Biomedicínske centrum SAV, v. v. i.
Názov témy
Transkripčná a epigenetická kontrola metabolického preprogramovania nádorových buniek
Program DŠ
genetika
Meno školiteľa/-ky
RNDr. Dana Jurkovičová, PhD.
Kontakt:
Prijímajúca škola
Prírodovedecká fakulta UK
Stručná anotácia
Zámerom projektu je odhaliť kľúčové vzorce metabolického preprogramovania chemorezistentných buniek testiculárnych karcinómov (TGCT) a ich asociované transkripčné a epigenetické signatúry. TGCT bunkové línie a 3D sféroidy budú použité na analýzu transkriptómov a epigenómov s cieľom odhaliť regulačné zmeny spojené s moduláciou metabolických dráh a ich dynamiku a identifikovať nové biomarkery a terapeutické ciele prekonania rezistencie.
CIEĽ1: Porovnať transkriptómy a aktívny chromatín CDDP rezistentných vs. senzitívnych TGCT bunkových línií a identifikovať ich kľúčové s fenotypom asociované rozdiely.
CIEĽ2: Porovnať zmeny transkriptómov a aktívneho chromatínu rezistentných vs. citlivých TGCT buniek vyvolané metabolickými moduláciami a identifikovať najviac ovplyvnené regulačné dráhy.
CIEĽ1: Porovnať transkriptómy a aktívny chromatín CDDP rezistentných vs. senzitívnych TGCT bunkových línií a identifikovať ich kľúčové s fenotypom asociované rozdiely.
CIEĽ2: Porovnať zmeny transkriptómov a aktívneho chromatínu rezistentných vs. citlivých TGCT buniek vyvolané metabolickými moduláciami a identifikovať najviac ovplyvnené regulačné dráhy.