný ako veľmi vaskularizovaný a imunogénny typ nádoru. Metastázy sa objavia u viac ako štvrtiny pacientov a 5-ročné prežívanie je približne 10-15%. ccRCC sú charakteristické pseudohypoxiou vznikajúcou v dôsledku inaktivácie nádorového supresorového génu VHL vedúcou k aktivácii expresie hypoxiou indukovaných proteínov aj v normoxických podmienkach. Jedným z takýchto proteínov je aj karbonická anhydráza IX (CAIX), transmembránový metaloenzým asociovaný s adaptáciou nádorov na hypoxický stres a s reguláciou extracelulárneho pH. V projekte sa chceme zamerať na vzájomné vzťahy medzi cielenou terapiou a imunitným mikroprostredím prostredníctvom viacstupňovej analýzy biomarkerov, imunoprofilácie a signálnych dráh spojených s CAIX v RCC, na testovanie účinnosti nových humanizovaných protilátok špecifických voči CAIX, ako aj na ozrejmenie ich vplyvu na imunofenotyp RCC nádorov. V projekte by sme chceli využiť viaceré 3D kokultivačné modely, ktoré vernejšie napodobňujú nádorovú architektúru a mikroprostredie. Jedným z 3D modelov sú nádorové organoidy predstavujúce nový, moderný prístup v personalizovanej/precíznej medicíne s využitím nádorového tkaniva pacienta. Kokultivácia organoidov s autológnymi imunitnými bunkami by mohla priniesť nové zistenia o vplyve CAIX na imunofenotyp RCC. Predpokladáme, že humanizované protilátky by mohli predstavovať nový terapeutický prístup v liečbe pseudohypoxických ako aj hypoxických RCC. Zároveň by mohli významne zmeniť nádorové mikroprostredie a zvýšiť účinnosť imunoterapie alebo inhibítorov tyrozínkináz, ktoré sú súčasťou štandardnej terapie pacientov s RCC.

Overenie pozitívneho účinku podávania kombinácie fruktóza - metylcelulóza na metabolizmus potkanov.

Verification of positive effect of fructose - methyl cellulose treatment on rat metabolism.

Doba trvania: 1.1.2024 - 31.12.2026
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: Ing. Zorad Štefan CSc.
Anotácia:Prezentovaný projekt vychádza z predbežných výsledkov s použitím kombinácie fruktóza a metylcelulóza (frucel). Frucel prekvapujúco znižuje plazmatické koncentrácie kyseliny močovej, ukazovatele oxidačného poškodenia lipidov a proteínov, glykáciu proteínov a uvolňovanie hemoglobínu z erytrocytov. Naviac, frucel zvyšuje proteínovú expresiu ACE2 v obličke. Zavedieme podávanie metylcelulózy v pitnom roztoku fruktózy namiesto stresujúcej žalúdočnej sondy. Budeme skúmať vplyv podávania frucel na metabolické parametre ako sú: adipozita, veľkosť tukových buniek, glukózová tolerancia, glykácia proteínov, ukazovatele ROS, koncentrácie hormónov a expresia klúčových komponentov RAS. Experimenty budú vykonané na zdravých potkanoch Wistar ako aj na obéznych diabetických zvieratách kmeňa Zucker. Koncentrácia metylcelulózy sa vyselektuje na základe bunkových experimentov zameraných na antioxidačný účinok frucel. Veríme, že sa nám podarí overiť pozitívny efekt frucel na metabolizmus vrátane zvýšenia aktivity ACE2.

Oxid uhličitý v nádorovom metabolizme glukózy: prehliadaná Achillova päta rakoviny

Carbon dioxide in cancer glucose metabolism: an overlooked Achilles’ heel of cancer

Doba trvania: 1.7.2023 - 30.6.2027
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: PharmDr. Goliaš Tereza PhD.

Pochopenie úlohy alternatívneho zostrihu pri rezistencii na cisplatinu

Understandingthe role of alternative splicing in cisplatin resistance

Doba trvania: 1.9.2024 - 30.6.2026
Program: Plán obnovy EÚ
Zodpovedný riešiteľ: MVDr. Borszéková Pulzová Lucia PhD.
Anotácia:Cisplatina patrí medzi vysoko účinné širokospektrálne chemoterapeutiká. Získaná rezistencia je hlavnou príčinou zlyhania terapie u pôvodne citlivých nádorov semenníkov tvorených zárodočnými bunkami (TGCTs). Aberantný alternatívny zostrih (AZ) molekuly pre-mRNA je sprievodným javom pri vývoji nádorov, progresii, metastázovaní a pravdepodobne zohrávajú úlohu aj pri vzniku rezistencie. Napriek pokroku technológii RNA-sekvenovania, zostáva úloha AZ vo vývoji chemorezistencie naďalej nedostatočne preskúmaná. Cieľom projektu je identifikácia biomarkerov (varianty AZ), ktoré sú schopné predikovať citlivosť na cisplatinu u TGCTs a pochopiť úlohu AZ vo vývoji rezistencie. Pomocou sekvenovania transkriptómu a in silico analýzy dát budú definované AZ charakteristík rezistentného fenotypu a taktiež bude študovaný aj vplyv AZ na expresiu génov a proteínových izoforiem. Na stanovenie vplyvu AZ na prežívanie buniek po terapii, budú využité inhibítory zostrihu a gene silencing regulátorov zostrihu.

Potenciál fyzickej aktivity ovplyvniť proliferačnú kapacitu a charakteristiky nádorových buniek: identifikácia exerkínov a mechanizmov s protinádorovým účinkom

The potential of physical activity to influence the proliferative capacity and characteristics of tumor cells: identification of exerkines and mechanisms with antitumor effects

Doba trvania: 1.1.2023 - 31.12.2026
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Kurdiová Timea PhD.

Potenciál hypoxiou indukovanej karbonickej anhydrázy IX v diagnostike a terapii adenokarcinómov pľúc.

Significance of hypoxia induced carbonic anhydrase IX in diagnostics and therapy of lung adenocarcinoma

Doba trvania: 1.1.2023 - 31.12.2026
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Csáderová Lucia PhD.
Anotácia:Nádory pľúc sú celosvetovo hlavnou príčinou úmrtí súvisiacich s rakovinou. Napriek snahe o včasné odhalenie je väčšina pacientov s rakovinou pľúc stále diagnostikovaná v pokročilom štádiu. Nemalobunkový karcinóm pľúc (NSCLC) predstavuje asi 85% všetkých nádorov pľúc. Najčastejším typom NCSLC je adenokarcinóm pľúc. Nové možnosti cielenej terapie posunuli liečbu rakoviny pľúc na personalizovanejšiu úroveň aj vďaka novým molekulovým markerom. Hypoxiou regulovaná karbonická anhydráza IX by mohla predstavovať nielen vhodný diagnostický a prognostický biomarker, ale aj terapeutický cieľ. V projekte sa chceme zamerať na analýzy zmien expresie /funkcie CA IX v kokultivačných 3D modeloch adenokarcinómu pľúc, ako aj na sledovanie tkanivovej a solubilnej CA IX a markerov nádorového mikroprostredia v pacientskych vzorkách pľúcneho adenokarcinómu a v tekutých biopsiách – v krvi a malígnych pleurálnych výpotkoch s cieľom získania dôležitých informácií o prognostickom a diagnostickom význame CAIX pri tomto ochorení.

Povrchová modifikácia 3D tlačených titánových spinálnych implantátov pre zlepšenie funkčných vlastností

Surface modification of 3D printed titanium spinal implants to improve functional properties

Doba trvania: 1.1.2024 - 31.12.2026
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Jelenská Lenka

Preprogramovanie mikroprostredia duktálneho adenokarcinómu pankreasu voči imunoterapii

Reprogramming pancreatic ductal adenocarcinoma microenvironment towards immunotherapy

Doba trvania: 1.7.2022 - 30.6.2026
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Smolková Božena PhD.
Anotácia:Duktálny adenokarcinóm pankreasu (PDAC) je smrteľné ochorenie s 5-ročným prežívaním nižším ako 10%. Hoci inhibítory imunitných kontrolných bodov spôsobili revolúciu v liečbe nádorových ochorení, pacientom s PDAC zlepšenie prežívania nepriniesli. Nedostatočná odpoveď na imunoterapiu spočíva hlavne v nízkej imunogenicite a nezápalovej povahe PDAC. Tieto skutočnosti vedú ku kľúčovej klinickej otázke: Akým spôsobom zmeniť t ieto “imuno-rezistentné“ nádory na “imuno-senzitívne“? Nedávne štúdie ukázali, že imunosupresívne nádorové mikroprostredie môže byť riadené epigenetickými regulátormi, prostredníctvom inhibície kľúčových komponentov antigén-prezentujúceho mechanizmu, cytok ínov alebo chemokínov. Z tohto dôvodu sa preprogramovani e epigenetických mechanizmov javí ako jedna z nádejných stratégií k naštartovaniu imunogenicity nádorových buniek. Predpokladáme, že cielená terapia, zameraná na jednotlivé bunkové subpopulácie prítom né v nádorovom mikroprostredí, ktoré bude možné odlíšiť na základe pre ne charakteristickej expresie markerov a špecifických medzibunkových interakcií, povedie k lepšej odpovedi PDAC na imunoterapiu. Cieľom projektu HeaTME je prispieť k pochopeniu komplexity a heterogenity nádorového mikroprostredia a jeho kľúčových zložiek, zodpovedných za rezistenciu PDAC voči imunoterapii. Veríme, že pomocou pokročilých predklinických modelov bude možné identifikovať a charakterizovať nové terapeutické ciele, zapojené do modulácie dynamicky sa meniaceho nádorového mikroprostredia. Využitie inovatívnych prístupov, medzi ktoré patrí aj priestorová transkriptomika, nám umožní navrhnúť a otestovať účinnú epigenetickú liečbu, ktorá by mohla aspoň u časti pacientov viesť k preprogramovaniu PDAC z imuno-rezistentného na imuno-senzitívny nádor.

Príprava nových biologicky aktívnych látok u streptomycét genetickými zásahmi do genómu a metódami syntetickej biológie

Preparation of new biologically active substances in streptomycetes by genetic interventions in the genome and methods of synthetic biology

Doba trvania: 1.9.2025 - 31.8.2029
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Cholujová Dana PhD.

Prognostické biomarkery neuro-nádorového mikroprostredia asociované s cirkulujúcimi nádorovými bunkami vo včasných nádoroch prsníka

Prognostic biomarkers of neuro-tumor microenvironment associated with the circulating tumor cells in early breast cancer

Doba trvania: 1.9.2025 - 31.8.2029
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Buociková Verona PhD.
Anotácia:Cirkulujúce nádorové bunky (CTC) sa objavujú v periférnej krvi (PB) pacientiek s nádorom prsníka (BRCA) už v ranom štádiu ich ochorenia. Epitelovo-mezenchymálny prechod (EMT) nádorových buniek predchádza ich intravazácii do krvného obehu. Prítomnosť CTC s fenotypom EMT (CTC_EMT) v PB a neurálnej infiltrácie v nádore v čase diagnózy je spojená so zlou prognózou pri BRCA. Mechanistické prepojenie medzi týmito biologickými javmi, ktoré sa súčasne vyskytujú veľmi skoro v tumorigenéze, zostáva nedostatočne preskúmané. Stratifikácia BRCA pacientiek podľa prítomnosti CTC_EMT umožnila identifikovať deregulované gény a signálne dráhy vo včasnom karcinóme prsníka, ktoré sú spojené s prognózou ochorenia. V projekte sa zameriame na funkčnú validáciu génov, ktoré sú deregulované v tkanive nádoru pacientiek s detegovanými CTC_EMT, ako sú SLC7A5, NUPR1, SEC61G, CHGA, KRT14 alebo gény hemidesmozómovej dráhy typu 1. Navyše viaceré neuroendokrinné markery (napr. DYT5b, RAMP1, ADRB1) sú v BRCA významne deregulované, a tiež spojené s prognózou ochorenia. Chceme preskúmať súvislosť medzi CTC_EMT v PB a markermi perineurálnej inervácie PNI v nádoroch. Skombinujeme bioinformatickú analýzu génovej expresie v našej kohorte pacientov s cieleným vyhľadávaním vo verejne dostupných databázach, aby sme identifikovali nové biomarkery na základe asociácie s CTC_EMT. Histopatologická analýza asistovaná AI sa použije na vyhodnotenie imunohistochemického farbenia nádorových tkanív. Validačné a mechanistické štúdie budeme robiť na bunkových modeloch BRCA in vitro, v mikrofluidnej kultivácii na modelovanie intravazácie CTC, mikrofluidných (ko)kultúrach s neurálnymi bunkami a v predklinických štúdiách na potvrdenie terapeutického potenciálu identifikovaných cieľov v BRCA. Tento projekt je pokračovaním dlhodobého zamerania sa na úlohu CTC v BRCA, a validácia vybraných markerov umožní ďalšie spresnenie v súčasnosti používaných metód stanovania génovej expresie vo včasnom štádiu rakoviny prsníka.

Protektívna a protirakovinová úloha tymolu a jeho derivátov na rakovinu hrubého čreva s použitím modelu choriovej alantoickej membrány

The protective and anti-cancer role of thymol and its derivatives in colon cancer cell lines using the Japanese quial chorioallantoic membrane model

Doba trvania: 1.8.2024 - 30.6.2026
Program: Plán obnovy EÚ
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Sedlačková Eva PhD.

Proti-nádorový a protizápalový účinok kurkumínu u onkologických pacientov

Anti - tumour and anti - inflammatory properties of curcumin in cancer patients

Doba trvania: 1.8.2024 - 30.6.2026
Program: Plán obnovy EÚ
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Durdík Matúš PhD.
Anotácia:Vážne vedľajšie účinky rádioterapie (RT) sú manifestované u približne 5% pacientov. Avšak doteraz nie je dostupný žiadny biomarker na diagnózu pacientov u ktorých sa prejavia vedľajšie účinky RT spôsobené zvýšenou úrovňou zápalových procesov indukovaných RT. Plánujeme zaviesť analýzu expresie génu EDA2R ako citlivého biomarkeru ožiarenia nízkymi dávkami ionizujúceho žiarenia a individuálnej rádiosenzitivity. Kurkumín, chemikália prítomná v rastline Curcuma longa, znižuje aktivitu procesov, ktoré hrajú dôležitú úlohu v kontrole zápalových procesov a tým môže zmierniť vedľajšie účinky indukované RT. Kurkumín môže mať tiež proti nádorové účinky, ktoré môžu byť nápomocné v liečbe nádorov. Kurkumín budeme podávať pacientom počas trvania RT a následne hodnotiť výskyt kožných reakcií pomocou RTOG kritérií. Naviac budeme študovať proti nádorový účinok kurkumínu pomocou in vitro experimentov na bunkových líniách.

Rastlinné endornavírusy: parazity alebo symbionty poľnohospodárskych plodín?

Plant endornaviruses: parasites or symbionts of agricultural crops?

Doba trvania: 1.1.2024 - 31.12.2027
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: doc. Ing. Glasa Miroslav DrSc.
Anotácia:Rastlinné endornavírusy (čeľaď Endornaviridae) sú jednovláknové RNA vírusy, ktoré perzistentne infikujú poľnohospodárske plodiny. Endornavírusy sú prenosné výlučne vertikálne prostredníctvom semien, vďaka čomu majú evolučne dlhodobé vzťahy so svojimi hostiteľmi. Infekcia endornavírusmi môže mať dokonca priaznivé účinky na svojich rastlinných hostiteľov, tieto vzťahy však boli doteraz len veľmi málo preskúmané. Napriek vzrastajúcim poznatkom o komplexnosti rastlinného virómu dosiahnutých vďaka aplikácii masívneho paralelného sekvenovania sú fakty o perzistentných vírusoch, ich diverzite, prirodzenom hostiteľskom okruhu a interakciách s plodinami doteraz veľmi málo objasnené. Cieľom projektu je získať originálne poznatky o distribúcii endornavírusov v rôznych poľnohospodárskych plodinách, zhodnotiť ich molekulárnu variabilitu a vyvinúť spoľahlivé a špecifické nástroje na ich detekciu. Na vybraných hostiteľoch budeme zároveň sledovať vplyv endornavírusovej infekcie na ich fenotypové a rastové charakteristiky.

Reakcia vybraných populácií buniek CNS na poranenie periférneho nervu a ich možná úloha pri regenerácii

The response of selected populations of CNS cells to peripheral nerve injury and their possible role in regeneration.

Doba trvania: 1.1.2024 - 31.12.2026
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Blaško Juraj PhD.
Anotácia:Centrálny a periférny nervový systém tvoria jeden funkčný celok, čo sa prejavuje aj za patologických podmienok. Pri poškodení periférneho nervu dochádza k aktivácii gliových populácii – astrocytov a mikroglie v mieche, čo pravdepodobne predstavuje dôležitý faktor v následnom regeneračnom procese. V našom projekte máme za cieľ zmapovať priestorovú a časovú dynamiku aktivácie gliových a imunitných buniek v mieche a dorzálnych gangliách po poranení nervu. Tieto procesy budú sledované v in vivo a in vitro podmienkach. V ďalšej fáze sa chceme venovať vplyvu prekondicionovania, teda aktivácii gliovej populácie v mieche po poranení periférneho nervu, na regeneráciu segmentálne príbuzného nervu.Veríme, že našim projektom tak prinesieme nové poznatky o vzájomných vzťahoch periférneho a centrálneho nervového systému po traumatickom poranení.

Regulácia hypoxickej signalizácie v karcinóme obličiek s dôrazom na úlohu karbonickej anhydrázy IX v nádorovom mikroprostredí

Regulation of hypoxic signalling in renal carcinoma with focus on the role of carbonic anhydrase IX in the tumor microenvironment

Doba trvania: 1.1.2024 - 31.12.2027
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Baráthová Monika PhD.
Anotácia:Karcinóm obličiek predstavuje závažnú urologickú malignitu. Pre vysokú incidenciu a mortalitu je závažným medicínskym problémom aj na Slovensku. Svetlobunkový podtyp renálneho karcinómu (ccRCC) je charakteristický mutáciou proteínu von Hippel Lindau a vysokou expresiou CAIX. CAIX je nielen relevantný biomarker ccRCC, ale aj vhodný terapeutický cieľ. V projekte sa chceme zamerať na testovanie efektov inhibície dvoch dôležitých proteínov RCC - CAIX a HIF2. CAIX je cieľovým proteínom HIF1 v odpovedi na akútnu hypoxiu, HIF2 zohráva dôležitú úlohu pri chronickej hypoxii. RCC patrí medzi vysoko imunogénne nádory. Zameriame sa na sledovanie vplyvu inhibície CAIX pomocou špecifických protilátok a HIF2 použitím inhibítora Belzutifan na základné bunkové parametre ako aj na proteíny kontrolných bodov imunitnej odpovede. Využijeme pritom 3D modely ako aj nádorové organoidy pripravené z tkaniva RCC, ktoré svojou štruktúrou a architektúrou predstavujú vhodný experimentálny nástroj na reprodukciu nádoru in vitro.

Regulácia prenosu Rickettsia a Coxiella prostredníctvom hematofágnych článkonožcov

Regulation of Rickettsia and Coxiella transmission via hematophagous arthropods

Doba trvania: 1.8.2024 - 30.6.2026
Program: Plán obnovy EÚ
Zodpovedný riešiteľ: Ing. Škultéty Ľudovít DrSc.

Regulácia transportu železa ako faktor prispievajúci k chemorezistencii testikulárnych nádorov

Regulation of iron transport as a factor contributing to the chemoresistance of testicular tumours

Doba trvania: 1.1.2024 - 31.12.2027
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Roška Jan PhD.
Anotácia:Testikulárne nádory zo zárodočných buniek (TGCTs) postihujú prednostne mladých mužov a sú veľmi dobre liečiteľné liečbou na báze cisplatiny (CDDP). Vynikajúce výsledky liečby vykazujú dokonca aj pokročilé metastatické štádiá. Približne 10 % pacientov však neodpovedá adekvátne na túto liečbu, resp. si vyvinie si voči nej rezistenciu. Poznáme viacero mechanizmov, ktoré prispievajú k vzniku rezistencie voči CDDP, vrátane alterácií jej transportu, zvýšenej detoxikácie liečiva a opravy poškodenia DNA, či zmien v transdukcii bunkovej smrti. Feroptóza predstavuje osobitný typ regulovanej bunkovej smrti, odlíšiteľný na morfologickej, metabolickej a genetickej úrovni. Proces feroptózy je závislý od železa a prítomnosti reaktívnych foriem kyslíka (ROS). Cieľom nášho projektu je preskúmať zapojenie feroportínu (SLC40A1) v procese vzniku rezistencie voči CDDP. Zároveň plánujeme preskúmať aj jeho epigenetickú reguláciu prostredníctvom mikro RNA v bunkových líniách TGCT s prirodzenou a získanou rezistenciou voči CDDP.

Regulačné mechanizmy vzájomnej komunikácie medzi hypoxiou-ischémiou a zápalom v akútnej a subakútnej fáze po traumatickom poranení miechy a liečbe Siponimodom

Regulatory mechanisms of mutual communication between hypoxia-ischemia and inflammation during the acute and subacute phase of traumatic spinal cord injury and Siponimod treatment

Doba trvania: 1.1.2024 - 31.12.2027
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Kisucká Alexandra PhD.
Anotácia:Cieľom projektu je zistiť, či v akútnej fáze poranenia miechy dochádza súčasne k proliferácii mikroglie a aktivácii hypoxiou indukovanej dráhy transkripčného faktora 1 (HIF-1), a ako prebieha ich vzájomná komunikácia. Keďže HIF-1 je hlavným mediátorom homeostázy v nervovom tkanive vystavenom hypoxii, následne plánujeme študovať aktiváciu HIF-1 a PI3K/Akt v dysregulovanom mikroprostredí (zápalové milieu) v mieste lézie a v okolitom tkanive (kraniálne a kaudálne) počas subakútnej fázy poranenia miechy. Okrem toho bude preskúmaná liečba protizápalovým liekom Siponimodom, zistí sa jeho vplyv na aktiváciu špecifických signálnych dráh a na reguláciu mechanizmov vedúcich k polarizácii prozápalových (M1/A1) a neuroprotektívnych (M2/A2) subtypov mikroglie/makrofágov a astrocytov. Predpokladáme, že liečebné stratégie, ktoré inhibujú M1/A1 fenotypy a podporujú ich polarizáciu na M2/A2 fenotypy, môžu inhibovať sekundárne procesy poranenia miechy a napomôcť jej regenerácii.

Rekombinantné varianty vírusu Kliešťovej Encefalitídy ako nástroj pre štúdium VIrulencie a úloha Neuroendokrinného systému kliešťa v prenose vírusu kliešťovej encefalitídy

Recombinant tick-borne encephalitis virus variants as a tool for studying virulence and the role of the tick neuroendocrine system in tick-borne encephalitis virus transmission

Doba trvania: 1.9.2024 - 30.6.2026
Program: Plán obnovy EÚ
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Koči Juraj PhD.

Revolučná diagnostika rakoviny: Využitie miRNA senzorov na báze aptamérov na rýchlu a priamu detekciu.

Revolutionizing Cancer Diagnostics: Utilizing Aptamer-based miRNA Sensors for Fast and Direct Detection

Doba trvania: 1.9.2025 - 31.8.2029
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Bábelová Andrea PhD.
Anotácia:Projekt APTAmiR sa zameriava na vývoj a validáciu biosenzorov na báze aptamérov na detekciu mikroRNA a exozómov vo vzorkách krvi. Hlavným cieľom je zlepšiť včasnú diagnostiku rakoviny. Biosenzory budú vyvinuté s použitím špecifických oligonukleotidov - aptamérov, ktoré ponúkajú kľúčové výhody, ako je vysoká selektivita, silná väzbová afinita a stabilita. Projekt sa bude riadiť štruktúrovaným prístupom vrátane návrhu a výberu aptamérov, optimalizácie funkčnosti biosenzorov a testovania biosenzorov so vzorkami pochádzajúcimi od pacientov. Aptaméry budú prichytené na zlatý povrch elektrochemického a QCM senzora alebo na modifikované nanočastice. Účinnosť biosenzorov sa bude merať z hľadiska citlivosti, špecificity, selektivity a reprodukovateľnosti. Limity detekcie a lineárne rozsahy biosenzorov sa porovnajú s konvenčnými diagnostickými technikami. Úspešná implementácia týchto biosenzorov má potenciál pokročiť vo včasnom zisťovaní chorôb, podporiť klinickú diagnostiku a zlepšiť terapeutické rozhodovanie.

Sekretóm krvných elementov v úlohe zdroja bioaktívnych faktorov sprostredkujúcich neuroprotekciu

Blood elements-derived secretome as a source of bioactive factors mediating the neuroprotection

Doba trvania: 1.7.2022 - 30.6.2026
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Bonová Petra PhD.
Anotácia:Cievne mozgové príhody (CMP), vrátane tých ischemických, sú celosvetovo druhou najčastejšou príčinou úmrtia a dlhodobej invalidity. Pri ischemických stavoch sú možnosti liečby limitované na jedinú, časovo obmedzenú, medikamentóznu intervenciu (tPA), ktorej rizikom je možná hemoragická transformácia. V nasledujúcom desaťročí je predpokladaný progresívny nárast počtu prípadov CMP, a to až o jednu tretinu. V súvislosti s pandémiou koronavírusu SARS-CoV-2 môže byť toto číslo ešte vyššie. Potreba ďalších podporných a regeneratívnych terapií sa tak stáva ešte aktuálnejšou. V klinickej praxi sa na zmiernenie dopadov CMP stále častejšie využíva metóda vzdialeného kondicionovania (RIC). Podstatou RIC je endogénna stimulácia mechanizmov vedúcich k neuroprotekcii a to ischémiou vzdialeného orgánu či končatiny. Aj napriek mnohým benefitom, závažným limitujúcim faktorom tejto terapie je načasovanie, dávka, ale aj faktory ako vek, pohlavie a metabolické disfunkcie pacienta. Účinným nástrojom regeneratívnej medicíny sa javí byť aj bunková terapia. Kvôli otázkam bezpečnosti sa však liečbe CMP venuje menej ako 1% z klinických štúdií. Pozitívne účinky transplantácie sú, okrem buniek štepu, pripisované hlavne mikroprostrediu, ktoré bunky vytvárajú sekréciou. Využitím sekretómu je tak eliminované riziko spojené s transplantáciou živých a potenciálne pluripotentných buniek. Ďalším benefitom v otázkach bezpečnosti bunkovej terapie je fakt, že parakrinná aktivita je zdokumentovaná aj u väčšiny diferencovaných typov buniek, vrátane buniek krvnej cirkulácie. Náš experimentálny prístup predstavuje kombináciu oboch hore uvedených stratégií- využíva parakrinnú aktivitu krvných elementov, ktoré boli endogénne stimulované RIC. Výsledkom je derivácia sekretómu, ktorý na modeli ischémie mozgu disponuje významným neuroprotektívnym efektom. Ďalším nevyhnutným krokom pre priblíženie tejto atraktívnej stratégie potrebám klinickej praxe je charakterizácia sekretómu a jeho bioaktívnych vlastností.

Skúmanie povrchu a obsahu pečeňových extracelulárnych vezikúl na identifikáciu cirkulujúceho biomarkera NAFLD

Uncovering the surfaceome and cargo of hepatic extracellular vesicles to identify circulating NAFLD biomarker

Doba trvania: 1.7.2023 - 30.6.2027
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Balážová Lucia PhD.

Sledovanie vzájomných interakcií kliešť - vírus kliešťovej encefalitídy - hostiteľ v koži

The study of mutual interactions of tick - tick-borne encephalitis virus - host in the skin

Doba trvania: 1.1.2025 - 31.12.2028
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Bartíková Pavlína PhD.
Anotácia:Koža predstavuje prvú obrannú líniu voči rôznym vonkajším atakom. Je však aj hlavnou vstupnou bránou pre patogény prenášané článkonožcami vrátane vírusov prenášaných kliešťami (TBV). Miesto v koži, kde kliešť cicia, je kľúčovým rozhraním vzájomných interakcií medzi kliešťom, TBV a hostiteľom. Toto miesto je prispôsobené na dlhodobý príjem krvi biologicky aktívnymi molekulami v slinách kliešťov a pre TBV, vstupujúce do tohto miesta spolu so slinami, je to priaznivé prostredie pre replikáciu a disemináciu v hostiteľovi. Koža ako miesto prvého kontaktu by si preto zaslúžila oveľa viac pozornosti. Vedomostí o vzájomných interakciách kliešť-vírus-hostiteľ v koži je veľmi málo. Použitie ľudských kožných explantátov ako tkanivového systému na štúdium týchto interakcií môže vyplniť medzery v poznatkoch a pomôcť identifikovať mechanizmy kožnej imunity a zapojené kľúčové molekuly hostiteľa a parazitov. Objasnenie týchto procesov môže viesť k vývoju nových stratégií na kontrolu chorôb prenášaných kliešťami.

Stanovenie genotoxicity indukovanej 5G žiarením a štúdium fytochemikálií ako modulátorov radiáciou indukovaného poškodenia DNA a rakoviny

Evaluation of 5G radiation induced genotoxicity and assessment of phytochemicals as modulator of radiation induced DNA damage and cancer

Doba trvania: 1.1.2023 - 31.12.2026
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: Gulati Sachin PhD.
Anotácia:Štúdie zaoberajúce sa expozíciou k  rádiofrekvenčnému žiareniu (RFR) z mobilnej komunikácie a následnej indukcie reaktívnych foriem kyslíka, poškodenia DNA a rakoviny ponúkajú kontroverzné výsledky. Tieto dáta však nie sú priamo porovnateľné, pretože sa uskutočnili pri rôznych parametroch expozície, ktoré sa ukázali ako kritické pre vznik účinkov RF. Navrhujeme vyhodnotenie genotoxických účinkov RFR používaných v signáloch 5G. Genotoxicita a oxidačný stres sa vyhodnotia vhodnou kombináciou sledovaných parametrov. Dlhodobá expozícia signálom 5G pri indukcii malígnej transformácie buniek sa vyhodnotí pomocou myší SCID. Fytochemikálie  ako extrakt z rastliny Gingko biloba a kurkumín budú hodnotené v kombinácii so signálmi 5G a vysokými dávkami gama-žiarenia používanými v rádioterapii, s cieľom overiť ich rádioprotektívny vplyv na poškodenie DNA, oxidačný stres a vznik malignít.

Stanovenie poškodenia DNA a genetickej nestability v bunkách rádiológov vystavených nízkym dávkam ionizujúceho žiarenia

Assessment of DNA damage and genetic instability in hospital workers occupationally exposed to low doses of ionizing radiation

Doba trvania: 1.1.2023 - 31.12.2026
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Košík Pavol PhD.
Anotácia:Vysoké dávky ionizujúceho žiarenia (IR) indukujú poškodenie DNA a genetickú nestabilitu súvisiace s rôznymi typmi nádorov. Avšak, dôsledky opakovanej a dlhotrvajúcej expozície ľudí nízkymi dávkami IR, ktoré sú typické pre diagnostické lekárske prostredie, nie sú dostatočne preskúmané. Naše predbežné výsledky naznačujú zvýšené poškodenie DNA a genetickú nestabilitu u slovenských rádiológov. Cieľom projektu je potvrdenie týchto predbežných výsledkov u rozšírenej skupiny rádiológov (medicínskych pracovníkov) použitím komplexného panelu najmodernejších techník, ktoré by nahradili klinicky relevantné ochranné opatrenia. Použijeme „gold standard“ cytogenetické metódy obohatené o Metafer fluorescenčnú mikroskopiu a FISH. Získané výsledky budeme korelovať s kumulatívnou dávkou IR a klinickými údajmi rádiologických pracovníkov vrátane prekonania COVID-19 a očkovania. Odhadneme riziko rakoviny u rádiológov. Budeme skúmať perzistenciu a genetickú nestabilitu po prekonaní COVID-19 pomocou FISH.

Subpopulácie imunitných buniek a apoptóza v odpovedi na infekciu vírusom chrípky A

The immune cell subsets and apoptosis in response to influenza A virus

Doba trvania: 1.1.2024 - 31.12.2027
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: doc. RNDr. Betáková Tatiana DrSc.
Anotácia:Vírusy chrípky A spôsobujú sezónne epidémie, ktoré majú signifikantný vplyv na globálne zdravie. Každoročne sa u 3-5 miliónov ľudí vyvinie závažné respiračné ochorenie a 290,000-650,000 ľudí infekciu neprežije. Imunitné bunky ako T bunky, makrofágy, neutrofily a pod. majú oveľa významnejšiu úlohu v patogenéze vírusovej infekcie ako sa doteraz myslelo. Povrchové receptory a Fas-FasL signalizácia môžu ovplyvňovať vývoj a funkciu imunitných buniek a produkciu rôznych cytokínov. Úloha proteínu NS1 v regulácii imunitnej odpovedi nie je zatiaľ úplne objasnená. Cieľom predkladaného projektu je: a) študovať vývoj subpopulácií imunitných buniek v primárnom (pľúcach) a sekundárnom (iné orgány) mieste infekcie; b) zistiť úlohu apoptózy imunitných buniek a c) objasniť úlohu proteínu NS1 vo vývoji subpopulácií imunitných buniek a v spustení apoptózy v týchto bunkách po letálnej infekcii vírusom chrípky.

Systémová verejná výskumná infraštruktúra – biobanka pre nádorové a zriedkavé ochorenia, II. fáza

Systemic public research infrastructure in the field of biobanking, II. phase

Doba trvania: 1.7.2023 - 30.6.2026
Program: Štrukturálne fondy EÚ Výskum a inovácie
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Gašperíková Daniela DrSc.

Špecifikácia štandardných protokolov pre prípravu a kontrolu kvality sekretómu stimulovaných krvných buniek ako perspektívneho biologického liečiva indukujúceho neuroprotekciu

Definition of standardized protocols for preparation and quality control of stimulated blood cells-derived secretome, a perspective biopharmaceutical inducing neuroprotection

Doba trvania: 1.1.2025 - 31.12.2027
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Bonová Petra PhD.
Anotácia:Aplikácia sekretómu krvných buniek získaného po stimulácii vzdialeným kondicionovaním (RIC) sa v predklinických štúdiách ukázala ako efektívny spôsob prenosu ischemickej tolerancie zo zvieraťa na zviera. Sekretóm aplikovaný v injekčnej forme úspešne iniciuje neuroprotekciu po ischémii mozgu, a to aj u jedincov s nízkou účinnosťou RIC akými sú obézne potkany. Napriek svojmu terapeutickému potenciálu je implementácia tejto stratégie do kliniky podmienená štandardizáciou výrobných postupov pre sekretóm za podmienok správnej výrobnej praxe (SVP) a toxikologickým testovaním. Predmetom projektu je definovanie procesov prípravy a testov sekretómu na modelovom organizme potkana. Sekretóm pripravený v podmienkach SVP otestujeme: 1) in vitro za účelom definovania skladovacích podmienok, vymedzenia vhodných testov účinnosti a špecifikácie markerov tolerantného sekretómu; 2) in vivo pre zhodnotenie neuroprotektívneho účinku na potkaňom modeli ischémie mozgu a testov akútnej a chronickej toxicity jeho aplikácie.

Štipendiá pre excelentných PhD. študentov a študentky (R1) - Mechanizmy spájajúce CAIX-súvisiace hypoxické nádorové mikroprostredie a obezitu s progresiou rakoviny pankreasu vo vzťahu k imunitnej odpovedi

Fellowships for excellent PhD students (R1) - Mechanisms linking CAIX-associated hypoxic tumor microenvironment and obesity to pancreatic cancer progression in relation to immune response

Doba trvania: 1.1.2024 - 31.12.2027
Program: Plán obnovy EÚ
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Ščasná Katarína

Štipendiá pre excelentných PhD. študentov a študentky (R1) - Úloha laktátu v kontrole energetického metabolizmu

Fellowships for excellent PhD students (R1) - Role of lactate in the control of energy metabolism

Doba trvania: 1.1.2024 - 31.12.2027
Program: Plán obnovy EÚ
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Jančovičová Alžbeta

Štipendiá pre excelentných PhD. študentov a študentky (R1) - Zhodnotenie imunitných kontrolných bodov v B-bunkových malignitách

Fellowships for excellent PhD students (R1) - Evaluation of immune checkpoints in B-cell malignancies

Doba trvania: 1.1.2024 - 31.12.2027
Program: Plán obnovy EÚ
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Suroviaková Katarína

Štúdia efektorových proteínov v patogenite a ich využitie v diagnostike Rickettsióz

Study of effector proteins in pathogenicity and their use in the diagnosis of Rickettsiosis

Doba trvania: 1.1.2024 - 31.12.2027
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Quevedo Diaz Marco PhD.
Anotácia:Rickettsia je rod nepohyblivých, gram-negatívnych, nespórovitých, vysoko pleomorfných baktérií, ktoré spôsobujú závažné epidemické ricketsiózy. Skupina škvrnitej horúčky, prechodná skupina a skupina týfusu sú členmi rodu Rickettsia. Patogénne druhy Rickettsiae si vyvinuli mechanizmy na zabránenie intracelulárnej detekcii a eliminácii patogénov v hostiteľských bunkách. Počas infekcie vstupuje do hostiteľskej bunky podskupina faktorov bakteriálnej virulencie, „efektorové proteíny“, kde fungujú tak, že modulujú procesy hostiteľskej bunky a následne vedú k bakteriálnej patogenéze. Bakteriálne efektorové proteíny sú translokované do hostiteľskej bunky pomocou špecializovaných sekrečných systémov. Cieľom tohto návrhu je identifikácia a charakterizácia efektorových proteínov vybraných patogénnych rickettsií v infikovaných makrofágoch a ich využitie pri diagnostike rickettsióz.

Štúdium biologických markerov a kurkumínu na diagnostiku a liečbu glioblastómu

Study of biological markers and curcumin for diagnosis and treatment of glioblastoma

Doba trvania: 1.9.2024 - 31.8.2026
Program: Plán obnovy EÚ
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Košík Pavol PhD.
Anotácia:Glioblastóm je najagresívnejšia forma mozgového nádoru pochádzajúca z gliových buniek s maximálnou dĺžkou života 15 mesiacov. Napriek zavedeniu viacerých sľubných terapeutických modalít je klinický výsledok pacientov s glioblastómom bezútešný. Preto identifikácia a validácia alternatívnych a doplnkových diagnostických techník predstavuje naliehavú a nesplnenú klinickú potrebu. Kvapalná biopsia sa v poslednej dobe považuje za neinvazívny alternatívny postup pre biopsiu tkaniva. Na tento účel plánujeme študovať odlišnú expresiu kandidátnych miRNA v plazme periférnej krvi pred, počas a po skončení rádioterapii a/alebo chemoterapie. Zároveň analyzujeme frekvenciu chromozomálnych aberácií a mikrojadier v lymfocytoch periférnej krvi. Kurkumín ako výživový doplnok podáme pacientom s glioblastómom po ukončení liečby a pomocou špecifických kognitívnych testov vyhodnotíme zlepšenie ich kognitívnych funkcií.

Štúdium diverzity a interakcií mikrobiómu kliešťov Ixodes ricinus s vírusom kliešťovej encefalitídy

Study of diversity and interactions of Ixodes ricinus tick microbiome with the tick-borne encephalitis virus

Doba trvania: 1.1.2023 - 31.12.2026
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Koči Juraj PhD.
Anotácia:Štruktúra mikrobiálnych spoločenstiev v organizmoch je častokrát formovaná interakciami medzi jednotlivými mikroorganizmami. Mikrobióm kliešťa Ixodes ricinus, jedného z najdôležitejších vektorov pôvodcov závažných chorôb v Európe, vo významnej miere ovplyvňuje kolonizáciu a prežívanie niektorých klinicky významných baktérií. Avšak informácie o úlohe celkového mikrobiómu kliešťa Ixodes ricinus pri prenose vírusov stále chýbajú. Cieľom tohto projektu bude (i) určiť spektrum mikrobiálnych druhov v kliešťoch infikovaných vírusom kliešťovej encefalitídy (TBEV) (ii) charakterizovať interakcie medzi TBEV a vybranými mikroorganizmani v experimentálne koinfikovaných kliešťoch a (iii) objasniť úlohu imunitných dráh v kliešťoch infikovaných TBEV. Cenné výsledky získané prostredníctvom inovatívneho prístupu prispejú k pochopeniu komplexných vzťahov medzi mikrobiálnym spoločenstvom, imunitou a vírusom, ktoré určujú vektorovú kompetenciu kliešťov.

Štúdium genotoxických zmien indukovaných magnetickou rezonanciou v ľudských lymfocytoch

Study of genotoxic  effects from magnetic resonance imaging in human lymphocytes

Doba trvania: 1.1.2023 - 31.12.2026
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Zastko Lucián PhD.
Anotácia:Magnetická rezonancia (MR) je v dnešnej dobe považovaná za integrálny neinvazívny diagnostický zobrazovací nástroj. Statické a časovo premenlivé gradientové magnetické pole v kombinácii s rádiofrekvenčným poľom umožňuje MR vynikajúci kontrast tkanív. Nedávne štúdie o potenciálnych genotoxických účinkoch, indukovaných rutinným 1.5 T MR skenovaním srdca v lymfocytoch, vyvolali bezpečnostné obavy. Genomická nestabilita indukovaná MR skenovaním však bola doteraz skúmaná len niekoľkými metódami a otázny je aj vzťah zisteného k reálnej situácii, keď sú bunky exponované v ľudskom tele. Cieľom našej štúdie je zistiť, či je štandardná 1.5 T MR schopná indukovať genotoxicitu – pomocou gama H2AX/53BP1 DNA opravných fokusov, kométového testu, analýzy mikrojadier, chromozomálnych aberácií, apoptózy a ROS indukcie v ľudských lymfocytoch in vitro, umiestnených v tkanivovom ekvivalentom fantóme ľudského tela. Identifikácia genotoxických účinkov MR môže viesť k možnosti do určitej miery upraviť jej diagnostické využitie.

Štúdium inverzného vzťahu medzi karbonickými anhydrázami CA IX a CA IV a jeho významu pre nádorový fenotyp

Study of inverse relationship between carbonic anhydrases CA IX and CA IV and its significance for tumor phenotype

Doba trvania: 1.1.2024 - 31.12.2027
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Takáčová Martina PhD.
Anotácia:Karbonické anhydrázy (CA) sú základnými zložkami fyziologických procesov spojených s acidobázickou rovnováhou a transportom iónov v zdravých aj nádorových tkanivách. Niektoré izoformy CA (napr. CA IV) sú v nádorových tkanivách znížené v porovnaní s ich zdravými náprotivkami, zatiaľ čo hladiny iných izoforiem, napr. CA IX, sú zvýšené v rôznych typoch nádorov primárne v dôsledku hypoxie. Kým CA IV je dôležitá pri regulácii pH a absorpcii bikarbonátu v obličkách a hrubom čreve, tak CA IX hrá kľúčovú úlohu pri adaptácii nádorových buniek na hypoxiu a acidózu a prostredníctvom ovplyvnenia migrácie, invázie a tvorby metastáz prispieva k progresii nádorov. Prostredníctvom in silico analýzy sme odhalili inverznú expresiu medzi CA IV a CA IX, ktorej regulácia a význam zostávajú nejasné. V tomto projekte sa zameriame na odhalenie molekulárnych mechanizmov zodpovedných za inverzný vzťah medzi CA IX a CA IV a objasnenie jeho významu pre nádorový fenotyp. Okrem toho budeme analyzovať klinický význam spomínanej zámeny.

Štúdium medziorgánových substrátových cyklov sprostredkovaných laktátom a glycerolom pri chlade

Study of interorgan substrate cycles mediated by lactate and glycerol in cold

Doba trvania: 1.2.2025 - 30.6.2026
Program: Plán obnovy EÚ
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Baláž Miroslav PhD.

Štúdium modulácie črevného mikrobiómu podávaním butyrátu u hematoonkologických pacientov podstupujúcich transplantáciu krvotvorných kmeňových buniek alebo CAR T - bunkovú terapiu.

Study of Gut Microbiome Modulation by Butyrate Administration in Patients with Hematologic Malignancies Undergoing Hematopoietic Stem Cell Transplantation or CAR-T Cell Therapy.

Doba trvania: 1.1.2026 - 31.12.2029
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: doc. RNDr. Čierniková Soňa PhD., MPH
Anotácia:Črevný mikrobióm ovplyvňuje účinnosť a toxicitu chemoterapie a imunoterapie. Modulácia mikrobiómu tak predstavuje nové možnosti v starostlivosti o onkologických pacientov. Hematoonkologickí pacienti podstupujú pred transplantáciou krvotvorných kmeňových buniek (TKB) prípravný režim s vysokodávkovanou chemoterapiou, ktorá spôsobuje dysbiózu a narúša metabolický potenciál baktérií. Butyrát, mastná kyselina s krátkym reťazcom, zohráva kľúčovú úlohu v udržiavaní integrity črevnej bariéry a imunoregulačných procesoch. Predkladaný projekt predstavuje translačnú výskumnú časť akademickej klinickej štúdie, ktorej cieľom je modulácia mikrobiómu u hematoonkologických pacientov podstupujúcich TKB alebo CAR T-bunkovú terapiu podávaním butyrátu. V projekte budeme hodnotiť vplyv butyrátu na parametre črevnej bariéry, imunoregulačné procesy a kvalitu života pacientov.Tento inovatívny prístup by mohol zlepšiť manažment imunokompromitovaných pacientov a prispieť k optimalizácii klinických výsledkov a zníženiu toxicity liečby.

Štúdium molekulárnych zmien v dynamike MASLD

Investigation of molecular changes in MASLD dynamics

Doba trvania: 1.9.2025 - 30.6.2026
Program: Plán obnovy EÚ
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Balážová Lucia PhD.
Anotácia:Steatotická choroba pečene spojená s metabolickou dysfunkciou (MASLD) je chronické ochorenie pečene s celosvetovo sa zvyšujúcou prevalenciou. V súčasnosti nie sú dostupné neinvazívne špecifické a citlivé markery tohto ochorenia ani farmakoterapia. Štúdium nových molekulárnych mechanizmov zapojených v patogenéze MASLD má teda potenciál priniesť nové diagnostické možnosti a prispieť k dizajnu inovatívnej terapeutickej stratégie. Naše predbežné dáta poukazujú na existenciu spätno-väzobných slučiek, ktoré modulujú aktivitu kľúčovej pro-fibrogénnej signalizácie zodpovednej za progresiu MASLD do pokročilých štádií. Cieľom predkladaného projektu je vykonať pilotné funkčné štúdie kandidátnych génov zapojených v patogenéze MASLD. Táto schéma mi umožní pokračovať vo výskume, prezentovať výsledky na domácom aj zahraničnom kongrese a predovšetkým vylepšiť ďalšiu žiadosť o ERC grant aj vďaka plánovanej návšteve držiteľa ERC grantu.

Štúdium možností a limitácií implementácie moderných genetických analýz v klinických diagnostických postupoch u pacientov bez jasnej a jednoznačnej klinickej diagnózy

Study of the possibilities and limitations of the implementation of modern genetic analyses in clinical diagnostic procedures in patients without a clear and unambiguous clinical diagnosis

Doba trvania: 1.1.2024 - 31.12.2027
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Zaťková Andrea PhD.
Anotácia:Projekt je zameraný na pacientov so zriedkavými až individuálnymi geneticky podmieneným ochoreniami, u ktorých doterajšie postupy neviedli k stanoveniu diagnózy. Hlavným vedeckým cieľom projektu je analyzovať a charakterizovať potenciál prechodu od analýz exómu (WES), ktoré už sú súčasťou diagnostickej praxe, na analýzu celého genómu (WGS), ktorá pokrýva aj nekódujúce časti genómu a dáva možnosť detailnejšie analyzovať takmer všetky druhy genetickej variability. Pomocou WGS zanalyzujeme DNA pacientov s cieľom odhaliť genetickú príčinu/y ich ochorenia. Na analýzu variantov a ich vyhodnocovanie použijeme hlavne bioinformatické nástroje, ktoré boli vyvinuté na spolupracujúcom pracovisku. Očakávame odhalenie nových variantov v už známych génoch, ako aj v nových kandidátnych génov zapojených do patofyziológie zriedkavých ochorení. Tieto nové zistenia možno rozvíjať v rámci budúcich projektov základného výskumu. Náš prístup tzv. personalizovanej medicíny tiež môže prispieť k voľbe adekvátnej terapie pre pacientov.

Štúdium vplyvu črevného mikrobiómu na liečbu a prognózu pacientov s testikulárnymi nádormi z germinatívnych buniek.

Impact of the gut microbiome on the treatment and prognosis of patients with testicular germ cell tumors.

Doba trvania: 1.1.2024 - 31.12.2027
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: doc. RNDr. Čierniková Soňa PhD., MPH
Anotácia:Testikulárne nádory z germinatívnych buniek (GCT) sú najčastejším typom onkologického ochorenia u mladých mužov vo veku 20-40 rokov a zároveň predstavujú model kurabilnej malignity. Napriek excelentnej prognóze, dokonca aj pri metastatickom ochorení, dochádza u niektorých pacientov k recidíve a zomierajú v dôsledku progresie ochorenia. Pribúdajúce dáta naznačujú, že črevný mikrobióm má pleiotropný účinok na rôzne aspekty normálnych, ako aj patologických procesov v organizme, vrátane rozvoja rakoviny. Cieľom tejto štúdie je charakterizovať črevný mikrobióm v animálnom modeli myšacích xenograftov a u pacientov s GCT a korelovať mikrobiálne zloženie s charakteristikami pacienta/nádoru, výsledkami liečby a toxicitou po podávanej terapii. Získané poznatky by mohli byť dôležité pri plánovaní následných intervenčných štúdií, zameraných na moduláciu mikrobiómu s cieľom zlepšiť terapeutickú odpoveď a znížiť toxicitu súvisiacu s liečbou u pacientov s GCT.

Terapeutická úloha selektívnej inhibície cholínesteráz v srdcovom zlyhávaní

Therapeutic role of selective ChE inhibition in heart failure

Doba trvania: 1.7.2023 - 30.6.2027
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Zahradníková, ml. Alexandra PhD.
Anotácia:Srdcové zlyhávanie (SZ) je chronické progresívne ochorenie, ktoré predstavuje celosvetovo významnú záťaž pre zdravotnú starostlivosť. Napriek pokroku v manažmente SZ, ku ktorému došlo za posledných niekoľko desaťročí, zostáva mortalita pacientov so SZ vysoká. V poslednej dobe narastá množstvo dôkazov o tom, že znížená cholínergická signalizácia môže byť vhodným terapeutickým prístupom a sú navrhnuté viaceré veľké klinické štúdie na vyhodnotenie dlhodobých účinkov inhibítorov cholínesteráz (ChE) (ChEI) v rôznych štádiách SZ. Informácie o ChE v srdci sú však veľmi chabé. Naše predbežné výsledky potvrdzujú prítomnosť oboch známych ChE, acetylcholínesterázy (AChE) a butyrylcholínesterázy (BChE), v srdci, avšak s odlišnou lokalizáciou a rôznymi úlohami v regulácii srdcových funkcií. V navrhovanom projekte sa zameriame na vyhodnotenie úlohy AChE a BChE v etiopatogenéze SZ indukovaného v myši transverzálnou aortálnou konstrikciou. Použijeme dva modely: geneticky modifikované myši, v ktorých je inaktivovaná AChE alebo BChE a farmakologickú intervenciu so špecifickým ChEI, vrátane donepezilu (AChEI), isoOMPA (BChEI), rivastigmínu (systémový AChEI a BChEI) a pyridostigmínu (periférny AChEI a BChEI). Okrem toho máme v úmysle charakterizovať zdroj kardioprotektívneho acetylcholínu. Geneticky modifikovaný kmeň myší s prakticky žiadnou aktivitou AChE v kostrovom svale bude použitý na skúmanie novej hypotézy, ktorá navrhuje, že acetylcholín je po inhibícii/inaktivácii ChE schopný difundovať z kostrového svalu do vzdialenejších tkanív, vrátane srdca, kde pôsobí toxicky. Priestorovú transkriptomiku použijeme na rozlíšenie medzi neuronálnym a neneuronálnym srdcovým acetylcholínom, ako aj na sledovanie priestorových zmien v prestavbe srdca pri SZ a po liečbe. Výsledky projektu by mali poskytnúť dôležité informácie o protektívnych mechanizmoch cholínergického systému v etiopatogenéze SZ a terapeutickom využití ChEI.

Účasť hypoxiou indukovanej karboanhydrázy IX na interakcii nádorových buniek a krvných buniek počas metastatického šírenia

Involvement of hypoxia-induced carbonic anhydrase IX in tumor cells-blood cells interaction during metastatic dissemination

Doba trvania: 1.8.2024 - 30.6.2026
Program: Plán obnovy EÚ
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Švastová Eliška PhD.

Účinky GLP-1 analógu na sclerosis multiplex

Effects of GLP-1 Analog on Multiple Sclerosis

Doba trvania: 1.7.2022 - 30.6.2026
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: doc. MUDr. Imrich Richard DrSc.
Anotácia:Primárnym cieľom našej štúdie je vyhodnotenie účinkov liečby agonistom GLP-1 na poškodenie axónov a neurodegeneráci u. Ako primárne premenné budú slúžiť anualizované zmeny objemov mozgu / šedej hmoty a plazmatických hladín neurofilamentu L. Sekundárnym cieľom je preskúmať účinky liečby agonistami GLP -1 na inzulínovú rezistenciu a kognitívne funkcie pri SM. Inzulínová rezistencia sa bude hodnotiť pomocou indexov inzulínovej citlivosti na základe orálneho glukózo - tolerančného testu a kognitívne funkcie sa budú testovať pomocou Symbol Digit Modalities (SDMT) a Stroopovho testu. V štúdii sa tiež vykonajú ďalšie analýzy a funkčné testy vrátane neinvazívneho hodnotenia endotelovej funkcie. V súčasnosti nie sú známe klinicky relevantné účinky GLP -1 analógov na progresiu SM. Napriek určitému pokroku vo vývoji nových spôsobov liečby SM v posledných rokoch zostáva problémom terapia a predchádzanie trvalému zdravotnému postihnutiu u pacientov so SM. Výsledky štúdie môžu poskytnúť základ pre potenciálnu terapiu analógmi GLP-1 na liečbu pacientov so SM s cieľom spomaliť proces neurodegenerácie a zabrániť alebo oddialiť rozvoj komorbidít spojených s inzulínovou rezistenciou (hlavne kardiovaskulárnymi ochoreniami a cukrovkou 2. typu).

Účinok patologických mutácií a posttranslačných modifikácií na funkcie mitochondriálnej procesujúcej peptidázy nevyhnutnej pre transport do mitochondrií

The effect of pathologic mutations and post-translational modifications on the functions of mitochondrial processing peptidase essential for transport to mitochondria

Doba trvania: 1.7.2024 - 30.6.2028
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Gašperíková Daniela DrSc.

Účinok telesného cvičenia a výživy na črevný mikrobióm a kvalitu života vyliečených onkologických pacientov

The Effect of Physical exercise and Nutrition on Gut Microbiome and Quality of Life in childhood cancer survivors

Doba trvania: 1.7.2023 - 30.6.2027
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: doc. MUDr. Penesová Adela PhD.

Úloha bunkových lipidov v životnom cykle vírusu lymfocytovej choriomeningitídy

The role of cellular lipids in lymphocytic choriomeningitis virus life cycle

Doba trvania: 1.1.2023 - 31.12.2026
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: Ing. Tomášková Jana PhD.
Anotácia:Bunkové lipidy zohrávajú kľúčovú úlohu v každej fáze životného cyklu vírusu. Tieto interakcie siahajú od väzby vírusu na plazmatickú membránu hostiteľskej bunky až po uvoľnenie nových infekčných viriónov do extracelulárneho priestoru. Hoci modulácia metabolizmu lipidov patrí medzi všeobecné replikačné stratégie, vírusy používajú rôzne mechanizmy na využívanie týchto dôležitých bunkových dráh. Cieľom navrhovaného projektu je preto objasniť tieto procesy počas infekcie vírusom lymfocytovej choriomeningitídy (LCMV), modelovým zástupcom čeľade Arenaviridae. Zameriame sa na zmeny v anabolických a katabolických dráhach lipidov vyvolané infekciou LCMV a ich úlohu v životnom cykle vírusu. Objavenie nových interakcií medzi vírusom a bunkovými lipidmi poskytne nielen neoceniteľné poznatky o molekulárnych mechanizmoch vírusovej patogenézy, ale tiež prispeje k identifikácii nových cieľov pre vývoj antivírusových liečiv.

Úloha Gingko-biloby v epigenetickej modulácii a malígnej transformácii buniek proti ionizujúcemu žiareniu u pacientov podstupujúcich rádioterapiu.

Role of Gingko-biloba in the epigenetic modulation and cell malignant transformation against ionizing radiation as used in radiotherapy patients

Doba trvania: 1.8.2024 - 30.6.2026
Program: Plán obnovy EÚ
Zodpovedný riešiteľ: Gulati Sachin PhD.
Anotácia:Terapeutická rezistencia k rádioterapii je jednou z hlavných prekážok pri liečbe rakoviny.Tento projekt rozvíja kombinačné stratégie zahŕňajúce Ginkgo biloba (GB) ako rádiosenzibilizátor na prekonanie rádioresistencie v konvenčnej rádioterapii a zosilnenie jej protinádorových účinkov. Zhodnotíme úlohu GB ako rádiosenzibilizátora pri podpore apoptózy indukovanej reaktívnymi kyslíkovými radikálmi pomocou prietokovej cytometrie po ožiarení ľudských nádorových línií. V súčasnosti neexistuje žiadna štúdia týkajúca sa úlohy GB ako epigenetického liečiva v kombinácii s ožiarením pre terapiu. Budeme skúmať epigenetickú moduláciu prostredníctvom metylácie DNA/RNA a histónových proteínov v nádorových líniách ovplyvnených GB po ožiarení. Zmeny v transformácii malígnych buniek vyhodnotíme metódou klonovania na mäkkom agare a metódou transplantácie buniek u SCID myší. Budeme sledovať odlišnú reakciu GB na nádory hodnotením veľkosti, hmotnosti a histopatologickej analýzy.

Úloha GPR180 v regulácii funkcie beta buniek pankreasu a patogenéze diabetu

The role of GPR180 in regulation of pancreatic beta cell function and pathogenesis of diabetes

Doba trvania: 1.1.2023 - 31.12.2026
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Balážová Lucia PhD.

Úloha imunitného systému pri progresii NAFLD a identifikácia potenciálnych imunologických biomarkerov

The role of immune system in NAFLD progression and identification of potential immunological biomarkers

Doba trvania: 1.8.2024 - 30.6.2026
Program: Plán obnovy EÚ
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Vince Kážmérová Zuzana PhD.
Anotácia:1. Excelentnosť Nealkoholová tuková choroba pečene (NAFLD) predstavuje významný problém verejného zdravotníctva s narastajúcim počtom pacientov na celom svete (globálna prevalencia presahuje 30 %) (1). Patologické stavy sa líšia v jednotlivých štádiách NAFLD, od relatívne benígnej stukovatenej pečene (NAFL) až po agresívnejšiu formu ochorenia - steatohepatitídu (NASH), ktorá je charakterizovaná zápalom a narastajúcou fibrózou pečene. V neskorších štádiách dochádza k rozvoju cirhózy pečene s funkčným poškodením alebo rozvojom hepatocelulárneho karcinómu (HCC) (2). Nedávne preklinické a klinické štúdie potvrdzujú kľúčovú úlohu imunitných buniek v progresii NAFLD. Tkanivové makrofágy, ako sú Kupfferove bunky (KCs) a od monocytov odvodené makrofágy, sú hlavné vrodené imunitné bunky zapojené do progresie ochorenia, a to od NAFL cez NASH až po HCC. Okrem toho viaceré imunologické štúdie preukázali, že ich špecifická polarizácia prispieva k progresii NAFLD (3). Zatiaľ čo vrodené imunitné bunky sú zodpovedné za iniciáciu poškodenia pečene, adaptívne imunitné bunky charakterizované zvýšenou translokáciou lymfocytov do pečene zohrávajú kľúčovú úlohu pri chronickom zápale vedúcom k poškodeniu pečene (4, 5). Tieto procesy spolu navzájom intenzívne interagujú a vytvárajú integrovanú imunitnú sieť zohrávajúcu kľúčovú úlohu v patofyziológii NAFLD (3), avšak ďalší výskum je stále potrebný. Identifikácia kľúčových zápalových mediátorov a jednotlivých podtypov aktivovaných imunitných buniek by mohla významne prispieť k objaveniu prediktívnych biomarkerov progresie NAFLD smerom k NASH alebo cirhóze pečene. Hlavným cieľom projektu je preto vyvinúť nový „in vitro“ bunkový systém (kokultúra hepatocytov a imunitných buniek), ktorý napodobní zjednodušenú verziu interakcií buniek v pečeni zapojených do progresie NAFLD a patogenézy NASH. Na hodnotenie a pochopenie procesov vrodenej a adaptívnej imunitnej odpovede bude vytvorená in vitro kultúra v prostredí simulujúcom podmienky nutričného preťaženia špecifického pre patogenézu NAFL a NASH. Súčasne monitorovanie a odhalenie špecifických podskupín aktivovaných imunitných buniek by mohlo viesť k identifikácii nových imunologických biomarkerov progresie NAFLD. 2. Dopad Krátkodobý dopad FLIMB projektu Model interakcie hepatálnych a imunitných buniek bude slúžiť ako nový „in vitro“ nástroj na výskum, ktorý poskytne nový pohľad na pochopenie kľúčových imunologických procesov zapojených do progresie NAFLD. Zároveň budú objasnené aj pokročilé znalosti o prepojeniach medzi progresiou NAFLD a zápalom. Dlhodobý dopad FLIMB projektu Identifikácia imunologických faktorov zodpovedných za iniciáciu poškodenia pečene alebo zhoršenie chronického zápalu by mohla byť v budúcnosti využitá ako potenciálne imunologické biomarkery využívané v diagnostike tohto ochorenia. Diagnostika NAFLD predstavuje významný problém pri manažmente pacientov. Nedostatok špecifických, citlivých a neinvazívnych diagnostických nástrojov komplikuje určenie závažnosti ochorenia, stratifikáciu pacientov na základe progresie ochorenia a bráni včasnej intervencii. Identifikácia nových biomarkerov môže pomôcť lekárom rozlíšiť jednotlivé štádiá ochorenia a identifikovať pacientov s rizikom progresie NAFLD od tých so samotnou steatózou. Niektoré z identifikovaných imunologických narkerov by mohli byť v budúcnosti využité na vývoj liekov v kontexte prevencie alebo liečbe NAFLD. FLIMB bude úzko prepojený so schváleným a financovaným výskumným projektom BMC (SRDA-22-0310, vedený L. Balazovou), ktorý je zameraný na identifikáciu biomarkerov NAFLD v extracelulárnych vezikulách (EV). 3. Implementácia Projekt FLIMB zahŕňa tri hlavné pracovné balíky (WP), ktoré sú logicky a chronologicky prepojené a pozostávajú z niekoľkých cieľov: WP 1: Vývoj nového „in vitro“ modelu interakcie hepatálnych a imunitných buniek • Cieľ 1: Zabehnutie kultivácie hepatocytov a stelatových buniek (HSC) • Cieľ 2: Zabehnutie kultivácie Kupfferových buniek (KCs) a monocyto-odvodzovaných makrofágov (MoMs) • Cieľ 3: Optimalizácia kokultivačných techník potrebných na vývoj modelu interakcie buniek WP 2: Hodnotenie imunitnej odpovede v modeli hepatálnych a imunitných buniek pri nutričnom preťažení • Cieľ 1: Simulácia podmienok nutričného preťaženia • Cieľ 2: Imunofenotypizácia KCs a MoMs a hodnotenie vrodenej imunitnej odpovede • Cieľ 3: Hodnotenie adaptívnej imunitnej odpovede (kokultivácia s PBMCs) v bunkovom modeli WP 3: Identifikácia nových imunologických biomarkerov progresie NAFLD • Cieľ 1: Izolácia PBMCs zo vzoriek krvi zdravých a NAFLD pacientov • Cieľ 2: Imunofenotypizácia a porovnanie PBMCs medzi zdravými a NAFLD pacientmi • Cieľ 3: Identifikácia biomarkerov v obsahu pečeňových extracelulárnych vezikúl (EV) Diseminácia výsledkov: • Aktívna účasť na kongresoch • Publikácie (open access, recenzované) • Ročné správy Inštitúcia, kde bude projekt realizovaný, má potrebné technické, materiálne a personálne vybavenie (napr. BD FACS Aria II SORP UV, laserový konfokálny fluorescenčný systém TCS SP2 AOBS). Projekt sa uskutoční v laboratóriu Dr. Balazovej (BMC), ktorá už pred tým preukázala silné vedecké zázemie v oblasti výskumu energetického metabolizmu a metabolických ochorení, ako aj v spolupráci s klinikmi (Dr. Med. Daniela Staníková, PhD., Oddelenie pediatrie, Lekárska fakulta Univerzity Komenského a Národný ústav detských chorôb, Bratislava, Slovensko), ktorí nám poskytnú vzorky krvi od pacientov s NAFLD. Súčasne ja ako hlavný riešiteľ projektu mám silné vedecké zázemie v oblasti imunológie, zápalu, vývoja bunkových kultivačných systémov, ako aj pokročilých laboratórnych techník potrebných na monitorovanie imunitnej odpovede. Referencie: 1. Riazi K, Azhari H, Charette JH, Underwood FE, King JA, Afshar EE, et al. The prevalence and incidence of NAFLD worldwide: a systematic review and meta-analysis. Lancet Gastroenterol Hepatol (2022) 7(9):851–61. doi: 10.1016/S2468-1253(22)00165-0. 2. Friedman SL, Neuschwander-Tetri BA, Rinella M, Sanyal AJ. Mechanisms of nafld development and therapeutic strategies. Nat Med (2018) 24(7):908–22. doi: 10.1038/s41591-018-0104-9. 3. Peiseler M, Schwabe R, Hampe J, Kubes P, Heikenwalder M, Tacke F. Immune mechanisms linking metabolic injury to inflammation and fibrosis in fatty liver disease - novel insights into cellular communication circuits. J Hepatol (2022) 77(4):1136–60. doi: 10.1016/j.jhep.2022.06.012. 4. Marra F, Tacke F. Roles for chemokines in liver disease. Gastroenterology (2014) 147(3):577–94.e1. doi: 10.1053/j.gastro.2014.06.043. 5. Shetty S, Lalor PF, Adams DH. Liver sinusoidal endothelial cells {{/amp]]mdash; gatekeepers of hepatic immunity. Nat Rev Gastroenterol Hepatol (2018) 15(9):555–67. doi: 10.1038/s41575-018-0020-y.

Úloha inhibičných neurónov v senzorických oblastiach mozgu v transgénnom modeli neurovývinového ochorenia.

Úloha inhibičných neurónov v senzorických oblastiach mozgu v transgénnom A role of Inhibitory neurons in sensory brain regions in a transgenic model of neurodevelopmental disorder.

Doba trvania: 1.7.2025 - 30.6.2027
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: doc. RNDr. Bakoš Ján PhD.

Úloha intrakolonálneho sírovodíka a butyrátu v rozvoji hypertenzie u obéznych potkanov

The role of intracolonic hydrogen sulfide and butyrate in the development of hypertension in obese rats

Doba trvania: 1.1.2023 - 31.12.2026
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Tomášová Lenka PhD.

Úloha metabolizmu kovov v replikácii a prežívaní Coxiella burnetii

The role of metal metabolism in the replication and survival of Coxiella burnetii

Doba trvania: 1.1.2024 - 31.12.2027
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: Ing. Škultéty Ľudovít DrSc.
Anotácia:Coxiella burnetii je intracelulárny bakteriálny patogén spôsobujúci klinické infekcie ľudí a zvierat, ktoré môžu významne ovplyvniť verejné zdravie. Po vstupe do hostiteľskej bunky sa C. burnetii replikuje vo vakuolách podobným fagolyzozómom. Počas infekcie C. burnetii vykazuje tropizmus pre rôzne tkanivá, čo naznačuje, že fyziológia patogénu súvisí s metabolizmom kovov. Nedávno sa ale preukázalo, že železo môže mať obmedzenú úlohu v regulácii virulencie C. burnetii. Nie je však známe, ako získava molekulárne železo a aký oxidačný stav železa má baktéria k dispozícii. Primárnym cieľom tohto projektu je preto poskytnúť nový pohľad na reguláciu metabolizmu kovov, najmä železa, zinku, mangánu, medi a iných enzymatických a metabolických kofaktorov pri infekcii. Projekt bude zároveň sledovať odpoveď makrofágov/neutrofilov na infekciu a odhalí malé molekuly, ktoré bude možné použiť na vývoj nových diagnostík alebo terapeutík.

Úloha mitochondrií v odpovedi nádorových buniek na liečbu: dynamika vývoja liekovej rezistencie

Role of mitochondria in treatment response of cancer cells: dynamics of drug resistance development

Doba trvania: 1.9.2025 - 28.2.2029
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Jurkovičová Dana DrSc.

Úloha poškodenia DNA a opravy v odpovedi nádorov urogenitálneho traktu na chemoterapiu na báze cisplatiny

Role of DNA damage and repair in response of urogenital cancers to cisplatin-based chemotherapy

Doba trvania: 1.1.2023 - 31.12.2026
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Chovanec Miroslav PhD.
Anotácia:Testikulárne nádory zo zárodočných buniek (TGCT) postihujú najčastejšie mužov v tretej dekáde života, zatiaľ čo malignity močového mechúra (BC) dominantne mužov v siedmej dekáde života. Základom liečby oboch malignít je cisplatina (CDDP), pričom vrodená alebo získaná rezistencia na toto liečivo zhoršujú celkovú prognózu TGCT a BC pacientov. Cieľom predkladaného grantu je skúmať mechanizmy odpovede oboch malignít na CDDP a hľadať prípadné korelácie medzi poškodením a opravou DNA a prežitím TGCT a BC pacientov, pretože sa domnievame sa, že pacienti nedostatočne odpovedajúci na liečbu prostredníctvom CDDP majú aberantné hladiny endogénneho a CDDP indukovaného poškodenia DNA, ako aj mechanizmov opravy DNA.

Úloha proteínov DNA opravy v génovej represii

The role of DNA repair proteins in gene repression

Doba trvania: 1.7.2022 - 30.6.2026
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: Ing. Čipáková Ingrid PhD.

Úloha R-slučiek a ich metabolizmu pri vzniku rezistencie na cisplatinu

Role of R-loops and their metabolism in in cisplatin resistance development

Doba trvania: 1.1.2025 - 31.12.2027
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: MVDr. Borszéková Pulzová Lucia PhD.
Anotácia:Cisplatina (CisPt) je široko používaným protinádorovým liečivom, ktorého účinok je sprostredkovaný tvorbou krížnych väzieb v DNA a následnou inhibíciou DNA replikacie a transkripcie. CisPt rezistencia, či už prirodzená alebo získaná, je hlavnou príčinou zlyhania protinádorovej liečby. Úloha transkripcie a ko-transkripčných R-slučiek v karcinogenéze a chemorezistencii začína v posledných rokoch naberať na svojom význame. Avšak úloha R-slučiek a ich narušeného metabolizmu pri vyniku rezistencie na CisPt nie je doteraz objasnená. Stanovenie hladiny R-slučiek v prirodzene citlivých bunkových líniách derivovanými z nádorov semenníkov tvorených zárodočnými bunkami a v ich rezistetných derivátoch a štúdium ich dynamiky počas CisPt-vyvolaneho stresu môže prispieť k objasneniu mechanizmu vzniku získanej rezistencie a priniesť nové markery, ktoré dokážu predikovať odpoveď nádorových buniek na chemoterapiu. Lepšie pochopenie mechanizmov rezistencie je nevyhnutné pre predchádzanie vzniku rezistencie.

Úloha selénových derivátov v regulácii kardiovaskulárnej homeostázy u obéznych potkanov

The involvement of selenium species in the regulation of cardiovascular homeostasis in obese rats

Doba trvania: 1.1.2025 - 31.12.2028
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Mišák Anton PhD.
Anotácia:Obezita a s ňou súvisiace pridružené ochorenia predstavujú hlavnú príčinu úmrtí na celom svete. Selén je esenciálny stopový prvok. Mnohé štúdie naznačujú, že selén hrá dôležitú úlohu pri regulácii kardiovaskulárnej homeostázy tým, že znižuje oxidačný stres a pôsobí protizápalovo. Nedávno sme zistili, že zlúčeniny selénu môžu byť aktivované tiolmi za vzniku účinných vazorelaxačných a hypotenzných produktov obsahujúcich selén. V projekte sa zameriavame na určenie úlohy selénových derivátov v regulácii kardiovaskulárneho systému pri obezite. Preskúmame vplyv selénových derivátov na krvný tlak a cievnu reaktivitu u obéznych potkanov. Ďalej posúdime, či selénové deriváty ovplyvňujú funkcie srdcových mitochondrií. Nakoniec preštudujeme aktivitu kľúčovej antioxidačnej peroxidázy, selenoproteínu GPX4 v kardiovaskulárnom systéme obéznych potkanov. Tieto výsledky môžu odhaliť terapeutický potenciál selénových derivátov pri liečbe zdravotných komplikácii spájaných s obezitou.

Úloha zlúčenín síry v rozvoji metabolických ochorení

The role of sulfur species in the development of metabolic diseases

Doba trvania: 1.8.2024 - 30.6.2026
Program: Plán obnovy EÚ
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Tomášová Lenka PhD.

Vektormi prenášané mikróby a možnosti ich eliminácie bez použitia antibiotík

Vector-borne microbes and the possibilities of their elimination without the use of antibiotics

Doba trvania: 1.1.2025 - 31.12.2028
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Špitalská Eva DrSc.
Anotácia:Zoonotické infekcie prenášané kliešťami patria k najrozšírenejším vektormi-prenášaným ochoreniam, sú spôsobené mikroorganizmami ako napr. vírus kliešťovej encefalitídy, Rickettsia spp., A. phagocytophilum, N. mikurensis, B. burgdorferii s.l., Babesia spp. Posledné roky rastie počet nových prípadov ochorení, ale aj lokalít, kde je výskyt patogénov zaznamenávaný, čo je spôsobené rýchlym vývinom molekulárnych nástrojov v diagnostike a identifikácii nových a novo sa objavujúcich mikróbov. Projekt je zameraný na štúdium výskytu a variability R. helvetica a N. mikurensis v kliešťoch Dermacentor a R. conorii subsp. raoultii v kliešťoch I. ricinus na Slovensku; a štúdiu výskytu a variability rickettsií, Bartonella spp. a Coxiella burnetii u C. boueti, C. confusus, S. transgriepinus, R. faini a R. camicasi parazitujúcich síce na netopieroch, avšak človek môže byť ich sekundárnym hostiteľom. Projekt zároveň prispeje k poznaniu využitia nanočastíc a fotodynamickej terapie na elimináciu kliešťami-prenášaných patogénov.

Viroidy - unikátne subvírusové patogény rastlín, ich diverzita a interakcie s hostiteľom

Viroids - unique subviral plant pathogens, their diversity and host interactions

Doba trvania: 1.7.2023 - 30.6.2027
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: doc. Ing. Glasa Miroslav DrSc.
Anotácia:Viroidy sú krátke jednovláknové cirkulárne RNA infikujúce rastliny, ktoré na rozdiel od vírusov nekódujú žiadne vlastné proteíny. Napriek svojej štruktúrnej jednoduchosti sú viroidy schopné sa v rastlinných hostiteľoch replikovať, etablovať a vyvolávať veľmi závažné symptómy vedúce, v prípade poľnohospodárskych plodín, k významným ekonomickým stratám. Poznatky o druhovom zastúpení viroidov a ich diverzite na Slovensku chýbajú, pričom v ostatných rokoch sme vo svetovom meradle konfrontovaní nárastom zmienok o nových a novo sa objavujúcich viroidových druhoch a ich divergentných variantov. Cieľom projektu je priniesť aktuálny pohľad na výskyt viroidových infekcií na našom území, identifikáciu pôvodcov a ich molekulárnu epidemiológiu. Metagenomická analýza virómu rastlín využitím masívneho paralelného a štandardného sekvenovania umožní charakterizáciu genómov vírusov a viroidov, možnú identifikáciu zmiešaných infekcií a hĺbku polymorfizmu vnútroizolátovej diverzity. Získané poznatky sa využijú na vývoj a optimalizáciu nástrojov umožňujúcich špecifickú detekciu viroidov v následných epidemiologických štúdiách (hostiteľský okruh, dynamika populácií v rôznych agroekologických kontextoch ...). Pomocou pripravených infekčných pospiviroidových klonov a riadenej kontrolovanej infekcie experimentálnych rastlín budeme sledovať etiológiu ochorenia, molekulárne faktory hostiteľskej špecificity a úlohu kľúčových mutácií v patogenéze viroidov. Pochopenie faktorov vplývajúcich na diverzifikáciu a evolúciu virodov umožní komplexný pohľad na ich patosystém a v širšom meradle prispeje k prijímaniu efektívnych preventívnych fytosanitárnych opatrení. Modifikovaným viroidovým vektorom zhodnotíme aj potenciál využitia viroidom indukovaného utlmovania génovej expresie (VdIGS) vo funkčnej genomike rastlín.

Vplyv menopauzy na vazoregulačnú úlohu sulfidovej signálnej dráhy pri kardiovaskulárnych komplikáciách diabetu II.

The impact of menopause on the vasoregulatory role of the sulfide signaling pathway in cardiovascular complications of diabetes II type

Doba trvania: 1.9.2025 - 31.8.2029
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: Ing. Kršková Katarína PhD.
Anotácia:Sírovodík (H2S) je dôležitá plynná molekula zapojená do regulácie cievneho tonusu a to aj v rôznych patologických stavoch, ako sú hypertenzia, diabetes a obezita. Perivaskulárne tukové tkanivo (PVAT), jeho prozápalové aktivity a vplyv na vazoaktívne funkcie zohrávajú kľúčovú úlohu pri vzniku kardiovaskulárnych komplikácií. Tieto faktory vzájomne interagujú , ale presný mechanizmus ich vzťahov nie je ešte plne objasnený. Ukazuje sa, že progresia metabolických porúch môže významne ovplyvniť rovnováhu medzi patologickým a kompenzačným pôsobením sulfidovej signálnej dráhy. Zápal a dysregulácia PVAT sú obzvlášť charakteristické pre pokročilé štádiá diabetu, čo môže negatívne ovplyvniť kompenzačné vazoaktívne účinky H2S pozorované pri menej závažných metabolických poruchách. Potvrdiť alebo vyvrátiť tento predpoklad je jedným z cieľov predkladaného projektu. V súčasnosti sú čoraz viac vyzdvihované aspekty personalizovanej medicíny, ktorá môže prispieť k efektívnejšej terapii presným zacielením na špecifické skupiny pacientov. Riziko rozvoja kardiovaskulárnych komplikácií a diabetu je výrazne vyššie u žien po menopauze, pričom u žien do 40 rokov je toto riziko nižšie v porovnaní s mužmi v rovnakom veku. Projekt sa bude zameriavať na vplyv reprodukčného stavu u samíc obéznych potkanov s diabetes mellitus II. typu (ZDF) po chirurgickej ovariektómii s cieľom identifikovať možné rozdiely v mechanizmoch kardiovaskulárnych porúch a lepšie špecifikovať terapeutické ciele pre obézne diabetické pacientky so závažnou dyslipidémiou alebo u žien po menopauze. Vybrané plazmatické parametre budú porovnávané s parametrami diabetických pacientiek rôzneho reprodukčného veku. V ďalšej fáze projektu sa preskúmajú účinky prírodného izotiokyanátu a pomaly uvoľňujúceho H2S donora erucínu na zníženie rizika kardiovaskulárnych komplikácií u diabetických ZDF samíc po ovariektómii.

Vplyv NG2 pozitívnej populácie buniek na rozsah poranenia a funkčnej obnovy po úraze miechy

The effect of NG2 positive cell population on extent of damage and functional recovery following spinalal cord injury

Doba trvania: 1.1.2024 - 31.12.2026
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: MUDr. Kuchárová Karolína PhD.
Anotácia:Cieľom predloženého projektu je ovplyvniť molekulárne a bunkové mechanizmy, ktoré produkciou NG2 proteoglykánu (NG2) bránia funkčnej obnove miechy po jej poranení. Úraz stimuluje produkciu NG2 v progenitoroch oligodendroglie, v pericytoch, fibroblastoch a zápalových bunkách. Kedy, kde a ktoré NG2+ typy buniek reagujú na poranenie miechy a jej farmakologické ovplyvňovanie zatiaľ nie je známe. Za účelom objasnenia úlohy NG2+ buniek po poranení miechy, sa v experimentoch porovnajú dva terapeutické prístupy a to 1) neuroregeneračne úspešná (avšak invazívna, intratekálna) liečba s chondroitinázou ABC a 2) orálna aplikácia antifibrotika. Odpoveď týchto funkčne rôznorodých typov NG2+ buniek na liečbu bude hodnotená bunkovo-špecifickými a funkčnými technikami. Predpokladáme, že projekt odkryje typy NG2+ buniek zúčastňujúcich sa na tvorbe jazvy, a naznačí, či môže menej invazívne a viac selektívne ovplyvnenie NG2+ fibroblastov ochrániť neuróny a zlepšiť funkčnú obnovu tkaniva po traumatickom poranení miechy.

Vplyv rozdielov vo vápnikovej a sulfidovej signalizácii na efektivitu rôznych typov chemoterapeutík

The influence of differences in calcium and sulfide signaling on the effectiveness of various types of chemotherapeutics

Doba trvania: 1.1.2025 - 31.12.2027
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: prof. Ing. Križanová Oľga DrSc.

Vplyv vonkajších faktorov na migráciu, terminálnu diferenciáciu a funkčnosť postnatálne vzniknutých neuroblastov v čuchovom systéme potkana

Effect of exogenous factors on the migration, terminal differentiation and function of postnatally generated neuroblasts in the olfactory system of the rat

Doba trvania: 1.1.2025 - 31.12.2027
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Račeková Enikö CSc.
Anotácia:Vznik nových neurónov v čuchovom systéme po narodení je rozhodujúci pre normálnu funkciu mozgu. Naše predchádzajúce výsledky ukázali, že faktory vonkajšieho prostredia dokážu modifikovať bunkovú proliferáciu v rostrálnej migračnej dráhe (RMS) dospelého potkana. Cieľom projektu je skúmať, či a ako ovplyvní modifikovaná proliferácia progenitorových buniek v RMS, navodená odlúčením mláďat od matky a vôňami obohateným prostredím, diferenciáciu neuronálnych prekurzorov v bulbus olfactorius. Proliferácia v RMS môže byť pozmenená v dôsledku narušenia migrácie neuroblastov. Preto ďalším cieľom bude sledovanie migrácie neuroblastov v RMS ovplyvnených potkanov. Behaviorálne testovanie ovplyvnených zvierat nám odpovie na otázku, či sa prípadné morfologické zmeny prejavia aj zmenami čuchových funkcií. Získané výsledky by mali poukázať na dôležitosť zvažovania tých exogénnych faktorov, ktoré významne ovplyvňujú neurogenézu a následne môžu prispieť k vzniku niektorých neurodegeneratívnych a psychiatrických ochorení.

Vplyv výživových doplnkov na oxidačný stres vo folikulárnej tekutine u neplodných žien

Effect of Dietary Supplements on Follicular Fluid in Female Infertility: Mitigating Oxidative Stress

Doba trvania: 1.1.2024 - 31.12.2027
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Kozics Katarína PhD.
Anotácia:Neplodnosť, inak nazvaná aj sterilita, sa stáva čoraz väčším problémom dnešnej spoločnosti. Vyskytuje sa tak u mužov, ako aj u žien. Jednou z príčin neplodnosti je aj oxidačný stres. Vplyv oxidačného stresu u neplodných mužov je potvrdeným rizikovým faktorom, ktorý je čiastočne eliminovaný suplementáciou antioxidantami. U žien zatiaľ takáto intervencia neexistuje. V tomto projekte sa chceme zamerať na oxidačný stres, ktorý je jeden z možných faktorov ovplyvňujúcich úspešnosť asistovanej reprodukcie (ART) u žien. Cieľom predkladaného projektu je stanovenie vplyvu antioxidačného účinku výživových doplnkov na oxidačný stres vo folikulárnej tekutine u neplodných žien. Okrem toho sa projekt zameriava na identifikovanie potenciálnych biomarkerov vo folikulárnej tekutine, ktoré majú súvis s oxidačným stresom a tým pádom aj na úspešnosť ART.

Výpočtové metódy na charakterizáciu a interpretáciu genomických mikrosatelitov pre klinické aplikácie v oblasti dedičných porúch a rakoviny

Computational methods for the characterization and interpretation of genomic microsatellites for clinical applications in hereditary disorders and cancer

Doba trvania: 1.9.2025 - 31.8.2029
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: doc. RNDr. Radvánszky Ján PhD.
Anotácia:Cieľom tohto projektu je rozvoj a validácia bioinformatických a štatistických metód na analýzu mikrosatelitných motívov (STR) z moderných sekvenačných údajov so zameraním na ich využitie v diagnostike zriedkavých dedičných a onkologických ochorení. Nadväzuje na úspešne ukončený projekt GenoMicrosat 1 (APVV-18-0319), v rámci ktorého sme vyvinuli nástroj na charakterizáciu STR lokusov v sekvenačných dátach druhogeneračného sekvenovania. Na základe sľubných výsledkov budeme v projekte GenoMicrosat 2 tieto nástroje ďalej zdokonaľovať pre: 1) riešenie nových výziev, ktoré redstavujú veľké objemy údajov pri analýzach sekvenovania celého genómu (WGS); 2) poskytovanie hĺbkovej charakterizácie a genotypizácie komplexných oblastí STR; a 3) inovatívne rozšírenie použitia nástroja na detekciu klinicky významnej mikrosatelitnej instability (MSI) a jeho využiteľnosti pri identifikácii a charakterizácii nádorových tkanív.

Výskum nových molekulárnych regulačných mechanizmov vybraných biologicky aktívnych 4-pyranónov vo vzťahu k ich perspektívnej využiteľnosti v humánnej onkológii

Investigation of new molecular regulatory mechanisms of selected biologically active 4H-pyran-4-ones in relation to their prospective applicability in human oncology

Doba trvania: 1.1.2024 - 31.12.2026
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Macejová Dana PhD.
Anotácia:Zdrojom biologicky aktívnych látok ako bazálnych zložiek farmaceutických prípravkov sú buď prírodné suroviny minerálneho, rastlinného alebo živočíšneho pôvodu alebo syntetické zlúčeniny. Existuje i ďalší zdroj, ktorý je kombináciou predchádzajúcich, keď látka prírodného charakteru slúži ako základná surovina na prípravu širokého spektra nových syntetických zlúčenín. 4-pyranóny sú z chemického hľadiska heterocyklické zlúčeniny obsahujúce kyslík. Ľahko sa degradujú na netoxické produkty, schopné zaradiť sa do kolobehu biogénnych prvkov v prírode. Chemická štruktúra 4-pyranónov má niekoľko reakčných centier, ktoré umožňujú prípravu veľkého počtu rôznorodých biologicky aktívnych zlúčenín. Medzi dôležitých predstaviteľov 4-pyranónov patrí 5-hydroxy-2-hydroxymetyl-4-pyranón. Cieľom predkladaného projektu je štúdium úlohy syntetizovaných nových derivátov bazálnej zlúčeniny 5-hydroxy-2-hydroxymetyl-4-pyranónu v procesoch vedúcich k indukcii apoptózy a inhibície proliferácie a migrácie invazívnych nádorových buniek.

Využitie genetického rizikového skóre pre DM1 pri identifikácii zriedkavých monogénových foriem diabetes mellitus

Use of genetic risk score for T1D in identification of rare monogenic forms of diabetes mellitus

Doba trvania: 1.1.2025 - 31.12.2028
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Škopková Martina PhD.
Anotácia:Monogénový diabetes mellitus (MDM) tvorí menej ako 5% všetkých typov DM. Jeho odlíšenie je dôležité, pretože títo pacienti môžu benefitovať z personalizovanej liečby. Klinicky je MDM ťažko odlíšiteľný od diabetu 1. typu (DM1) u detí a u dospelých je zase často zamieňaný za diabetes 2. typu (DM2). Potvrdenie diagnózy je možné len na základe DNA analýzy. Keďže táto je finančne náročná, pacienti sú selektovaní na základe klinických kritérií, ktoré však nie sú dostatočne špecifické. V tomto projekte zavádzame do procesu selekcie pacientov využitie genetického rizikového skóre pre DM1 (GRS T1D), ktorým vylúčime pacientov s DM1 pre ďalšie genetické analýzy. Metódu GRS sme zaviedli v predchádzajúcich projektoch a tento projekt predstavuje jej pilotnú transláciu do praxe. Súčasne má projekt ambíciu pokračovať vo funkčnej charakterizácii variantov neznámeho významu v génoch spojených s MDM, a to s využitím GRS pri ich prioritizácii. Výsledkom by mal byť vyšší záchyt pacientov s MDM, ktorí sú stále poddiagnostikovaní.

Využitie potyvírusov v rastlinných systémoch pre prezentáciu epitopov

The use of potyviruses for epitope presentation in plant expression systems

Doba trvania: 1.1.2025 - 31.12.2027
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Šubr Zdeno CSc.
Anotácia:Genóm vírusu šarky slivky (PPV) bol adaptovaný ako vírusový vektor pre prezentáciu cudzorodých epitopov na povrchu pseudovírusových častíc PPV v jeho rastlinných hostiteľoch, výsledky expresie však boli na rozdiel od voľných polypeptidov dosiaľ neuspokojivé. Projekt je zameraný na testovanie viacerých alternatívnych stratégií prípravy pseudoviriónov alebo vírusu podobných častíc (VLP), a to zmenou polohy klonovacieho miesta, duplikáciou génu pre kapsidový proteín (CP) vírusu či využitím CP iného potyvírusu, alebo dekonštrukciou vektora. V prípade úspechu ktorejkoľvek stratégie sa zameriame na optimalizáciu purifikácie pseudoviriónov alebo VLP z rastlinného materiálu.

Využitie prírodných rastlinných olejov a extraktov pre potravinové obaly

Application of natural plants oils and extracts for foodpackaging

Doba trvania: 1.7.2024 - 30.6.2027
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Kozics Katarína PhD.
Anotácia:Už dlhé roky sa veľká pozornosť venuje obalovým materiálom. Obal je vitálnou zložkou potravinového produktu, ovocia alebo zeleniny, nakoľko má za cieľ chrániť samotný produkt od vonkajších vplyvov pri transporte či skladovaní, má zabezpečiť čo najdlhšiu čerstvosť potraviny a zároveň slúži na prilákanie zákazníka. Vlastnosti obalov sa neustále zdokonaľujú a smerujú k takzvaným aktívnym obalom. Najnovšie obaly opakovane uzatvárateľné, udržateľné, ekologické, prispôsobené na mieru a vyrobené z rôznych materiálov (PET, PP, PS, papieroviny, MaterBi PLA) spĺňajú technické požiadavky. Našim cieľom je však vylepšiť biotechnologické parametre tak, aby boli inhibované devastačné/hnilobné procesy ovocia a zeleniny. Nosnou zložkou vyvíjaného obalového materiálu bude kompostovateľné a biodegradovateľné polyméry PLA/PHB. Bioaktívnu zložku predstavujú rastlinné oleje, esenciálne oleje, rastlinné extrakty získané z odpadového priemyslu zo spracovania ovocia alebo z rastlín. Na prípravu obalového materiálu sa využije technológia elektrostatického zvlákňovania. Pripravený materiál je nanovlákenná membrána, ktorá zabezpečí dostatočnú priestupnosť plynov a pár. Aplikáciou bioaktívnych zložiek s antimikrobiálnymi vlastnosťami do nosnej biologicky odbúrateľnej polymérnej matrice očakávame predlženú životnosť potraviny a jej bezpečnosť pre spotrebiteľa.

Vývoj a štandardizácia MR metód na detekciu a vyhodnocovanie metabolických a štrukturálnych adaptácií svalov na starnutie a cvičenie.

Development and standardization of MR-based methods for detecting and evaluating metabolic and structural adaptations of aging muscles to exercise.

Doba trvania: 1.9.2025 - 31.8.2029
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Ukropec Jozef DrSc.

Vývoj kauzálnych inferenčných algoritmov AI pre multi-omickú integráciu a identifikáciu základných príčin a ciest ich vplyvu pri rakovinovej hypoxii

Development of causal inference AI algorithms for multi-omics integration and identification of root causes and their impact patways in cancer hypoxia

Doba trvania: 1.1.2024 - 30.6.2026
Program: Plán obnovy EÚ
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Švastová Eliška PhD.

Vývoj nanosystémov na báze albumínu a dendriméru proti vírusu kliešťovej encefalitídy

Development of albumin and dendrimer-based nanosystems against tick-borne encephalitis virus

Doba trvania: 1.9.2024 - 30.6.2028
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Koči Juraj PhD.
Anotácia:Kliešťová encefalitída je klinicky významné arbovírusové ochorenie s potenciálne agresívnymi neurologickými následkami. Napriek dostupnému a účinnému očkovaniu sa počet prípadov TBE u ľudí za posledné tri desaťročia zvýšil. Až v 30 % symptomatických prípadov môže infekcia TBEV prejsť do chronickej a perzistujúcej encefalitídy. Žiaľ, pre chronických pacientov s oslabujúcou formou ochorenia nie je dostupná žiadna liečba proti TBEV. Jednou z najsľubnejších cieľových molekúl pre vývoj terapeutík proti TBEV je doména III vírusového obalového proteínu E. Doména III je exponovaná výlučne na povrchu viriónu a podieľa sa na prichytení vírusu a vstupe do bunky. Nanoprotilátky ťavy (Nb) a malé blokujúce peptidy (bP) zamerané na DIII ponúkajú elegantné nástroje na blokovanie vstupu vírusu vďaka svojej veľkosti a nízkym výrobným nákladom. Nb a bP však neprechádzajú hematoencefalickou bariérou (BBB), vysoko selektívnou bariérou, ktorá bráni bežným terapeutikám prechádzať z krvi do mozgu. Túto vlastnosť by bolo možné zlepšiť ich konjugáciou s biokompatibilnými nanonosičmi a BBB- homing peptidom (napr. angiopep-2). Zámerom projektu je vytvoriť nanosystémy založené na dendriméri PAMAM a ľudskom sérovom albumíne, ktoré budú značené navádzacím peptidom ako aj Nb alebo bP, ktoré blokujú TBEV. Cieľom projektu je aj hodnotenie stability, bezpečnosti a biodistribúcie nanosystémov in vitro a in vivo. Kvôli nedostatku reportérových TBEV in vivo plánujeme vytvoriť reportérový system, ktorý by uľahčil monitoring in vivo schopnosti nanosystému prechádzať cez BBB a neutralizovať vírus v CNS. Veríme, že nanosystémy vyvinuté a dôkladne vyhodnotené v tomto projekte by mohli byť využité v klinickom testovaní anti-TBEV terapeutík.

Záruka bezpečnosti krvi a krvných derivátov vo vzťahu k ochoreniam prenášaných komármi v ére glabálnej zmeny

Warranty of blood safety towards mosquito-borne viruses infections in the era of global change

Doba trvania: 1.7.2023 - 30.6.2027
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: RNDr. Čabanová Viktória PhD.

Získanie pravdivých informácií o kliešťoch.

Getting the right info on ticks.

Doba trvania: 1.7.2023 - 30.6.2027
Program: APVV
Zodpovedný riešiteľ: Mgr. Špitalská Eva DrSc.
Anotácia:Napriek faktu, že kliešť obyčajný, Ixodes ricinus je predmetom štúdií minimálne storočie, ostáva množstvo nezodpovedaných otázok týkajúcich sa ekológie tohto druhu. Viaceré aspekty základnej biológie a fenológie druhu sú stále nepreskúmané. Globálne zmeny v životnom prostredí vrátane klimatických zmien, zmeny charakteru krajiny a urbanizácie sa podieľajú nielen na zmenách v distribúcii kliešťov, ale ovplyvňujú aj bionómiu a sezónnu aktivitu kliešťov. Pijak lužný, Dermacentor reticulatus sa meniacim sa podmienkam rýchlo prispôsobuje a jeho areál rozšírenia sa zväčšuje. Je potrebné podrobne preskúmať oblasti, kde sa tieto kliešte vyskytujú (prírodné aj mestské biotopy), keďže ich areál výskytu sa v priebehu posledných desaťročí zmenil. Hustota kliešťov infikovaných patogénnymi agens je hlavným rizikovým faktorom pre ľudí, ktorí sú v danej oblasti vystavení kliešťom. V navrhovanom projekte bude sledovaná aktivita kliešťov číhajúcich na hostiteľa pomocou metódy „kliešťových záhradiek“, ale aj prostredníctvom zberu kliešťov z vegetácie metódou vlajkovania. Pomocou metodiky „kliešťových záhradiek“ budeme sledovať aj životný cyklus kliešťov a sezónnu aktivitu jednotlivých vývojových štádií, ako aj ich prežívanie. Keďže tieto dva druhy kliešťov sú považované za epidemiologicky najvýznamnejšie, zameriame sa aj na prevalenciu a výskyt kliešťov infikovaných patogénnymi agens nielen v prípade nenacicaných kliešťov, ale aj kliešťov cicajúcich na zvieratách. V dôsledku meniacich sa podmienok, budeme sledovať aj prenikanie a výskyt nepôvodných druhov kliešťov na Slovensku, keďže tieto druhy kliešťov môžu do našej oblasti zanášať nové patogény. Informácie získané výskumným tímom počas plnenia cieľov projektu, ako aj počas predchádzajúcich štúdií budú použité pri vývoji mobilnej aplikácie na identifikáciu kliešťov a vytvorení webovej stránky, ktorá prinesie benefity širokej verejnosti ako aj odborníkom na vyhodnotenie rizika infekcie patogénmi prenášanými kliešťami.

Zvládanie psychosociálnych stresových situácií u pacientov s depresívnou poruchou v závislosti od veku a odkrývanie zúčastnených mechanizmov

Coping with psychosocial stress situations in patients with depressive disorder in relation to age and unravelling the mechanisms involved

Doba trvania: 1.1.2023 - 31.12.2026
Program: VEGA
Zodpovedný riešiteľ: prof. PharmDr. Ježová Daniela DrSc.
Anotácia:Hlavným cieľom projektu je odhaliť rozdiely v neuroendokrinných zmenách dôležitých pre zvládanie stresových situácií u adolescentov a dospelých pacientov s depresívnou poruchou v porovnaní so zdravými jedincami. Dôraz sa bude klásť na odhalenie neurobiologickej podstaty vplyvu sociálnej bolesti a kognitívneho deficitu na rozvoj a priebeh depresívnej poruchy. Ďalším dôležitým cieľom je odhaliť nové endokrinné a imunitné koreláty a zmeny mozgovej plasticity, ktoré súvisia s depresívnou poruchou. Očakávané nálezy môžu napomôcť k identifikácii nových potenciálnych terapeutických cieľov a umožniť adekvátnu terapeutickú intervenciu s ohľadom na vek pacienta. Projekt má translačný charakter nakoľko prepája klinický a predklinický výskum. Predpokladané originálne výsledky významne rozšíria súčasné poznatky o patofyziológii depresie a zvládaní stresových situácii. Prispejú tiež k lepšej prevencii a cieleným prístupom k liečbe depresívnej poruchy vo vzťahu k veku.

Celkový počet projektov: 149