Čo ponúkame - Najlepšie výsledky

Gény eukaryotov obsahujú intróny, ktoré prerušujú kódujúce oblasti genetickej informácie – exóny – a musia byť v procese tvorby mediátorovej RNA odstránené. Tento proces zabezpečuje vysoko dynamický komplex – spliceozóm, ktorý je formovaný veľkým množstvom proteínov a ďalších molekúl. Kritickým krokom jeho formovania je správne rozpoznanie intronických hraníc – miest zostrihu, na ktorom sa významne podieľa zostrihový faktor PUF60. Táto molekula obsahuje dve domény rozpoznávajúce RNA (RRM) a uľahčuje asociáciu ďalších zostrihových faktorov s primárnym transkriptom. Nedostatok PUF60 (PD) súvisí s oneskoreným vývinom, mentálnym postihnutím a poruchami funkcie obličiek, miechy a srdca, ale patogenéza ochorenia nie je dosiaľ objasnená. Použitím RNA NGS riešiteľky identifikovali a charakterizovali gény/exóny regulované PUF60 proteínom, ktorý pôsobí prevažne ako ich aktivátor (obr. II-4). Sledovali tiež funkčné dôsledky vrodených mutácií PUF60 na zostrih RNA. Zistili, že mutácie postihujú selekciu kompetujúcich zostrihových miest regulovaných PUF60 a že heterogenita zárodočných mutácií rovnakej RRM domény môže zvyšovať fenotypickú variabilitu na úrovni selekcie zostrihových miest (obr. II-5).

 

• KRÁLOVIČOVÁ, JANA – ŠEVČÍKOVÁ, IVANA – STEJSKALOVÁ, EVA – OBUCA, MINA – HILLER, MICHAEL – STANĚK, DAVID – VOŘECHOVSKÝ, IGOR. PUF60-activated exons uncover altered 3' splice-site selection by germline missense mutations in a single RRM. In Nucleic Acids Res. 2018 Jul 6; 46(12): 6166-6187. doi: 10.1093/nar/gky389.