Informačná stránka organizácie SAV
Projekty
Centrum biológie rastlín a biodiverzity SAV, v. v. i.
Medzinárodné projekty
Soil Biodiversit - Biodiversa+ pilotný projekt monitoringu biodiverzity - Subpilot 2.6.3. Prieskum pôdnej diverzity v chránených prirodzených lesoch
The European Biodiversity Partnership - Sub-task 2.6.3 Pilot on soil biodiversity in protected, near natural forests
| Doba trvania: |
1. 1. 2023 - 31. 12. 2026 |
| Evidenčné číslo: | 101052342 |
| Program: |
Horizont Európa |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Caboň Miroslav PhD. |
| Anotácia: | Biodiversa+ je európske spolufinancované partnerstvo podporujúce excelentný výskum biodiverzity s vplyvom na politiku a spoločnosť.
Biodiversa+ je súčasťou Európskej stratégie pre biodiverzitu do roku 2030, ktorej cieľom je do roku 2030 nasmerovať európsku biodiverzitu na cestu k obnove.
Cieľom partnerstva je prepojiť vedu, politiku a prax pre transformačné zmeny. V súčasnosti zhromažďuje 80 výskumných agentúr a financovateľov a tvorcov environmentálnej politiky zo 40 európskych a pridružených krajín, aby pracovali na 5 hlavných cieľoch: (I) Plánovanie a podpora výskumu a inovácií v oblasti biodiverzity prostredníctvom spoločnej stratégie, každoročných spoločných výziev na výskumné projekty a budovanie kapacít. činnosti , (II) Vytvorenie siete harmonizovaných schém na zlepšenie monitorovania biodiverzity a ekosystémových služieb v celej Európe, (III) Prispenie k špičkovým znalostiam pre zavádzanie riešení založených na prírode a hodnotenie biodiverzity v súkromnom sektore, (IV) Zabezpečiť účinnú vedecky podloženú podporu pre tvorbu a implementáciu politiky v Európe, (V) Posilniť význam a vplyv celoeurópskeho výskumu na biodiverzitu v globálnom kontexte. |
| Web stránka projektu: | https://www.biodiversa.eu/biodiversity-monitoring/pilot/ |
Biodiversa+ pilotný projekt monitoringu biodiverzity - Subpilot monitoring inváznych druhov
The European Biodiversity Partnership - IAS Subpilot
| Doba trvania: |
1. 1. 2023 - 31. 12. 2027 |
| Evidenčné číslo: | 101052342 |
| Program: |
Horizont Európa |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Šingliarová Barbora PhD. |
| Anotácia: | Projekt monitorovania druhov bude pozostávať z dvoch modulov: modul 1 zameraný na rastliny a modul 2 zameraný na hmyz. Hlavný dôraz je kladený na invázne nepôvodné druhy, ale ďalší dôraz sa bude klásť na širšiu skupinu nepôvodných druhov, ktorých vplyv nie je úplne objasnený. Tento širší rozsah by mal pripraviť na odhalenie budúcich inváznych cudzích druhov. Oba moduly využívajú rozpoznávanie obrazu pomocou počítačového videnia a modelov hlbokého učenia na nákladovo efektívnu a rýchlu detekciu druhov vzbudzujúcich obavy. Tieto metódy sa pri efektívnom fungovaní spoliehajú na tréningové dáta o dotknutých druhoch. Takéto údaje sú k dispozícii v GBIF, ako aj v pilotných projektoch z Dánska (rastliny a hmyz) a Francúzska a Švajčiarska (rastliny), ale v rámci tohto pilotného programu sa budú zbierať ďalšie údaje, aby sa zabezpečili presné modely detekcie do budúcnosti. V prípade modulu 1 bude snaha monitorovať zavlečenie aj rozšírenie. Týmto spôsobom bude pilotný program relevantný v kontexte introdukčných lokalít, ako aj pre zber dodatočných tréningových údajov na zlepšenie modelov rozpoznávania obrazu. |
| Web stránka projektu: | https://www.biodiversa.eu/biodiversity-monitoring/pilot/ |
COPYTREE - Európska sieť pre inovatívne klonovanie drevín
European Network for Innovative Woody Plant Cloning
| Doba trvania: |
24. 10. 2022 - 23. 10. 2026 |
| Evidenčné číslo: | COST CA21157 |
| Program: |
COST |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Perniš Miroslav PhD. |
| Anotácia: | In vitro metódy množenia drevín zažívajú presun z akademických výskumných laboratórií do komerčnej sféry, kde sa ďalej vyvíjajú v množstve aplikácií v záhradníctve a lesníctve ako reakcia na klimatické zmeny a meniace sa celosvetové nároky na spotrebu potravín a dreva. Návrh projektu sa zaoberá výzvami, ktorých riešenie môže mať významný vedecký, spoločenský a ekonomický dopad. Najdôležitejšími sú: prekonanie nepoddajnosti niektorých drevín pri in vitro klonovaní; nájdenie efektívnych nástrojov na diagnostiku, ozdravovanie a uskladnenie zdravých kultúr; zvýšenie produkcie kvalitných klonov za primeranú cenu a vyhodnotenie technologických rizík a spôsobu komunikácie s verejnosťou a komerčným sektorom za účelom akceptovania, ocenenia, investovania a aplikácie in vitro klonov v praxi.
Hlavný cieľ akcie COST CA21157 je teda zameraný na riešenie závažných výskumných výziev in vitro klonovania drevín a jeho akceptácie verejnosťou ako i podporu komerčnej aplikácie výskumu. Výsledkom má byť vytvorenie siete spájajúcej európskych výskumníkov z rôznych oblastí, ktorí sa budú podieľať na riešení vyššie spomenutých otázok zdieľaním inovácií, vývojom nových stratégií výskumu, vyhodnocovaním technologických rizík a zlepšením informovanosti verejnosti a komunikácie s politickými orgánmi, zainteresovanými stranami, a trhom.
|
| Web stránka projektu: | https://www.cost.eu/actions/CA21157/ |
E-NICHE - Európska sieť v chemickej ekológii: transformácia súčasného života k udržateľnosti
European Network In CHEmical Ecology: translating the language of life into sustainability
Resistance - LIFE Resistance
LIFE Resistance
| Doba trvania: |
1. 6. 2024 - 30. 9. 2030 |
| Evidenčné číslo: | LIFE23-NAT-SK-LIFE-RESISTANCE/101148377 |
| Program: |
LIFE |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Šibíková Mária PhD. |
| Anotácia: | Projekt sa zameriava na potlačenie inváznych druhov rastlín v dunajských lužných biotopoch komplexnými opatreniami. Prirodzene je teda projekt spoluprácou organizácií zo Slovenska aj Maďarska. Prostredníctvom obnovenia vodného režimu a pôvodného druhového zloženia rastlín lužných lesov, ako aj prinavrátením pastvy na projektové lokality vytvoríme podmienky nevhodné pre invázne rastliny, ktoré potláčajú našu pôvodnú biodiverzitu. Pastvu obnovíme v spolupráci s lokálnymi farmármi. Súčasťou projektu je aj vývoj a testovanie softvéru na včasnú detekciu porastov inváznych druhov a ich rozširovania použitím satelitných a dronových snímok. Vplyv revitalizačných opatrení na živé organizmy budeme analyzovať prostredníctvom environmentálnej DNA Projekt zahŕňa aj viaceré inovatívne prístupy, ako napríklad vypestovanie sadeníc pôvodných druhov drevín lužných lesov s lokálnymi ektomykoríznymi hubami, ktoré budú odolné voči nepriaznivým podmienkam a budú môcť inváznym druhom konkurovať, alebo odstraňovanie invázneho pajaseňa žliazkatého pomocou jeho prirodzeného nepriateľa – húb Verticillium sp. |
| Web stránka projektu: | https://broz.sk/en/projekty/life-resistance/ |
PlantWallK - Multidisciplinárne konzorcium pre akceleráciu poznania bunkovej steny
Multidisciplinary consortium to accelerate plant cell wall knowledge (PlantWallK)
| Doba trvania: |
26. 9. 2025 - 25. 9. 2029 |
| Evidenčné číslo: | COST CA24116 |
| Program: |
COST |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Mravec Jozef PhD. |
| Anotácia: | Rastlinná bunková stena bola jedným z prvých biologických objektov pozorovaných pod mikroskopom v 17. storočí. Hoci poznanie tejto komplexnej a dynamickej štruktúry výrazne pokročilo, pretrvávajúce medzery v porozumení stále bránia plnému využitiu potenciálu tohto dôležitého zdroja v poľnohospodárstve, potravinárstve, výrobe krmív, bioenergetike a materiálových vedách. Cieľom tejto Akcie je spojiť vedcov z odlišných disciplín s cieľom prekonať bariéry v chápaní komplexnej povahy bunkových stien. Na to sú potrebné holistické a koordinované prístupy na získanie hlbších poznatkov o zložení, štruktúre, biomechanike a regulácií bunkových stien. Multidisciplinárna spolupráca môže pomôcť identifikovať a prekonať súčasné výskumné úzke miesta, ako aj zlepšiť výskumné metódy vizualizácie bunkových stien, ich analýzy, výpočtov a modelovania. Cieľom tejto COST Akcie je navrhnúť stratégie na riešenie nedostatkov v poznaní, začať budovať dátovú a znalostnú infraštruktúru v danej oblasti a posilniť multidisciplinárne výskumné úsilie prostredníctvom efektívneho sieťovania a spolupráce. Výskum rastlinných bunkových stien bude pokračovať prostredníctvom spolupráce, mobility a vytvárania spoločnej komunikácií na zníženie fragmentácie, čím vznikne moderná výskumná komunita. Táto Akcia poskytne členským štátom COST konkurenčnú výhodu a prispeje k tomu, aby EÚ dosiahla ciele stanovené v kľúčových dokumentoch. |
| Web stránka projektu: | www.plantwallk.org |
LIFE23-NAT-SK-LI - Obnova prioritných trávnatých biotopov na Slovensku a v Rumunsku
Restoration of priority grassland habitats in Slovakia and Romania
| Doba trvania: |
1. 6. 2024 - 30. 9. 2031 |
| Evidenčné číslo: | LIFE23-NAT-SK-LIFE DIVERSEED/101148306 |
| Program: |
LIFE |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Dúbravková Daniela PhD. |
| Anotácia: | LIFE DIVERSEED je 7-ročný projekt zameraný na obnovu prioritných trávnatých biotopov spoločných medzi Slovenskom a Rumunskom. Prináša inovatívne techniky mapovania a obnovy, ktoré budú mať široký a dlhodobý vplyv aj po ukončení projektu. Zameria sa na 10 biotopy (9 prioritných biotopov uvedených v prílohe I k smernici o biotopoch a jeden ohrozený biotop v červenom zozname európskych biotopov) v 33 územiach európskeho významu, 30 na Slovensku a 3 v Rumunsku. Najmenej 920 ha prioritných trávnatých biotopov sa obnoví priamo a ďalších 1 200 ha nepriamo prostredníctvom replikácií. Okrem toho projekt významne podporí budúcu obnovu trávnych porastov tým, že demonštruje a zanechá udržateľnú kapacita na zber semien z prioritných biotopov a vypracuje protokoly pre zber a opätovný výsev osiva v chránených trávnatých porastoch. Lokálne zmesi semien nie sú v súčasnosti dostupné na Slovensku a ani v Rumunsku a sú potrebné na uspokojenie rastúceho dopytu na obnovu lúk. DIVERSED bude úzko spolupracovať s poľnohospodármi a združeniami poľnohospodárov, environmentálnymi agentúrami a vnútroštátnymi orgánmi, ktoré o to vyjadrili záujem. Obnova bude využívať klasické opatrenia vrátane pastvy, kosenia a odstraňovania inváznych druhov. Inovatívnym prístupom bude navyše výsev semien, čím sa obnoví druhové zloženie rastlín v trávnatých porastoch, čo bude zároveň prínosom aj pre opeľovače. Rastliny a opeľovače sa budú monitorovať s cieľom posúdiť vplyv projektu na tieto zložky biodiverzity. Dôležité je, že projekt tiež riadne zmapuje a posúdi kritický úbytok trávnatých porastov v Rumunsku, ktorý je podhodnotený z dôvodu nedostatočnej mapovacej kapacity s použitím najnovších techník mapovania. Výsledky projektu pomôžu zlepšiť nastavenie agroenvironmentálnych programov v Rumunsku, ktoré v súčasnosti nedokážu zastaviť úbytok trávnych porastov. Uskutoční sa mnoho aktivít pre dobrovoľníkov, školy a širokú verejnosť, ako aj práca s úradmi a rozsiahla odborná príprava poľnohospodárov. Zmesi semien budú navrhnuté tak, aby sa mohli ďalej replikovať. |
| Web stránka projektu: | https://broz.sk/projekty/life-diverseed/ |
Od pôvodných po nepôvodné: Rozuzlenie ekologickej dichotómie rozšírovania areálu a jej dôsledky
From Native to Non-Native: Unraveling the Ecological Dichotomy of Range Expansion and Its Implications
| Doba trvania: |
1. 1. 2025 - 31. 12. 2026 |
| Evidenčné číslo: | Open-Mob-2024-12 |
| Program: |
Open Mobility |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Šibík Jozef PhD. |
| Anotácia: | Biologické invázie, spôsobené globálnym prepojením a ľudskou činnosťou, sú významným problémom, najmä najmä v dôsledku rozširovania nepôvodných druhov vrátane stromov. Pochopenie interakcií medzi druhmi a environmentálnymi faktormi limitujúcich vytváranie spoločenstiev je kľúčové pre predpovedanie invazívneho potenciálu vybraných druhov a dopadov na ekosystémy, s širšími dôsledkami pre ekológiu spoločenstiev. Na Slovensku sa etablovali niektoré nepôvodné druhy stromov, ako napr. agát (Robinia pseudoacacia) a javor jaseňolistý (Acer negundo). Agát, pôvodom z juhovýchodnej časti USA, sa vyskytuje zvyčajne v blízkosti riek a okrajov lesov, zatiaľ čo javorovec sa nachádza v rôznych rastlinných spoločenstvách Severnej Ameriky. Oba druhy vykazujú invazívne tendencie, najmä v odlesnených a požiarom postihnutých oblastiach, a v súčasnosti sú výrazne rozšírené v Európe. Duglaska tisolitá (Pseudotsuga menziesii) je ďalším príkladom druhu, bežne sa vyskytujúcim v horách USA, zatiaľ čo v Európe je často vysádzaná. Pochopenie histórie vytvárania spoločenstiev je zásadné pre porozumenie rozmanitosti, zloženiu, funkcii a reakciám na invázie. Teória zostavovania spoločenstva naznačuje, že konkurencia a filtrovanie prostredia formujú rozdelenie vlastností. Filtrovanie prostredia významne ovplyvňuje úspešné rozširovanie nepôvodných druhov v pôvodných rastlinných spoločenstvách, aj keď rozlišovacie vlastnosti sa líšia. Aby sme vyplnili medzeru o druhovom zložení v spoločenstvách s edifikátormi nepôvodnými druhmi stromov, dali sme si za cieľ zhromaždiť dáta pomocou dvojičkových porovnávacích plôch v pôvodných a nepôvodných porastoch na oboch kontinentoch berúc do úvahy aj živočíšnu (vtáky, netopiere) zložku. |
MSCA4Ukraine 202 - Odhalenie zložiek redox proteómu pšenice, ktoré definujú odolnosť voči suchu
Unveiling components of wheat redox proteome that defines drought resilience
| Doba trvania: |
1. 10. 2025 - 30. 9. 2028 |
| Evidenčné číslo: | SoE/2025/61/MSCA4Uk |
| Program: |
Seal of Excelence |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Lakhneko Olha PhD. |
PANGEOS - Pan-Európska sieť zelenej dohody o poľnohospodárstve a vedy o lesníctve a pozorovaní Zeme
Pan-European Network of Green Deal Agriculture and Forestry Earth Observation Science
| Doba trvania: |
6. 11. 2023 - 5. 11. 2027 |
| Evidenčné číslo: | CA22136 |
| Program: |
COST |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Galgóci Martin PhD. |
| Anotácia: | Udržateľnosť biodiverzity v Európe je ohrozená zmenami životného prostredia v spojitosti so zmenou klímy. Poľnohospodárske a lesné ekosystémy patria medzi ekosystémy väčšinou prepojené s ľudským zdravím a blahobytom vďaka sociálnoekonomickým službám, ktoré poskytujú. Či už teplo, sucho, extrémne počasie alebo biotické stresory. Konvenčné poľnohospodárstvo a lesníctvo dnes nie je pripravené na budúce nepredvídateľné klimatické scenáre, rastúcu populáciu, meniace sa spotrebiteľské návyky produktov zo zmienených ekosystémov, a preto tradičné manažérske postupy si vyžadujú celkové prehodnotenie. Ciele stanovené spoločnosťou PANGEOS sa rozvíjajú v nadväznosti na strategické ciele Európskej zelenej dohody (GREEN DEAL). V prípade poľnohospodárstva zahŕňa zaistenie potravinovej bezpečnosti vzhľadom na zmenu klímy, posilnenie odolnosti potravinového systému EÚ a zníženie environmentálnej a klimatickej stopy poľnohospodárskeho sektora EÚ smerom ku konkurencieschopnému a udržateľnému využívaniu a riadeniu zdrojov. V prípade lesníctva ide o ochranu, obnovu a rozširovanie lesov v EÚ s cieľom bojovať proti zmene klímy, zvrátiť stratu biodiverzity a zabezpečiť odolné a multifunkčné lesné ekosystémy. Na podporu týchto cieľov sa spoločnosť PANGEOS zameriava na využitie najmodernejších technológií diaľkového snímania (RS) na pokrok v pracovných tokoch fenotypizácie v teréne, precíznych poľnohospodárskych/lesníckych postupoch a rozsiahlejších prevádzkových hodnoteniach pre udržateľnejšie riadenie európskych prírodných zdrojov. V rámci tejto akcie navrhujeme preklenúť často priepastné rozdiely medzi najmodernejšími technológiami a aplikovanými vedami. V neposlednom rade, priamo poskytovať služby a informovať akademických pracovníkov, mladých výskumníkov a inovátorov v cieľovej inkluzívnosti. Tiež sa plánujeme zamerať na susedné krajiny, koncových používateľov (napr. poľnohospodárov, lesníkov), a zainteresované strany v priemysle. Uplatnenie by mohli mať výstupy pri tvorbe politík spojením odborníkov a aplikácií RS v (1) terénnej fenotypizácii, (2) presnom a regeneratívnom poľnohospodárstve, (3) trvalo udržateľnom hospodárení s pôdou v komplexnej európskej krajine a (4) analýze a štandardizácii neistoty. |
PectoProbe - PectoProbe: Zaplnenie medzery v repertoáru prób zacielených na bunkové steny novými prístupmi
PectoProbe: Filling the gaps of cell wall-directed probe repertoire by novel approaches
| Doba trvania: |
1. 1. 2025 - 31. 12. 2026 |
| Evidenčné číslo: | CSIC-SAS-2024-04 |
| Program: |
Mobility |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Mravec Jozef PhD. |
| Anotácia: | Molekulárne próby, ako sú monoklonálne protilátky proti glykanom, zohrávajú už desaťročia kľúčovú úlohu pri štúdiu rastlinných bunkových stien in situ. Napriek tomu stále existujú limitujúce faktory, ktoré bránia štúdiu dynamiky bunkovej steny v reálnom čase in vivo. Projekt PectoProbe si kladie za cieľ etablovať slovensko-španielsku spoluprácu s cieľom zaplniť problematické medzery v repertoári prób na štúdium bunkovej steny a podporiť lepšie prepojenie vedeckej komunity prostredníctvom organizácie tematicky zameraného workshopu a výskumnej mobility. Zameriame sa na jednu z najdôležitejších zložiek bunkovej steny určujúcich jej vlastnosti – homogalakturonán – a na jeho málo preskúmanú chemickú modifikáciu. Predpokladáme, že acetylácia homogalakturonánu (HG) udržiava integritu bunkovej steny počas invazívneho rastu hubového patogéna Fusarium oxysporum a zároveň môže predstavovať jeden z markerov vysokej alebo nízkej embryogénnej kapacity kalusov ihličnanov. Na riešenie týchto otázok využijeme nové prístupy k vývoju sond, ako je generovanie in vitro selektovaných chemických protilátok – DNA aptamérov – a ich dôkladnú charakterizáciu pomocou rôznych biochemických metód. Napokon demonštrujeme použiteľnosť vyvinutých nástrojov molekulárneho rozpoznávania pri štúdiu dynamiky bunkovej steny in vivo. |
RECROP - Reprodukčné zvýšenie odolnosti plodín voči extrémnemu podnebiu
Reproductive Enhancement of CROP resilience to extreme climate
| Doba trvania: |
4. 10. 2023 - 3. 10. 2027 |
| Evidenčné číslo: | CA22157 |
| Program: |
COST |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Lakhneko Olha PhD. |
| Anotácia: | Klimatické zmeny sú hrozbou pre potravinovú bezpečnosť, keďže extrémne poveternostné javy znížia úrodu všetkých hlavných plodín. Obilniny a ovocné plodiny, ktoré tvoria jadro ľudskej stravy, sú obzvlášť zraniteľné v dôsledku citlivosti procesu pohlavnej reprodukcie na abiotický stres. V dôsledku toho existuje naliehavá potreba vytvoriť elitné odrody so zvýšenou odolnosťou voči stresu vo fáze reprodukcie rastlín. RECROP (Zvýšenie odolnosti plodín vo fáze reprodukcie na extrémne klimatické podmienky) je tím agronómov, fyziológov, genetikov, biológov a bioinformatikov z verejných organizácií a súkromného sektora, ktorý bude využívať holistické prístupy na pochopenie základov citlivosti plodín a navrhovať riešenia na zvýšenie úrody plodín v ére klimatických zmien. Cieľom RECROP je: (1) identifikovať genetické, molekulárne a fyziologické komponenty citlivosti reprodukčnej fázy plodín, (2) navrhnúť plán na tvorbu odolných plodín a (3) poskytnúť usmernenia pre exogénne ošetrenia na zvýšenie odolnosti udržateľným spôsobom a posúvať hranice geneticky zdedenej tolerancie stresu. Ciele budú plniť štyri pracovné skupiny (PS), ktoré okrem výskumných diskusií budú organizovať školiace kurzy, workshopy, konferencie a iné odborné aktivity. RECROP bude aktívne podporovať výskumných pracovníkov v počiatočnej fáze kariéry prostredníctvom školení a vytvárania sietí a podporovať interakcie s partnerskými krajinami COST. Členovia RECROP sa budú aktívne zapájať do budovania komunikačných kanálov s politickými inštitúciami s cieľom poskytovať vedecké poradenstvo v oblasti biotechnológie, technológie a poľnohospodárstva. |
Riešenia pre prípravu semien: Zvyšovanie odolnosti plodín pre udržateľnú budúcnosť
Seed Priming Solutions: Boosting Crop Resilience for a Sustainable Future
| Doba trvania: |
15. 10. 2025 - 14. 10. 2029 |
| Evidenčné číslo: | CA24156 |
| Program: |
COST |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Danchenko Maksym PhD. |
| Anotácia: | Projekt bude vyvíjať škálovateľné a efektívne technológie na prípravu semien s cieľom zvýšiť odolnosť plodín voči vplyvom zmeny klímy. Projekt bude skúmať biologické, chemické a fyzikálne látky na zlepšenie tolerancie rastlín voči abiotickému stresu, vrátane sucha, zasolenia a extrémnych teplôt. Tím bude skúmať molekulárne mechanizmy spúšťané latkami na ošetrenie semien a identifikovať kľúčové biomarkery, ktoré predpovedajú zvýšenú odolnosť voči stresu, a to prostredníctvom implementácie najmodernejších omických technológií. Tým sa zabezpečí vytvorenie štandardizovaných protokolov overených v teréne, ktoré budú prispôsobiteľné rôznym plodinám a podmienkam prostredia. |
Trávne porasty pre biodiverzitu: podpora ochrany trávnych porastov bohatých na biodiverzitu a súvisiacich postupov hospodárenia v Alpách a Karpatoch
Grasslands for biodiversity: supporting the protection of the biodiversity-rich grasslands and related management practices in the Alps and Carpathians
| Doba trvania: |
1. 4. 2023 - 31. 3. 2026 |
| Evidenčné číslo: | Biodiversa2021-532 |
| Program: |
Horizont Európa |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Janišová Monika PhD. |
SUSTAIN - Trvalo udržateľné využívanie zasolených pôd
Sustainable use of salt-affected lands
| Doba trvania: |
3. 10. 2023 - 2. 10. 2027 |
| Evidenčné číslo: | CA22144 |
| Program: |
COST |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Mistríková Veronika PhD. |
| Anotácia: | Zasolenie - akumulácia vo vode rozpustných solí v pôde, je jednou z hlavných príčin degradácie pôdy, ktorá celosvetovo postihuje 833 miliónov hektárov pôdy a 1,5 miliardy obyvateľov. Zasolené pôdy sa však dajú využiť v špecifických poľnohospodárskych postupoch (tzv. saline agriculture), ktoré zahŕňajú využitie zasolenej pôdy, vody a manažment plodín tolerantných voči zasoleniu. Pestovanie plodín na zasolených pôdach pomáha pri riešení potravinovej bezpečnosti a hospodárení s vodou v časoch postupujúcich klimatických zmien a rastu populácie. Existuje preto naliehavá potreba prepojiť výskum a prax a podporiť tak udržateľné využívanie zasolených pôd.
Cieľom tejto COST akcie je vybudovať globálnu transdisciplinárnu sieť vedeckých odborníkov a podnikateľských subjektov z oblasti výskumu zasolenia v spojitosti s potravinovou bezpečnosťou, trvalou udržateľnosťou a prehlbujúcou sa klimatickou krízou. Naše aktivity sa zamerajú na: (i) pochopenie reakcií na heterogenitu zasolenia pôd a iné kombinované stresy v systéme pôda-rizosféra-rastlina; (ii) budovanie vedomostnej základne na zlepšenie hospodárenia s vodou, pôdou a pestovanie plodín na zasolených pôdach; (iii) demonštrovanie dôležitosti a významu zasolených pôd a slanísk; (iv) prepojenie podnikateľských subjektov využívajúcich stratégiu pestovania plodín na zasolených pôdach; a (v) rozvoj cielených politických rámcov pre správne riadenie zasolenia, začlenenie využívania zasolených pôd k pestovaniu ako doplnkovej zložky do Európskeho programu potravinovej bezpečnosti pre pobrežné a vnútrozemské zasolené územia. Vzájomná výmena poznatkov a zdieľanie osvedčených postupov prispeje k udržateľnejšiemu využívaniu zasolených pôd a zvýši odolnosť krajiny ako celku.
|
| Web stránka projektu: | https://www.cost.eu/actions/CA22144/#tabs+Name:Description |
Untangling the spatial microbial diversity within roots of endemic saxicolous shrub Daphne arbuscula
Untangling the spatial microbial diversity within roots of endemic saxicolous shrub Daphne arbuscula
| Doba trvania: |
1. 1. 2025 - 31. 12. 2026 |
| Evidenčné číslo: | CAS-SAS-2024-03 |
| Program: |
Mobility |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Caboň Miroslav PhD. |
| Anotácia: | Daphne arbuscula predstavuje vlajkový druh karpatských endemitov s úzkym rozšírením na extrémne skalnaté biotopy v rámci jediného horského masívu. Naše predchádzajúce výskumy (s obmedzeným počtom analyzovaných rastlinných jedincov na každej lokalite) odhalili signifikantne odlišné spoločenstvá koreňom asociovaných húb u týchto kríkov na rôznych lokalitách. Lokalita Šiance vykazovala vyššiu heterogenitu mikroklimatických podmienok („teplejšie“ a „chladnejšie“ miesta v tesnej blízkosti), čo korešpondovalo s našimi zisteniami o dvoch odlišných vzoroch koreňového mykobiomu. Naším cieľom je detailne preskúmať mikroklímou riadené priestorové vzorce mikroorganizmov v rámci populácie Daphne na tejto jedinej odberovej lokalite, pričom minimalizujeme vplyv ďalších environmentálnych faktorov. Skombinujeme tradičné mikroskopické hodnotenie mykorhíz s vysokokapacitným sekvenovaním troch špecifických rDNA barcodingových regiónov. Rozšírime naše poznanie o koreňových mikrobiálnych spoločenstvách D. arbuscula analýzou koreňov celej populácie zo Šiancov a pridaním dodatočného markera na pokrytie málo preskúmaného bakteriálneho mikrobiomu. |
Z morských pobreží do vnútrozemia - (ktoré) halofyty šíria vtáky?
The role of waterbirds in the dispersal of coastal halophytes to inland salt marshes
| Doba trvania: |
1. 1. 2025 - 31. 12. 2026 |
| Evidenčné číslo: | HAS-SAS-2024-07 |
| Program: |
Mobility |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Dítě Zuzana PhD. |
SMILES - Zvýšenie odolnosti malých a stredných ostrovov zabezpečením udržateľnosti ekosystémových služieb
Enhancing Small-Medium IsLands resilience by securing the sustainability of Ecosystem Services
| Doba trvania: |
22. 9. 2022 - 21. 9. 2026 |
| Evidenčné číslo: | COST CA 21158 |
| Program: |
COST |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Šibík Jozef PhD. |
| Anotácia: | xx |
Národné projekty
Genetická analýza borievok Juniperus communis var. communis, J. sibirica a ich predpokladaných hybridov J. communis var. intermedia na Slovensku
Genetic analysis of juniper species Juniperus communis var. communis, J. sibirica and their putative hybrids J. communis var. intermedia in Slovakia
| Doba trvania: |
1. 1. 2023 - 31. 12. 2026 |
| Evidenčné číslo: | VEGA 2/0005/23 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Galgóci Martin PhD. |
| Anotácia: | Predmetom našej štúdie sú druhy J. communis var. communis L., J. sibirica Lodd in Burgsde a J. communis var. intermedia (Sahur) Sanio o ktorom sa predpokladá, že má hybridný pôvod za účasti zmienených rodičov. V rámci štúdia sa plánujeme zamerať na anatomické znaky ihlíc, ako aj urobiť DNA výskum, ktorého výsledkom by malo byť nájdenie DNA druhovo špecifického markera. Uskutočníme tiež populačno genetické štúdie, ktoré by mali priniesť nové poznatky ohľadne genetickej štruktúry a diverzity a tým vysvetliť jedinečnosti jednotlivých študovaných populácií. Rovnako sa plánujú uskutočniť hybridologické štúdie na preverenie hybridologickej afinity rodičovských druhov a s tým spojené štúdie zamerané na stanovenie kvality peľu a kvality na úrovni semien. Získané semená budú podrobené cytologickému štúdiu zameranému na štúdium pre- a pozygotických porúch v priebehu vývinu embryí.
|
Adaptačné a tolerančné mechanizmy rýchlorastúcich drevín na (polo)kovy a sucho - cesta ako obnoviť a opätovne využiť kontaminované územia a opustené miesta
Adaptation and tolerance mechanisms of fast growing trees to metal(loid)s and drought - a way how to restore and reuse contaminated sites and marginal land
| Doba trvania: |
1. 7. 2024 - 30. 6. 2028 |
| Evidenčné číslo: | APVV-23-0318 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Vaculíková Miroslava PhD. |
| Anotácia: | Kovy a polokovy sú jedným z kľúčových negatívnych faktorov, ktoré sa podieľajú na znečistení životného prostredia a zníženej kvalite života. Na Slovensku máme viac než 800 registrovaných kontaminovaných území, z ktorých na viac než 300 zatiaľ neprebehol proces sanácie alebo remediácie. Preto je dôležité hľadať rôzne udržateľné spôsoby dekontaminácie pôdy a vhodného využitia takejto krajiny. Cieľom tohto projektu je zistiť mechanizmy vzájomných odpovedí rýchlorastúcich drevín z rodov topoľ (Populus sp.) a vŕba (Salix sp.) na prítomnosť kovov v pôde a súčasne na sucho, ako jedného z hlavných dôsledkov meniacej sa klímy v stredoeurópskom regióne. Výsledky tohto projektu môžu byť využité na selekciu vhodných druhov drevín pre remediáciu kontaminovaných pôd a opustených území, a súčasne môžu poslúžiť na výber vhodných druhov pre produkciu bezpečnej drevnej biomasy ako obnoviteľného zdroja energie. |
Ak to nie je výzva, nepovedie to k zmenám: vplyv substrátu na mikroekológiu symbiotických organizmov
If it does not challenge you, it does not change you: legacy of substrate opportunities on microecology of symbiotic organisms
| Doba trvania: |
1. 1. 2025 - 31. 12. 2028 |
| Evidenčné číslo: | VEGA 2/0046/25 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Fačkovcová Zuzana PhD. |
| Anotácia: | Tradičný pohľad na lišajníky ako konzorcium huby a fotosyntetizujúcich rias alebo siníc sa zásadne zmenil. Okrem stabilných, hlavných partnerov zahŕňa aj ďalšie komponenty tvoriace systém rôznorodých zoskupení mikroorganizmov.
Kombináciou Sangerovho a vysokovýkonného sekvenovania budeme skúmať lišajníky ako celok a ich prostredie, aby sme sa dozvedeli o ich mikroekológií - vzťahoch medzi organizmami v stielkach v spojitosti s ich substrátom. Cieľom je zistiť, ako a do akej miery geochémia skalných substrátov ovplyvňuje zloženie hlavných biontov a s nimi spojené zoskupenia mikroorganizmov. Odhalíme a porovnáme mikroekológiu biontov obývajúcich stielky vo vzorkách lišajníkov rastúcich na obligátnom a alternatívnom („extrémnom“) podloží z pohľadu diverzity. Z hľadiska mikroekológie získame aj informácie o schopnosti lišajníkov prispôsobiť sa environmentálnym zmenám v dôsledku ich translokácie do oblastí s odlišným podložím.
|
COMBAT - Ako nepôvodné druhy stromov limitujú vytváranie biologických spoločenstiev?
Understanding COmmunity asseMBly driven by Alien Trees
| Doba trvania: |
1. 1. 2024 - 31. 12. 2027 |
| Evidenčné číslo: | VEGA 2/0143/24 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Šibíková Mária PhD. |
| Anotácia: | Hlavným cieľom tohto projektu je získať nové poznatky o procesoch a základných mechanizmoch zodpovedných za vývoj špecifických rastlinných spoločenstiev, ktorý je podmienený nepôvodnými druhmi stromov. Predchádzajúce štúdie ukazujú, že rastlinné spoločenstvá, v ktorých dominujú nepôvodné stromy, sa výrazne líšia od pôvodných lesných spoločenstiev celkovým druhovým zložením, spektrom funkčných znakov a funkčnými skupinami druhov. Neofyty a archeofyty rastúce v podraste nepôvodných drevín pochádzajú z rôznych kontinentov, nielen z domovského kontinentu nepôvodnej dreviny. Vývoj týchto rastlinných spoločenstiev sa teda riadi inými pravidlami ako vývoj prirodzených lesov. Proces vytvárania bylinnej synúzie pod nepôvodnými druhmi stromov, ktoré už vytvorili štruktúru lesa, zostáva neznámy a navrhovaný projekt má za cieľ vyplniť túto medzeru v poznaní. Výsledky projektu budú kľúčové z hľadiska pochopenia adaptácie organizmov tvoriacich ekosystémy v rámci prebiehajúcej klimatickej zmeny. |
STRESSPOND - Biodiverzita, fungovanie a medziekosystémové vzťahy malých vodných nádrží pod vplyvom viacerých stresorov
Pond biodiversity, functioning and cross-boundary pathways under multiple stressors
| Doba trvania: |
1. 9. 2025 - 31. 8. 2029 |
| Evidenčné číslo: | APVV-24-0463 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Svitková Ivana PhD. |
| Anotácia: | Plytké stojaté vody označované ako pondy patria medzi sladkovodné ekosystémy s najvyššou biodiverzitou a z ekologického pohľadu medzi globálne najdôležitejšie sladkovodné habitaty. Napriek ich veľkej ekologickej a spoločenskej hodnote boli pondy historicky prehliadané ako menejcenné a masívne odstraňované v dôsledku intenzifikácie poľnohospodárstva a postupujúcej urbanizácie. Aj v súčasnosti majú tieto ekosystémy z pohľadu ochrany prírody stále nízku prioritu a čoraz viac sú vystavované tlaku rôznych antropogénnych faktorov, ktoré ovplyvňujú ich biodiverzitu a fungovanie. Eutrofizácia a klimatická zmena sa radia medzi najzávažnejšie stresory ovplyvňujúce malé vodné nádrže. V predloženom projekte sa preto zameriavame na posúdenie vzájomného vplyvu eutrofizácie a klimatickej zmeny na biodiverzitu a fungovanie týchto ekosystémov.
|
Červená kniha rastlinných spoločenstiev Slovenska
Red Book of Plant Communities of Slovakia
| Doba trvania: |
1. 1. 2024 - 31. 12. 2027 |
| Evidenčné číslo: | VEGA 2/0067/24 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Valachovič Milan DrSc. |
| Anotácia: | Červená kniha na úrovni asociácií rastlinných spoločenstiev je veľká výzva a doteraz pomerne ojedinelý počin v hodnotení vzácnych a ohrozených biologických objektov v rámci celej Európy. Existuje množstvo červených zoznamov a prehľadov na druhovej úrovni a je tomu tak aj na Slovensku. Na Slovensku je ale spracovaný aj prehľad rastlinných spoločenstiev a bohatá databáza zápisov. Naviac existuje prvý červený zoznam asociácií z roku 1983, upravený v roku 2001. Po dvadsiatich rokoch dozrel čas za pomoci najnovších metodických postupov a softwarových nástrojov takýto ambiciózny cieľ zrealizovať.
Hlavnými cieľmi projektu sú
i) identifikovať ohrozené rastlinné spoločenstvá na území Slovenska a následne
ii) vypracovať národný červený zoznam týchto spoločenstiev v rámci širšie stanovených skupín biotopov. Predpokladáme, že súčasťou zoznamu bude aj detailné spracovanie charakteristík spoločenstiev a následné komplexné hodnotenie formou vedeckej knižnej publikácie s názvom Červená kniha rastlinných spoločenstiev Slovenska, ktorou by sa symbolicky zavŕšila séria publikácií „Vegetácia Slovenska“.
Čiastkovými cieľmi, ktoré sú predpokladom úspešného splnenia hlavných cieľov sú
i) vypracovať vhodnú metodiku pre hodnotenie formálnych kritérií vzácnosti a ohrozenosti a parametrov (tieto by boli stanovené pomocou kvantitatívnych a semikvantitatívnych údajov o každom spoločenstve zaznamenanom na území Slovenska),
ii) uskutočniť podrobnú literárnu rešerš doteraz používaných postupov v Európe a ich vzájomné porovnanie ako nástroj k výberu najvhodnejšej metodiky využiteľnej u nás (prípadné národné odlišnosti by boli doplnené do vybranej metodiky čím by došlo k vytvoreniu čo najvhodnejších metodických postupov zohľadňujúcich regionálne špecifiká) a
iii) doplniť recentné údaje o skutočnom rozšírení a stave rastlinných spoločenstiev do národnej databázy.
|
MEADOW - Druhovo bohaté lúky a pasienky Karpát: mapovanie, história, príčiny zmien a ochrana
Species-rich Carpathian grasslands: mapping, history, drivers of change and conservation
| Doba trvania: |
1. 7. 2022 - 30. 6. 2026 |
| Evidenčné číslo: | APVV-21-0226 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Janišová Monika PhD. |
| Anotácia: | Európske poľnohospodárstvo sa nachádza na rázcestí. Pokračovať v industriálnej intenzifikácii poľnohospodárskej výroby a súvisiacom opúšťaní marginálnej pôdy znamená pokračovať v priamych negatívnych environmentálnych dopadoch na kvalitu krajiny a pokles biodiverzity. Druhou možnosťou je prijať kvalitu krajiny a jej udržateľnosť za podstatné kritériá optimalizácie a riadenia poľnohospodárskej výroby. Hlavným zámerom nášho transdisciplinárneho projektu je podporiť druhú možnosť, a to poskytnutím praktických vedeckých poznatkov o environmentálnych a spoločenských výhodách trvalo udržateľného obhospodarovania trávnych porastov v oblasti Karpát s využitím tradičných poľnohospodárskych postupov, a tiež o tom, ako by sa preň dali vytvoriť priaznivejšie spoločenské a inštitucionálne podmienky v rámci moderného slovenského hospodárstva. Hlavné ciele projektu sú: 1) identifikovať a zmapovať oblasti karpatského regiónu s vysokou biodiverzitou trávnych porastov a súvisiace miestne environmentálne a sociálne faktory; 2) identifikovať a zmapovať oblasti s vysokým environmentálnym a spoločenským potenciálom pre úspešnú ekologickú obnovu trávnych porastov na Slovensku; a 3) navrhnúť národnú stratégiu štátnej a mimovládnej podpory ekologickej obnovy, ochrany a správy identifikovaných oblastí s trávnymi porastmi. Ku komplexnému a praktickému porozumeniu hodláme dospieť prostredníctvom kolaboratívneho kombinovania najnovších dostupných plošných údajov za karpatský región, analytických metód a nástrojov, ale aj pionierskeho terénneho výskumu, a to paralelne za vedné odbory botanika, ekológia, geografia, diaľkový prieskum Zeme a etnografia/sociálna antropológia. Plánované výstupy projektu – vedecké štúdie a návrh stratégie podpory druhovo bohatých trávnych porastov – môžu popri priamom využití konkrétnymi zazmluvnenými domácimi odberateľmi (MŽP SR, BROZ) zároveň slúžiť aj ako predloha pre aplikovaný výskum v oblasti podpory ekologickej obnovy v Európe. |
Evolučné a ekologické dôsledky rastlinných invázií: aké sú potenciálne dopady hybridizácie a polyploidizácie po invázii na inváznosť taxónov rodu Solidago (zlatobyľ) v Európe?
Evolutionary and ecological outcomes of plant invasions: What are the potential consequences of post-invasion hybridization and polyploidization on the invasiveness of Solidago taxa in Europe?
| Doba trvania: |
1. 1. 2023 - 31. 12. 2026 |
| Evidenčné číslo: | VEGA 2/0024/23 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Šingliarová Barbora PhD. |
| Anotácia: | Vzhľadom na zložitosť biologických invázií a následných procesov (napr. interakcie s pôvodnými druhmi) je dôkladné pochopenie kľúčových faktorov a ich manažment veľkou výzvou. Nepôvodní zástupcovia rodu Solidago (zlatobyľ) predstavujú v Európe výnimočne úspešné invázne druhy. V tomto projekte sa zameriavame na určenie vplyvu hybridizácie a introgresie v populáciách krížiacich sa inváznych a pôvodných druhov S. canadensis-xniederederi-virgaurea a polyploidizácie v populáciách S. gigantea na evolučný a invázny potenciál novovytvorených genotypov v rámci invadovaného areálu v Európe. Využijeme prístup, ktorý kombinuje skríning relatívneho obsahu DNA, vyhodnotenie podrobnej genetickej štruktúry populácií pomocou moderných molekulárnych markerov a zhodnotenie reprodukčného potenciálu a fitness parametrov. Očakávame, že projekt prinesie nové poznatky o mikroevolučných procesoch po inváziách a ich vplyve na ďalšiu inváznosť, ako aj poskytne podklady pre rozhodnutia v oblasti ochrany prírody a manažmentu. |
Flóra Slovenska – biosystematické štúdium taxónov z podčeľadí Cichorioideae a Vernonioideae (Asteraceae) a rodu Rubus (Rosaceae)
Flora of Slovakia – biosystematic study of taxa from the subfamilies Cichorioideae and Vernonioideae (Asteraceae) and from the genus Rubus (Rosaceae)
| Doba trvania: |
1. 1. 2025 - 31. 12. 2028 |
| Evidenčné číslo: | VEGA 2/0060/25 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Mereďa Pavol PhD. |
| Anotácia: | Projekt je zameraný na taxonomickú a chorologickú revíziu zástupcov podčeľadí Cichorioideae a Vernonioideae (čeľaď Asteraceae) a zástupcov rodu Rubus (čeľaď Rosaceae) na Slovensku, resp. v širšom stredoeurópskom priestore. Hlavným výstupom budú ďalšie dve knižné publikácie z monografickej edície Flóra Slovenska: (1) zväzok VI/2, 3. časť, obsahujúci spracovanie tribusov Cichorieae a Arctotideae (spolu 26 rodov a ca 340 druhov) a (2) zväzok venovaný rodu Rubus (ca 60 druhov), ktorý bol pri príprave čeľade Rosaceae do Flóry Slovenska IV/3 (1992) vzhľadom na jeho obtiažnosť vynechaný a doposiaľ nebol spracovaný. Každý taxón bude charakterizovaný z hľadiska nomenklatúry, morfológie, karyológie, ekológie a chorológie. Súčasťou budú aj určovacie kľúče (v slovenčine a angličtine), originálne perokresby rastlín (v prípade rodu Rubus farebné fotografie diakritických znakov) a mapy rozšírenia. V rámci taxonomicky komplikovaných skupín budú v osobitných publikáciách uverejnené aj hlbšie systematické štúdie. |
Hodnotenie druhovej diverzity a fyziologickej odozvy rastlín na ekologické podmienky lužných lesov
The plant species diversity and physiological response to changing ecological conditions of floodplain forests
| Doba trvania: |
1. 1. 2023 - 31. 12. 2026 |
| Evidenčné číslo: | VEGA 2/0053/23 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Ing. Hrivnák Richard DrSc. |
Hrozienka v koláči biodiverzity jazýčkovitých húb (Ascomycota): taxonómia, evolučné vzťahy a životná stratégia
Gemstones of biodiversity: taxonomy, evolutionary relationships and life strategies of target earth tongues (Fungi, Ascomycota)
| Doba trvania: |
1. 1. 2023 - 31. 12. 2026 |
| Evidenčné číslo: | VEGA 2/0074/23 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Kučera Viktor PhD. |
| Anotácia: | Jazýčkovité huby (zástupcovia dvoch čeľadí: Geoglossaceae a Leotiaceae) patria medzi vzácne a považujú sa za ohrozené takmer vo všetkých krajinách ich výskytu. Napriek tomu počet známych druhov za posledné desaťročie narástol o viac ako tridsať. Na základe výskumu z našich minulých projektov je evidentné, že tento trend bude pokračovať. Zo sledovaných lokalít na území Karpát možno očakávať opísanie nových druhov v rode Microglossum a Geoglossum. Výsledkom spolupráce so zahraničnými kolegami bude predpokladané zviditeľnenie ďalších hrozienok v biodiverzitnom koláči, a to opis nových druhov pre vedu. Podľa doterajších výskumov je evidentné, že niektoré druhy rodov Sarcoleotia a Leotia tvoria mykorízu s rastlinami. Rody Leotia a Microglossum sú fylogeneticky príbuzné, preto predpokladáme, že by mohli mať aj podobné vlastnosti. Podľa našej testovacej štúdie postavenej na analýze DNA sa preto domnievame, že aj niektoré druhy rodu Microglossum, príp. ďalších rodov, vytvárajú mykorízu s koreňmi vyšších rastlín. |
Integratívna taxonómia Elmidae a Dryopidae (Insecta: Coleoptera) ostrova Borneo - významného evolučného hotspotu biodiverzity
The integrative taxonomy of Elmidae and Dryopidae (Insecta: Coleoptera) from Borneo - one of the major evolutionary biodiversity hotspots
| Doba trvania: |
1. 1. 2023 - 31. 12. 2026 |
| Evidenčné číslo: | VEGA 1/0541/23 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Čiampor Fedor PhD. |
| Anotácia: | Borneo spolu s časťou Indočíny patrí k významným evolučným hotspotom biodiverzity Juhovýchodnej Ázie a jeho recentná fauna je pravdepodobne výsledok diverzifikácie in situ spojenej s akumuláciou imigrantov. Chrobáky čeľadí Elmidae a Dryopidae sú morfologicky a fyziologicky adaptované na život vo vodnom prostredí, výnimočne sú niektoré rody čeľade Dryopidae (napr. Sostea, Geoparnus, Spalacosostea) prispôsobené na život v pôde, hrabanke alebo vegetácii. Biodiverzita týchto skupín a ich evolučná minulosť sú málo preskúmané a to napriek skoro kozmopolitnému rozšíreniu a významu organizmov v eko-enviro štúdiach. Projekt rieši otázky taxonómie a fylogenézy bornejských druhov komplexným prístupom integratívnej taxonómie na základe mitochodriálnych a jadrových markerov v kombinácii s analýzou morfologických znakov a snaží sa rozoznať spoločné evolučné vzory a zákonitosti vo fylogenéze a rozšírení. |
Kombinovaný manažment ako nástroj na ochranu a obnovu travinnobylinných biotopov
Combined management as a tool for conservation and restoration of grassland habitats
| Doba trvania: |
1. 1. 2023 - 31. 12. 2026 |
| Evidenčné číslo: | VEGA 2/0065/23 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Janišová Monika PhD. |
| Anotácia: | Ochrana, zlepšenie a potenciálne rozšírenie oblastí bohatých na biodiverzitu je najvyššou prioritou politík v rámci štátov, kontinentov ako aj globálne. Najnovšia výzva Európskej únie Green Deal označila biodiverzitu a ekosystémy za kľúčové pre zlepšenie kvality krajiny a zmiernenie účinkov klimatických zmien, pričom poloprírodné biotopy sú oblasťami, v ktorých možno dosiahnuť najúčinnejšie zmeny. Extenzívne tradičné poľnohospodárstvo zachované v horských oblastiach Karpát je inšpiráciou pre diverzifikáciu moderných agroekosystémov. Mechanizmy zvyšovania biodiverzity trávnych porastov diverzifikáciou a kombináciou poľnohospodárskych postupov sú však stále nedostatočne známe. V projekte plánujeme preskúmať viaceré aspekty vybraných kombinácií tradičných manažmentových postupov - kosenia, pasenia a hnojenia - a založiť riadený poľný experiment na testovanie ich účinkov na biodiverzitu, v prípade, že sa použijú ako obnovný zásah v modernej poľnohospodárskej krajine. |
Krasové pramene Západých Karpát - refúgiá genetickej diverzity a unikátnosti bentickej fauny?
Karst springs of the Western Carpathians - Are refuges of genetic diversity and uniqueness of benthic fauna?
| Doba trvania: |
1. 1. 2025 - 31. 12. 2028 |
| Evidenčné číslo: | VEGA 1/0170/25 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Čiamporová-Zaťovičová Zuzana PhD. |
| Anotácia: | Pramene sú unikátne akvatické biotopy významne prispievajúce k regionálnej biodiverzite a fungovaniu ekosystémových služieb celej riečnej krajiny. Mnohé z nich sú však v súčasnosti ohrozené, a to hlavne ľudskými aktivitami a klimatickou zmenou. Ich potenciálna ochrana musí vždy vychádzať z exaktných a aktuálnych dát. Predkladaný projekt preto nadväzuje na doterajší výskum krasových prameňov, po prvýkrát však aplikuje inovatívne molekulárne metódy (NGS sekvenovanie, DNA metabarkóding), ktoré majú veľký potenciál doplniť a skvalitniť doterajšie poznatky o taxonomickej diverzite bioty a zhodnotiť úroveň genetickej variability jednotlivých druhov, ako i celej bentickej fauny prameňov. Súčasťou projektu je aj budovanie referenčnej knižnice DNA barkódov, ktorá je kľúčová pre korektnú interpretáciu výstupov metabarkódingu a DNA-biomonitoringu. Získané výsledky významne obohatia naše vedomosti o pramennom ekosystéme a doplnia tak bázu poznatkov pre kvalitnú ochranu a manažment týchto unikátnych akvatických habitatov. |
Maryna Kryvokhyzha, R2 - Postdoktorand
Maryna Kryvokhyzha, R2 - Postdoctoral Fellow
| Doba trvania: |
1. 3. 2023 - 28. 2. 2026 |
| Evidenčné číslo: | 09I03-03-V01-00142 |
| Program: |
Plán obnovy EÚ |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Kryvokhyzha Maryna PhD. |
| Anotácia: | xx |
SYTDEV - Molekulárna analýza synaptotagmínov a ich úlohy vo vývine suchozemských rastlín
Molecular dissection of synaptotagmins and their roles in the development of land plants
| Doba trvania: |
1. 7. 2024 - 30. 6. 2028 |
| Evidenčné číslo: | APVV-23-0463 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
doc. RNDr. Jásik Ján DrSc. |
| Anotácia: | V rastlinných genómoch sa nachádzajú, prekvapujúco, homology génov, ktoré boli považované za typické pre živočíšne organizmy. Jednými z nich sú rastlinné synaptotagmíny (SYTs), homológy vápnikových senzorov v živočíšnych neurónoch. Dominantný AtSYT1 sa v modelovom organizme Arábkovka Thalova podieľa na odpovediach voči rôznym biotickým a abiotickým stresom. Úloha ostatných členov rodiny je slabo definovaná. Špecifická expresia AtSYT génov, ktorú sme zistili v predchádzajúcich štúdiách naznačuje, že tieto gény sú zapojené aj do regulácie vývinu pletív. Všestrannou analýzou dvojitých a viacnásobných atsyt mutantov chceme zistiť v akých vývinových programoch vyšších rastlín sú AtSYT proteíny zapojené. V projekte budeme tiež študovať SYT gény v machu Physcomitrium patents a využijeme jedinečné výhody, ktoré ponúka tento modelový organizmus pre evolúciu vývinu rastlín. Podrobne budeme charakterizovať časovo priestorovú expresiu a funkciu PpSYT génov a vnútrobunkovú dynamiku PpSYT proteínov počas jednotlivých vývinových štádií organizmu. Pre konštrukciu línií s GUS a GFP próbami použijeme homologickú rekombináciu. Pomocou CRISPR/Cas9 techník vytvoríme línie s deaktivovanými jednotlivými PpSYT génmi a línie s vyradenými viacerými PpSYT génmi. Súčasnými prístupmi reverznej genetiky, bunkovej biológie a biochémie budeme analyzovať funkcie PpSYT génov v priebehu celej ontogenézy rastliny. Projekt prispeje k poznaniu úlohy SYT génov vo vývine vyšších a nižších rastlín a k pochopeniu fylogenézy SYT génov. |
Molekulárne klonovanie a biochemická charakterizácia unikátnej proteázy z mäsožravej rosičky
Molecular cloning and biochemical characterisation of a peculiar protease from carnivorous sundew
| Doba trvania: |
1. 7. 2024 - 30. 6. 2026 |
| Evidenčné číslo: | 09I03-03-V04-00573 |
| Program: |
Plán obnovy EÚ |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Danchenko Monika PhD. |
CARBODNA - Nová analytická platforma pre in situ a in vitro analýzy komplexných sacharidov na báze aptamérov
Aptamer-based analytical platform for in vitro and in situ analyses of complex carbohydrates
| Doba trvania: |
1. 9. 2022 - 31. 8. 2027 |
| Evidenčné číslo: | IM-2021-230 |
| Program: |
IMPULZ |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Mravec Jozef PhD. |
| Anotácia: | Komplexné sacharidy syntetizované rastlinami sú jedny z najdôležitejších prírodných polymérov pre ľudstvo, ako zdroj materiálov, energie a ako súčasť potravy a krmív. Pre ich vysokú molekulovú hmotnosť a komplexnosť, určenie ich presného množstva a štruktúry vo vzorke je veľmi technicky náročné. Napríklad súčasná metóda nazývaná Compositional Microarray Polymer Profiling (CoMPP) založená na špecifických monoklonálnych protilátkach zacielených na sacharidy a microarray technológii má niekoľko nedostatkov a vyžaduje vysoký stupeň expertízy, drahé vybavenie a je veľmi nákladná.
Tento projekt má za ciel vyvinúť novu analytickú platformu na báze aptamérov (tiež nazývaných syntetické alebo chemické protilátky), krátkych polynukleotidov so schopnosťou viazať sa na určené molekuly s vysokou špecificitou a aviditou podobnou konvenčným proteínovým protilátkam. V rámci projektu vyvinieme nové aptaméry zacielené na významné komponenty rastlinných bunkových stien pre ktoré nie sú dostupné monoklonálne protilátky a súčasne sa pokúsime izolovať aptaméry rozoznávajúce komplikované trojdimenzionálne štruktúry vytvárajúce bunkovú stenu ako napríklad vzájomné interakcie biopolymérov. Vytvorené aptaméry budú použité na vytvorenie nového efektívneho systému na kvantifikáciu a kompozičné profilovanie vzoriek rôzneho pôvodu a určenia pomocou etablovaných metód molekulárnej biológie ako napríklad qPCR, detailné mikroskopické štúdium štruktúry bunkových stien a lokalizácie vzájomných interakcii murálnych komponentov. Súčasť projektu bude použitie tejto novej technológie na popísanie dynamiky bunkových stien počas somatickej embryogenézy a bunkovej elongácie.
|
Objasnenie skrytej diverzity a evolúcie v polyploidných komplexoch druhov
Uncovering cryptic diversity and evolution in polyploid species complexes
| Doba trvania: |
1. 7. 2024 - 30. 6. 2026 |
| Evidenčné číslo: | 09I03-03-V04-00489 |
| Program: |
Plán obnovy EÚ |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Zozomová Judita PhD. |
Pokročilý výskum rastlín prostredníctvom analýzy údajov NGS
Integrative Bioinformatics Analysis of Next Generation Sequencing Data for Advanced Plant Research
| Doba trvania: |
1. 7. 2024 - 30. 6. 2026 |
| Evidenčné číslo: | 09I03-03-V04-00494 |
| Program: |
Plán obnovy EÚ |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Šlenker Marek PhD. |
| Anotácia: | Rýchly pokrok v botanike, najmä v oblasti fylogenézy rastlín a skúmania pôvodu polyploidných druhov možno bezpochyby pripísať rozšírenej aplikácii metód sekvenovania novej generácie (NGS) v posledných rokoch a súčasnému rozvoju bioinformatických nástrojov určených na spracovanie týchto údajov. Aj keď sú tieto metódy univerzálne a široko použiteľné, čoraz viac sa dostáva do popredia potreba prístupov, ktoré zohľadňujú jedinečné vlastnosti študovaných druhov rastlín. Hlavným cieľom tohto projektu je poskytnúť inovatívne bioinformatické riešenia šité na mieru na analýzu NGS dát a získať odpovede na špecifické vedecké otázky. Vyvinuté skripty a nástroje budú verejne sprístupnené, čím sa uľahčí ich použitie iným výskumníkom v ich štúdiách, a zároveň to umožní prípadné úpravy na zabezpečenie ďalšieho vývoja. |
Pôdne aditíva ako potenciálny nástroj pre remediáciu kovmi a polokovmi kontaminovaných pôd a zlepšenie bezpečnosti potravín
Soil additives as possible tools for remediation of metal(loid) contaminated soils and improvement of food safety
AntioxEnz - Racionálny dizajn, mutagenéza, optimalizácia a efektívny prísun enzýmových antioxidantov
Rational design, mutagenesis, optimization and efficient delivery of diverse enzymatic antioxidants
| Doba trvania: |
1. 9. 2025 - 31. 8. 2029 |
| Evidenčné číslo: | APVV-24-0473 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Caboň Miroslav PhD. |
| Anotácia: | Enzýmové antioxidanty predstavujú kľúčové biomakromolekuly vyvinuté počas dlhodobej evolúcie v bunkách
rôznych organizmov. Sú špecificky zamerané na likvidáciu toxických účinkov reaktívnych zlúčenín kyslíka
spontánne vznikajúcich v metabolizme, alebo prítomných v životnom prostredí. Predmetom základného výskumu
predkladaného projektu sú rôzne typy oxidoreduktáz, ktoré je možné považovať za enzýmové antioxidanty:
katalázy, peroxidázy, peroxygenázy a superoxid dismutázy. Budeme skúmať ich natívne formy, vyskytujúce sa v
prírode, ale pripravíme aj cielené mutácie ovplyvňujúce katalýzu a zabezpečíme ich stabilnú produkciu pre
skúmanie ich priaznivých účinkov s ohľadom na očakávané vysoko účinné katalytické pôsobenie týchto enzýmov
proti škodlivým účinkom oxidačnému stresu v jeho rôznych formách a prejavoch. Pokúsime sa tiež o ich efektívnu
imobilizáciu na kompatibilné nosiče, alebo ich včlenenie do nanočastíc pomocou biokompatibilných polymérov.
Podobné výskumy včlenenia uskutočníme aj pre flavoenzým glukózo-oxidázu produkujúci peroxid vodíka, ktorý sa
vaužíva v mnohých priemyselných a medicínskych aplikáciách. Výsledkom predkladaného projektu budú dostupné
a vysoko účinné enzýmové antioxidanty, použiteľné aj vo vhodných kombináciách, ktoré budú môcť byť v
budúcnosti využité v mnohých aplikáciách medicíny a biotechnológií. |
Rastlinné kalpaíny a ich molekulárny mechanizmus kontroly bunkovej identity
Plant calpains and their molecular mode of action in cell fate control
| Doba trvania: |
1. 7. 2022 - 30. 6. 2026 |
| Evidenčné číslo: | APVV-21-0227 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
doc. RNDr. Jásik Ján DrSc. |
| Anotácia: | XX |
RedoxDrought - Regulácia odolnosti pšenice voči suchu na úrovni redox proteómu
Redox proteome regulation of drought resilience in wheat
| Doba trvania: |
1. 3. 2025 - 31. 12. 2028 |
| Evidenčné číslo: | VV-MVP-24-0368 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Lakhneko Olha PhD. |
RET-EVOL-BRASS - Retikulátna alebo divergentná evolúcia? Objasnenie procesov, ktoré stoja za veľkou druhovou bohatosťou a endemizmom v rodoch čeľade Brassicaceae
Reticulate or divergent evolution? Resolving processes behind the high species richness and endemism in Brassicaceae genera
| Doba trvania: |
1. 7. 2022 - 30. 6. 2026 |
| Evidenčné číslo: | APVV-21-0044 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
prof. RNDr. Marhold Karol DrSc. |
| Anotácia: | Retikulátna evolúcia je pozoruhodná téma výskumu, ktorá si v posledných rokoch získala zvýšenú pozornosť najmä vďaka pokroku v poznávaní genómov a vývoju nových vedeckých metodík a prístupov. Dnes sa už všeobecne akceptuje fakt, že introgresia a hybridizácia významne ovplyvňujú evolúciu rastlín, ale naše poznanie týchto procesov a ich dopadu na diverzifikáciu a speciáciu je stále nedostatočné. Predkladaný návrh projektu sa zameriava na štúdium retikulátnej evolúcie v štyroch rodoch z čeľade Brassicaceae (Alyssum, Cardamine, Erysimum a Odontarrhena). Našim cieľom bude detailnejšie preskúmať, aký vplyv mali retikulátne udalosti na evolúciu študovaných rodov, zistiť, či vysoký podiel endemitov je dôsledkom opakovaných, nezávislých polyploidizačných udalostí alebo skôr dôsledkom zvýšenej diverzifikácie už vytvorených polyploidných línií. Budeme tiež študovať, ako mohli zmeny v areáloch druhov v minulosti aj v súčasnosti stimulovať introgresiu či alopolyploidnú speciáciu a budeme tiež sledovať spôsob a tempo evolúcie genómu alopolyploidov. Na dosiahnutie cieľov sme si zvolili komplexný metodický prístup, v ktorom budeme spájať metódy fylogenomické (RADseq a HybSeq metódy sekvenovania novej generácie, doplnené aj o analýzu mikrosatelitov), cytogenomické, cytometrické a morfometrické, ako aj modelovanie ekologických ník. Rozmanité dáta, zhromaždené z rôznych metodík a zdrojov, nám umožnia pozrieť sa na študované javy a procesy z odlišných uhlov pohľadu a získať tak o nich ucelenejší obraz. Keďže naše štúdium bude zamerané na rôzne skupiny druhov, poskytne nám to aj možnosť porovnávania a výsledky nebudú len druhovo alebo rodovo špecifické, ale umožnia nám odvodiť aj spoločné a všeobecnejšie platné mechanizmy retikulátnej evolúcie rastlín. |
REFLECT - Revolučná budúcnosť: Zlepšovanie mapovania lesnej biomasy a odhadu viazania uhlíka pomocou technológií diaľkového prieskumu zeme.
Revolutionizing the Future: Enhancing Forest Biomass Mapping and Carbon Sequestration Estimation through Remote Sensing Technologies
| Doba trvania: |
1. 3. 2025 - 28. 2. 2029 |
| Evidenčné číslo: | MVP VV 24-0412 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Šibík Jozef PhD. |
| Anotácia: | Keďže sa celosvetovo diskutuje o rastúcej potrebe získavania komplexných informácií, na základe nadobudnutých poznatkov a skúseností v oblasti výskumu lesných ekosystémov prostredníctvom rôznych moderných metód diaľkového prieskumu Zeme (DPZ) sa zrodila myšlienka preskúmať výpočet množstva biomasy a uhlíka viazaného v lese a zrodila sa inšpirácia pre projekt REFLECT. V projekte výskumný tím spája technické zručnosti a znalosti tvorby vysokokvalitných 3D priestorových údajov s dendrológiou, botanikou a jemnými vedami o fyziologických procesoch v rámci ekosystému. Dôvodom je fakt, že kolobeh uhlíka sa nedá rozdeliť podľa samostatných jednotlivých zložiek ekosystému. Namiesto toho je potrebné zdôrazniť význam komplexného pohľadu a vyzdvihovať vzájomnú prepojenosť všetkých prvkov v priestore a čase.
Naším cieľom je identifikácia, návrh, overenie a stanovenie rôznych aspektov súvisiacich s mapovaním a monitorovaním nadzemnej biomasy lesných porastov, pomocou nových technológií a metód DPZ. V prvom kroku výskumu sa zameriavame sa na experimenty, ktoré pristupujú k tvorbe priestorových 3D údajov z rôznych hľadísk a v odlišnej mierke. Na jednej strane je terestrické laserové skenovanie (TLS), ktoré vytvára modely prostredia vo vynikajúcom detaile s vysokou presnosťou. Protipól TLS tvorí iná metóda DPZ - vyhodnocovanie satelitných snímok, ktorá poskytuje možnosť študovať rozsiahle ekosystémy z orbitálnej perspektívy a teda neporovnateľne širšom meradle, avšak za cenu nízkeho detailu. Následne priestorové údaje doplníme o data z integrovaných analytických nástrojov na pokročilé merania tokov CO₂ a H₂O v lesných ekosystémoch. Takáto fúzia dát z rôznych zdrojov a interdisciplinárna spolupráca medi špecificky zameranými odborníkmi môže zlepšiť presnosť odhadu biomasy a sekvestrácie uhlíka pre nasledujúce výstupy, ktoré v súčasnosti vyplývajú z požiadaviek spoločnosti.
Cieľom projektu REFLECT je najmä vyplniť zjavnú medzeru vypracovaním novej, komplexnej metodiky na kvantifikáciu množstva uhlíka v ekosystéme ako celku, pomocou rôznych technológií DPZ s dosahom od litosféry až po exosféru. Týmto spôsobom chceme prispieť ku globálnemu poznaniu, interdisciplinárnemu prenosu a zlúčeniu informácií s cieľom rozvíjať výskum lesných ekosystémov smerom, ktorým ho zatiaľ žiadny tím neposúval.
|
Riečne koridory ako vektor šírenia nepôvodných rastlín: časovo-priestorové štúdie
River corridors as a vector for the spread of non-native plants: spatio-temporal studies
| Doba trvania: |
1. 1. 2025 - 31. 12. 2028 |
| Evidenčné číslo: | VEGA 2/0022/25 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Ing. Hrivnák Richard DrSc. |
Rodina GH72: Reakčný mechanizmus a inhibičné stratégie
Targeting the GH72 Family: Mechanisms of Action and Inhibition Strategies
| Doba trvania: |
1. 9. 2025 - 31. 8. 2029 |
| Evidenčné číslo: | APVV-24-0594 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Mravec Jozef PhD. |
CWIK - Rozsiahly súbor nástrojov chemickej a syntetickej biológie na skúmanie interaktómu rastlinných bunkových stien
A comprehensive chemical and synthetic biology toolkit for investigating plant cell wall interactome
| Doba trvania: |
1. 3. 2025 - 31. 3. 2026 |
| Evidenčné číslo: | 09I01-03-V05-00010 |
| Program: |
Plán obnovy EÚ |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Mravec Jozef PhD. |
| Anotácia: | Zámerom pôvodného ERC projektu CWIK bolo vytvoriť novú technologickú platformu na rozsiahle a detailné štúdium komplexity bunkovej steny rastlín. Toto by bolo dosiahnuté prostredníctvom vývoja nových kreatívnych nástrojov napr. prób na sledovanie a manipulovanie 3D štruktúr a interakcií komponentov bunkovej steny pre ich funkčnú analýzu a hľadania nových možností ich biotechnologického využitia. Cieľom preklenovacieho grantu bude demonštrovanie uskutočniteľnosti niektorých pôvodných zámerov a to hlavne použitie metódy tzv. click chemistry na zosieťovanie rastlinných polymérov a sledovanie fyziologického efektu takejto cielenej manipulácie a tiež overenie a charakterizácia nových detekčných prób na báze DNA-aptamérov. Získanie dôležitých prvotných dát, prezentácia výsledkov na medzinárodných konferenciách a vytvorenie novej medzinárodnej spolupráce pomôže pripraviť novú vylepšenú žiadosť o ERC Advanced grant ale aj iné prestížne granty ako napr. Human Frontiers Science Program. |
Rýchlorastúce dreviny z čeľade Salicaceae a ich potenciál pri remediácii lokalít kontaminovaných antimónom a arzénom
Fast-growing trees from the Salicaceae family and their potential in the remediation of sites contaminated with antimony and arsenic
| Doba trvania: |
1. 1. 2025 - 31. 12. 2028 |
| Evidenčné číslo: | VEGA 2/0047/25 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Vaculíková Miroslava PhD. |
| Anotácia: | Rozmach mestských území a nárast priemyselných aktivít vedie k zmenšovaniu plochy kvalitnej poľnohospodárskej pôdy. Navyše, pôda znehodnotená priemyselnou činnosťou a ťažbou nerastných surovín je často kontaminovaná ťažkými kovmi a toxickými látkami. Keďže Slovensko patrilo v minulosti k významným producentom antimónovej rudy, oblasti kontaminované antimónom a s ním sa často vyskytujúcim prvkom arzénom, sú pretrvávajúcim problémom dodnes. Niektoré druhy rastlín a drevín sú schopné osídľovať aj takéto územia a rásť na nich bez väčších problémov. Našim cieľom je charakterizovať takéto dreviny, sledovať príjem a akumuláciu Sb a As do ich pletív a objavovať fyziologické a biochemické mechanizmy ich prispôsobenia sa na kontamináciu v prostredí. Výstupy projektu môžu nájsť uplatnenie pre optimalizáciu fytoremediačných techník na Sb/As kontaminovaných pôdach na Slovensku i vo svete.
|
SegDeepLearningF - Segmentáciou obrazu determinované algoritmy hlbokého strojového učenia v ochrane prírody
Segmentation-based deep learning image analysis for nature protection
| Doba trvania: |
1. 3. 2025 - 31. 12. 2028 |
| Evidenčné číslo: | VV-MVP-24-0116 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Šibíková Mária PhD. |
| Anotácia: | Projekt je venovaný vývoju originálnych matematických metód pre geobotanický a fytogeografický výskum. Integráciou veľkých dát diaľkového prieskumu Zeme, výkonných segmentačných algoritmov a nových metód založených na hlbokom strojovom učení tento projekt prispeje k lepšiemu pochopeniu procesov ovplyvňujúcich životné prostredie a posilní nástroje ochrany prírody. Tento interdisciplinárny prístup prinesie nové poznatky o komplexných vzťahoch medzi vegetačnými typmi, ekologickými procesmi a monitorovaním environmentálnej dynamiky, čo uľahčí rozvoj informáciami podložených a efektívnych stratégií ochrany. Naše konkrétne ciele sú:
1. Vyvinúť inovatívny matematický model na automatickú identifikáciu hraníc oblastí krajinných prvkov v reálnom čase, vrátane chránených biotopov, polí, mestských oblastí a vodných plôch. Tento cieľ si kladie za úlohu vytvoriť riešenie, ktoré umožní pracovať s rôznymi typmi dát získanými diaľkovým prieskumom Zeme, ako sú satelitné dáta (Sentinel-2, Landsat a dostupné komerčné satelity), ortofoto dáta, dáta z bezpilotných lietadiel a LiDAR dáta.
2. Vyvinúť matematické modely na tvorbu nového a unikátneho priestoru vlastností pre algoritmy hlbokého strojového učenia. Tieto modely budú navrhnuté tak, aby identifikovali a extrahovali významné črty z rôznych typov krajinných prvkov a dát diaľkového prieskumu Zeme, čo umožní algoritmu ich presnú klasifikáciu.
3. Vyvinúť nový optimalizovaný algoritmus hlbokého strojového učenia na klasifikáciu založený na Prirodzených Numerických Sieťach, ktoré sú riadené dopredno-spätnou difúziou na grafe. Integráciou nových prístupov bude algoritmus presne identifikovať krajinné prvky a efektívne vytvárať mapy relevancie. Využitím vytvorených natrénovaných sietí poskytnú výsledné mapy relevancie cenné informácie o výskyte chránených biotopov s vysokou biodiverzitou.
|
Sírovodík a oxid dusnatý: nepostrádateľné plynné signálne molekuly v obranných reakciách rastlín na abiotický stres
Hydrogen sulfide and nitric oxide: indispensable gaseous signaling molecules in plant defense responses to abiotic stress
| Doba trvania: |
1. 1. 2024 - 31. 12. 2027 |
| Evidenčné číslo: | VEGA 2/0059/24 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Tamás Ladislav PhD. |
| Anotácia: | Sírovodík (H2S) a oxid dusnatý (NO) sú malé plynné signálne molekuly, pravdepodobne zapojené do všetkých vývinových a stresových procesov v rastlinách. Komplexné prepojenie signálnych dráh H2S a NO vedie k ich synergickému, ako aj k antagonistickému účinku, v závislosti od ich koncentrácií, typu bunky, redoxného stavu a hladiny fytohormónov v rastlinných bunkách. Cieľom tohto projektu je analýza funkcie NO a H2S v stresových reakciách pomocou bioaktívnych molekúl, ktoré aktivujú a/alebo blokujú špecifické metabolické a signálne dráhy NO a H2S. Tento prístup môže taktiež odhaliť spôsob akým sú NO a H2S zapojené do regulácie fyziologických a biochemických procesov počas obranných aj toxických reakcií koreňov jačmeňa na nepriaznivé podmienky prostredia. |
Stabilita vďaka inováciám: Optimalizácia taxonómie chrobákov čeľade Elmidae vďaka využívaniu objemných DNA dát
Driving Stability with Innovation: Improving Riffle Beetle Taxonomy using massive DNA barcoding data
| Doba trvania: |
1. 1. 2025 - 31. 12. 2028 |
| Evidenčné číslo: | VEGA 2/0111/25 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Čiampor Fedor PhD. |
| Anotácia: | Projekt nadväzuje na predchádzajúce výskumy riešiteľov projektu. Projekt je veľmi kvalitne napísaný. Z projektu je zrejmá vynikajúca znalosť študovanej problematiky a stavu poznania v taxonómii čeľade Elmidae. Ciele sú sformulované jasne a pri danom zložení riešiteľského kolektívu sú v plnej miere dosiahnuteľné. Pri riešení budú použité najmodernejšie metódy v taxonómii – masívny DNA barkóding vzoriek chrobákov, sekvenovanie celých mitigenómov a vybraných jadrových markerov. Predpokladaný vlastný prínos projektu je generovanie významného množstva nových DNA barkódov, ktoré zrýchľujú a zjednodušujú determináciu druhov, nové barkódy môžu prispieť k rutinnému využívaniu molekulárnych postupov (DNA metabarkóding) pri monitoringu sladkých vôd. Viacvrstvové (mtDNA, nDNA, mitogenómy) dáta umožnia s robustnou podporou definovať evolučné vzťahy v rámci čeľade Elmidae.
Harmonogram projektu je dobre spracovaný, zloženie a veľkosť kolektívu sú optimálné. Odborná zdatnosť a scientometrické ukazovatele riešiteľov a spolupráca so špičkovými zahraničnými odborníkmi garantujú, že výsledky budú publikované vo forme článkov špičkovej medzinárodnej kvality. Rozpočet projektu je úplne v súlade s potrebami riešenia projektu a je primeraný. |
Štipendiá ponúkané v rámci bilaterálnych programov spolupráce na akademický rok 2025/2026
-
Štúdium dynamiky bunkovej steny v procese somatickej embryogenézy pomocou nových molekulárnych prób
Elucidating the dynamics of the cell wall during somatic embryogenesis with the use of novel probes
| Doba trvania: |
1. 3. 2023 - 30. 6. 2027 |
| Evidenčné číslo: | 09I03-03-V02-00005 |
| Program: |
Plán obnovy EÚ |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Ing. Heldesová Katarína |
| Anotácia: | Projekt je zameraný na podporu výskumných aktivít počas doktorandského štúdia zodpovednej riešiteľky. Cieľom je štúdium dynamiky bunkovej steny počas vývinových procesov ako somatická embryogenéza a rast koreňových vláskov, pomocou rozličných in situ a in vitro prístupov. Súčasťou projektu je aj vývin nových molekulárnych prób na detekciu pektínu v bunkovej stene. |
Štúdium hydroláz zúčastňujúcich sa procesov trávenia v mäsožravých rastlinách rodu Drosera
Study of hydrolases involved in digestion in carnivorous plants of the genus Drosera
| Doba trvania: |
1. 1. 2024 - 31. 12. 2027 |
| Evidenčné číslo: | VEGA 2/0021/24 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Ing. Libantová Jana CSc. |
| Anotácia: | Mäsožravé rastliny vrátane druhov rodu Drosera využívajú pri trávení koristi bohatú zmes enzýmov, ktoré sú vylučované stopkatými žľazami listovej pokožky - tentakulami. Navrhovaný projekt zahŕňa analýzu hydroláz indukovaných trávením ako aj prítomných v tráviacich žľazách konštitutívne metódou hmotnostnej spektrometrie. Vybraný gén pre hydrolázu aktívnu v trávení budeme následne izolovať a charakterizovať jej expresný profil. Projekt zároveň zahŕňa zavedenie eukaryotického expresného systému pre charakterizáciu hydroláz s predpokladanými post-translačnými modifikáciami v podmienkach nášho laboratória. Súčasťou projektu je aj získanie ďalších enzýmových charakteristík chitináz a beta-1,3-glukanázy izolovaných a purifikovaných v predchádzajúcom období z mäsožravých rastlín pre účely ich potenciálneho biotechnologického využitia. |
POLINES - Včely všetko nestihnú – DNA metabarkódingová analýza biodiverzity opeľovačov pre zlepšenie ich ochrany a ekosystémových služieb
Bees cannot make it all - DNA metabarcoding analysis of pollinator biodiversity for improving their protection and ecosystem services
| Doba trvania: |
1. 7. 2022 - 30. 6. 2026 |
| Evidenčné číslo: | APVV-21-0386 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Čiampor Fedor PhD. |
| Anotácia: | Podľa mnohých zdrojov sme svedkami masívneho úbytku biodiverzity, čo môže mať pre ľudstvo katastrofické následky. Kriticky ohrozené sú aj opeľovače, ktoré sú nenahraditeľné pre poľnohospodárstvo, výživu, fungovanie ekosystémov a zachovanie ich ekosystémových služieb. Skutočnú diverzitu opeľovačov a zloženie ich spoločenstva však nepoznáme a bez relevantných dát nie je možná ich efektívna ochrana. Potrebujeme preto výrazne skvalitniť poznatky a inovovať postupy biodiverzitného výskumu. Konvenčné postupy sú zdĺhavé, finančne náročné a náchylné k chybám, čo znižuje výpovednú hodnotu výsledkov. DNA (meta)barkóding v súčasnosti revolucionizuje našu schopnosť hodnotiť biodiverzitu v celom rade biotopov. Tento prístup je efektívny a ľahko realizovateľný, čo z neho robí nástroj 21. storočia pre rozsiahly výskum a monitorovanie biodiverzity.
Projekt vychádza z najnovších poznatkov v oblasti DNA metabarkódingu bioty a využíva analýzu DNA dát v kombinácii s faktormi prostredia na hodnotenie stavu biodiverzity opeľovačov. Využitá bude aj environmentálna DNA (eDNA) z kvetov, čo je zatiaľ ojedinelý a inovatívny prístup k prieskumu biodiverzity tejto dôležitej skupiny živočíchov.
Hlavnými cieľmi projektu je a) DNA metabarkódingová analýza biodiverzity opeľovačov spojených s pestovaním troch modelových plodín (repka, mak, jabloň), b) odhad vplyvu faktorov prostredia na diverzitu opeľovačov, c) odhad vplyvu biodiverzity opeľovačov na výnosy plodín a d) výrazné doplnenie referenčných DNA barkódingových databáz o unikátne dáta fauny opeľovačov.
Výstupy projektu zlepšia všeobecné poznatky o biodiverzite, zlepšia možnosti rutinnej aplikácie DNA metód v budúcnosti a poskytnú poznatkovú bázu pre efektívnejšie prijímanie informovaných rozhodnutí v kontexte prispôsobovania sa zmene klímy a udržateľného rozvoja.
|
Vnútrozemské slaniská strednej Európy: ostrovy špecifickej diverzity v čase výrazných zmien prírodného prostredia
Inland saline habitats in Central Europe: islands of specific diversity in the midst of changes of natural ecosystems
| Doba trvania: |
1. 1. 2024 - 31. 12. 2027 |
| Evidenčné číslo: | VEGA 2/0019/24 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Dítě Daniel PhD. |
| Anotácia: | Projekt nadväzuje na výsledky vlastného dlhodobého výskumu slanísk v Panónskej nížine a priľahlých regiónoch strednej Európy štúdiom ich vegetačnej dynamiky. Cieľom je identifikovať zásadné príčiny negatívnych zmien tohto celoeurópsky ohrozeného biotopu v časových odstupoch 5 až 20 rokov od regionálnej škály po územie celej Panónskej panvy. Hodnotíme úspešnosť viacerých obnovných aktivít získaných z dlhodobého sledovania dynamiky slanomilnej vegetácie na trvalých plochách v rôznych typoch využívania lokalít v rámci Podunajskej nížiny. Ďalším zámerom je stanoviť hranice slaniskovej vegetácie od vegetácie rôznych typov kontaktných biotopov použitím prístupu založenom na prezencii halofytov v rastlinných spoločenstvách. Nové budú vedomosti získané realizáciou základného výskumu inventarizácie a ekologickej väzby druhov rovnokrídlovcov ako indikátorov prírodných halofytných biotopov v menej preskúmaných regiónoch Panónskej nížiny. |
MycoRock - Vplyv rôznorodosti prostredia na zloženie hubových spoločenstiev kolonizujúcich korene rastlín v temperátnych skalných stanovištiach
Influence of habitat heterogeneity on composition of root-associated mycobiome in temperate rocky habitats
| Doba trvania: |
1. 9. 2025 - 31. 8. 2029 |
| Evidenčné číslo: | APVV-24-0473 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Caboň Miroslav PhD. |
| Anotácia: | Skalnaté biotopy v miernych oblastiach predstavujú drsné a náročné prostredie v dôsledku extrémne variabilných teplôt, nízkej dostupnosti vody a nedostatočne vyvinutej pôde. Napriek týmto podmienkam sú obývané vysoko špecializovanými rastlinnými spoločenstvami a slúžia ako diverzitné refúgiá pre mnohé endemické a reliktné druhy. Prežitie skalných rastlín v takomto stresujúcom prostredí je zásadne ovplyvnené ich interakciami s mykobiómom koreňov (hubovou komunitou). Niektoré druhy húb sú úzko špecializované na skalnaté biotopy, kde zohrávajú kľúčovú úlohu v kolobehu živín. Ich zloženie však môže byť významne ovplyvnené vlastnosťami pôdy a charakteristikami stanovišťa. Interakcie medzi mykobiómom a rhizosférou cievnatých rastlín obývajúcich izolované skalnaté biotopy mierneho pásma stále zostávajú však málo preskúmané. Pokroky v HTS amplikónovom sekvenovaní a metagenomike výrazne vylepšili možnosti skúmania komplexných hubových spoločenstiev a umožňujú identifikovať skrytú diversitu pôdnych mikroorganizmov. Predkladaný projekt sa zameriava na analýzu koreňového mykobiómu cievnatých rastlín v exponovaných skalných biotopoch v temperátnom pásme strednej Európy. Cieľom je zistiť, ako odlišnosti v type podložia, heterogenita stanovišťa a identita hostiteľa formujú mykobiom v extrémnych ekologických podmienkach. Projekt implementuje amplikónové sekvenovanie (metabarcoding) na identifikáciu koreňového mykobiómu v prirodzene sa vyskytujúcich saxikolných rastlinách s určením biologických vlastností húb indikujúcich ich ekologickú funkciu. Zároveň zahŕňa aj experimentálnu overenie pozorovaných zmien mykobiómu prostredníctvom kultivačných experimentov v kontrolovaných podmienkach. |
Vráťme kvety na lúky – zmeny a ekologická obnova diverzity vzácnych lúčnych biotopov európskeho významu
Let's return flowers to meadows - changes and ecological restoration of the diversity of rare grassland biotopes of European importance
| Doba trvania: |
1. 1. 2025 - 31. 12. 2028 |
| Evidenčné číslo: | VEGA 2/0062/25 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Vantarová Katarína PhD. |
| Anotácia: | Trávnaté biotopy čelia v Európe hrozbám v dôsledku nevhodných poľnohospodárskych postupov, urbanizácie a fragmentácie krajiny. Európska komisia navrhla zákon o obnove biotopov s cieľom zachovať a posilniť biodiverzitu ekosystémov. Ide o kľúčový prvok Dohovoru o biologickej diverzite a Stratégie biodiverzity EU 2030 požadujúcej záväzné ciele na obnovu degradovaných ekosystémov. Výsledky pravidelného monitoringu biotopov európskeho významu potvrdili, že viaceré z nich sú na Slovensku v nepriaznivom stave. Cieľom projektu je vyhodnotiť zmeny vzácnych a ohrozených nelesných biotopov za posledné tri desaťročia s využitím fytocenologických zápisov a na základe riadených experimentov navrhnúť vhodné obnovné manažmentové postupy. Otestujeme opatrenia zamerané na zvýšenie druhovej diverzity na veľkoplošne využívaných ako aj na neobhospodarovaných porastoch. Získané poznatky pomôžu v ochranárskej a poľnohospodárskej praxi pri plnení záväzkov súvisiacich s obnovou biotopov vyplývajúcich z legislatívy EU. |
Vývin listových pascí mäsožravých rastlín rosičky: Zdroj unikátnych hydroláz s možnosťami využitia v biotechnológiách
Developing leaf traps of carnivorous sundews: Source of unique hydrolases with a high potential in biotechnology
| Doba trvania: |
1. 9. 2024 - 30. 6. 2028 |
| Evidenčné číslo: | APVV-23-0448 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Ing. Libantová Jana CSc. |
ApFlax - Vývoj prístupu pre štúdium diverzity bunkovej steny ľanového vlákna založeného na aptaméroch
Development of an aptamer-based approach for studying flax fibre cell wall diversity
| Doba trvania: |
1. 7. 2024 - 30. 6. 2026 |
| Evidenčné číslo: | 09I03-03-V04-00525 |
| Program: |
Plán obnovy EÚ |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Ing. Harenčár Ľubomír PhD. |
| Anotácia: | Jednou z možných stratégií udržateľnosti je nájsť nové spôsoby využitia nedocenených pôvodných plodín, čo si vyžaduje nové analytické prístupy. Linum usitatissimum L., ako viacúčelová plodina úzko spätá so slovenskou kultúrou, je vhodným kandidátom na opis vlastností bunkovej steny vlákna pomocou aptamérov. Na hodnotenie biodiverzity ľanu, ako aj na charakterizáciu vlastností bunkovej steny už boli použité rôzne analýzy. Stále však existuje nedostatok nových účinných nástrojov na zodpovedanie otázok: čo odlišuje priadny a olejný typ ľanu a akú úlohu v tomto rozdiele zohráva zloženie a štruktúra bunkovej steny? Tieto odpovede sú dôležité nielen pre biológiu rastlín, keďže ľanové vlákno je skvelým príkladom nekonvenčnej bunkovej steny, ale aj pre výrobu vysokokvalitného ľanového vlákna, najmä v dvojúčelových odrodách. Súčasné molekulárne sondy pre analýzu bunkovej steny majú obmedzenia v oblasti presného zacielenia širokej škály štruktúr. Aptaméry, krátke jednovláknové molekuly DNA alebo RNA, sú syntetizované in vitro prostredníctvom SELEX (systematického vývoja ligandov exponenciálnym obohatením). Zatiaľ čo sú vo veľkej miere aplikované v biomedicínskom a environmentálnom výskume, ich použitie vo výskume bunkovej steny je len v začiatkoch. Cieľom tohto projektu je vyvinúť nové respektíve vybrať známe aptaméry, špecifické pre bunkovú stenu ľanového vlákna, ktoré sú schopné odlíšiť priadny typ ľanu od olejného, ako aj kvantifikovať a opísať vlastnosti bunkovej steny ľanu. Kľúčové slová: Syntéza, modifikácia a metabolizmus uhľohydrátov; Aplikované genetické inžinierstvo, transgénne organizmy, rekombinantné proteíny, biosenzory; Poľnohospodárstvo v súvislosti s rastlinnou výrobou, aplikovaná biológia rastlín; Linum usitatissimum L.; Aptamér |
EVOPLROHA - Význam reprodukčných systémov, hybridizácie a symbiotickej asociácie pre evolúciu a prežívanie cievnatých rastlín v prostredí skalných biotopov
The role of reproductive systems, hybridization, and symbiosis in the evolution and long-term survival of vascular plants in a rocky environment
| Doba trvania: |
1. 7. 2023 - 30. 6. 2027 |
| Evidenčné číslo: | APVV-22-0365 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Slovák Marek PhD. |
| Anotácia: | Nelesné skalnaté biotopy predstavujú ekologické ostrovy v rámci okolitej krajiny a napriek náročným environmentálnym podmienkam sú ohniskami biodiverzity s vysokým podielom reliktných a endemických druhov. Napriek tomu sa skalným druhom rastlín kvôli ich vysokej neprístupnosti venuje oveľa menej pozornosti ako ich príbuzným žijúcim v priľahlých ekosystémoch. V dôsledku toho zostali mechanizmy a faktory, ktoré sú základom ich adaptability a vývoja, neobjasnené a to i napriek faktu, že tieto poznatky sú kľúčové pre ich zachovanie a dlhodobé prežitie, najmä vo svetle globálnych klimatických zmien. Plánujeme preskúmať význam vybraných vnútorných a vonkajších znakov na dlho žijúcich krovitých druhoch rodu Daphne (Thymelaeaceae) využívajúc moderné vedecké prístupy (genomika založená na RAD sekvenovaní, meta-barcoding) v kombinácii s počítačovým modelovaním ekologických ník, karyologickými a morfologickými analýzami. Hlavným cieľom tohto projektu je porovnať celkovú genetickú štruktúru a úroveň klonality dvoch skalných špecialistov, D. arbuscula (Západné Karpaty) a D. petraea (Južné Alpy), s bežnejším no stále reliktným a vzácnym príbuzným D. cneorum. Zameriame sa tiež na zistenie úrovne medzidruhovej hybridizácie a introgresie, ako aj na diverzitu mykoríznych zoskupení u študovaných skalných druhoch a pokúsime sa navrhnúť hypotézy o ich úlohe pri adaptácii a prežívaní oboch druhov v skalných biotopoch. Dúfame, že náš výskum poskytne nové informácie nielen o cieľových druhoch, ale aj o evolúcii a adaptácii druhov žijúcich v náročnom prostredí skalných biotopov stredných nadmorských výšok v miernom pásme. Veríme, že výsledky projektu poskytnú kľúčové informácie pre riešenie stratégií ochrany, a tým aj zabezpečenie dlhodobého prežitia týchto cenných a vzácnych druhov európskej flóry.
|
Za hranicou viditeľnosti: Objavovanie skrytej diverzity a nedávnej speciácie pomocou fylogenomiky
Beyond the visible: Uncovering hidden diversity and recent speciation with phylogenomics
| Doba trvania: |
1. 1. 2025 - 31. 12. 2028 |
| Evidenčné číslo: | VEGA 2/0010/25 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Zozomová Judita PhD. |
| Anotácia: | Cieľom navrhovaného projektu je preskúmať evolúciu nedávno diferencovaných a druhovo bohatých skupín rastlín, pre ktoré je typická rozsiahla, ale slabo štrukturovaná variabilita, nejasné ohraničenie druhov, komplikovaná retikulátna a polyploidná evolučná história, ako aj prítomnosť skrytej (kryptickej) diverzity. Pomocou fylogenomického prístupu a s použitím dvoch účinných metód sekvenovania novej generácie získame a spracujeme dáta zo stoviek až tisícov lokusov v genóme veľkého počtu jedincov. Modelovými objektami na toto štúdium budú dva rody z čeľade kapustovitých, Odontarrhena a Erysimum, s pomocou ktorých objasníme spoločné evolučné sily pôsobiace v takýchto skupinách rastlín, ako aj jedinečné a vzácne procesy, ktoré prispievajú k širokému spektru faktorov ovplyvňujúcich diverzitu a evolúciu nedávno diferencovaných rodov. Tento projekt umožní presnejšie hodnotenie skutočnej druhovej diverzity v Európe a tiež zásadne prispeje k lepšiemu chápaniu evolučných procesov rastlín. |
Celkový počet projektov: 62
