Témy doktorandského štúdia
Parazitologický ústav SAV, v. v. i.
Názov témy
Mapovanie rozšírenia motolíc (Trematoda) s epidemiologickým a veterinárnym významom v strednej Európe pomocou environmentálnej DNA.
Program DŠ
Parazitárne choroby zvierat, denná forma
Rok prijímania
2025
Meno školiteľa/-ky
MVDr. Daniel Barčák, PhD.
Kontakt:
Prijímajúca škola
Univerzita veterinárskeho lekárstva a farmácie v Košiciach
Stručná anotácia
Dizertačná práca je zameraná na objasnenie aktuálneho rozšírenia motolíc spôsobujúcich ochorenia ľudí a rýb v strednej Európe pomocou neinvazívnej identifikácie parazitárnej DNA vo vode. Cieľovými skupinami parazitov sú i) vtáčie schistosómy, spôsobujúce cerkáriovú dermatitídu, ii) heterofyidné a opistorchidné motolice ako pôvodcovia črevných a pečeňových trematodóz a iii) motolice rodov Diplostomum, Posthodiplostomum a Sanguinicola, ktoré sú patogénne pre sladkovodné ryby. Environmentálna DNA bude extrahovaná zo vzoriek vody odobratých z vodných plôch využívaných na rekreáciu alebo chov rýb. Prítomnosť DNA cieľových skupín parazitov v týchto vzorkách bude potvrdená PCR amplifikáciou krátkych úsekov DNA využívaných na druhovú identifikáciu, Next-Generation sekvenovaním pool-ovaných PCR produktov a porovnaním získaných sekvencií s údajmi v databáze GenBank. Účinnosť tejto neinvazívnej metódy bude porovnaná s tradičným parazitologickým vyšetrením hostiteľov, pri ktorom budú vodné slimáky a ryby podrobené parazitologickej pitve s cieľov získať vývojové štádia motolíc (cerkárie a metacerkárie). Získané poznatky umožnia lepšie využitie potenciálu eDNA skríningu v parazitológii.