Zoznam medzinárodných projektov SAV
Biomedicínske centrum SAV, v. v. i.
A4L_BRIDGE Úloha a mutačný profil imunitných kontrolných bodov v hematologických nádoroch
A4L_BRIDGE The role and mutational profile of immune checkpoint molecules in hematologic malignancies
A4L_BRIDGE Expresia imunitných génov v neimunitných bunkách ľudskej kože ovplyvnených infekciou TBEV
A4L_BRIDGE Expression of immune genes in human skin non-immune cells affected by TBEV infection
| Doba trvania: |
1.11.2024 - 31.10.2025 |
| Program: |
Iné |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Štibrániová Iveta PhD. |
| Anotácia: | Kliešť, hostiteľ a patogén tvoria interaktívny trojuholník, v ktorom je koža hostiteľa miestom prvého kontaktu. Napriek svojej účinnej bariérovej funkcii je koža stále hlavným vstupným bodom pre väčšinu patogénov prenášaných kliešťami, vrátane vírusu kliešťovej encefalitídy (TBEV). TBEV vstupuje do kože cez sliny infikovaných kliešťov počas kŕmenia. TBEV sa zameriava na rezidentné kožné bunky, čo vedie k antivírusovej odpovedi aktivovanej vírusovou RNA. Prostredníctvom imunomodulácie podporujú kliešťové sliny replikáciu TBEV v mieste kŕmenia kliešťa. Jedna z najhojnejších neimunitných buniek kože – keratinocyty – nielenže predstavujú potenciálny rezervoár TBEV, ale sú tiež schopné vyvolať imunitnú odpoveď na TBEV, ktorá môže ovplyvniť jeho distribúciu do cieľových orgánov. Kožné keratinocyty budú ošetrené TBEV (Hypr) alebo extraktmi zo slinných žliaz (SGE) z neinfikovaných a TBEV (Hypr) infikovaných kliešťov dvoch druhov, Ixodes ricinus a Dermacentor reticulatus. Pomocou mRNA-seq chceme identifikovať expresiu génov spojených s vrodenými antivírusovými odpoveďami keratinocytov ľudskej kože infikovaných TBEV a objasniť potenciálny vplyv bioaktívnych zlúčenín v SGE kliešťov infikovaných TBEV na túto expresiu. Transkripčné profilovanie buniek ošetrených SGE z kliešťov bez TBEV v porovnaní s bunkami ošetrenými SGE infikovanými TBEV, získané v rámci tejto štúdie, by tiež poskytlo komplexný obraz o tom, ako kŕmenie kliešťov ovplyvňuje lokálne prostredie v priebehu času. |
A4L_BRIDGE Identifikácia molekúl viažúcich TGF-β 1 v slinách dospelých kliešťov Dermacentor reticulatus
A4L_BRIDGE Identification of TGF-β 1 binding molecule(s) in saliva of adult ticks Dermacentor reticulatus
Alliance4Life Preklenutie výskumnej a inovačnej priepasti v živých vedách
Alliance4Life Bridging the Research and Innovation Gap in Life Sciences
Alzheimerova choroba: Diagnostika, inovácie a translácia do klinickej praxe v strednej Európe
Alzheimer's Disease Diagnostics Innovation and Translation to Clinical Practice in Central Europe
Európska sieť pre kožné inžinierstvo a modelovanie
European Network for Skin Engineering and Modeling
Európske konzorcium pre Sigma-1 receptor ako terapeutický cieľ
European Network for Sigma-1 Receptor as a Therapeutic Opportunity
| Doba trvania: |
25.10.2024 - 24.10.2028 |
| Program: |
COST |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Cagalinec Michal PhD. |
| Anotácia: | Sigma-1 receptor (S1R) je ligandom regulovaný chaperónový proteín endoplazmatického retikula a reprezentuje nádejný terapeutický cieľ pre novovytvorené ligandy na liečbu neurodegeneratívnych a zápalových ochorení, rakoviny a bolesti. Sieť SIGMA-1 EUROPE bude spájať disciplíny a odborné znalosti v celej Európe s cieľom pokročiť vo výskume a identifikácii úlohy sigma-1 receptora vo fyziológii a patológiách, navrhnúť inovatívne ligandy S1R pre bunkovú biológiu a medicínu a v konečnom dôsledku vyškoliť mladých výskumníkov a inovátorov pre prehodnotenie doterajších názorov na tieto ochorenia a skúmanie nových a inovatívnych terapeutických príležitostí. |
Európske partnerstvo prehlbujúce spoluprácu v rámci Európskeho výskumného priestoru (ERA) pre zdravotnícky výskumu
European partnership fostering a European Research Area (ERA) for health research
Genomická nestabilita v bunkách od osôb vystavených RF zo základných staníc
Genomic instability in cells from persons exposed to RF from base stations
| Doba trvania: |
8.9.2021 - 31.12.2027 |
| Program: |
Iné |
| Zodpovedný riešiteľ: |
doc. Ing. Beliaev Igor DrSc. |
| Anotácia: | Vzorky krvi od osôb vystavených rádiofrekvenčnému žiareniu (RF) zo základných staníc budú analyzované na poškodenie DNA a genetickú nestabilitu s použitím komplexných techník a koncových bodov vrátane oxidačného poškodenia, kométového testu, chromozomálnych aberácií, mikronukleového testu, preleukemických génových fúzií. Údaje budú korelované s RF parametrami expozícií poskytnutými nemeckým partnerom. |
Identifikácia biologických markerov pre prevenciu a translačnú medicínu pri rakovine pankreasu
Identification of biological markers for prevention and translational medicine in pancreatic cancer
| Doba trvania: |
11.10.2022 - 10.10.2026 |
| Program: |
COST |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Smolková Božena PhD. |
| Anotácia: | Karcinóm pankreasu má vysokú úmrtnosť a predpokladá sa, že sa stane masívnym problémom verejného zdravia v Európe. COST TRANSPAN podporí výskum v oblasti genetických rizikových faktorov, stratifikácii rizika, identifikácii biomarkerov na včasnú detekciu a monitorovanie pacienta, objasňovaní biologických mechanizmov a funkčnej farmakogenomike pre personalizovanú medicínu.
Projekt bude realizovaný v nasledujúcich pracovných skupinách:
• Profilovanie rizika ochorenia. Táto pracovná skupina bude používať zárodočné genetické varianty, epigenetiku, transkriptomiku a environmentálne faktory na modelovanie rizika ochorenia a aplikovanie skóre stratifikácie rizika na lepší výber jedincov vhodných na skríning.
• Neinvazívne biomarkery. Táto pracovná skupina bude aplikovať najmodernejšie metódy tekutej biopsie na detekciu a charakterizáciu cirkulujúcich nádorových buniek a DNA, exozómov odvodených z nádoru, krvných doštičiek edukovaných nádorom, epigenetických markerov a bude testovať ich diagnostickú hodnotu na prekurzory karcinómu pankreasu.
• Profilovanie nádoru. Genomické, epigenomické a transkripčné profilovanie PC a jeho prekurzorov metódami celogenómovej analýzy bude využité na identifikáciu nových biomarkerov s prognostickou a prediktívnou hodnotou pre stratifikáciu pacientov.
• Funkčná genomika a terapia. Táto WG bude funkčne overovať kandidátne genetické varianty pomocou špičkových prístupov, ako je napríklad metóda CRISPR-Cas9. Budú využité nové prístupy, ako sú organoidy / avatary zebričiek, na implementáciu (chemo)terapeutických stratégií na báze personalizovanej medicíny. |
Informácia, kódovanie a biologická funkcia: Dynamika života
Information, Coding, and Biological Function: the Dynamics of Life
| Doba trvania: |
2.10.2023 - 18.9.2026 |
| Program: |
COST |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Farkaš Robert CSc. |
| Anotácia: | Predošlá aj súčasná práca našej skupiny sa zameriava na mechanistické aspekty apokrinnej sekrécie (AS), nového a v minulosti nesprávne opisovaného nekanonického a nevezikulárneho transportného a sekrečného mechanizmu. AS sme nečakane objavili v slinných žľazách Drosophila, najlepšie definovaného genetického modelového organizmu. Naším dlhodobým cieľom je odhaliť molekulárne a genetické determinanty AS za použitia unikátnych nástrojov dostupných u Drosophila. AS je fylogeneticky konzervovaná a je prítomná u všetkých metazoálnych eukaryontov vrátane ľudí. Naviac, zmeny v AS sú súčasťou najmenej dvoch tuctov ľudských ochorení. Materiál vylučovaný pri apokrinnej sekrécii je mimoriadne bohatý na proteíny (proteomická analýza dosiaľ odhalila >1500 proteínov), a táto tekutá „polievka“ obsahuje veľkú škálu imunokompetentných dormantných molekúl zymogénneho charakteru pripravených na podnet k okamžitej aktivácii. Všetky tieto úkazy robia AS veľmi dynamickým biologickým systémom. V súčasnosti sme jediným laboratóriom vo svete, ktoré sa zaoberá elementárnymi molekulárne-genetickými a štrukturálnymi vlastnosťami apokrinnej sekrécie per se. |
Integrované služby pre výskum prepuknutia infekčných chorôb
Integrated Services for Infectious Disease Outbreak Research
Interakcia medzi odmenou a stresom ako neurobiologický podklad odolnosti a rezistencie v duševnom zdraví a depresii: Rozsiahly translačný projekt
Reward-stress interactions as neurobiological substrate for resilience and vulnerability in mental health and depression: A translational large-scale project
| Doba trvania: |
1.1.2024 - 31.12.2026 |
| Program: |
ERANET |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Hlaváčová Nataša PhD. |
| Anotácia: | Je známe, že stres v skorom období života zvyšuje riziko vzniku mentálnych porúch, najmä depresie v dospelosti. Nie je však zrejmé, prečo sa u niektorých jedincov, ktorí boli vystavení stresu/traumatizujúcej udalosti v ranom období života rozvinie depresívna symptomatológia, zatiaľ čo iní ostávajú rezistentní. Cieľom projektu je odhaliť neurobehaviorálne faktory a biomarkery, ktoré stoja v pozadí asociácie medzi známymi environmentálnymi rizikovými faktormi a rozvojom
depresívnych symptómov v rôznom období života (mladí dospelí a starší dospelí).
Hlavnou hypotézou je, že nerovnováha medzi senzitivitou odmeňovacieho systému v striate a reaktivitou amygdaly počas stresu môže predstavovať
prediktor rozvoja psychopatologických symptómov resp. pre odolnosti voči mentálnym poruchám. Náš inovatívny translačný projekt spája A) predklinické modely stresu u hlodavcov, B) funkčné zobrazovanie magnetickou rezonanciou (fMRI) a elektroencefalografické (EEG) štúdie u ohrozených participantv vyselektovaných zo súborov z kohorty Mannheimského psychoepidemiologického centra) a ich rozšírenie o cielený zber údajov u mladých a starších ľudí vystavených stresu v skorom období života, C) behaviorálne štúdie na vzorke pacientov s depresiou , D) sofistikované štatistické metódy asociácií neuronových sietí a E) vytvorenie spoločnej databázy umožňujúcej testovanie všeobecných hypotéz pomocou rozsiahlych analýz.
|
KOMPLEXNÉ ONKOLOGICKÉ INFRAŠTRUKTÚTY 4 EUROPE
COMPREHENSIVE CANCER INFRASTRUCTURES 4 EUROPE
Kontrola translácie v Cancer European Network
Translational control in Cancer European Network
Liečba chorôb modifikáciou genómu
Genome Editing to Treat Humans Diseases
| Doba trvania: |
15.9.2022 - 14.9.2026 |
| Program: |
COST |
| Zodpovedný riešiteľ: |
prof. PharmDr. Ježová Daniela DrSc. |
| Anotácia: | Nedávne pokroky génového inžinierstva pri liečbe niektorých genetických porúch, infekčných chorôb či rakoviny v animálnych modeloch otvorili otázku možnosti liečby chorôb modifikáciou konkrétnych génov u ľudí. Nedostatočná integrácia získaných výsledkov z akademického a vedeckého prostredia pri vývoji nových liekov farmaceutickými firmami a absencia registračných štandardov potrebných na posúdenie pomeru rizika a prínosu zo strany regulačných agentúr bránia aplikácii týchto poznatkov pri liečbe chorôb. Hlavným cieľom projektu je získavať nové poznatky využívaním metód ovplyvnenia expresie génov pre budúcu liečbu vybraných ochorení u ľudí. K plneniu uvedeného cieľa prispeje spoločné úsilie farmaceutických spoločností, vedeckých inštitúcií, biotechnologických firmy a pacientskych organizácií. |
Medzinárodná sieť zameraná na in vitro modely hrubého čreva simulujúce interakcie sprostredkované črevnou mikrobiotou
International networking on in vitro colon models simulating gut microbiota mediated interactions
Modelovanie toxicity a odpovede na imunoterapiu pri liečbe rakoviny
Modelling immunotherapy response and toxicity in cancer
| Doba trvania: |
2.11.2022 - 1.11.2026 |
| Program: |
COST |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Smolková Božena PhD. |
| Anotácia: | Projekt COST IMMUNO-model má za cieľ podporiť výskum a inovácie v oblasti predklinických imuno-onkologických modelov s konečným cieľom napredovať v liečbe pacientov s rakovinou zlepšením ich výsledkov a kvality života. Bezprecedentnú zmenu, ktorú imunoterapia predstavovala v liečbe rakoviny, najlepšie ilustrujú výsledky dosiahnuté u predtým neliečiteľných malignít, ako je napríklad metastatický melanóm. Širokému používaniu týchto terapií však bráni ich obmedzená účinnosť a súvisiace toxicity. Na riešenie týchto problémov a na vývoj efektívnejších a bezpečnejších imunoterapií je prísne potrebné lepšie pochopenie komplexných interakcií medzi nádorovými bunkami a imunitným systémom. Jednou z najdôležitejších prekážok v imuno-onkologickom výskume je však nedostatok predklinických modelov, ktoré verne rekapitulujú ľudskú imunitu a prispievajú k identifikácii nových terapeutických cieľov, charakterizujú biomarkery terapeutickej odozvy a toxicity a vytvárajú spoľahlivé údaje o synergiách liekov. Model IMMUNO spojí európskych výskumníkov z rôznych sektorov (akademická obec, klinický priemysel, priemysel) so spoločným cieľom vytvoriť sieť, ktorá podporuje imuno-onkologický výskum špecifickou podporou zdieľania, štandardizácie a aplikácie predklinických modelov imunoterapie.
|
Nanotechnológie pre inovatívne terapeutické prístupy pre rakovinu
Nanobiotechnologies for Innovative Therapeutic Approaches for Cancer
| Doba trvania: |
1.11.2023 - 31.10.2028 |
| Program: |
Horizont Európa |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Matúšková Miroslava PhD. |
| Anotácia: | NANOBIO4CAN je kooperatívny výskumný a školiaci program excelentnosti pre nábor 24 postdoktorandov v oblasti využitia nanomedicíny u onkologických ochorení. Koordinátorom je Centrum pre výskum a aplikácie nanotechnológií Univerzity Sabanci (SUNUM) v spolupráci s 3 poprednými tureckými výskumnými centrami v oblasti biologických vied: Výskumné centrum TUBITAK Marmara (TUBITAK-MAM), výskumné centrum univerzity Koç pre translačnú medicínu (KUTTAM) a Izmir Centrum pre biomedicínu a genóm (IBG). Hlavným cieľom programu je zvýšiť potenciál a perspektívu budúcej kariéry prijatých postdoktorandov poskytovaním vysoko interdisciplinárneho a medzisektorového výskumného prístupu v oblasti nanobiotechnológie a výskumu rakoviny pri zachovaní najvyšších štandardov kvality výskumu a plnení všetkých princípov otvorenej vedy. Program tiež ďalej posilní prístup založený na spolupráci všetkých zúčastnených subjektov tým, že upevní ich excelentnosť a vynikajúce výsledky a poskytne ideálne prostredie pre potenciálnych postdoktorandských výskumných pracovníkov v rámci výskumných priorít programu. |
Presná medicína pri rakovine žlčových ciest
Precision medicine in biliary tract cancer
Prevencia, predvídanie a zmierňovanie rizika ochorenia prenášaného kliešťami pomocou protokolu DAMA
Prevention, anticipation and mitigation of tick-borne disease risk applying the DAMA protocol
| Doba trvania: |
18.10.2022 - 17.10.2026 |
| Program: |
COST |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Špitalská Eva PhD. |
| Anotácia: | Znovuobjavujúce sa infekčné ochorenia (EID) predstavujú hrozbu pre každú krajinu v dôsledku zmeny klímy, rozširovaniu ľudskej populácie, urbanizácie a globalizácie. Na základe teoretických očakávaní sa EID považovali za zriedkavé a nepredvídateľné, keďže infikovanie nových hostiteľov vyžaduje nové genetické mutácie. Nový koncepčný rámec sa vyvíjal takmer 40 rokov a nedávno bol sformulovaný spôsob, ktorý vedie priamo k protokolu na prijímanie proaktívnych alebo predvídavých krokov pri zvládaní EID. Tento rámec sa nazýva Štokholmská paradigma, ktorá ukazuje, že hlavným spúšťačom vznikajúcej choroby, teraz aj v minulosti, bola zmena klímy. Cieľom akcie PRAGMATICK COST je rozšíriť poznatky a podporovať aplikáciu Štokholmskej paradigmy s cieľom predvídať a zmierňovať riziko ochorenia spojeného s kliešťami a kliešťami prenášanými patogénmi (TBP) pod antropogénnym tlakom a meniacou sa klímou. Bude uplatňovaný komplexný protokol DAMA (Document, Assess, Monitor, Act), ktorý umožňuje „predvídať a zmierňovať“ vznikajúce choroby. Hlavný dôraz sa kladie na mestské kliešte a ohniská TBP. PRAGMATICK sa zameria na vyhľadávanie nových kliešťov a patogénov prenášaných kliešťami skôr, ako oni nájdu nás. Uplatnením „občianskej vedy“ a podporou budovania kapacít v oblasti prevencie kliešťov a chorôb prenášaných kliešťami COST akcia nakoniec povedie k novým a lepším poznatkom o potenciálnych hrozbách súvisiacich s touto dôležitou skupinou vektorov v celej Európe. |
Prevencia, predvídanie a zmierňovanie rizika ochorenia prenášaného kliešťami pomocou protokolu DAMA
Prevention, anticipation and mitigation of tick-borne disease risk applying the DAMA protocol
Úloha ektodomény CA IX v nádorovom raste a metastázovaní
Role of the CA IX ectodomain in tumor growth and metastasis
Úloha tukového tkaniva a svalov v regulácii metabolickej flexibility: Skúmanie nových prediktorov úspešnej intervencie do životného štýlu obéznych pacientov
The role of Adipose tissue and muscle crosstalk in the regulation of METabolic flexibility: exploration of novel predictors of the lifestyle Intervention Success in patients with obesity
Včasná detekcia spinocelulárneho karcinómu pažeráka pomocou Cytosponge v spojení s molekulárnymi biomarkermi a strojovým učením
Early detection of esophageal squamous cell carcinoma with the Cytosponge coupled with molecular biomarkers and machine learning
Výskum malárie voľne žijúcich zvierat
Wildlife Malaria Network
Výskum vybraných triorganocíničitých zlúčenín potenciálne účinkujúcich ako ligandy nukleárnych retinoidných X receptorov v ľudských karcinómoch prsníka pomocou in silico a in vitro metodologických prístupov
Investigation of selected triorganotin compounds potentially acting as nuclear retinoid X receptor ligands in breast cancer derived cell lines by in silico and in vitro approaches
Vznik zoonóz v poškodených a obnovených lesných ekosystémoch
Zoonoses Emergence across Degraded and Restored Forest Ecosystems
Zdravý proteóm pre zdravé telo: zacielenie proteolýzy na remodeláciu proteómu
A sound proteome for a sound body: targeting proteolysis for proteome remodeling
| Doba trvania: |
1.11.2023 - 6.10.2025 |
| Program: |
COST |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Farkaš Robert CSc. |
| Anotácia: | Precízna kontrola proteínovej aktivity a degradácie prostredníctvom prirodzených inhibítorov a proteolytických efektorov je nepochybne jednou z rozhodujúcich ciest ako je funkcia kľúčových komponentov apokrinnej sekrécie regulovaná. Našou snahou je prispieť multidisciplinárnej komunite v projekte ProteoCure (CA20113) našimi experimentami a poznatkami o proteolýze a fungovaní proteáz a ich inhibítorov v apokrinnom sekréte, ktorý predstavuje nový dosiaľ necharakterizovaný typ sekrétu v živočíšnej ríši. Naše proteomické úsilie pri identifikácii sekretorických komponentov prináša rad novýh poznatkov o veľmi komplexnom biologickom fenoméne kde okrem proteáz a ich inhibítorov účinkuje cca 1500 ďalších dosiaľ nami odhalených zložiek, mnohé s neznámou funkciou. To otvára perspektívu poznania viacerých interakcií proteáz a proteázových inhibítorov s ďalšími na obraných mechanizmoch zúčastnenými signálnymi dráhami. |
Zvrátenie epitranskriptomických zmien pre chemosenzibilizáciu nádorov pankreasu
Reversing Epitranscriptomic Alterations for CHemosensitization of Pancreatic Cancer
Celkový počet projektov: 30
Databáza medzinárodných projektov