Biomedicínske centrum SAV, v. v. i.
Názov témy
Štúdium účinku patogénnych mutácií na alosterickú reguláciu ryanodínového receptora pomocou molekulových simulácií
Program DŠ
biofyzika
Meno školiteľa/-ky
Ing. Miloslav Karhánek, PhD.
Kontakt:
Prijímajúca škola
Prírodovedecká fakulta UPJŠ
Stručná anotácia
Ryanodínové receptory (RyR) sú iónové kanály, ktoré zabezpečujú spriahnutie excitácie s kontrakciou v kostrovom (RyR1) aj srdcovom svale (RyR2). Mutácie narušujú reguláciu RyR iónmi Ca2+a Mg2+ a tak spôsobujú závažné genetické ochorenia. Cieľom je pomocou molekulárnych simulácií objasniť vplyv vybraných patogénnych mutácií na alosterické dráhy medzi väzbovými miestami regulačných ligandov (Ca2+, Mg2+, ATP, xantíny) a vrátkovacím mechanizmom v póre RyR. Metódy: štruktúrna biológia, programy NAMD alebo GROMACS.