Ústav molekulárnej biológie SAV, v. v. i.
Názov témy
Štúdium a charakterizácia regulácie bakteriálneho bunkového delenia Min proteínmi
Program DŠ
Genetika, Molekulárna biológia, Biochémia
Meno školiteľa/-ky
Mgr. Naďa Labajová, PhD.
Kontakt:
Prijímajúca škola
Prírodovedecká fakulta UK
Stručná anotácia
Narastajúca rezistencia voči antibiotikám ohrozuje našu schopnosť účinne liečiť bakteriálne infekcie a predstavuje vážne globálne zdravotný problémy. Štúdium a pochopenie kľúčových procesov zúčastňujúcich sa bakteriálneho delenia buniek môže prispieť k identifikácii potenciálnych cieľov a k vývoju nových liečiv. Proteíny Min komplexu patria medzi deliace proteíny a sú zodpovedné za reguláciu polohy deliaceho septa. Patria medzi negatívne regulátory delenia, teda blokujú delenie na miestach, kde sa nachádzajú. Homológy Min proteínov možno nájsť ako v Gram pozitívnych, tak aj v Gram negatívnych baktériách. V Gram negatívnych baktériách, ako napr. v Escherichia coli sa vyznačujú veľkou dynamikou. Min proteíny v bunke oscilujú od jedného bunkového pólu k druhému a blokujú póly pred vytvorením deliaceho septa. Naopak, v Gram pozitívnych baktériách, ako napr. v Bacillus subtilis sú obyčajne stabilnejšie ukotvené na póloch. Clostridioides difficile je Gram pozitívna baktéria a ľudský patogén. Zaujímavé je, že nesie niektoré homológy proteínov Min systému typické ako pre Gram negatívne, tak aj pre Gram pozitívne baktérie. Témou PhD. práce bude štúdium a lepšia charakterizácia Min proteínov v B. subtilis a ich homológov z C. difficile. Zameriame sa na štúdium ich dynamiky a nových proteín-proteínových interakcií. PhD. študent/ka sa oboznámi s najmodernejšími metódami molekulárnej biológie, mikrobiálnej genetiky, biochémie a super-rozlišovacej mikroskopie. Súčasťou štúdia môže byť aj krátkodobá stáž v zahraničí.