Zoznam národných projektov SAV
Biomedicínske centrum SAV, v. v. i.
Úloha Gingko-biloby v epigenetickej modulácii a malígnej transformácii buniek proti ionizujúcemu žiareniu u pacientov podstupujúcich rádioterapiu.
Role of Gingko-biloba in the epigenetic modulation and cell malignant transformation against ionizing radiation as used in radiotherapy patients
| Doba trvania: |
1.8.2024 - 31.7.2026 |
| Program: |
Plán obnovy EÚ |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Gulati Sachin PhD. |
| Anotácia: | Terapeutická rezistencia k rádioterapii je jednou z hlavných prekážok pri liečbe rakoviny.Tento projekt rozvíja kombinačné stratégie zahŕňajúce Ginkgo biloba (GB) ako rádiosenzibilizátor na prekonanie rádioresistencie v konvenčnej rádioterapii a zosilnenie jej protinádorových účinkov. Zhodnotíme úlohu GB ako rádiosenzibilizátora pri podpore apoptózy indukovanej reaktívnymi kyslíkovými radikálmi pomocou prietokovej cytometrie po ožiarení ľudských nádorových línií. V súčasnosti neexistuje žiadna štúdia týkajúca sa úlohy GB ako epigenetického liečiva v kombinácii s ožiarením pre terapiu. Budeme skúmať epigenetickú moduláciu prostredníctvom metylácie DNA/RNA a histónových proteínov v nádorových líniách ovplyvnených GB po ožiarení. Zmeny v transformácii malígnych buniek vyhodnotíme metódou klonovania na mäkkom agare a metódou transplantácie buniek u SCID myší. Budeme sledovať odlišnú reakciu GB na nádory hodnotením veľkosti, hmotnosti a histopatologickej analýzy. |
„Matching“ granty ku zdrojom získaným od súkromného sektora v rámci výskumnej spolupráce
„Matching" grants to resources obtained from the private sector in the framework of research cooperation
„Matching“ granty ku zdrojom získaným od súkromného sektora v rámci výskumnej spolupráce
„Matching" grants to resources obtained from the private sector in the framework of research cooperation
Aktivácia VGF/BDNF/TrkB dráhy syntetickou mRNA zapúzdrenou v polyplexových nanočasticiach: účinky na nervovú excitabilitu, neuroplasticitu a správanie zvierat
Activation of the VGF/BDNF/TrkB pathway by synthetic mRNA encapsulated in polyplex nanoparticles: effects on neural excitability, neuroplasticity and animal behavior
| Doba trvania: |
1.7.2021 - 30.6.2025 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
prof. PharmDr. Ježová Daniela DrSc. |
| Anotácia: | Neuroplasticita je schopnosť centrálneho nervového systému (CNS) sa meniť a prispôsobovať požiadavkám okolia
za účelom vytvorenia vhodných adaptívnych odpovedí. Tento zložitý proces sa dosahuje reorganizáciou CNS na
štruktúrnej a/alebo funkčnej úrovni. Neuroplasticita je nevyhnutná pre normálnu činnosť CNS. Pri viacerých
porucházh CNS, napr. pri depresívnej poruche a pri schozofrénii, nastáva zníženie plasticity mozgu. Neurotrofické
rastové faktory ako napr. mozgový neurotrofický rastový faktor (BDNF), VGF a fibroblastový rastový faktor 2
(FGF2) hrajú kľúčovú úlohu v neuroplasticite. Cieľom predloženého projektu je využitie originálneho prístupu, ktorý
umožní skúmať účinky neinvazívneho doručenia exogénnej mediátorovej RNA (mRNA) kódujôcej tieto faktory do
CNS na neuronálnu excitabilitu, plasticitu a správanie zvierat. Fluorescenčne značená mRNA bude zapúzdrená v
polyplexových nanomicelách a aplikovaná intranazálne. Inkorporácia mRNA v štruktúrach CNS bude sledovaná
STED mikroskopiou. Budeme skúmať účinky exogénnej mRNA kodujúcej rastové faktory na neuronálnu
excitabilitu použitím in vitro a in vivo elektrofyziológie, na neurogenézu použitím použitím značkovačov bunkového
delenia a imunohistochemického farbenia a dendrito- a synaptogenéza bude sledovaná elektrónovou
mikroskopiou. Zmeny v množstve endogénnej mRNA a expresii proteínov sa preskúmajú použitím real-time PCR
a Western blotovaním. Na monitorovanie zmien vo Ca2+ signalizácii sa použije metóda planárnych lipidových
membrán. Zmeny v správaní zvierat (kognitívne schopnosti, sociálna interakcia, úzkostné správanie) budú
posúdené použitím príslušných behaviorálnych testov. Očakávame, že polyplexné nanomicely, ktoré
nadizajnujeme, dopravia zvolenú mRNA kodujúcu neurotrofické faktory do hlbokých mozgových štruktúr a
následne vyvolajú pro-neuroplastické, pro-kognitívne a anxiolytické účinky. Tento neinvazívny spôsob doručenia
terapeutickej mRNA do mozgu by mohol byť v budúcnosti využitý v moderných stratégiách. |
Analýza klinickej relevancie duplikácie EDA2R génu v kmeňových bunkách chlapa s autizmom k jeho ochoreniu. Charakterizácia expresie EDA2R receptora v kmeňových bunkách získaných z dentálnej pulpy permanentných a dočasných zubov.
Analysis of the clinical relevance of EDA2R gene duplication in autistic boy stem cells to his disease.Characterization of EDA2R receptor expression in stem cells obtained from the dental pulp of permanent and temporary teeth.
Analýza úlohy G-patch proteínov pri regulácii RNA helikáz zapojených do zostrihu pre-mRNA kvasinky Schizosaccharomyces pombe
Analysis of the role of G-patch proteins in regulating RNA helicases involved in pre-mRNA splicing in Schizosaccharomyces pombe
Analýza úlohy málo charakterizovaných faktorov v regulácii procesivity RNA polymerázy II v kvasinke Schizosaccharomyces pombe
Analysis of the role of poorly characterized factors in regulating the processivity of RNA polymerase II in the fission yeast Schizosaccharomyces pombe
| Doba trvania: |
1.7.2024 - 31.12.2025 |
| Program: |
PostdokGrant |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Selický Tomáš PhD. |
| Anotácia: | Udržiavanie génovej expresie závisí od regulácie transkripcie RNA katalyzovanej RNA polymerázou II (RNAP II).
RNAP II je komplexný enzým zložený z viacerých podjednotiek. Najväčšia podjednotka RNAP II, Rpb1, má
charakteristickú C-terminálnu doménu (CTD) pozostávajúcu z viacerých opakovaní konzervovaného heptapeptidu
YSPTSPS. Je známe, že aktivita RNAP II priamo súvisí s fosforylačným vzorom heptapeptidových opakovaní v CTD.
V súčasnosti sa vie, že niekoľko CTD kináz a fosfatáz je spojených s iniciáciou, produktívnou elongáciou a
termináciou transkripcie. V tomto projekte plánujem analyzovať regulačnú úlohu dvoch doposiaľ málo
charakterizovaných faktorov, SPBP4H10.16c a Whi2, spojených s malou fosfatázou RNAP II CTD S5 Psr1, pre ich
možnú úlohu pri regulácii procesivity RNAP II v kvasinke S. pombe. Lepšie pochopenie toho, ako faktory
SPBP4H10.16c a Whi2 modulujú aktivitu Psr1 fosfatázy, by pomohlo objasniť dynamiku regulácie aktivity konkrétnych
CTD kináz a fosfatáz, respektíve poodhaliť ako prípadna nerovnováha vo fosforylácii RNAP II CTD v dôsledku
dysfunkcie SPBP4H10.16c, Whi2 a Psr1 ovplyvňuje génovú expresiu. |
Analýza úlohy novoidentifikovaných faktorov viažucich sa na komplex zostrihu pre-mRNA pri zostavovaní a prestavbe skorých komplexov zostrihu pre-mRNA a aktivácii komplexu zostrihu pre-mRNA v kvasinke Schizosaccharomyces pombe
Analysis of the role of newly identified spliceosome-associated factors in the assembly and remodeling of early splicing complexes and the activation of the spliceosome in the fission yeast Schizosaccharomyces pombe
Antivirálne liečivá proti COVID-19: Dizajn, syntéza a testovanie aktivity špecifických inhibítorov virálnych proteáz koronavírusu SARS-CoV-2
Antiviral drugs against COVID-19: Design, synthesis and biological activity testing of specific inhibitors of viral proteases of coronavirus SARS-CoV-2
| Doba trvania: |
1.7.2022 - 30.6.2026 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Nemčovičová Ivana PhD. |
| Anotácia: | Pandémia nového koronavírusu SARS-CoV-2, ktorá spôsobuje závažné ochorenia respiračného traktu (COVID-
19), predstavuje dlhodobé ohrozenie zdravia populácie. Zaočkovanosť populácie dostupnými vakcínami na Slovensku je nízka a v súčasnosti je na liečbu COVID-19 schválené len jedno širokospektrálne antivirotikum –
remdesivir, ktorý je zacielený na virálnu RNA polymerázu. Náš tím, na základe mnohoročných skúseností v oblasti navrhovania nových antivirálnych látok (napr. proti HIV-1, HCV, Dengue, chrípka typu A), sa od začiatku pandémie COVID-19 intenzívne venuje výskumu inhibítorov virálnych proteáz: hlavnej proteázy Mpro a papaínovej proteázy PLpro vírusu SARS-CoV-2, ktoré patria medzi kľúčové farmakologické targety pre antivirálnu terapiu. Predkladaný projekt nadväzuje na naše predchádzajúce výsledky, v ktorých sa kombinujú kompetencie z piatich skúsených
skupín riešiteľov z dvoch univerzít (FaF a PriF UK, UCM), spolu s CHÚ SAV a VÚ BMV SAV. Stratégia projektu sa opiera o nasledovný integrovaný prístup výskumu liečiv.
• Počítačový dizajn a optimalizáciu špecifických peptidomimetických α-ketoamidov, ktoré inhibujú proteolytickú aktivitu Mpro; optimalizáciu sérií bis-benzylidéncyklohexanónov a benzamidov, ktoré inhibujú proteolytickú a deubiquitinačnú aktivitu PLpro koronavírusu SARS-CoV-2.
• Vývoj syntetických ciest a syntézu peptidomimetických α-ketoamidov, benzamidov a bis- benzylidéncyklohexanónov.
• Testovanie inhibície enzymatickej aktivity troch skupín látok na rekombinantne pripravených enzýmoch Mpro a PLpro a vývoj nových metód testovania inhibičnej aktivity na virálnych enzýmoch.
• Testovanie antivirálnej aktivity in vitro troch skupín látok na úrovni inhibície humánnych bunkových línií
infikovaných vírusom SARS-CoV-2.
• Výskum interakcií nových inhibítorov s biologickými membránami a optimalizácia absorpcie a biodostupnosti v tkanivách respiračného traktu. |
Bakteriálna Lon proteáza ako perspektívny nástroj na liečbu mnohopočetného myelómu
Bacterial Lon protease as an emerging tool for multiple myeloma treatment
Bariérové proteíny vo vzťahu k myelínu a mentálnym poruchám
Barrier proteins in relation to myelin and mental disorders
| Doba trvania: |
1.7.2024 - 31.12.2025 |
| Program: |
PostdokGrant |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Karailiev Peter PhD. |
| Anotácia: | Schizophrenia is a highly prevalent psychiatric disorder with severe socio-economic consequences. Using an animal
model of acute stress in early postnatal age, with subsequent development of symptoms comparable to those
observed in schizophrenia, we will test the hypothesis that neurochemical alterations in the brain structure corpus
callosum are associated with changes in animal behaviour and brain lateralization. To fulfill this objective, we will
evaluate changes in the gene expression of selected proteins of the corpus callosum, which are important for the
function of both the myelin sheath and the blood-brain barrier. The identified changes along with alterations in animal
behaviours and brain lateralization will be evaluated with respect to the animal sex. Novel observations in this area
may deepen the understanding of the pathophysiology of psychotic disorders. |
Biočipové systémy na cielenú glykánovú analýzu biomarkerov pre biomedicínske a biotechnologické aplikácie
Biochip systems for targeted glycan analysis of biomarkers for biomedical and biotechnological applications
| Doba trvania: |
1.7.2021 - 30.6.2025 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Nemčovičová Ivana PhD. |
| Anotácia: | Projekt GLYCO4BIO je zameraný na výskum a vývoj analytických systémov založených na microarray biočipoch umožňujúcich cielené a vysokovýkonné glykoprofilovanie, a na ich použitie v biomedicíne a biotechnológii. Jedná sa o interdisciplinárny výskum s vysokou mierou inovatívnosti, najmä v oblasti konštrukcie a aplikácií originálnych biočipových zariadení na microarray platforme. Budú vyvíjané, overované a validované nové systémy pre analýzu glykánových štruktúr v rôznych typoch biologických vzoriek, ako vysokovýkonný mikrofluidický reflektometrický label-free microarray systém, a on-chip glykoprofilačná platforma kombinujúca microarray a MS techniky. Predpokladaný prínos projektu je najmä vo vývoji inovatívnych biočipových systémov pre cielené glykorozpoznávanie na báze moderných technológií pre využitie v biomedicíne, biotechnológii, pri štúdiu biointerakcií a pri analýze a skríningu biomarkerov. Systémy budú aplikované napríklad pri výskume a detekcii biomarkerov kongenitálnych porúch glykozylácie (CDG), rakoviny, tehotenskej cukrovky, v onkologickom výskume, ako aj pri vývoji a testovaní vlastností terapeutických proteínov. Vyvíjané biočipové systémy svojou výkonnosťou výrazne prevyšujú tradičné techniky a majú vysoký potenciál pre ich transláciu do klinickej analýzy. Očakávané výsledky projektu prinesú zlepšenie a rozšírenie možností diagnostiky a terapie a významný prínos sa predpokladá aj v rozšírení poznatkov na poli biomedicínskeho výskumu, glykoproteomiky a v biotechnológii. |
Biologicky relevantné zmesi endokrinných disruptorov: účinky na in vitro modeloch ovariálnych intrafolikulárnych procesov a ovariálnych nádorových líniách
Biologically relevant mixtures of endocrine disruptors: effects on in vitro models of ovarian intrafollicular processes and ovarian cancer cell lines
Cielená modulácia chromatínovej štruktúry v liečbe malígneho melanómu uvey so zlou prognózou
Targeting high-order chromatin regulation for the treatment of poor prognosis uveal melanoma
| Doba trvania: |
1.7.2024 - 30.6.2028 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Smolková Božena PhD. |
| Anotácia: | Pokrok v liečbe nádorových ochorení bol v posledných desaťročiach dosiahnutý hlavne vďaka úspechom cielených terapií, inhibítorov opravy DNA a využitiu imunoterapie. Pre značnú časť pacientov, vrátane pacientov s malígnym melanómom uvey (UM), však tieto prístupy neprinášajú požadovaný efekt, preto sa pri liečbe zvažujú alternatívne mechanizmy. Hoci bolo dokázané, že v nádorových tkanivách vysoko rizikových UM pacientov dochádza k rozsiahlemu preprogramovaniu metylácie DNA, aberácie na vyššej úrovni epigenetickej regulácie neboli doteraz študované. Na základe našich predbežných výsledkov, ktoré ukázali dereguláciu veľkého počtu epigenetických enzýmov, zodpovedných za modifikácie histónov a remodeláciu chromatínu, sa však domnievame, že tieto zohrávajú v progresii UM významnejšiu úlohu ako samotná metylácia DNA. Pochopenie týchto zmien by mohlo byť prínosné predovšetkým pre liečbu pacientov s UM. Úspech epigenetických liečiv tretej generácie, špecificky zacielených na tieto modifikácie, je však možný iba s využitím prístupov personalizovanej medicíny, založených na molekulárnej charakterizácii nádorov a poznaní mechanizmov účinku vybraných inhibítorov. V predkladanom projekte plánujeme využiť najnovšie technológie, ktoré prinášajú prevrat v chápaní nádorovej heterogenity a úloh jednotlivých bunkových populácií. Metóda scATAC-seq (Single cell Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing) sa využíva na stanovenie dostupnosti chromatínu. V kombinácii s scRNA-seq (Single cell RNA sequencing) umožňuje identifikáciu regulačných oblastí. Ich použitie nám umožní posúdiť doteraz málo preskúmanú heterogenitu tkaniva UM, rozsah preprogramovania v jednotlivých bunkových populáciách a ich úlohu v progresii ochorenia. Na základe získaných údajov vyberieme prostredníctvom in silico nástrojov najrelevantnejšie terapeutické ciele pre validáciu in vitro a in vivo, s použitím nami vyvinutých a na celogenómovej úrovni charakterizovaných modelov nádorových xenograftov. |
Cirkulácia vírusu kliešťovej encefalitídy v blízkosti poľnohospodárskych fariem a lesných lokalitách na Slovensku
Circulation of tick-borne encephalitis virus in foci close to agricultural farms and in sylvatic sites of Slovakia
| Doba trvania: |
1.7.2024 - 30.6.2028 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Ličková Martina PhD. |
| Anotácia: | Kliešťová encefalitída (KE) je vírusové ochorenie centrálneho nervového systému, ktoré je spôsobené vírusom KE.
Hlavným zdrojom nákazy u ľudí sú v koži prichytené infekčné kliešte, najmä druh Ixodes ricinus. Okrem toho
existuje aj alimentárna nákaza prostredníctvom konzumácie nepasterizovaného mlieka a mliečnych výrobkov z
nakazených hospodárskych zvierat (ovce, kozy, hovädzí dobytok). V rámci Európy sa Slovensko vyznačuje
relatívne vysokým podielom alimentárnych nákaz na celkovom počte prípadov KE. V posledných desaťročiach má
chorobnosť KE vrátane alimentárnych infekcií stúpajúci trend a boli identifikované nové ohniská v severnejších
oblastiach Slovenska a vo vyšších nadmorských výškach. Vírus KE koluje v prírodných ohniskách, prenášačmi sú
kliešte, rezervoárovými hostiteľmi sú drobné zemné cicavce, najmä hlodavce. Napriek tomu, že existuje veľa
poznatkov o ohniskách KE na Slovensku z druhej polovice 20. storočia, v súčasnej ére globálnych zmien a nárastu
chorobnosti KE sa výskumu ohnísk KE venuje relatívne malá pozornosť. V navrhova nom projekte sa bude
uplatňovať prístup „One Health“. Hlavným cieľom projektu je charakterizovať osobitosti cirkulácie a šírenia vírusu
KE v novo objavených ohniskách v blízkosti poľnohospodárskych fariem na Slovensku. Okrem toho sa bude
sledovať úloha drobných hlodavcov v udržiavaní vírusu KE v mikro-ohniskách a rozdiel v cirkulácii vírusu medzi
vidieckymi ohniskami a prírodnými ohniskami v lesnom ekosystéme. Projekt má charakter základného výskumu s
možnosťou využitia výstupov projektu farmármi v eliminácii rizík nákazy KE u voľne pasúcich sa domácich
hospodárskych zvierat a v epidemiologickom informačnom systéme Úradu verejného zdravotníctva SR. |
Cvičenie moduluje náklad cirkulujúcich extracelulárnych vezikúl u ľudí v zdraví a chorobe
Exercise modulates cargo of circulating extracellular vesicles in humans in health and disease
Cytokínové profilovanie v spojení s imunotargetingom karbonickej anhydrázy IX ako perspektívny nástroj v diagnostike a liečbe rakoviny pankreasu
Cytokine profiling together with carbonic anhydrase IX immunotargeting as a promising tool in diagnostics and treatment of pancreatic cancer
Detailná analýza a objasnenie funkcie Cka1 a Ksg1 proteínkináz využitím ich kondičných na ATP analógy citlivých mutantov
Detailed analysis and elucidation of functions of Cka1 and Ksg1 protein kinases using the conditional ATP analog-sensitive mutants
DNA metylácia ako nástroj pre implemetáciu tekutej biopsie u melanómu uvey
DNA methylation biomarkers as a tool for the implementation of liquid biopsy in uveal melanoma
| Doba trvania: |
1.1.2024 - 31.12.2027 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Horváthová Kajabová Viera PhD. |
| Anotácia: | Melanóm uvey (MU) predstavuje agresívny typ nádoru pochádzajúci z pigmentových vrstiev oka. Klinické
rozhodovanie pri UM sa rutinne opiera o hodnotenie rizika metastázovania na základe klinicko-patologických
vlastností nádoru. Avšak predikcia prognózy u pacientov, ktorí podstúpia oko zachovávajúcu terapiu, je možná
len prostredníctvom invazívnej biopsie tkaniva, čo nesie riziko uvoľnenia a šírenia nádorových buniek.
Neinvazívna tekutá biopsia, ktorá u MU zahŕňa detekciu nádorovo asociovaných genetických aberácií v krvi, má
však viacero limitácií. Nedávny výskum odhalil, že významnou črtou vysoko rizikových MU je zmenený profil
metylácie DNA. Preto predpokladáme, že nádorovo špecifické zmeny metylácie DNA, identifikované v periférnej
krvi, by mohli slúžiť ako spoľahlivé prognostické markery. Ich senzitivita a špecificita bude testovaná a
validovaná v starostlivo vybranej kohorte pacientov s MU. Implementácia tekutej biopsie u MU má potenciál
podporiť klinické rozhodovanie a zlepšiť starostlivosť o pacienta. |
Eliminácia kliešťami prenášaných infekcií bez použitia antibiotík
Non-antibiotic approach for the treatment of tick-borne infections
Epigenetická regulácia účinku circRNA na radiačne-indukované poškodenie
Epigenetic regulation effect of circRNA on radiation-induced damage
| Doba trvania: |
1.7.2024 - 30.6.2026 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
doc. Ing. Beliaev Igor DrSc. |
| Anotácia: | Pľúcna fibróza spôsobená ožiarením je bežnou komplikáciou u pacientov podstupujúcich rádioterapiu. Vzhľadom
na nedostatok účinnej prevencie a liekov v klinickej praxinie je poškodenie pľúc fibrózou kontrolovaným a
reverzibilným procesom. Predchádzajúce štúdie zistili, že epiteliálno-mezenchymálna transformácia (EMT) je
kľúčovým hnacím faktorom a dôležitým článkom v procese pľúcnej fibrózy. Okrem toho je proces EMT
sprevádzaný významnou zmenou v profile expresie cirkulárnej RNA (circRNA), ktorá sa teraz považuje za kľúčový
prvok mechanizmu regulácie pľúcnej fibrózy.
Skríning vykonaný čínskym tímom ukázal, že circRNA0085439 reaguje na žiarenie. Nadmerná expresia
circRNA0085439 môže účinne zvrátiť žiarením indukované zníženie expresie epitelového markera E -kadherínu a
zvýšenie expresie intesticiálneho markera N-kadherínu. Slovenský výskumný tím bude testovať dve nezávislé
metódy kvantifikácie circRNA0085439 vo vybraných pľúcnych epitelových bunkových líniách. Tento prístup sa
použije na validáciu qPCR dát.
V navrhovanom projekte sme predpokladali, že circRNA0085439 môže aktivovať Hippo signálnu dráhu pomocou
SAV1, čím inhibuje výskyt a rozvoj rádioaktívnej pľúcnej fibrózy. Plánujeme uskutočniť cielenú syntézu nanočastíc
na báze zlata, platiny a paládia, a študovať ich fyzikálno-chemické a biologické vlastnosti na bunkových a
animálnych modeloch. Predpokladáme, že veľkosť, koncentrácia, doba inkubácie s nanočasticami, dávka a typ
žiarenia budú mať vplyv na expresiu circRNA0085439. Na základe uvedeného plánujeme vybrať a vyvinúť
nanonosič funkcionalizovaný pomocou spektroskopických a termogravimetrických metód z hľadiska jeho funkčnosti
a stability, aby sme určili schopnosť indukovať nadmernú expresiu circRNA0085439. |
Eradikácia multirezistentných mikroorganizmov vrátane nosných kmeňov u pacientov pomocou personalizovaného prístupu
Eradication of multiresistant microorganisms including carrier strains in patients using the personalised approach
| Doba trvania: |
1.7.2024 - 30.6.2028 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Zelník Vladimír CSc. |
| Anotácia: | V súčasnosti rozsah šírenia multirezistentných mikroorganizmov (MDR) je globálnym problémom. Prevalencia rezistencie na antibiotiká znižuje účinnosť liečby, vedie k objaveniu sa ťažko liečiteľných infekcií a zvýšenej úmrtnosti. Prevažovanie MDR má negatívny vplyv aj na životné prostredie vrátane poľnohospodárstva, ktoré je hrozbou pre potravinovú bezpečnosť. Podľa WHO cirkulácia cefalosporín-rezistentných E. coli v roku 2022 dosiahla 42 % v 76 krajinách sveta, meticilín-rezistentných S. aureus – 35 %. Vývoj nových terapeutických riešení, vrátane alternatívnych, zlepšenie existujúcich, ktoré znížia používanie antimikrobiálnych liekov a šírenie antimikrobiálnej rezistencie je veľmi dôležitý. Autovakcinácia jedná zo známych alternatívnych metód, využívaných na liečbu chronických recidivujúcich ochorení. Napriek rozsiahlym skúsenostiam s používaním autovakcín nie sú mechanizmy ich účinku dostatočne preštudované, neexistujú štandardizované metódy, čo obmedzuje ich široké použitie. Využitie možností modernej imunológie a mikrobiológie umožní prehĺbiť poznatky o imunitných mechanizmoch účinku autovakcín a zmodernizovať spôsob výroby autovakcín s cieľom zvýšiť bezpečnosť autovakcíny a zachovať jej imunogenicitu, čo bude mať pozitívny sociálny a ekonomický efekt. |
Experimentálne štúdium interakcií viroidov s ich rastlinnými hostiteľmi
An experimental study of the interactions of viroids with their plant hosts
Extracelulárne vezikuly ako nástroj integrovanej adaptačnej odpovede na cvičenie: štúdie in vitro a in vivo
Extracellular vesicles a tool integrating adaptive response to exercise: in vitro and in vivo studies
| Doba trvania: |
1.1.2024 - 31.12.2027 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Ukropec Jozef DrSc. |
| Anotácia: | Obezita je patofyziologickým podhubím mnohých chronických ochorení. Pravidelné cvičenie prispieva k prevencii obezity a jej komorbidít. Adaptácia na cvičenie so sebou prináša významné zmeny, ktorých dôsledkom je integrácia energetického metabolizmu na systémovej úrovni. Exerkíny, signálne molekuly, ktoré sa uvoľňujú do krvi pri cvičení, sa podieľajú na integrácii energetického metabolizmu, a kvôli lepšej biologickej dostupnosti môžu byť prenášané pomocou extracelulárnych vezikúl (EV). Primárnym cieľom práce je skúmať moleukové zloženie a schopnosť EV, uvoľňovaných do krvi pri cvičení (i) napodobniť metabolicky významné účinky cvičenia v bunkách ľudského kostrového svalu a tukového tkaniva, a (ii) vyvolať multiorgánové zmeny energetického metabolizmu u myší. Navrhovaný projekt umožní (i) objasniť úlohu extracelulárnych vezikúl pri akútnej a adaptačnej odpovedi na cvičenie a (ii) identifikovať biologicky významné molekuly obsiahnuté v EVs, ktoré majú potenciál zlepšiť metabolické zdravie pacientov s obezitou. |
Funkčná analýza necharakterizovaných na komplex zostrihu viažúcich sa faktorov kvasinky Schizosaccharomyces pombe
Functional analysis of uncharacterized spliceosome-associated factors of Schizosaccharomyces pombe
| Doba trvania: |
1.1.2024 - 31.12.2027 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Kretová Miroslava PhD. |
| Anotácia: | Zostrih pre-mRNA je proces, pri ktorom dohádza k odstráneniu intrónov a spojeniu exónov za vzniku zrelej mRNA. Napriek tomu, že poznáme základné princípy fungovanie zostrihu pre-mRNA ako aj väčšinu zostrihových faktorov, stále existuje množstvo faktorov regulujúcich proces zostrihu pre-mRNA, ktoré zatiaľ nie sú charakterizované. Cieľom tohto projektu je podrobné preskúmanie doteraz necharakterizovaných faktorov SPAC683.02c, SPAC1071.09c, SPAC1952.06c, SPAC30D11.14c a SPBC11C11.01 deliacej kvasinky S. pombe na molekulárnej úrovni, o ktorých predpokladáme, že sa podieľajú na regulácii zostrihu pre-mRNA. Zameriame sa hlavne na ich schopnosť regulácie iných zostrihových faktorov, ako aj na ovplyvnenie procesu zostrihu pre-mRNA v prípade ich nefunkčnosti. Získané vedomosti o fungovaní predpokladaných faktorov zostrihu na molekulárnej úrovni nám pomôže rozšíriť poznatky o komplexnosti mechanizmov podieľajúcich sa na zostrihu pre-mRNA. |
Genetické príčiny vzácnych metabolických ochorení s dôrazom na funkčné štúdie nových génových variantov.
Genetic causes of rare inherited metabolic diseases with emphasis on functional studies of novel variants
| Doba trvania: |
1.7.2023 - 30.6.2027 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Gašperíková Daniela DrSc. |
| Anotácia: |
Dedičné metabolické poruchy sú veľkou skupinou zriedkavých ochorení, kde značná časť pacientov stále nie je diagnostikovaná pre nedostatok súčasných poznatkov alebo pre nejednoznačný klinický obraz. S rastúcou dostupnosťou sekvenovania novej generácie sa identifikuje čoraz viac genetických variantov, ktorých patogenita nie je známa. Genetická diagnostika zriedkavých chorôb si preto vyžaduje vedecký prístup a má predpoklad priniesť nové základné poznatky. Tento projekt sa zameriava na identifikáciu a genetickú diagnostiku pacientov s extrémne zriedkavými metabolickými poruchami. Súčasťou projektu je nielen pokračovanie v rozširovaní DNA a RNA biobanky, ale aj vytvorenie novej biobanky primárnych bunkových línií fibroblastov od pacientov. Osobitné úsilie vynaložíme na skríning pediatrických pacientov s podozrením na Wolframov syndróm. Varianty identifikované sekvenovaním budeme klasifikovať podľa medzinárodných štandardov a u tých kde nebude jasný ich význam vykonáme analýzy s cieľom potvrdiť alebo vylúčiť ich patogenitu. V rámci projektu budeme skúmať aj nové varianty v génoch PSMB5 a ATAD3A, ktoré sme identifikovali v predchádzajúcich štúdiách. Gén PSMB5 zatiaľ nebol spojený s ochorením, preto určíme patogenitu identifikovaných variantov pomocou „rescue“ experimentu, po ktorom budú nasledovať štúdie mechanizmu a vplyvu variantov na mitochondrie. V prípade génu ATAD3A budeme hodnotiť vplyv testovaných variantov na mitochondrie, endoplazmatické retikulum a ich kontakty, ktoré sú sľubným terapeutickým cieľom. Podrobne zdokumentujeme klinický fenotyp pacientov a upravíme liečbu podľa farmakogenetického princípu, v prípade Wolframového syndrómu zmenou liečby diabetu. Projekt má potenciál priniesť nové poznatky o etiopatogenéze metabolických porúch s okamžitou aplikáciou do klinickej praxe. |
Genomika pyretroid-rezistentných komárov z rodu Culex infikovaných vírusom západonílskej horúčky v súvislosti s lepším pochopením zmien v citlivosti na vírus
Genomics of pyrethroid-resistant mosquitoes from genus Culex infected by West Nile virus in connection to a better understanding of changes in the viral susceptibility
Glymfatický systém a jeho využitie vo farmakoterapii ochorení CNS
Glymphatic system and its utilization in pharmacotherapy of CNS diseases
| Doba trvania: |
1.7.2024 - 30.6.2028 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Račeková Enikö CSc. |
| Anotácia: | Glymfatický systém je nedávno objavený systém pozostávajúci z paravaskulárnych priestorov v centrálnom nervovom systéme (CNS), ktorý slúži na drenáž rozpustných proteínov a metabolitov z nervového tkaniva do cerebrospinálneho moku (CSF). Počas starnutia účinnosť glymfatického systému klesá, pričom akumulácia metabolitov a bielkovinových agregátov (napr. tau proteín, beta amyloid) v nervovom tkanive je spájaná s rozvojom neurodegeneratívnych ochorení. Napriek kľúčovej úlohe v udržaní homeostázy nervového tkaniva sú doteraz známe vedomosti o usporiadaní glymfatického systému obmedzené na oblasť mozgu a usporiadanie glymfatického systému miechy ostáva aj naďalej z veľkej miery nepreskúmané. Pochopenie usporiadania a fyziológie glymfatického systému by mohlo mať dopad aj na posun v oblasti farmakoterapie patologických stavov CNS. Predložený projekt je zameraný na výskum glymfatického systému a jeho využitia na podávanie terapeutík pri liečbe ochorení CNS. V prvej časti projektu bude cieľom analyzovať jednotlivé komponenty glymfatického systému počas ontogenézy s ohľadom na charakterizáciu atribútov, ktoré sú dôležité nielen pre udržanie homeostázy, ale aj pre potenciálne využitie pri farmakoterapii. V druhej časti projektu zistíme, či je možné využiť glymfatický systém na intracisternálne podávanie terapeutík naviazaných na biodegradovateľné nanočastice na báze oxidu kremičitého, čím by bolo možné prekonať obmedzenia spojené s podávaním liečiv cez hematoencefalickú bariéru, či konvenčného podávania liečiv intracisternálnou alebo intratekálnou cestou. V tretej časti projektu sa zameriame na možné riziká a dopady nami vyvinutej farmakoterapie na funkcie nervového a glymfatického systému. |
Hľadanie klinicky relevantných biomarkerov pre stratifikáciu CRC pacientov použitím molekulárnych a bioinformatických metód.
Verification of clinically relevant biomarkers for the stratification of CRC patients by molecular and bioinformatic methods.
| Doba trvania: |
1.1.2022 - 31.12.2025 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Ing. Poturnajová Martina PhD. |
| Anotácia: | Slovenská republika má druhý najvyšší výskyt a mortalitu na nádory hrubého čreva a rekta („colorectal cancer“ -CRC) na svete. U 50% pacientov sa vyvinú metastázy a 40% pacientov v štádiu II-III podľahne recidíve v nasledujúcich 5 rokoch po chirurgickej liečbe. Výskum sa preto zameriava na identifikáciu vysokorizikových pacientov pomocou nových prognostických biomarkerov. V projekte budeme analyzovať expresiu novoobjavených dlhých nekódujúcich RNA (lncRNA), ich koreláciu s prognózou ochorenia, chemorezistenciou a metastázovaním a overíme možnosť ich využitia ako prognostického biomarkera ochorenia.
Výsledky by mali umožniť definovať rizikové skupiny CRC pacientov s horšou prognózou alebo naznačia možnosti liečby individuálneho pacienta pri rozhodovaní medzi radikálnejšou vs. šetrnejšou terapiou. Prepojenie aplikovaného vývoja s potrebami klinického onkologického pracoviska za použitia najnovších bioštatistických a bioinformatických metód nám umožňuje priblížiť sa k personalizovanej liečbe CRC pacienta. |
Hľadanie nových neurobiologických cieľov súvisiacich so stresovými duševnými poruchami na jedinečných zvieracích modeloch
Searching for new neurobiological targets implicated in stress-related mental disorders in unique animal models
Hodnotenie protektívneho pôsobenia vybraných fytochemikálií proti neurotoxickým účinkom kovových nanočastíc pomocou bunkových modelov in vitro
Assessment of protective action of selected phytochemicals against metal nanoparticle-induced neurotoxicity using in vitro cell models
| Doba trvania: |
1.1.2024 - 31.12.2027 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Scsuková Soňa CSc. |
| Anotácia: | Rýchly rozvoj nanotechnológií vedie k produkcii inovatívnych (nano)produktov a aplikácií, zároveň však vyvoláva
obavy z možného vystavenia ľudí nanočasticiam (NČ) a ich nepriaznivých účinkov na ľudské zdravie. Kovové
NČ majú širokospektrálne využitie v produktoch dennej spotreby a biomedicínskych aplikáciách. Existujú dôkazy,
že po prekročení hematoencefalickej bariéry môžu NČ interagovať s neurálnymi bunkami a vyvolať sériu porúch
v nervovom systéme, čím sa zvyšuje potenciálne riziko neurotoxicity. Potenciálne mechanizmy pôsobenia NČ
súvisia najmä s oxidačným stresom a zápalom. V poslednej dobe sa venuje veľká pozornosť novým prístupom k
zvýšeniu biologickej bezpečnosti nanočastíc. Podávanie fytochemikálií s antioxidačnými a protizápalovými
vlastnosťami poskytuje sľubný potenciál na zmiernenie nepriaznivých účinkov NČ na biologické systémy. V
tomto projekte budeme analyzovať možné protektívne účinky vybraných fytochemikálií proti neurotoxickým
účinkom kovových NČ pomocou série testov in vitro. |
Charakterizácia excitačných a inhibičných neurónov v oblastiach mozgu doležitých pre vývin sociálneho správania v modeli autizmu
Characterization of excitatory and inhibitory neurons in the brain areas relevant for development of social behaviour in the autism-related model
Charakterizácia NF-kB signalizácie definovaním anti-myelómovej aktivity a mechanizmov účinku inhibítora QNZ
Characterization of NF-kB signaling by defining the anti-myeloma activity and mechanisms of action of QNZ inhibitor
Charakterizácia nových proteínov podieľajúcich sa na regulácii zostrihu pre-mRNA
Characterization of novel proteins involved in the regulation of pre-mRNA splicing
Charakterizácia solubilnej formy karbonickej anhydrázy IX v molekulárnych podtypoch karcinómu prsníka a jej význam pre prognózu.
Characterization of the soluble form of carbonic anhydrase IX in molecular subtypes of breast cancer and its significance for prognosis.
| Doba trvania: |
1.1.2024 - 31.12.2027 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Režuchová Ingeborg PhD., MPH |
| Anotácia: | Karbonická anhydráza IX (CAIX) je uznávaným endogénnym markerom nádorovej hypoxie a jej vysoká expresia
v tkanive mnohých solídnych nádoroch, vrátane karcinómov prsníka, je považovaná za nepriaznivý prognostický
marker. Význam solubilnej formy CAIX, ktorá môže byť detegovaná v telových tekutinách, nie je doteraz
spoľahlivo definovaný. Solubilná forma CAIX (sCAIX) obsahuje okrem ektodomény CAIX, odštepovanej z
nádorových buniek metaloproteázami, aj CAIX-pozitívne exozómy. Keďže sCAIX cirkuluje v organizme aj po
odstránení primárneho nádoru, môže ďalej pôsobiť v autokrinnej a/alebo parakrinnej signalizácii. Sledovanie
hladín sCAIX a ich korelácia s expresiou CAIX v nádorovom tkanive a ostatnými klinicko-patologickými
parametrami u pacientok s včasným karcinómom prsníka, spolu s detailným poznaním biogenézy CAIX a jej
solubilnej formy v jednotlivých podtypoch karcinómu prsníka, zohľadňujúc ich odlišnú molekulovú výbavu a
odpoveď na hypoxiu, významne prispejú k pochopeniu úlohy sCAIX v prognóze ochorenia. |
Identifikácia génov kontrolujúcich apokrinnú sekréciu.
dentification of genes controling apocrine secretion
| Doba trvania: |
1.7.2024 - 30.6.2028 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Farkaš Robert CSc. |
| Anotácia: | Na rozdiel od historickej vízie, apokrinnú sekréciu (AS) je možné v súčasnosti označiť za zreteľne definovaný nekanonický a nevezikulárny bunkový transportný a sekretorický mechanizmus. V porovnaní s klasickou a intenzívne študovanou exocytózou (merokrinnou sekréciou), ktorej hlavné komponenty sú už desiatky rokov známe, molekulárno-genetické determinanty AS začínajú byť iba poznávané, najmä kvôli intenzívnemu výskumu slinných žľazách u modelového organizmu Drosophila melanogaster. V predkladanom projekte plánujeme využitím molekulárnych a genetických nástrojov rozšíriť identifikáciu génov regulujúcich proces AS, a súčasne analyzovať ich vzájomné interakcie vrátane interakcií ich proteínových produktov. Naša proteomická analýza apokrinných sekrétov poukázala na významnú fylogenetickú konzervovanosť medzi drozofilou a človekom, čo dovoľuje predpokladať, že charakterizovanie signálnej dráhy AS môže významne prispieť k osvetleniu niektorých patologických procesov asociovaných s poruchami AS u človeka. |
Identifikácia kĺúčových génov metastázovania a tumorigenicity v bunkách gastrointestinálnych nádorov pomocou epigenetického CRISPR/dCas9.
Identification of key genes for metastasis and tumorigenicity in gastrointestinal tumour cells using epigenetic CRISPR/dCas9.
| Doba trvania: |
1.1.2025 - 31.12.2028 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Kozovská Zuzana PhD. |
| Anotácia: | Onkologické ochorenia vznikajú v dôsledku rôznych genetických zmien. Okrem mutácií v onkogénoch a
tumor-supresorových génoch zohrávajú kľúčovú úlohu aj epigenetické zmeny, ktoré vyvolávajú nestabilitu
genómu a zmenu v expresii génov. V projekte sa zameriame na pochopenie mechanizmov epigenetickej
regulácie expresie kľúčových génov tumorigenicity a metastázovania v gastronitestinálnych nádoroch s ich
využitím pri včasnej diagnostike karcinómu kolorekta (CRC) a pankreasu (PDAC). Použijeme génovo špecifickú
úpravu metylácie vybraných génov (MLH1, CDH1, CXCL12, VHL, TWIST1, DSC2 a NID2), súvisiacich s
progresiou nádoru pomocou epigenetického CRISPR/dCas9. Prístup, pri ktorom budeme špecificky
metylovať/demetylovať konkrétny gén a tým znižovať/zvyšovať jeho expresiu je účinnejší ako použitie
širokospektrálnych epigenetických inhibítorov, ktoré účinkujú na celý genóm a okrem zmien v želaných génoch,
môžu indukovať zmeny vedúce napr. k progresii nádoru. |
Identifikácia nových biomarkerov spojených s relapsom metastatického kolorektálneho karcinómu po metastasektómii
Identification of novel biomarkers linked to the relapse of metastatic colorectal cancer after metastasectomy
| Doba trvania: |
1.7.2022 - 30.6.2026 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Matúšková Miroslava PhD. |
| Anotácia: | Kolorektálny karcinóm (CRC) patrí celosvetovo k najčastejšie diagnostikovaným malignitám. Približne 20% pacientov má v čase diagnózy aj vzdialené pečeňové metastázy. Pečeň je najčastejším miestom metastáz a väčšinou jediným postihnutým orgánom. Po chirurgickom odstránení metastáz pečene (CRLM) dosahuje medián celkového prežitia (OS) 5 rokov len 31-60% pacientov. Lokálna recidíva ochorenia po resekcii je žiaľ stále vysoká a až u 50-75% pacientov sa objaví do dvoch rokov. V časovom horizonte 5 rokov po resekcii CRLM je úmrtnosť pacientov asi 50%. Hľadaniu spoľahlivých indikačných kritérií a prediktívnych biomarkerov, ktoré by dokázali predpovedať úspešnosť metastasektómie, resp. nepriaznivú prognózu bolo venovaných mnoho retrospektívnych štúdií. Predpokladáme, že benefit z chirurgického odstránenia pečeňových metastáz pri CRC veľmi závisí na genetických predispozíciách a expresnom profile nádorového tkaniva. Resekcia pečene je pritom vážna, invazívna operácia, ktorej by malo predchádzať neinvazívne vyšetrenie schopné posúdiť prognózu, ideálne napr. stanovenie špecifických cirkulujúcich nukleových kyselín z periférnej krvi (tzv. liquid biopsy). Cieľom projektu bude identifikovať spoľahlivý biomarker, resp. súbor biomarkerov v plazme pacientov, ktorý koreluje so zvýšeným rizikom relapsu po metastasektómii pečene. Pokročilé metódy sekvenovania DNA a RNA nám umožnia identifikovať nové kandidátne biomarkery a vyhodnotiť ich relevantnosť bioštatistickými metódami. Vybrané najperspektívnejšie markery podrobíme funkčnej analýze in vitro a in vivo na inovatívnych predklinických modeloch CRC – organoidoch a xenograftoch odvodených od pacientskych vzoriek. Tie sú v súčasnej dobe považované za najlepšie modely, ktoré si uchovávajú klinickopatologické črty a genetický profil pôvodného pacientskeho nádorového tkaniva. |
Identifikácia nových možností liečby u refraktérnych testikulárnych nádorov zárodočných buniek
Identification of new treatment options in refractory testicular germ cell tumors
| Doba trvania: |
1.7.2021 - 30.6.2025 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Kučerová Lucia DrSc. |
| Anotácia: | Nádory semeníkov zo zárodočných buniek (TGCT) sú najčastejším nádorom mladých mužov s rastúcou incidenciou na Slovensku a predstavujúc svojím klinickým a biologickým charakterom model kurabilnej rakoviny. Malá časť pacientov, však nedosiahne kompletnú remisiu iniciálnou chemoterapiou na báze cisplatiny. Iba 20–40% z nich je možné vyliečiť pomocou chemoterapie so štandardnými alebo vysokými dávkami obsahujúcou platinu s autológnou transplantáciou kmeňových buniek. Pacienti, ktorí sa nedokážu vyliečiť po záchrannej liečbe v druhej línií, majú mimoriadne zlú prognózu a dlhodobé prežitie bolo dokumentované u menej ako 5%. U pacientov s refraktérnym TGCT bolo testovaných množstvo nových liečebných režimov, vrátane cielenej a biologickej terapií; avšak s veľmi obmedzenou účinnosťou. Cieľom tohto projektu je identifikovať nové terapeutické ciele u chemorefraktérneho ochorenia pomocou vysoko výkonných metód molekulárnej biológie a translačného výskumu a identifikovať nové lieky, ktoré prekonávajú rezistenciu na cisplatinu. |
Identifikácia nových proteínov a malých molekúl zapojených do interakcie kliešť-hostiteľ-patogén
Identification of novel proteins and small molecules involved in tick-host-pathogen interaction
| Doba trvania: |
1.1.2024 - 31.12.2027 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Minichová Lenka PhD. |
| Anotácia: | Kliešte sú vektormi baktérii, vírusov, prvokov aj helmintov, ktoré vyvolávajú závažné ochorenia ľudí i ekonomické straty na hospodársky dôležitých zvieratách. V podávanom projekte sa sústredíme na intracelulárne baktérie. Vytvoríme model interakcie kliešť-patogén (model umelého kŕmenia kliešťov), aby sme vedeli kvantifikovať a následne regulovať množstvo patogénov vstupujúcich do kliešťov spolu s prijímanou krvou. Následne budeme monitorovať priebeh príjmu patogénov, ich distribúciu v orgánoch kliešťa i exkréciu patogénov v čase. Na štúdium a charakterizáciu procesov imunitného systému kliešťov použijeme najmodernejšie omikové metódy. Budeme sledovať, ako imunitný systém reguluje prežívanie patogénov, ich pomnoženie v tele vektora a následne spôsob prenosu do hostiteľa. Zlúčeniny, ktoré identifikujeme ako špecifické pre kliešte modulované patogénmi, môžu byť cennými cieľmi na definovanie účinnej antimikrobiálnej terapie alebo vývoja ochranných antigénov schopných blokovať prenos patogénov. |
Imunitný kontrolný bod BTLA ako potenciálny biomarker v terapii difúzneho veľkobunkového B-lymfómu
Immune checkpoint BTLA as a potential biomarker in the therapy of diffuse large B-cell lymphoma
Individuálna rádiosenzitivita onkologických pacientov a využitie Gingko biloba na prevenciu vedľajších účinkov rádioterapie
Individual radiosensitivity of cancer patients and use of Gingko biloba in the prevention of radiotherapy induced side effects
| Doba trvania: |
1.1.2023 - 31.12.2026 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Durdík Matúš PhD. |
| Anotácia: | U približne 5% onkologických pacientov liečených rádioterapiou (RT) sa prejaví vážna toxicita liečby. Avšak, v
klinickej praxi zatiaľ nie je dostupná metóda na stanovenie rádiosenzitivity na individuálnej úrovni. Na odhalenie
rádiosenzitívnych (RS) pacientov pred začatím RT a štúdium ich odpovede na ožiarenie budeme analyzovať in
vitro radiačne indukovanú apoptózu lymfocytov a in vivo-definované mikrojadrá a chromozomálne aberácie (CA).
Následne porovnáme odpoveď na in vitro ožiarenie u RS a normálne odpovedajúcich pacientov pomocou
analýzy DNA opravných fokusov, CA a mikrojadier. Gingko biloba je rastlina so silnými antioxidačnými
vlastnosťami a jej extrakt môže byť použiteľný k ochrane pred vedľajšími účinkami rádioterapie u pacientiek s
rakovinou prsníka. Cieľom tohto projektu je validovať kombináciu metód vhodnú na detekciu individuálnej
rádiosenzitivity, overiť potenciálny ochranný efekt extraktu z Gingko biloba, a tiež vplyv prekonania COVID-19 na
vedľajšie účinky rádioterapie u onkologických pacientov. |
Infraštruktúra na monitorovanie vitálnych funkcií experimentálnych zvierat a biochemickú analýzu sledovaných tkanív
Infrastructure for monitoring the vital functions of experimental animals and biochemical analysis of the monitored tissues
Infraštruktúra pre spracovanie a fenotypizáciu extracelulárnych vezikúl
Infrastructure for extracellular vesicle processing and phenotyping
| Doba trvania: |
1.7.2024 - 30.6.2025 |
| Program: |
Plán obnovy EÚ |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Balážová Lucia PhD. |
| Anotácia: | Cieľom a aktivitou projektu je obstaranie výskumnej infraštruktúry a jej využitie počas implementácie APVV projektu a na realizáciu ďalšieho nezávislého výskumu a vývoja. |
Infraštruktúra pre štúdium genetických príčin vzácnych metabolických ochorení
Infrastructure for the study of genetic causes of rare metabolic diseases
Infraštruktúra pre štúdium oxidu uhličitého v nádorovom metabolizme glukózy
Infrastructure for the study of carbon dioxide in tumor glucose metabolism
Infraštruktúra pre výskum termogenézy a metabolizmu tukového tkaniva
Infrastructure for research on thermogenesis and adipose tissue metabolism
Inhibícia hypoxiou-indukovanej karbonickej anhydrázy IX ako prostriedok na prekonanie chemorezistencie v kolorektálnom karcinóme
Inhibition of Hypoxia-Induced Carbonic Anhydrase IX as a Strategy to Overcome Chemoresistance in Colorectal Cancer
| Doba trvania: |
1.7.2024 - 31.12.2025 |
| Program: |
PostdokGrant |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Ing. Puzderová Barbora PhD. |
| Anotácia: | Solídne nádory ako je kolorektálny karcinóm (CRC) sú spojené s agresívnejším fenotypom, pre ktoré je charakteristický vznik hypoxie a acidózy. Hypoxiou indukovaná karbonická anhydráza IX (CAIX) sa významne podieľa na adaptačnom mechanizme nádorových buniek reguláciou pH, čím sa zvyšuje ich prežívanie, invazívnoť a tiež prispieva k imunitnému úniku. CRC je jedným z najčastejších nádorových ochorení spojený s rezistenciou na chemoterapiu. V liečbe CRC sa stále viac dostáva do popredia imunoterapia, založená na inhibícii imunitných kontrolných bodov. Ukazuje sa, že kombinácia štandardnej chemoterapie a imunoterapie zlepšuje prognózu pacientov s CRC. V projekte sa zameriame na zasiahnutie CAIX v 3D ko-kultivačnom modeli pozostávajúcom z nádorových kolorektálnych buniek HCT116wt alebo rezistentnej bunkovej línie HCT116 FUR, stromálnych fibroblastov MRC5 a imunitných buniek PBMC, s cieľom senzitizovať kolorektálne nádorové bunky na podávanú chemoterapiu a imunoterapiu. |
Inovatívna antisense terapeutická platforma pre CKD - chronické ochorenie obličiek
Novel renal antisense therapy platform for CKD
| Doba trvania: |
1.8.2021 - 30.6.2025 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Bábelová Andrea PhD. |
| Anotácia: | Chronické ochorenie obličiek (chronic kidney disease, CKD) známe svojím progresívnym charakterom vedúcim ku
koncovému štádiu ochorenia obličiek (end-stage renal disease, ESRD) je ochorenie s vysokou mortalitou, ktorej
predchádzajú rapídne sa zhoršujúce závažné zdravotné komplikácie vedúce k významne zníženej kvalite života.
Napriek výrazným pokrokom vo včasnej diagnostike CKD v posledných rokoch, súčasné CKD terapeutiká
nedokážu výrazne znížiť riziko renálnych a kardiovaskulárnych komorbidít u pacientov s CKD a ich úmrtnosť
zostáva naďalej devastujúco vysoká. Tento žalostný fakt tak zvýrazňuje nielen urgentnú potrebu vývoja nových
liečiv, ale aj potrebu implementácie nových experimentálnych a klinických poznatkov do translačného procesu ich
vývoja. V tomto kontexte ponúka navrhovaný projekt RENASTHERA nové terapeutické riešenie vedúce k
spomaleniu alebo dokonca zastaveniu progresívneho zlyhania obličiek. Toto riešenie je založené na patentovanej
metóde inhibície nukleových kyselín. Za jedného z kľúčových hráčov v rozvoji CKD bol identifikovaný periostín,
sekretovaný proteín s veľkosťou 90 kDa, ktorého cielená inhibícia účinne zastavila progresiu CKD v pilotných
proof-of-pri nciple štúdiách. Dizajn, syntéza a funkčná validácia RNA inhibítora špecificky navrhnutého voči
periostínu je preto jasne definovaným cieľom navrhovaného RENASTHERA projektu. |
Inovatívne prístupy k diagnostike a liečbe duktálneho adenokarcinómu pankreasu
Innovative approaches to the diagnosis and treatment of pancreatic ductal adenocarcinoma
| Doba trvania: |
1.9.2024 - 30.6.2026 |
| Program: |
Plán obnovy EÚ |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Smolková Božena PhD. |
| Anotácia: | Duktálny adenokarcinóm pankreasu (PDA) je jedna z najagresívnejších malignít gastrointestinálneho traktu. 5-ročné prežívanie pacientov je v priemere 8-10%. Jedinou kurabilnou liečebnou metódou je kompletná resekcia tumoru a aj napriek radikálnej liečbe je priemerné 5-ročné prežívanie len približne 20%. Pri stanovení diagnózy má viac ako 80 % chorých lokálne pokročilé alebo metastatické štádium ochorenia. Skorá diagnostika a optimalizácia liečebných postupov s využitím najnovších poznatkov z celogenómových analýz predstavujú aktuálne stratégie na zlepšenie nepriaznivej prognózy pacientov s PDA. Projekt PDAid predstavuje integrovaný prístup k včasnej diagnostike a liečbe, ktorý kombinuje bioinformatiku, molekulárnu biológiu a klinickú transláciu. V centre výskumu je snaha využiť nástroje molekulárnej biológie na zlepšenie manažmentu pacientov s PDA prostredníctvom inovatívnych metodológií. Cieľom proejktu je poskytnúť výkonné nástroje na včasnú detekciu, a monitorovanie priebehu ochorenia u pacientov s PDA.
Čiastkovými cieľmi sú:
1. Komplexný skríning verejne dostupných celogenómových dát a identifikácia metylačných markerov pre diagnostiku, a monitorovanie priebehu ochorenia.
2. Analýza metylácie DNA sekvenovaním novej generácie (NGS) v cfDNA z plazmy.
3. Integrácia techník tekutej biopsie. Integrácia dvoch techník tekutej biopsie (kombinácia mutačných a metylačných markerov) umožní prekonať obmedzenia tradičných metód tkanivovej biopsie, a poskytne monitorovanie progresie ochorenia a odpovede na liečbu v reálnom čase.
4. Validácia a prenos do klinickej praxe. Klinickú relevantnosť a diagnostickú presnosť identifikovaných metylačných markerov budeme validovať v relevantných kohortách pacientov s PDA metódou digitálnej kvapôčkovej PCR (ddPCR).
5. In silico analýza prinesie aj poznatky o expresných zmenách v nádoroch. Zameriame sa na dereguláciu expresie epigenetických regulátorov, ktorá otvára možnosti pre cielenú epigenetickú terapiu.
6. Využitie metodológie OTSC na validáciu účinnosti epigenetických inhibítorov v liečbe PDA predstavuje inovatívny prístup k terapii PDA, ktoré sa vyznačujú častou rezistenciou na liečbu, pretože umožní modelovať mikroprostredie PDA a poskytne relevantnejšie testovanie účinnosti liečby.
|
Interakcie vápnikových transportných systémov v karcinogenéze
Interactions of calcium transport systems in carcinogenesis
Kardiometabolické účinky stimulácie Mas receptorov modulovaním renín-angiotenzínového systému - klúčová úloha angiotenzín-konvertujúceho enzýmu 2.
Cardiometabolic effects of Mas receptor stimulation by modulation of the renin-angiotensin system - the key role of angiotensin-converting enzyme 2.
| Doba trvania: |
1.7.2021 - 30.6.2025 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Ing. Zorad Štefan CSc. |
| Anotácia: | Renín-angiotenzínový systém (RAS) je hormonálna kaskáda, ktorej chronická aktivácia vedie ku kardiovaskulárnym patológiám spôsobených najmä remodeláciou srdca a ciev. Stále viac sa stáva zrejmou skutočnosť, ze benefit inhibítorov RAS zahrňuje okrem inhibície účinkov Ang II aj stimuláciu protektívneho ramena RAS (ACE2/Ang1-7/Mas receptor) s vazodilatačnými, protizápalovými a metabolickými účinkami. Cieľom projektu bude porovnanie účinku ACE inhibície, AT1 blokády a stimulácie ACE2 a Mas receptora na modeli starých, obéznych, diabetických hypertenzných potkanov kmeňa Zucker so zameraním sa na potenciálny benefit pôsobenia Ang1-7/Ang1-5 na utilizáciu glukózy, transdukciu inzulínového signálu, redukciu zápalovej reakcie a funckiu kardiovaskulárneho systému. Vzhľadom na potenciálne ústrednú úlohu RAS a predovšetkým ACE2 v rozvoji akútneho respiračného distress syndrómu bude cieľom projektu bude aj detekcia zmien mebránového a solubilného ACE2 a ďalších klúčových molekúl pre vírusovú infekciu pri použití jednotlivých farmakologických intervencií. Závislosť predpokladaných alterácií na aktivite Mas receptora sa bude sledovať pomocou jeho špecifického antagonistu A779. In vitro, po pôsobení inhibítorov RAS a stimulátora ACE2 na kultúry ľudských alveolárnych a tukových buniek, sa budú posudzovať zmeny v ich schopnosti viazať SARS-CoV-2 vírus pomocou pseudovírusovej metodiky. Získané výsledky by mohli reálne prispieť k objasneniu úlohy ACE2 a Mas receptora v patogenéze obezity a diabetu. Projekt by tiež mohol participovať na ozrejmení výberu efektívneho inhibítora RAS u starých jedincov s kombináciou hypertenzie, obezity a diabetu, ako aj na vhodnosti používania a terapeutického využitia RAS-inhibície u pacientov s COVID-19. Úspešná realizácia projektu môže reálnou mierou prispieť aj k snahe o prípravu netoxických aktivátorov ACE2 a exogénnych agonistov Mas receptora. |
Kardiovaskulárna ochrana sprostredkovaná alfa1AMPK proti endotelovej dysfunkcii sprostredkovanej metabolickým syndrómom – identifikácia nových rizikových faktorov
CARDIOvascular protection mediated by alfa1AMPK against metabolic syndrome-mediated ENdothelial Dysfunction – identifying new risk factors
| Doba trvania: |
1.7.2023 - 30.6.2027 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Hlaváčová Nataša PhD. |
| Anotácia: | Narušenie vaskulárnej homeostázy spôsobené zníženou biologickou dostupnosťou oxidu dusnatého v dôsledku oxidačného stresu a zápalu je najzávažnejšou komplikáciou metabolického syndrómu (MetS), ktorá vedie k zvýšenej chorobnosti či úmrtnosti. Je preto dôležité identifikovať a analyzovať kľúčové faktory, ktoré zabraňujú alebo chránia vaskulárny endotel a tým zlepšiť primárnu a sekundárnu prevenciu kardiovaskulárnych ochorení. Zdá sa, že takýmto faktorom môže byť AMP-dependentná proteínkináza (AMPK). Jej ochranné vlastnosti a pozitívny vplyv na funkciu endotelu a oxidačný stres sú už známe. Práve tieto vlastnosti naznačujú, že AMPK sa môže podieľať na zlepšení metabolickej kontroly počas MetS, avšak molekulárne zmeny spôsobené dysreguláciou súvisiacou s a1AMPK počas vývoja MetS nie sú dostatočne pochopené. Projekt sa zameriava na rizikové faktory ovplyvňujúce funkciu endotelu počas MetS a AMPK ako potenciálny nástroj na modifikáciu týchto rizikových faktorov, ktoré vedú k prevencii alebo liečbe MetS. Originalita projektu je založená na komplexnom hodnotení funkčných, molekulárnych a biochemických zmien funkcie endotelu, zápalu a metabolickej senescencie počas MetS s detailným zameraním na cievny endotel - proliferáciu, senescenciu a apoptózu. Dôraz sa bude klásť na rizikové faktory ovplyvňujúce endotelovú funkciu, ako je interakcia/adhézia leukocytov s vaskulárnym endotelom a AMPK-dependentnú úlohu erytrocytov počas rozvoja MetS. Projekt bude obohatený o štúdium fenotypových a molekulárnych zmien na úrovni CNS s dôrazom na neurozápal a zmeny správania. Dôležité je tiež, že projekt má translačný charakter, keďže sa budú vykonávať aj humánne štúdie u pacientov s MetS. Výsledky tejto štúdie predstavujú potenciálny nástroj na zlepšenie zdravotného stavu súčasnej populácie, zvýšenia kvality života a zníženie ekonomickej záťaže spojenej s liečbou tohto kardiometabolického ochorenia. |
Klonálne a imunitné interakcie pri high-grade transformácii Bbunkových lymfómov
Clonal and immune interactions in high-grade transformation of B-cell lymphomas
Kontrolné body a vírusové immunomodulatory v nádorovej terapii
Checkpoint molecules and viral immunomodulators in cancer therapy
Laktát, metabolický signál a zdroj energie pre alternatívne mechanizmy termogenézy
Lactate, a metabolic signal and energy source for alternative thermogenesis mechanisms
| Doba trvania: |
1.1.2023 - 31.12.2026 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Baláž Miroslav PhD. |
| Anotácia: | Chlad spúšťa v našom tele komplexnú fyziologickú odpoveď vrátane aktivácie termogénnych mechanizmov.
Keďže tvorba tepla je energeticky náročný proces, jeho aktivácia je považovaná za veľmi sľubný terapeutický
prístup v prevencii a liečbe obezity a pridružených ochorení. K najvýznamnejším zmenám pri akútnej odpovedi
na chlad patrí zvýšenie cirkulujúcich hladín voľných mastných kyselín a laktátu. Zatiaľ čo zdrojom mastných
kyselín, ktoré sú energetickým substrátom pre termogenézu, sú biele tukové bunky, nie je jasné odkiaľ pochádza
laktát, ani aká je jeho fyziologická funkcia počas adaptácie na chlad. Primárnym cieľom práce je preto skúmať
pôvod, osud a fyziologickú funkciu laktátu počas chladu. Navrhovaný projekt umožní nielen objasniť úlohu
laktátu v odpovedi na chlad, ale zároveň prinesie prvú podrobnú metabolomickú analýzu ľudského hnedého
tukového tkaniva, vďaka ktorej identifikujeme a následne overíme účinnosť nových terapeutických cieľov s
potenciálom zlepšiť metabolické zdravie pacientov s obezitou. |
Lipidomické štúdium bunkovej membrány Rickettsia spp.
Lipidomic study of the cell membrane of Rickettsia spp.
| Doba trvania: |
1.1.2024 - 31.12.2027 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
MVDr. Csicsay František PhD. |
| Anotácia: | Zástupcovia rodu Rickettsia sú obligátne intracelulárne, gramnegatívne kokobacily, prenášané krv cicajúcimi článkonožcami. Početné ľudské patogény patriace do prechodnej skupiny (TRG), týfusovej skupiny (TG) a do skupiny škvrnitých horúčok (SFG) sú roznášané rôznymi druhmi článkonožcov. Vektormi sú rôzne blchy, vši, kliešte alebo roztoče.
Ich povrch pokrýva lipopolysacharidová (LPS) vrstva, ktorá je ukotvená vo vonkajšej membráne pomocou lipidovej domény. Lipid A je bioaktívnou zložkou LPS, indukuje vrodenú imunitnú odpoveď a má endotoxický charakter. Napriek zjavnému významu lipidu A pri udržiavaní integrity vonkajšej membrány baktérií, ako aj jeho zápalového potenciálu počas infekcie, táto molekula je v rickettsiách stále málo prebádaná.
Cieľom tohto projektu je odhalenie štrukturálnych rozdielov lipidov vonkajšej membrány rickettsií s využitím lipidomických techník a analýz na báze hmotnostnej spektrometrie, ako aj výskum imunogenicity rickettsiálneho lipidómu. |
Mechanizmy poškodenia periférneho nervu pri chemoterapiou-indukovanej periférnej neuropátii.
Mechanisms of peripheral nerve damage in chemotherapy-induced peripheral neuropathy.
| Doba trvania: |
1.1.2023 - 31.12.2026 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
MVDr. Vanický Ivo CSc. |
| Anotácia: | Chemoterapiou indukovaná periférna neuropatia (CIPN) je nežiadúci vedľajší efekt liečby ktorý vedie k zníženiu
dávky alebo k prerušeniu život zachraňujúcej liečby. V predloženom projekte plánujeme testovať hypotézy
predpokladaných mechanizmov vzniku periférnej neuropátie na experimentálnych modeloch. V in vivo
experimentoch chceme potvrdiť, prípadne vylúčiť degeneráciu axónov pri dávkach Paclitaxelu, ktoré vyvolávajú
hypersenzitívne zmeny a zdokumentovať akumuláciu makrofágov v periférnych nervoch a v spinálnych
gangliách v rôznych časových obdobiach vzniku CIPN. V kritických fázach CIPN budeme detekovať prítomnosť
zápalových mediátorov, (produkcia NO) ktoré môžu spôsobovať hypersenzitivitu. V in vitro experimentoch
chceme zaviesť model ko-kultúry explantovaných spinálnych ganglií a makrofágov na sledovanie interakcií
neurónov a makrofágov po podaní Paclitaxelu. |
Metabolická dysregulácia ako základný princíp integrovanej patofyziológie chronických ochorení súvisiacich s obezitou: Molekulárna krajina komplexnej úpravy životného štýlu
Metabolic dysregulation as the underlying principle of integrated pathophysiology of obesity-associated chronic diseases: Molecular Landscape of Complex Lifestyle Modification
Metabolická charakterizácia nádorových buniek semenníkov s cieľom zvýšiť citlivosť rezistentných buniek na cisplatinu
Metabolic profiling of testicular cancer cells to increase the sensitivity of resistant cells to cisplatin
Mikrokapsuly na báze alginátu so zvýšenou stabilitou a biokompatibilitou pre enkapsuláciu pankreatických ostrovčekov v liečbe cukrovky
Alginate-based microcapsules with enhanced stability and biocompatibility for encapsulation of pancreatic islets in diabetes treatment
Mitochondriálne ochorenia a zlyhanie srdca
Mitochondrial disease in heart failure
| Doba trvania: |
1.7.2022 - 30.6.2026 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Zahradníková, ml. Alexandra PhD. |
| Anotácia: | Niekoľko mutácií v mitochondriálnych génoch proteínov dýchacieho reťazca je spojených so srdcovým zlyhaním
(SZ). Rozsah ich príspevku k rozvoju SZ na úrovni kardiomyocytov (CM) nie je známy. Nedávne zistenia
naznačujú, že rôzne etiológie SZ zdieľajú podobnú remodeláciu srdcových myocytov (CM), najmä ich
membránového systému a vápnikovej signalizácie. Projekt je zameraný na overenie in vitro modelu rozvoja SZ pri genetickej poruche so zníženou funkciou mitochondriálneho dýchacieho reťazca a overenie prevencie rozvoja SZ na bunkovej úrovni metabolickou terapiou výživovými doplnkami. Použijeme bunkovú líniu HL-1 CM s alotopickou expresiou mutantnej formy génu MT-ND5 pre podjednotku 5 respiračného komplexu I (mG13513A), spojenú s ľudskou hypertrofickou kardiomyopatiou, na určenie vplyvu chorých mitochondrií na cytoarchitektúru a kontraktilnú funkciu srdcových myocytov. Metódami elektrónovej a konfokálnej mikroskopie, bunkovej elektrofyziológie,
oxygrafie a molekulárnej biológie budeme sledovať expresiu a lokalizáciu dyadických proteínov a zmeny
mitochondriálnej štruktúry, lokalizácie a oxidačnej kapacity. Keďže genetickú kardiomyopatiu zatiaľ nemožno riešiť génovou terapiou, budeme skúmať prínosy metabolickej terapie na kompenzáciu zhoršenej mitochondriálnej funkcie. V HL-1 CM porovnáme účinok dedičnej mitochondriálnej insuficiencie s účinkom rozvoja SZ vyvolaného nadmernou stimuláciou. Očakávame, že výživová suplementácia mitochondriálnej funkcie zlepší výkonnosť CM a potlačí rozvoj SZ. Výsledky budú publikované v popredných časopisoch experimentálnej kardiológie a fyziológie a
zverejnené na webovej stránke projektu a v médiách. Projektu sa zúčastnia traja doktorandi a niekoľko študentov magisterskej formy štúdia. |
Moderné "omics" postupy ako efektívne nástroje pre identifikáciu a charakterizáciu vírusových patogénov strukovín
Modern "omics" approaches as effective tools for identification and characterization of leguminous viral pathogens
| Doba trvania: |
1.7.2021 - 30.6.2025 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
doc. Ing. Glasa Miroslav DrSc. |
| Anotácia: | Strukoviny (čeľaď bôbovité, Fabaceae) predstavujú nutrične a ekonomicky významnú plodinu, dôležitú pre výživu
človeka a aj hospodárskych zvierat. Kvalita i kvantita produkcie strukovín však môže byť negatívne ovplyvnená
komplexom vírusových patogénov. Dostupné poznatky o prítomnosti, epidemiológii a diverzite fytopatogénnych
vírusov strukovín v poľných podmienkach, kolekciách dlhodobo uchovávaných genetických zdrojov a divorastúcich
druhoch Fabaceae na Slovensku sú nedostatočné. Zámerom predkladaného projektu je neskreslená a presná
identifikácia virómu prítomného na strukovinách a následná genomická charakterizácia patogénov na našom
území využitím moderných sekvenančných prístupov. Získané dáta sa využijú na vývoj efektívnych detekčných
metód a cielené molekulárno-epidemiologické štúdie zohľadňujúce regionálnu diverzitu patogénov vrátane
semenom prenosných infekčných agens. Experimentálnou inokuláciou charakterizovanými vírusovými izolátmi sa
zhodnotí citlivosť vybraných genotypov strukovín voči vírusovej infekcii. Vzájomná interakcia vybraných genotypov
strukovín a skúmaného biotického patogénu bude analyzovaná modernými postupmi cellomického výskumu
zahŕňajúceho sekvenovanie novej generácie (genomika, transkriptomika) a proteóm bude študovaný klasickými
imunochemickými metódami v kombinácii s modernými analyticko – chemickými postupmi na báze hmotnostnej
spektrometrie (LC-MS/MS, nanoLC-ESI-Q-TOF). Kombináciou týchto v súčasnosti najprogresívnejších metód
virologického štúdia získame presné a detailné údaje potrebné pre čo najkomplexnejšie zhodnotenie vzťahu
patogén/rastlina. Použitá metodická platforma, využívajúca moderné a efektívne genomické, transkriptomické,
proteomické a in silico postupy, poskytne dôležité poznatky pre diagnostiku a charakterizáciu vírusových ochorení
a súčasne aj poznatky pre zvyšovanie kvality pestovania strukovín na Slovensku. |
Modifikované regulačné T lymfocyty na liečbu sklerózy multiplex
Modified regulatory T cells for therapy of multiple sclerosis
Modulácia CXCR4/CXCL12 signalizácie anti-myelómovou aktivitou CXCR4 antagonistu WZ811
Modulation of CXCR4/CXCL12 axis by the anti-myeloma activity of CXCR4 antagonist WZ811
Molekulárne mediátory účinkov komplexnej úpravy životného štýlu u pacientov s obezitou: Regulácia metabolickej flexibility, in vitro and in vivo
Molecular mediators of the response to complex lifestyle intervention in patients with obesity: Regulation of metabolic flexibility in vitro and in vivo
| Doba trvania: |
1.7.2024 - 30.6.2028 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Ukropec Jozef DrSc. |
| Anotácia: | Výskum molekulárnych mechanizmov, ktoré umožňujú metabolickú adaptáciu spojenú s cvičením môže poskytnúť celé spektrum nových poznatkov o systémových a tkanivo špecifických procesoch potenciálne využiteľných na prevenciu a liečbu metabolických ochorení spojených s obezitou. Našim cieľom je preto študovať kľúčové molekulárne mechanizmy a mediátory celotelovej odpovede na multi-komponentný (cvičenie, výživa, mindfulness) program manažmentu obezity, ktorý vedie k úprave telesného zloženia, metabolickej flexibility, kardiometabolickej zdatnosti a kognitívnych funkcií. Využijeme pritom inovatívne klinicko-fyziologické prístupy, bunkové a zvieracie modely a molekulárne genetické metódy na identifikáciu a validáciu mediátorov adaptačnej odpovede spojenej so zlepšením metabolického zdravia pacientov s obezitou. Najnovší výskum ukázal, že bunkovo-špecifická s cvičením spojená sekrécia proteínov do systémovej cirkulácie je modulovaná cvičením a že extracelulárne vezikuly sú prostriedkom medzi-tkanivovej komunikácie a celotelovej metabolickej integrácie. Navrhovaná randomizovaná klinická štúdia bude obohatená o výskum dynamických zmien metabolickej flexibility pri cvičení. Výsledný obraz účinkov intervencie získame integráciou klinických údajov a paralelných biofyzikálne, biochemicky a molekulárne definovaných zmien v systémovej cirkulácii, vrátane zmien extracelulárnych vezikúl. Charakterizácia zloženia membrány a obsahu extracelulárnych vezikúl umožní odhaliť potenciálne mediátory účinkov intervencie, ktoré budeme (i) funkčne charakterizovať na in vitro modeloch a (ii) následne na myšiach s diétou-vyvolanou obezitou. Tento holistický prístup poskytuje možnosť študovať komplexné procesy, ktoré určujú dynamiku metabolickej odpovede na cvičenie, a umožňuje tak odhaliť (i) biomarkery metabolickej flexibility, (ii) indikátory účinnosti intervencií spojených so zmenou životného štýlu a (iii) bioaktívne látky napodobňujúce účinky cvičenia, vhodné pre manažment obezity. |
Molekulárne mechanizmy interakcie signálnych dráh kortikosteroidov a monoamínov v kardio- a neuropatológiách vyvolaných stresom
Molecular mechanisms implicated in corticosteroid-monoamine interaction in stress-related cardio- and neuropathologies
| Doba trvania: |
1.7.2023 - 30.6.2027 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Cagalinec Michal PhD. |
| Anotácia: | Stres je definovaný ako odpoveď organizmu na vonkajšie stresory, ktoré spôsobujú narušenie homeostázy. Živé organizmy sú vystavené takýmto stresorom počas celého života, pričom k prvej expozícii môže dôjsť ešte pred narodením (napr. v dôsledku infekcie matky počas tehotenstva). Stres nemusí byť iba škodlivý. Regulovaná expozícia môže mať na organizmy aj pozitívny vplyv (napr. kognitívna behaviorálna terapia). Naopak, chronický stres negatívne ovplyvňuje najmä kardiovaskulárny a nervový systém, čo vedie k rozvoju rôznych patológií, ktoré patria k najčastejším príčinám invalidity a smrti. Na základe našich doterajších výsledkov na potkanoch predpokladáme, že interakcia medzi kortikosteroidmi a monoamínmi je významným faktorom, ktorý určuje či reakcia organizmu určitého pohlavia na daný stresor bude pre neho škodlivá, neutrálna alebo dokonca pozitívna. Našim cieľom je detailnejšie preskúmať molekulárne mechanizmy interakcie kortikosteroidov s monoamínmi v potkaňom modeli prenatálneho stresu (prenatálna stimulácia imunitného systému matky aplikovaním LPS) a prepojenie tejto interakcie s Ca2+ signalizáciou, ktorá sa podieľa na dekódovaní rôznych signálov do špecifických bunkových odpovedí. Sústredíme sa predovšetkým na preskúmanie zmien vyvolaných prenatálnym stresom na úrovni kontraktility kardiomyocytov a excitability serotonergných a dopaminergných neurónov v strednom mozgu. Ca2+ signalizácia ako možný vnútrobunkový efektor interakcie kortikosteroidov s monoamímni bude sledovaná na úrovni vnútrobunkových Ca2+ kanálov, ktoré patria k hlavných komponentov Ca2+ signalizácie v kardiomyocytoch ako aj neurónoch. Ďalej otestujeme predpokladaný terapeutický potenciál pyridoindolov v liečbe neurologických ako aj kardiovaskulárnych ochorení vyvolaných prenatálnym stresom. Testovanie bude zahŕňať in silico modelovanie (počítačové simulácie interakcií liečiva) a in vivo aplikáciu. |
Molekulárne mechanizmy protinádorových vlastností trialkyl- /triarylcíničitých izotiokyanátov a karboxylátov, nových ligandov jadrových retinoidných X receptorov v karcinómoch mliečnej žľazy potkana a v ľudských nádorových bunkách prsníka
Molecular mechanisms of trialkyl-/triaryltin isothiocyanates' and carboxylates' antitumour properties - novel ligands of nuclear retinoid X receptors in rat mammary gland carcinomas and human tumour cell lines
| Doba trvania: |
1.7.2021 - 30.6.2025 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Macejová Dana PhD. |
| Anotácia: | Organokovové zlúčeniny sú vďaka štrukturálnej diverzite používané v humánnej onkológii pri liečbe nádorových
ochorení. Triorganocíničité deriváty preukázali značné cytotoxické vlastnosti. Na bunkovej úrovni indukujú masívnu
bunkovú smrť v rôznych typoch bunkových kultúr už pri nízkych koncentráciách a sú schopné aktivovať procesy
apoptotických dráh, pri čom zohrávajú úlohu viaceré molekulárne mechanizmy. Významným prielomom v poznaní
bolo i naše nedávne experimentálne potvrdenie schopnosti molekúl triorganocíničitých zlúčenín viazať sa na
jadrové retinoidné X receptory, a tak prevziať funkciu potentných agonistov. Cieľom predkladaného projektu je
sledovanie in vivo účinkov tributyl-/trifenylcíničitých izotiokyanátov v procese chemickej karcinogenézy mliečnej
žľazy samíc potkana, ktoré sa opiera o naše súčasné výsledky in vitro experimentov. Zároveň sa predpokladá
výskum dosiaľ nepreskúmaných protinádorových vlastností triorganocíničitých zlúčenín aktivujúcich heterodiméry
RXR-RAR vrátane nových agonistov RXR na báze karboxylátov triorganocíničitých zlúčenín. Nasledovať budú in
vitro analýzy molekulárnych mechanizmov vedúcich k inhibícii rastu nádorových buniek alebo k indukcii apoptózy,
a to v prítomnosti/neprítomnosti prirodzených ligandov RAR receptorov na ľudských nádorových bunkových líniách
prsníka: MCF-7 (neinvazívna, ER pozitívna), T47D (ER pozitívna), MDA-MB-231 (invazívna, „triple negative“) a
MDA-MB-436 (invazívna, ER negatívna, PR negatívna). Plánujeme tiež získať nové údaje o možnej endokrinnej
disrupcii sledovaných látok na myšacej TM3 bunkovej línii a ľudskej COV434 bunkovej línii reprezentujúcich
reprodukčný systém. Predpokladáme, že riešením predkladaného projektu sa získajú nové a originálne poznatky o
mechanizme účinku študovaných látok prostredníctvom ich väzby a aktivácie jadrových receptorov, ich
transaktivácie, ako aj „crosslink“ s ďalšími signálnymi dráhami, ktoré prispejú k vývoju nových liečebných možností
nádorových ochorení prsníka. |
Molekulárne základy riadiace kompetenciu kliešťov pri prenose patogénov
Molecular fundamentals driving tick competence in pathogen transmission
| Doba trvania: |
1.9.2024 - 30.6.2028 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Sekeyová Zuzana PhD. |
| Anotácia: | Klimatické zmeny ovplyvňujú prenos vektormi prenášaných ochorení mi a umožňuje ich šírenie do nových oblastí. Keďže sú zodpovedné za viac ako 17 % všetkých infekčných ochorení (spôsobujú viac ako 700 000 úmrtí ročne), kontrola vektorov a prevencia ich výskytu sa stali jednou z priorít WHO. Predkladaný projekt má za úlohu objasniť vektorovú kompetenciu na prenos a opísať molekulárne a funkčné rozhranie medzi patogénnymi baktériami (Rickettsia spp. a Coxiella burnetii) a ich bežnými vektormi kliešťami v Európe (Dermacentor reticulatus a Ixodes ricinus). Oba patogény vyvolávajú závažné ochorenia u ľudí alebo straty na hospodársky významných prežúvavcoch (kozy, ovce, kravy). Patogénne a imunitné dráhy spolu s mechanizmami prežívania patogénu vo vektore a hostiteľovi boli čiastočne charakterizované, ale len niekoľko štúdií sa zameralo na komplexné interakcie vzťahu patogén-vektor počas kŕmenia. Počas riešenia projektu aplikujeme interdisciplinárny prístup a najmodernejšie zobrazovacie techniky na opis toho, ako môže imunitný systém kliešťa kontrolovať prežívanie patogénov a ich prenos. Naším cieľom je (i) vyvinúť nové metódy vizualizácie a kvantifikácie kliešťom prenášaných patogénov pomocou najmodernejších zobrazovacích techník. To nás privedie k (ii) identifikácii biomarkerov (špecifických metabolitov a proteínov) dôležitých pre prenos patogénov, ktoré budú anotované alebo určené de novo. Nakoniec (iii) použijeme unikátne zlúčeniny špecifické pre kliešte modulované bakteriálnymi faktormi ako ciele na definovanie účinnej antimikrobiálnej terapie a vývoj ochranných antigénov schopných blokovať prenos patogénov. |
Molekulárno-biologická analýza mechanizmu ischemickej tolerancie pri zmierňovaní následkov cievnej mozgovej príhody formou kondicionovania
Molecular-biological analysis of the mechanism of ischemic tolerance in mitigating the consequences of stroke by conditioning
| Doba trvania: |
1.1.2024 - 31.12.2027 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Mucha Rastislav PhD. |
| Anotácia: | Z klinickej praxe je známe, že po ischemickom poškodení mozgu je možné formou kondiciovania navodiť
toleranciu voči degradácii nervového tkaniva. Komplexné popísanie tohto procesu na molekulárnej úrovni však
doposiaľ nebolo realizované. Rozpoznanie mechanizmov aktivácie neuroprotektivity po ischemickom poškodení
mozgu na molekulovej úrovni je nevyhnutné pre pochopenie tohto procesu. Vieme, že periférna krv veľmi citlivo
a špecificky reflektuje zmeny expresie ako génov, tak aj proteínov v mozgu. Cieľmi predkladaného projektu sú:
1) identifikovať potenciálne markery (génové, proteínové) aktivácie ischemickej tolerancie, 2) zatriedenie a
špecifikácia génov aj proteínov v ich signálnych dráhach s vytvorením reakčnej mapy molekulových kaskád
špecifickej pre mechanizmus ischemickej tolerancie vo vzorkách krvi človeka a na potkaňom modeli. Splnenie
týchto cieľov umožní prispieť k poznaniu procesov neuroprotektivity a zvýšeniu úrovne prežívania neurónov. |
Molekulárno-genetická analýza glejového Sgs-sekrétu slinných žliaz Drosophila melanogaster a jeho biologických vlastností
Molecular-genetic analysis of salivary gland Sgs-glue secretion from Drosophila melanogaster and its biological properties
| Doba trvania: |
1.1.2023 - 31.12.2026 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Farkaš Robert CSc. |
| Anotácia: | Uplynulé dekády sa venovalo nemalé úsilie hľadaniu bioadhezív, ktoré mali primárne slúžiť ako zásadný zdroj inšpirácie na vývoj derivátov a biomimetík pre širokú škálu využitia v medicíne alebo rôznych oblastiach priemyslu vrátane vývoja subkutánnych glejových implantátov, biopolymérov pre ochranu a hojenie kombinovaných epidermálno-neuronálnych štruktúr, liečby idiopatickej pľúcnej fibrózy, kontrole hemostázy a medzitkanivovej adhézie v chirurgii, nových diagnostických postupov alebo úprave biopolymérov pre kontrolované uvoľňovanie liečiv. Medzi nesporne úspešné deriváty tohto snaženia patria semisyntetické adhezíva na báze katecholu. Avšak komplexnejšie multiproteínové bioadhezíva i napriek svojím atraktívnym vlastnostiam nezaznamenali takú mieru aplikácie. V predkladanom projekte navrhujeme na modelovom organizme Drosophila pomocou genetických nástrojov poodhaliť molekulárny mechanizmus tvorby a polymerizácie tzv. Sgs-gleja zo slinných žliaz a tak prispieť k pochopeniu komplexnosti tvorby bioadhezív. |
Mutácie asociované s Wolframovým syndrómom: rozdielne signálne dráhy v zmysle metabolizmu vápnika a funkcie mitochondrií
Mutations associated with Wolfram syndrome: alternative signaling pathways for calcium and mitochondrial physiology
| Doba trvania: |
1.7.2022 - 30.6.2026 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Cagalinec Michal PhD. |
| Anotácia: | Wolframov syndróm (WS), diagnostikovaný na základe diabetes insipidus, diabetes mellitus, atrofie optického nervu a hluchoty, je spôsobený mutáciami v géne WFS1. V súlade s týmito príznakmi, proteín WFS1 je vo vysokej miere produkovaný v mozgu a pankrease. Okrem toho je popísaná jeho vysoká expres ia aj v srdci; prekvapivo však vo veľkej väčšine prípadov príznaky na srdci pozorované neboli. WFS1 predstavuje intergrálny proteín membrány endoplazmatického retikula (ER) s výrazným vplyvom na metabolizmus vápnika, funkciu mitochondrií a stres ER. Otvorenou otázkou však ostáva, prečo sú β-bunky pankreasu a neuróny pri WS silne poškodené a zmeny v myocytoch sú iba minimálne, keď je v nich WFS1 vysoko exprimovaný? Vysvetlením by mohol byť zatiaľ neznámy kompenzačný mechanizmus prítomný v myocytoch a/alebo odlišné signálne dráhy, ktoré nie sú prítomné v neurónoch/β-bunkách. Preto prvá hypotéza znie: Líši sa metabolizmus vápnika a funkcia mitochondrií v srdcových myocytoch v porovnaní s neurónmi a pankreatickými β-bunkami v prípade poškodenia WFS1? Väčšina prípadov WS predstavuje recesívne mutácie; bolo však identifikovaných aj niekoľko dominantných mutácií. Druhá hypotéza preto znie: Líši sa metabolizmus vápnika a mitochondriálna dynamika v bunkách exprimujúcich patogénne dominantné voči recesívnym mutáciám proteínu WFS1? Úplným unikátom projektu je charakterizácia doteraz nepozorovaného heterozygotného delečného variantu WFS1, ktorý bol len nedávno identifikovaný u prvého slovenského pacienta s WS na ústave žiadateľa a jeho funkčné porovnanie s dominantnými a recesívnymi variantmi. Využitie moderných prístupov vrátane metódy CRISPR/Cas9, optogenetických techník, konfokálnej mikroskopie a know-how navrhovaného výskumného tímu pomôže, aspoň čiastočne, objasniť funkciu WFS1, čo v dlhodobom horizonte poslúži pre vývoj včasnej diagnostiky a efektívnej liečby nielen pacientov trpiacich WS, ale aj pacientov s diabetes mellitus a kardiovaskulárnymi ochoreniami s vysokou prevalenciou. |
Na stope identity mitochondriálneho chloridového kanálu
On the trace of mitochondrial chloride channel identity
| Doba trvania: |
1.7.2023 - 30.6.2027 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Polčicová Katarína PhD. |
| Anotácia: | Mitochondriálne chloridové kanály sa spolupodieľajú na regulácii mitochondriálneho membránového potenciálu deltaΨm. V in vitro podmienkach bolo pozorované, že oxidačný stres má za následok oscilácie deltaΨm, čo vedie prostredníctvom produkcie ATP v mitochondriách k skráteniu akčného potenciálu na plazmatickej membráne
kardiomyocytov a k vzniku arytmií. Na úrovni celého srdca boli pozorované arytmie ako dôsledok ischémie- reperfúzie. Špecifické ligandy translokátorového proteínu (TSPO) zabraňujú vzniku post-ischemických arytmií. Rovnaký účinok má aj nešpecifický blokátor chloridových kanálov. Ligandy TSPO inhibujú chloridový kanál v
mitochondriách pri veľmi nízkych koncentráciách, čo napovedá, že TSPO protein sprostredkúva blokovanie kanálu. Je teda pravedpodobné, že TSPO bude v tesnom kontakte s chloridovým kanálom. Chloridové kanály z mitochondria sú dobre popísané na úrovni elektrofyziológie, avšak ich molekulárna identita ostáva nejasná. Nedávno bolo ukázané, že niektoré izoformy z rodiny chloridových intracelulárnych kanálov (CLIC) sa nachádzajú v mitochondriách. CLIC kanály však boli popísané len v umelom systéme – nadexprimované v hostiteľských
bunkách. Predpokladá sa, že mitochondriálne chloridové kanály z natívnych vzoriek budú identické s niektorou z CLIC izoforiem. Cieľom predkladaného projektu je overiť hypotézu, že merané natívne chloridové kanály zo srdcových mitochondrií sú členmi CLIC rodiny a či daná CLIC izoforma a TSPO sú v tesnom fyzickom kontakte. Predpokladáme, že získané výsledky pomôžu objasniť molekulárnu identitu mitochondriálneho chloridového kanálu, ktorý predstavuje významný potenciálny ciel pre odvrátenie vzniku post-ischemických arytmií. |
Nádorové imunoeditovanie v mnohopočetnom myelóme: imunitné kontrolné body a klinický význam
Cancer immunoediting in multiple myeloma: immune checkpoints and clinical significance
| Doba trvania: |
1.8.2021 - 30.6.2025 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Jakubíková Jana PhD. |
| Anotácia: | Pochopenie komplexných imunitných obranných mechanizmov proti nádorom, tzv. imunoeditovanie nádorov, je pri mnohopočetnom myelóme (MM) náročné. Charakteristickým znakom mikroprostredia MM je závažná imunitná dysregulácia a strata imunitného dozoru. Celkovým cieľom projektu je charakterizovať imunoeditovanie v MM
pomocou bunkových a molekulárnych prístupov. Zameriame sa na pochopenie komplexného vrodeného a adaptívneho imunitného systému počas vývoja MM: od premalígnych štádií MGUS a tlejúci MM po symptomatický MM. Zadefinujeme rôzne mechanizmy imunitných kontrolných bodov a ich biologické prejavy na nádor podporujúce/potláčajúce subtypy imunitných buniek v mikroprostredí nádoru, spolu s nádorovými MM bunkami, ako aj blokujúci účinok nových inhibítorov imunitných kontrolných bodov ex vivo. Preskúmame vplyv anti-MM terapie na moduláciu imunoeditovania MM v homogénne liečenej skupine pacientov s MM, čo nám umožní vyhodnotiť vplyv potlačeného imunitného systému na vznik rezistentných nádorových klonov a naopak. Pomocou hmotnostnej cytometrie vyhodnotíme imunoeditovanie MM na primárnych vzorkách pacientov spolu s mechanizmami imunitných kontrolných bodov, vrátane regulačných kostimulačných/nádorových antigénov/kontrolných molekúl a signálnych dráh. Tieto štúdie identifikujú mechanizmy a biologické následky imunoeditovania v MM a budú podkladom pre dizajn cielenej terapie a imunoterapie v MM. |
Nanocéria - doplnková liečba pre senzitizáciu testikulárnych karcinómov neodpovedajúcich na cisplatinu
Nanoceria - the complementary treatment to sensitize testicular tumors not responding to platinum agents
| Doba trvania: |
1.1.2025 - 31.12.2025 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Jurkovičová Dana DrSc. |
| Anotácia: | Terapeutická rezistencia je jedným z kľúčových problémov liečby rakoviny. Pochopenie jej molekulárnych mechanizmov umožňuje skúmať nové terapeutické prístupy. Nanočastice oxidu céru (nanocérie) predstavujú
novú technológiu s veľkým potenciálom ako antioxidačné a rádioprotektívne protirakovinové činidlá. Inhibujú
progresiu rakoviny, sú toxické pre nádorové bunky, ale netoxické pre stromálne bunky, čo sľubuje aj ich klinické
využitie. Nanocérie budú testované na unikátnych in vitro modeloch testikulárnych nádorov (TGCT), voči
cisplatine (CDDP) senzitívnych a rezistentných bunkových líniách a z nich generovaných 3D sféroidoch. TGCT
sú známe vynikajúcou odpoveďou na liečbu s CDDP, ale malé percento pacientov je rezistentných,
recidivujúcich, so zlou prognózou. Nanocérie otestujeme ako potenciálny terapeutický doplnok k CDDP na
senzibilizáciu rezistentných TGCT. Vzhľadom na proapoptotické a antiinvazívne vlastnosti by nanocérie
aplikované spolu s CDDP mohli zlepšiť výsledky terapie rezistentných pacientov. |
Nefarmakologické postupy v prevencii Alzheimerovej choroby na Slovensku
Non-pharmacological strategies in the prevention of Alzheimer's Disease in Slovakia
| Doba trvania: |
1.7.2024 - 30.6.2026 |
| Program: |
Plán obnovy EÚ |
| Zodpovedný riešiteľ: |
prof. MUDr. Ukropcová Barbara PhD. |
| Anotácia: | Celosvetovo trpí demenciou viac ako 55 miliónov ľudí. Hlavnou príčinou demencie je Alzheimerova choroba (ACh), zatiaľ bez existujúcej efektívnej liečby. Včasná diagnostika a úprava životného štýlu môžu výrazne znížiť prevalenciu ACh aj náklady na liečbu. Cieľom projektu je významne rozšíriť možnosti identifikácie molekúl, regulovaných cvičením a komplexnou úpravou životného štýlu v krvi seniorov so zvýšeným rizikom ACh; a stanoviť efektivitu a udržateľnosť dlhodobej nefarmakologickej intervencie. Ciele nadväzujú na klinickú štúdiu LIBRA-Net (ADDIT-CE). Extracelulárne vezikuly predstavujú atraktívny transportný systém pre molekulárne mediátory integrujúce adaptačné účinky cvičenia na mozog a iné tkanivá, ktoré je možné využiť aj pri včasnej diagnostike a monitorovaní ACh. Dlhodobá udržateľnosť programov založených na komplexnej úprave životného štýlu je predpokladom zníženia prevalencie demencií a zlepšenia zdravia a kvality života starnúcej populácie Slovenska. |
Nekódujúca RNA ako biomarker pre diagnostiku a terapiu detskej leukémie
Non-coding RNA as a biomarker for diagnostics and therapy of childhood leukemia
| Doba trvania: |
1.8.2024 - 30.6.2026 |
| Program: |
Plán obnovy EÚ |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Jakl Lukáš PhD. |
| Anotácia: | Aktuálne modely terapie sú založené na obmedzených diagnostických nástrojoch založených na prítomnosti leukemických buniek (blastov) pomocou cytometrie a prítomnosti a typu preleukemických fúznych génov v blastoch. Tieto diagnostické nástroje sa používajú na zaradenie pacienta do 3 rôznych rizikových skupín. Pri každej z nich sa používa odlišný liečebný protokol na základe medzinárodnej lekárskej klasifikácie. Stále existujú pacienti so slabou odpoveďou na liečbu a protokol sa musí zmeniť. Súčasné poznatky v oblasti klinického výskumu naznačujú kľúčovú úlohu ncRNA a mohli by slúžiť ako potenciálny biomarker na predikciu zlej odpovede u pacientov a od začiatku terapie by sa dala použiť vhodná silnejšia terapia, ktorá je nevyhnutná. Pacienti s dobrou odpoveďou na liečbu, ktorí dosiahli remisiu, sú stále vystavení riziku relapsu leukémie. NcRNA by sa tiež mohli exprimovať odlišne u pacientov, u ktorých došlo k relapsu, v porovnaní s pacientmi, ktorí dosiahli úplnú remisiu. |
Neuroprotektívny a regeneračný potenciál posttraumatickej liečby zacielenej na angiotenzínové receptory
Neuroprotective and regenerative potential of post-traumatic cure targeted to Angiotensin II receptors
| Doba trvania: |
1.7.2023 - 30.6.2027 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Pavel Jaroslav PhD. |
| Anotácia: | Traumatické poranenie miechy môže spôsobiť vážne celoživotné postihnutie prejavujúce sa rôznymi symptómami
vrátane parestézie, spasticity, straty motorickej kontroly a často silnej bolesti. Napriek tomu, že intenzívny výskum
patológie SCI v posledných desaťročiach viedol k identifikácii mnohých sľubných cieľov liečby, následné klinické
štúdie boli väčšinou negatívne a žiadny z týchto experimentálne sľubných prístupov nebol zatiaľ plne akceptovaný
v klinickej praxi. Súčasná liečba akútneho SCI je obmedzená na chirurgickú dekompresiu a intravenóznu aplikáciu
vysokých dávok metylprednizolónu, ktorých klinická účinnosť zostáva stále nejasná. Tzv. „brain-machine
interfaces“ a epidurálna elektrostimulácia ukázali značný prísľub pre funkčné zotavenie, avšak tieto stratégie
využívajú funkciu ušetrených nervových vlákien a obchádzajú miesto poranenia namiesto toho, aby vyvolávali
biologickú opravu. Z tohto pohľadu má identifikácia intervencií modifikujúcich poranenie miechy stále vysokú
klinickú prioritu. Naše experimentálne výsledky poukázali na prechodné dlhodobé zvýšenie krvného tlaku takmer
bezprostredne po vážnej traume miechy a oneskorenú prechodnú expresiu angiotenzínových AT2 receptorov.
Návrh projektu predpokladá normalizáciu hypertenzie a obmedzenie fibrózy prostredníctvom blokátorov AT1
receptorov a následnú stimuláciu AT2 receptorov s cieľom obmedzenia rozsahu poškodenia a zvýšenie
neuroregeneračnej schopnosti poškodeného nervového tkaniva miechy. Predbežné výsledky poukázali sľubný
potenciál stimulácie AT2 receptorov v procesoch spojených s axonálnou regeneráciou a obnovou vaskulárneho
systému. |
Nová technológia na báze suchej kvapky moču pre detekciu virálnej RNA
New dry urine drop-based technology for viral RNA detection
Nové liečebné postupy cielené na nádorové kmeňové bunky v patogenéze mnohopočetného myelómu
Novel Drug Approaches Targeting Cancer Stem-like Cells in Multiple Myeloma Pathogenesis
Nové spôsoby detekcie subtypov vybraných herpesvírusov u pacientov s hematologickými malignitami na Slovensku
New methods of detection of subtypes of selected herpesviruses in patients with hematological malignancies in Slovakia
| Doba trvania: |
1.7.2024 - 31.12.2025 |
| Program: |
PostdokGrant |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Benko Mário PhD. |
| Anotácia: | Rakovina je na Slovensku každoročne diagnostikovaná u viac ako 40-tisíc pacientov. Spomedzi onkologických
ochorení sú štvrtým najčatejším ochorením hematologické malignity (HM). HM spôsobujú zhubné nádorové
ochorenia krvi a krvotvorných orgánov ako sú leukémie, myelodysplastické syndrómy, alebo imunoproliferačné
ochorenia. Pacienti s HM častokrát trpia imunodeficienciami, ktoré narušujú funkciu jednej alebo viacerých zložiek
imunitného systému. Veľké riziko v tomto ohľade predstavujú predovšetkým vírusové infekcie. U imunodeficitných
jedincov sa javia ako ideálni kandidáti z plejády vírusov na hlbšie štúdium herpetické vírusy, nakoľko majú unikátnu
schopnosť nebadane modulovať imunitnú odpoveď u hostiteľa. Charakteristickou črtou herpesvírusov je latentná
infekcia, ktorá v organizme doživotne pretváva po primárnej infekcii. Vo väčine prípadov je infekcia asymptomatická,
avšak u imunokompromitovaných jedincov (onkologickí pacienti, HIV pozitívni pacienti alebo po transplantácií
orgánov) sa môžu herpetické vírusy reaktivovať a spôsobovať závažné zdravotné komplikácie. Herpesvírusy sú
asociované so širokou paletou ochorení počnúc od ľahkých infekcií ústnej dutiny až po život ohrozujúce ochorenia
nervovej sústavy, urogenitálneho traktu, neonatálnej straty zraku a sluchu, ako aj závažných infekcií kože.
Predložený projekt sa zameriava na diferenciálnu diagnostiku nešpecificky identifikovateľných herpesvírusov vo
vzorkách pacientov s HM na Slovensku. Predmetný výskum je unikátny nakoľko je na našom území prvý svojho
druhu. Prehĺbenie poznatkov v danej problematike má potenciál pri etablovaní nových diagnostických metód v
manažmente herpetických ochorení nielen u pacientov s HM, ale aj pri diagnostike ďalších ochorení asociovaných s
herpesvírusmi, ktoré doposiaľ v laboratóriách na Slovensku neboli rutinne vykonávané. Navrhovaný projekt vychádza
z aktuálnej potreby v klinickej praxi a jeho výsledky budú ďalej využité ako pilotná štúdia k ďalším projektom |
Objasnenie mechanizmu vzniku závažnej formy kliešťovej encefalitídy
Elucidating the mechanism behind severe tick-borne encephalitis
| Doba trvania: |
1.9.2024 - 30.6.2028 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Ličková Martina PhD. |
| Anotácia: | Kliešťová encefalitída (TBE) je závažné vírusové ochorenie človeka, ktoré postihuje centrálny nervový systém. Incidencia v Európe sa zvýšila z 0,4 v roku 2015 na 0,9 prípadu na 100 000 ľudí v roku 2020. Ochorenie sa prejavuje ako meningitída, meningoencefalitída alebo meningoencefalomyelitída a je zodpovedné za viac ako 10 000 hospitalizácií ročne. Z tohto dôvodu predstavuje TBE významný medicínsky problém s vysokými nákladmi pre zdravotnícky systém a spoločnosť. Presné determinanty závažnosti ochorenia nie sú známe; ale existuje niekoľko hypotéz. Ambíciou navrhovanej štúdie je identifikovať faktory ovplyvňujúce závažnosť TBE. U pacientov s kritickou formou COVID-19 a u pacientov s ťažkou infekciou vírusom západonílskej horúčky sa zistili neutralizačné autoprotilátky IgG (auto-Abs) proti IFN typu I. Preto je prvým cieľom navrhovaného projektu testovanie auto-Abs proti IFN typu I v sére pacientov s neurologickými príznakmi diagnostikovanými ako TBE. Niektoré mutácie vo vírusových proteínoch môžu ovplyvniť neuroinvazívnosť infekcie TBEV. Mutácie v géne proteínu E boli spojené s častejším výskytom závažných a smrteľných infekcií TBE. Preto budeme v rámci projektu sekvenovť klinické vzorky pacientov pomocou NGS technológie. Posledným faktorom, ktorý sa podieľa na závažnosti ochorenia, je nesprávne diagnostikovaná infekcia inými flavivírusmi v dôsledku ich skríženej reaktivity počas diagnostiky. Projekt poskytne podrobné informácie o tom, či sú auto-Abs proti IFN typu I spojené s ťažkými prípadmi TBE. Tieto informácie môžu zlepšiť liečbu ochorenia. Okrem toho získané sérologické údaje ponúknu ďalšie epidemiologické dáta o TBEV a príbuzných flavivírusoch. Kompletné sekvencie genómu TBEV zo vzoriek pacientov prinesú poznatky o genetickej diverzite kmeňov TBEV, ktoré v súčasnosti cirkulujú na Slovensku, ako aj potenciálnu identifikáciu molekulárnych faktorov, ktoré prispievajú k patogenite vírusu. |
Odhalenie molekulárnych mechanizmov a metabolickej regulácie substrátových cyklov
Elucidating the molecular mechanisms and metabolic regulation of substrate cycles
| Doba trvania: |
1.7.2023 - 30.6.2027 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Baláž Miroslav PhD. |
| Anotácia: | Obezita predstavuje vážnu hrozbu pre ľudské zdravie keďže je primárnym rizikovým faktorom rozvoja diabetu 2. typu, stukovatenia pečene a srdcovocievnych ochorení. Nakoľko tvorba tepla je energeticky náročný proces, jeho aktivácia je považovaná za sľubný terapeutický prístup v liečbe obezity a metabolických ochorení. Tukové tkanivo produkuje teplo v procese známom ako netriašková termogenéza, ktorý je sprostredkovaný Odpájacím proteínom 1. Avšak myši ktorým chýba táto klasická termogénna dráha si dokážu udržať stabilnú telesnú teplotu ak sú na chlad adaptované postupne, čo poukazuje na existenciu doposiaľ neznámych, avšak účinných alternatívnych mechanizmov tvorby tepla. Na základe našich predbežných výsledkov a existujúcej literatúry navrhujeme existenciu substrátových cyklov v metabolizme sacharidov v hnedom tuku, ktoré prispievajú k udržaniu stabilnej telesnej teploty, a môžu mať terapeutický potenciál v liečbe obezity a metabolických ochorení. Preto špecifickým cieľom nášho projektu je: 1) identifikovať substrátové cykly prebiehajúce v hnedom tukovom tkanive, 2) odhaliť ich molekulárne mechanizmy a reguláciu, a 3) identifikovať terapeutické ciele s potenciálom regulovať ich aktivitu. Komplexné transkriptomické a metabolomické analýzy hnedého a bieleho tukového tkaniva pacientov, C57Bl/6 a Ucp1 KO myší za rôznych teplotných podmienok poskytnú dôležité poznatky o energetike tukového tkaniva a poslúžia ako základ pre identifikáciu substrátových cyklov. V navrhovanom výskume využijeme genetické modely myší, bunkové línie, farmakologické nástroje a najnovšie experimentálne postupy, najmä nukleárnu magnetickú rezonančnú spektroskopiu, metabolické sledovanie 13C-značených substrátov, sekvenovanie RNA novej generácie, infračervenú termografiu a bioenergetické merania na dokázanie existencie, odhalenie molekulárnych mechanizmov a potvrdenie fyziologického významu substrátových cyklov, ako aj na identifikáciu a validáciu nových terapeutických cieľov na liečbu obezity. |
Odhalenie tajomstva cvičenia: Dekódovanie exozomálnych molekulárnych vzorcov u ľudí počas cvičenia pomocou metabolomického a lipidomického skríningu a pokročilej výpočtovej analýzy
Unveiling the Secrets of Exercise: Decoding Exosomal Molecular Patterns in Humans During Exercise Using Metabolomic and Lipidomic Screening and Advanced Computational Analysis
Odhalenie úlohy fosfatidylserín syntáz v kontrole aktivácie tukového tkaniva
Uncovering the Role of Phosphatidylserine Synthases in the Control of Adipose Tissue Activation
Organizácia nádorového a imunitného mikroprostredia v karcinóme obličkových buniek a význam nádorových organoidov v predikcii odpovede na liečbu
Orchestration of tumor and immune microenvironment in renal cell carcinoma and significance of tumor organoids in predicting therapy response
| Doba trvania: |
1.7.2024 - 30.6.2028 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Baráthová Monika PhD. |
| Anotácia: | Nádory obličiek predstavujú jednu z najagresívnejších urologických malignít. Incidencia nádorov obličiek má stále zvyšujúcu tendenciu najmä v krajinách východnej Európy, pričom Slovensko patrí medzi krajiny s najvyššou incidenciou a mortalitou. Svetlobunkový renálny karcinóm (ccRCC), najčastejší podtyp asociovaný so zlou klinickou odpoveďou, je charakterizovaný ako veľmi vaskularizovaný a imunogénny typ nádoru. Metastázy sa objavia u viac ako štvrtiny pacientov a 5-ročné prežívanie je približne 10-15%. ccRCC sú charakteristické pseudohypoxiou vznikajúcou v dôsledku inaktivácie nádorového supresorového génu VHL vedúcou k aktivácii expresie hypoxiou indukovaných proteínov aj v normoxických podmienkach. Jedným z takýchto proteínov je aj karbonická anhydráza IX (CAIX), transmembránový metaloenzým asociovaný s adaptáciou nádorov na hypoxický stres a s reguláciou extracelulárneho pH. V projekte sa chceme zamerať na vzájomné vzťahy medzi cielenou terapiou a imunitným mikroprostredím prostredníctvom viacstupňovej analýzy biomarkerov, imunoprofilácie a signálnych dráh spojených s CAIX v RCC, na testovanie účinnosti nových humanizovaných protilátok špecifických voči CAIX, ako aj na ozrejmenie ich vplyvu na imunofenotyp RCC nádorov. V projekte by sme chceli využiť viaceré 3D kokultivačné modely, ktoré vernejšie napodobňujú nádorovú architektúru a mikroprostredie. Jedným z 3D modelov sú nádorové organoidy predstavujúce nový, moderný prístup v personalizovanej/precíznej medicíne s využitím nádorového tkaniva pacienta. Kokultivácia organoidov s autológnymi imunitnými bunkami by mohla priniesť nové zistenia o vplyve CAIX na imunofenotyp RCC. Predpokladáme, že humanizované protilátky by mohli predstavovať nový terapeutický prístup v liečbe pseudohypoxických ako aj hypoxických RCC. Zároveň by mohli významne zmeniť nádorové mikroprostredie a zvýšiť účinnosť imunoterapie alebo inhibítorov tyrozínkináz, ktoré sú súčasťou štandardnej terapie pacientov s RCC. |
Overenie pozitívneho účinku podávania kombinácie fruktóza - metylcelulóza na metabolizmus potkanov.
Verification of positive effect of fructose - methyl cellulose treatment on rat metabolism.
| Doba trvania: |
1.1.2024 - 31.12.2026 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Ing. Zorad Štefan CSc. |
| Anotácia: | Prezentovaný projekt vychádza z predbežných výsledkov s použitím kombinácie fruktóza a metylcelulóza (frucel). Frucel prekvapujúco znižuje plazmatické koncentrácie kyseliny močovej, ukazovatele oxidačného poškodenia lipidov a proteínov, glykáciu proteínov a uvolňovanie hemoglobínu z erytrocytov. Naviac, frucel zvyšuje proteínovú expresiu ACE2 v obličke. Zavedieme podávanie metylcelulózy v pitnom roztoku fruktózy namiesto stresujúcej žalúdočnej sondy. Budeme skúmať vplyv podávania frucel na metabolické parametre ako sú: adipozita, veľkosť tukových buniek, glukózová tolerancia, glykácia proteínov, ukazovatele ROS, koncentrácie hormónov a expresia klúčových komponentov RAS. Experimenty budú vykonané na zdravých potkanoch Wistar ako aj na obéznych diabetických zvieratách kmeňa Zucker. Koncentrácia metylcelulózy sa vyselektuje na základe bunkových experimentov zameraných na antioxidačný účinok frucel. Veríme, že sa nám podarí overiť pozitívny efekt frucel na metabolizmus vrátane zvýšenia aktivity ACE2. |
Oxid uhličitý v nádorovom metabolizme glukózy: prehliadaná Achillova päta rakoviny
Carbon dioxide in cancer glucose metabolism: an overlooked Achilles’ heel of cancer
Pochopenie úlohy alternatívneho zostrihu pri rezistencii na cisplatinu
Understandingthe role of alternative splicing in cisplatin resistance
| Doba trvania: |
1.9.2024 - 30.6.2026 |
| Program: |
Plán obnovy EÚ |
| Zodpovedný riešiteľ: |
MVDr. Borszéková Pulzová Lucia PhD. |
| Anotácia: | Cisplatina patrí medzi vysoko účinné širokospektrálne chemoterapeutiká. Získaná rezistencia je hlavnou príčinou zlyhania terapie u pôvodne citlivých nádorov semenníkov tvorených zárodočnými bunkami (TGCTs). Aberantný alternatívny zostrih (AZ) molekuly pre-mRNA je sprievodným javom pri vývoji nádorov, progresii, metastázovaní a pravdepodobne zohrávajú úlohu aj pri vzniku rezistencie. Napriek pokroku technológii RNA-sekvenovania, zostáva úloha AZ vo vývoji chemorezistencie naďalej nedostatočne preskúmaná.
Cieľom projektu je identifikácia biomarkerov (varianty AZ), ktoré sú schopné predikovať citlivosť na cisplatinu u TGCTs a pochopiť úlohu AZ vo vývoji rezistencie. Pomocou sekvenovania transkriptómu a in silico analýzy dát budú definované AZ charakteristík rezistentného fenotypu a taktiež bude študovaný aj vplyv AZ na expresiu génov a proteínových izoforiem. Na stanovenie vplyvu AZ na prežívanie buniek po terapii, budú využité inhibítory zostrihu a gene silencing regulátorov zostrihu. |
Porovnanie účinku nanosfér a nanobipyramíd zlata konjugovaných so silibinínom pri liečbe fibrózy pečene in vivo.
Comparison between silibinin-conjugated gold nanospheres and nanobipyramids impacts on the treatment of liver fibrosis in vivo.
| Doba trvania: |
1.1.2022 - 31.12.2025 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Svitková Barbora PhD. |
| Anotácia: | Fibróza pečene vzniká ako dôsledok chronického poškodenia pečene spojeného s akumuláciou proteínov extracelulárnej bunkovej matrix. Spravidla je finálnym vyústením rôznych infekčných aj neinfekčných chorôb a predstavuje globálny zdravotný problém vyplývajúci z vysokej celosvetovej prevalencie a obmedzených možností liečby. Liečba fibrózy pečene hrá kľúčovú úlohu v predchádzaní vzniku cirhózy pečene a hepatocelulárneho karcinómu, no v súčasnosti neexistuje žiadna účinná farmaceutická intervencia na liečbu tohto ochorenia. Jeden zo sľubných, avšak do dnešnej doby málo preskúmaných prístupov ku liečbe fibrózy pečene zahŕňa použitie cielenej terapie s využitím nanomateriálov s naviazaným liečivom. V prípade anorganických nanomateriálov sa skúma využitie nanosfér zlata. Nanomateriály iného tvaru (napr. nanobipyramídy) by mohli mať ešte lepšie diagnostické a terapeutické vlastnosti, vďaka ich fyzikálno-optickým vlastnostiam. |
Post-translačné modifikácie glutamátových transportérov stimulované vzdialeným kondicionovaním zodpovedné za ich zvýšenú kapacitu vychytávania glutamátu
Post-translational modifications of glutamate transporters stimulated by remote conditioning responsible for their enhanced glutamate uptake capacity
| Doba trvania: |
1.7.2024 - 31.12.2025 |
| Program: |
PostdokGrant |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Končeková Jana PhD. |
| Anotácia: | Glutamát predstavuje hlavný excitačný neurotransmiter v mozgu. Jeho koncentrácia v extracelulárnom prostredí je prísne regulovaná prostredníctvom glutamátových transportérov (EAATs). Počas ischémie mozgu sú však mechanizmy zabezpečujúce homeostázu glutamátu výrazne ovplyvnené, čoho výsledkom je jeho nahromadenie v extracelulárnom prostredí, spúšťajúce proces excitotoxicity. Úprava metabolizmu glutamátu predstavuje jeden z kľúčových protektívnych mechanizmov stimulovaných vzdialeným ischemickým kondicionovaním (RIC), ktoré vedú k výraznej redukcii ischemického poškodenia mozgu. RIC zabezpečuje efektívnejšie vychytávanie glutamátu prostredníctvom EAATs, avšak konkrétne mechanizmy modulácie glutamátových transportérov nie sú doposiaľ objasnené. |
Potenciál fyzickej aktivity ovplyvniť proliferačnú kapacitu a charakteristiky nádorových buniek: identifikácia exerkínov a mechanizmov s protinádorovým účinkom
The potential of physical activity to influence the proliferative capacity and characteristics of tumor cells: identification of exerkines and mechanisms with antitumor effects
Potenciál hypoxiou indukovanej karbonickej anhydrázy IX v diagnostike a terapii adenokarcinómov pľúc.
Significance of hypoxia induced carbonic anhydrase IX in diagnostics and therapy of lung adenocarcinoma
| Doba trvania: |
1.1.2023 - 31.12.2026 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Csáderová Lucia PhD. |
| Anotácia: | Nádory pľúc sú celosvetovo hlavnou príčinou úmrtí súvisiacich s rakovinou. Napriek snahe o včasné odhalenie je
väčšina pacientov s rakovinou pľúc stále diagnostikovaná v pokročilom štádiu. Nemalobunkový karcinóm pľúc
(NSCLC) predstavuje asi 85% všetkých nádorov pľúc. Najčastejším typom NCSLC je adenokarcinóm pľúc.
Nové možnosti cielenej terapie posunuli liečbu rakoviny pľúc na personalizovanejšiu úroveň aj vďaka novým
molekulovým markerom. Hypoxiou regulovaná karbonická anhydráza IX by mohla predstavovať nielen vhodný
diagnostický a prognostický biomarker, ale aj terapeutický cieľ. V projekte sa chceme zamerať na analýzy zmien
expresie /funkcie CA IX v kokultivačných 3D modeloch adenokarcinómu pľúc, ako aj na sledovanie tkanivovej a
solubilnej CA IX a markerov nádorového mikroprostredia v pacientskych vzorkách pľúcneho adenokarcinómu a
v tekutých biopsiách – v krvi a malígnych pleurálnych výpotkoch s cieľom získania dôležitých informácií o
prognostickom a diagnostickom význame CAIX pri tomto ochorení. |
Povrchová modifikácia 3D tlačených titánových spinálnych implantátov pre zlepšenie funkčných vlastností
Surface modification of 3D printed titanium spinal implants to improve functional properties
Preprogramovanie mikroprostredia duktálneho adenokarcinómu pankreasu voči imunoterapii
Reprogramming pancreatic ductal adenocarcinoma microenvironment towards immunotherapy
| Doba trvania: |
1.7.2022 - 30.6.2026 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Smolková Božena PhD. |
| Anotácia: | Duktálny adenokarcinóm pankreasu (PDAC) je smrteľné ochorenie s 5-ročným prežívaním nižším ako 10%. Hoci
inhibítory imunitných kontrolných bodov spôsobili revolúciu v liečbe nádorových ochorení, pacientom s PDAC
zlepšenie prežívania nepriniesli. Nedostatočná odpoveď na imunoterapiu spočíva hlavne v nízkej imunogenicite a
nezápalovej povahe PDAC. Tieto skutočnosti vedú ku kľúčovej klinickej otázke: Akým spôsobom zmeniť t ieto
“imuno-rezistentné“ nádory na “imuno-senzitívne“? Nedávne štúdie ukázali, že imunosupresívne nádorové
mikroprostredie môže byť riadené epigenetickými regulátormi, prostredníctvom inhibície kľúčových komponentov
antigén-prezentujúceho mechanizmu, cytok ínov alebo chemokínov. Z tohto dôvodu sa preprogramovani e
epigenetických mechanizmov javí ako jedna z nádejných stratégií k naštartovaniu imunogenicity nádorových
buniek. Predpokladáme, že cielená terapia, zameraná na jednotlivé bunkové subpopulácie prítom né v nádorovom
mikroprostredí, ktoré bude možné odlíšiť na základe pre ne charakteristickej expresie markerov a špecifických
medzibunkových interakcií, povedie k lepšej odpovedi PDAC na imunoterapiu. Cieľom projektu HeaTME je prispieť
k pochopeniu komplexity a heterogenity nádorového mikroprostredia a jeho kľúčových zložiek, zodpovedných za
rezistenciu PDAC voči imunoterapii. Veríme, že pomocou pokročilých predklinických modelov bude možné
identifikovať a charakterizovať nové terapeutické ciele, zapojené do modulácie dynamicky sa meniaceho
nádorového mikroprostredia. Využitie inovatívnych prístupov, medzi ktoré patrí aj priestorová transkriptomika, nám
umožní navrhnúť a otestovať účinnú epigenetickú liečbu, ktorá by mohla aspoň u časti pacientov viesť k
preprogramovaniu PDAC z imuno-rezistentného na imuno-senzitívny nádor. |
Protektívna a protirakovinová úloha tymolu a jeho derivátov na rakovinu hrubého čreva s použitím modelu choriovej alantoickej membrány
The protective and anti-cancer role of thymol and its derivatives in colon cancer cell lines using the Japanese quial chorioallantoic membrane model
Proti-nádorový a protizápalový účinok kurkumínu u onkologických pacientov
Anti - tumour and anti - inflammatory properties of curcumin in cancer patients
| Doba trvania: |
1.8.2024 - 30.6.2026 |
| Program: |
Plán obnovy EÚ |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Durdík Matúš PhD. |
| Anotácia: | Vážne vedľajšie účinky rádioterapie (RT) sú manifestované u približne 5% pacientov. Avšak doteraz nie je dostupný žiadny biomarker na diagnózu pacientov u ktorých sa prejavia vedľajšie účinky RT spôsobené zvýšenou úrovňou zápalových procesov indukovaných RT. Plánujeme zaviesť analýzu expresie génu EDA2R ako citlivého biomarkeru ožiarenia nízkymi dávkami ionizujúceho žiarenia a individuálnej rádiosenzitivity. Kurkumín, chemikália prítomná v rastline Curcuma longa, znižuje aktivitu procesov, ktoré hrajú dôležitú úlohu v kontrole zápalových procesov a tým môže zmierniť vedľajšie účinky indukované RT. Kurkumín môže mať tiež proti nádorové účinky, ktoré môžu byť nápomocné v liečbe nádorov. Kurkumín budeme podávať pacientom počas trvania RT a následne hodnotiť výskyt kožných reakcií pomocou RTOG kritérií. Naviac budeme študovať proti nádorový účinok kurkumínu pomocou in vitro experimentov na bunkových líniách. |
Radiačne-indukované nekódujúce RNA v mononukleárnych bunkách pupočníkovej krvi
Radiation-induced noncoding RNAs in mononuclear cells of umbilical cord blood
| Doba trvania: |
1.1.2022 - 31.12.2025 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Škorvaga Milan CSc. |
| Anotácia: | Nekódujúce RNA (ncRNA), vrátane cirkulárnych RNA (circRNA) a dlhých ncRNA (lncRNA), sú zapojené do regulácie génovej expresie v eukaorytických bunkách na transkripčnej a posttranskripčnej úrovni. Štúdie odhalili, že vplyvom stredných dávok ionizujúceho žiarenia (IR) došlo k zmenám v expresii circRNA a lncRNA, avšak nie je známe, či táto expresia je regulovaná nízkymi dávkami IR. V tomto projekte chceme študovať úroveň expresie circRNA (circPvt1, circSPRY2, KIRKOS-71, KIRKOS-73) a lncRNA (lncMALAT1, lncGAS5) po ožiarení nízkymi dávkami IR a rádiofrekvenčného (RF) žiarenia v mononukleárnych bunkách pupočníkovej krvi (UCB MNC). Okrem toho budeme monitorovať v UCB MNC ožiarených IR/RF dva Pvt1 chimérické transkripty generované ako posttranskripčné udalosti. NcRNA, u ktorých zistíme signifikantnú dereguláciu expresie vplyvom žiarenia, použijeme na skríning periférnej krvi rádiológov. Táto práca je zameraná na vyhodnotenie potenciálu analyzovaných ncRNA ako markerov biodozimetrie nízkodávkového IR a RF žiarenia. |
Rastlinné endornavírusy: parazity alebo symbionty poľnohospodárskych plodín?
Plant endornaviruses: parasites or symbionts of agricultural crops?
| Doba trvania: |
1.1.2024 - 31.12.2027 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
doc. Ing. Glasa Miroslav DrSc. |
| Anotácia: | Rastlinné endornavírusy (čeľaď Endornaviridae) sú jednovláknové RNA vírusy, ktoré perzistentne infikujú
poľnohospodárske plodiny. Endornavírusy sú prenosné výlučne vertikálne prostredníctvom semien, vďaka čomu
majú evolučne dlhodobé vzťahy so svojimi hostiteľmi. Infekcia endornavírusmi môže mať dokonca priaznivé
účinky na svojich rastlinných hostiteľov, tieto vzťahy však boli doteraz len veľmi málo preskúmané. Napriek
vzrastajúcim poznatkom o komplexnosti rastlinného virómu dosiahnutých vďaka aplikácii masívneho paralelného
sekvenovania sú fakty o perzistentných vírusoch, ich diverzite, prirodzenom hostiteľskom okruhu a interakciách s
plodinami doteraz veľmi málo objasnené. Cieľom projektu je získať originálne poznatky o distribúcii
endornavírusov v rôznych poľnohospodárskych plodinách, zhodnotiť ich molekulárnu variabilitu a vyvinúť
spoľahlivé a špecifické nástroje na ich detekciu. Na vybraných hostiteľoch budeme zároveň sledovať vplyv
endornavírusovej infekcie na ich fenotypové a rastové charakteristiky. |
Reakcia vybraných populácií buniek CNS na poranenie periférneho nervu a ich možná úloha pri regenerácii
The response of selected populations of CNS cells to peripheral nerve injury and their possible role in regeneration.
| Doba trvania: |
1.1.2024 - 31.12.2026 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Blaško Juraj PhD. |
| Anotácia: | Centrálny a periférny nervový systém tvoria jeden funkčný celok, čo sa prejavuje aj za patologických podmienok. Pri poškodení periférneho nervu dochádza k aktivácii gliových populácii – astrocytov a mikroglie v mieche, čo pravdepodobne predstavuje dôležitý faktor v následnom regeneračnom procese. V našom projekte máme za cieľ zmapovať priestorovú a časovú dynamiku aktivácie gliových a imunitných buniek v mieche a dorzálnych gangliách po poranení nervu. Tieto procesy budú sledované v in vivo a in vitro podmienkach. V ďalšej fáze sa chceme venovať vplyvu prekondicionovania, teda aktivácii gliovej populácie v mieche po poranení periférneho nervu, na regeneráciu segmentálne príbuzného nervu.Veríme, že našim projektom tak prinesieme nové poznatky o vzájomných vzťahoch periférneho a centrálneho nervového systému po traumatickom poranení. |
Regulácia hypoxickej signalizácie v karcinóme obličiek s dôrazom na úlohu karbonickej anhydrázy IX v nádorovom mikroprostredí
Regulation of hypoxic signalling in renal carcinoma with focus on the role of carbonic anhydrase IX in the tumor microenvironment
| Doba trvania: |
1.1.2024 - 31.12.2027 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Baráthová Monika PhD. |
| Anotácia: | Karcinóm obličiek predstavuje závažnú urologickú malignitu. Pre vysokú incidenciu a mortalitu je závažným medicínskym problémom aj na Slovensku. Svetlobunkový podtyp renálneho karcinómu (ccRCC) je charakteristický mutáciou proteínu von Hippel Lindau a vysokou expresiou CAIX. CAIX je nielen relevantný biomarker ccRCC, ale aj vhodný terapeutický cieľ. V projekte sa chceme zamerať na testovanie efektov inhibície dvoch dôležitých proteínov RCC - CAIX a HIF2. CAIX je cieľovým proteínom HIF1 v odpovedi na akútnu hypoxiu, HIF2 zohráva dôležitú úlohu pri chronickej hypoxii. RCC patrí medzi vysoko imunogénne nádory. Zameriame sa na sledovanie vplyvu inhibície CAIX pomocou špecifických protilátok a HIF2 použitím inhibítora Belzutifan na základné bunkové parametre ako aj na proteíny kontrolných bodov imunitnej odpovede. Využijeme pritom 3D modely ako aj nádorové organoidy pripravené z tkaniva RCC, ktoré svojou štruktúrou a architektúrou predstavujú vhodný experimentálny nástroj na reprodukciu nádoru in vitro. |
Regulácia prenosu Rickettsia a Coxiella prostredníctvom hematofágnych článkonožcov
Regulation of Rickettsia and Coxiella transmission via hematophagous arthropods
Regulácia transportu železa ako faktor prispievajúci k chemorezistencii testikulárnych nádorov
Regulation of iron transport as a factor contributing to the chemoresistance of testicular tumours
| Doba trvania: |
1.1.2024 - 31.12.2027 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Roška Jan PhD. |
| Anotácia: | Testikulárne nádory zo zárodočných buniek (TGCTs) postihujú prednostne mladých mužov a sú veľmi dobre liečiteľné liečbou na báze cisplatiny (CDDP). Vynikajúce výsledky liečby vykazujú dokonca aj pokročilé metastatické štádiá. Približne 10 % pacientov však neodpovedá adekvátne na túto liečbu, resp. si vyvinie si voči nej rezistenciu. Poznáme viacero mechanizmov, ktoré prispievajú k vzniku rezistencie voči CDDP, vrátane alterácií jej transportu, zvýšenej detoxikácie liečiva a opravy poškodenia DNA, či zmien v transdukcii bunkovej smrti. Feroptóza predstavuje osobitný typ regulovanej bunkovej smrti, odlíšiteľný na morfologickej, metabolickej a genetickej úrovni. Proces feroptózy je závislý od železa a prítomnosti reaktívnych foriem kyslíka (ROS). Cieľom nášho projektu je preskúmať zapojenie feroportínu (SLC40A1) v procese vzniku rezistencie voči CDDP. Zároveň plánujeme preskúmať aj jeho epigenetickú reguláciu prostredníctvom mikro RNA v bunkových líniách TGCT s prirodzenou a získanou rezistenciou voči CDDP. |
Regulačné mechanizmy vzájomnej komunikácie medzi hypoxiou-ischémiou a zápalom v akútnej a subakútnej fáze po traumatickom poranení miechy a liečbe Siponimodom
Regulatory mechanisms of mutual communication between hypoxia-ischemia and inflammation during the acute and subacute phase of traumatic spinal cord injury and Siponimod treatment
| Doba trvania: |
1.1.2024 - 31.12.2027 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Kisucká Alexandra PhD. |
| Anotácia: | Cieľom projektu je zistiť, či v akútnej fáze poranenia miechy dochádza súčasne k proliferácii mikroglie a aktivácii
hypoxiou indukovanej dráhy transkripčného faktora 1 (HIF-1), a ako prebieha ich vzájomná komunikácia. Keďže
HIF-1 je hlavným mediátorom homeostázy v nervovom tkanive vystavenom hypoxii, následne plánujeme
študovať aktiváciu HIF-1 a PI3K/Akt v dysregulovanom mikroprostredí (zápalové milieu) v mieste lézie a v
okolitom tkanive (kraniálne a kaudálne) počas subakútnej fázy poranenia miechy. Okrem toho bude preskúmaná
liečba protizápalovým liekom Siponimodom, zistí sa jeho vplyv na aktiváciu špecifických signálnych dráh a na
reguláciu mechanizmov vedúcich k polarizácii prozápalových (M1/A1) a neuroprotektívnych (M2/A2) subtypov
mikroglie/makrofágov a astrocytov. Predpokladáme, že liečebné stratégie, ktoré inhibujú M1/A1 fenotypy a
podporujú ich polarizáciu na M2/A2 fenotypy, môžu inhibovať sekundárne procesy poranenia miechy a
napomôcť jej regenerácii. |
Rekonštrukcia komplexnosti duktálneho adenokarcinómu pankreasu: implementácia technológie Orgán na čipe na zlepšenie terapeutických poznatkov
Recreating Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Complexity: Implementation of Organ-on-a-Chip Technology for Enhanced Therapeutic Insights
| Doba trvania: |
1.7.2024 - 31.12.2025 |
| Program: |
PostdokGrant |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Buociková Verona PhD. |
| Anotácia: | Duktálny adenokarcinóm pankreasu (PDAC) je nádorové ochorenie typické agresívnou povahou, výraznou
heterogenitou a nízkou účinnosťou terapie. V predkladanom projekte je našim cieľom vývoj komplexného
predklinického modelu PDAC, ktorý presnejšie rekapituluje mnohobunkovú štruktúru a fyziologickú funkciu
pankreasu, s využitím inovatívnej technológie organ-on-a-chip. Denzná extracelulárna matrix nádorového
mikroprostredia PDAC, ktorá je považovaná za hlavnú prekážku v účinnosti systémovej terapie, je vo veľkej miere
vylučovaná fibroblastami asociovanými s nádorom (CAFs). Kokultiváciou organoidov derivovaných od pacienta
(PDOs) s CAFs v dynamických podmienkach sa pokúsime modelovať histopatologické a molekulárne charakteristiky
pôvodného nádoru, čo umožní presnejšie predikovať terapeutickú odpoveď. Na základe poznatkov o úlohe
epigenetickej deregulácie v progresii PDAC a v rezistencii na terapiu predpokladáme, že kombinácia epigenetických
liečiv s nízkomolekulovými inhibítormi bude synergicky zacielená na kľúčové dráhy zapojené do progresie PDAC.
Vysokovýkonná skríningová platforma nám umožní rýchle testovanie účinnosti viacerých tried inhibítorov proti PDAC.
Náš výskum má potenciál poskytnúť nové poznatky o patogenéze PDAC a uľahčiť vývoj účinnejších terapeutických
stratégií. Vzhľadom na závažné spoločenské, ekonomické a klinické dôsledky PDAC, predkladaný projekt prispieva k
snahe zlepšiť neuspokojivý klinický manažment tohto ochorenia. |
Samovražedná génová terapia sprostredkovaná exozómami z mezenchýmových stromálnych a pankreatických nádorových buniek v liečbe duktálneho adenokarcinómu pankreasu
Suicide gene therapy mediated by mesenchymal stromal and pancreatic tumor cell-excreted extracellular vesicles in the treatment of pancreatic ductal adenocarcinoma
| Doba trvania: |
1.7.2021 - 30.6.2025 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Buociková Verona PhD. |
| Anotácia: | Prežívanie pacientov s duktálnym adenokarcinómom pankreasu (PDAC) je napriek pokroku vo výskume
pankreatických malignít stále nízke. Preto je nevyhnutné hľadať inovatívne terapeutické riešenia. Nádorový
tropizmus mezenchýmových stromálnych buniek (MSC) podnietil vývoj samovražednej génovej terapie. MSC s
integrovaným samovražedným génom, kvasinkovou cytozín deaminázou::uracil fosforibozyltransferázou
(yCD::UPRT), sa ukázali ako efektívny prostriedok pri liečbe viacerých foriem nádorov v predklinických štúdiách. Pri liečbe sa podáva netoxické predliečivo 5-fluorocytozín, ktoré je následne v bunke metabolizované na toxický 5-fluorouracil. Pozorovali sme, že MSC transdukované yCD::UPRT génom produkujú extracelulárne vezikuly, ktoré dokážu transportovať mRNA samovražedného génu. Vďaka tomu, že toxicky účinkujú až vo vnútri cieľovej bunky, ich kontinuálnej toxickej aktivite a výraznej teplotnej stabilite sa dajú považovať za štandardné „off-the-shelf“ liečivo. Hlavným cieľom predkladaného projektu je vývoj, charakterizácia a stanovenie bezpečnosti inovatívnej cielenej liečby PDAC prostredníctvom terapeutických extracelulárnych vezikúl. Účinnosť liečby vezikulami so samovražedným génom budeme hodnotiť na PDAC bunkových líniách a primárnych pankreatických nádorových bunkách v in vitro a in vivo podmienkach. Zároveň využijeme najrelevantnejšie predklinické modely, organoidy a xenografty z pacientskeho nádorového tkaniva, ktoré sa svojou podstatou najviac približujú komplexnosti nádoru u pacienta. Okrem toho budeme charakterizovať extracelulárne vezikuly produkované bunkami PDAC, ktoré sa podieľajú na vytváraní pre-metastatickej niky. Kombináciou génovej terapie a štandardných protinádorových liečiv budeme sledovať schopnosť terapeutických vezikúl zabrániť tvorbe metastáz.
Veríme, že spojením najnovších vedeckých poznatkov a multidisciplinárnej spolupráce sa nám podarí naplniť ciele projektu a v konečnom dôsledku zlepšiť prežívanie pacientov s PDAC. |
Sekretóm krvných elementov v úlohe zdroja bioaktívnych faktorov sprostredkujúcich neuroprotekciu
Blood elements-derived secretome as a source of bioactive factors mediating the neuroprotection
| Doba trvania: |
1.7.2022 - 30.6.2026 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Bonová Petra PhD. |
| Anotácia: | Cievne mozgové príhody (CMP), vrátane tých ischemických, sú celosvetovo druhou najčastejšou príčinou úmrtia a
dlhodobej invalidity. Pri ischemických stavoch sú možnosti liečby limitované na jedinú, časovo obmedzenú,
medikamentóznu intervenciu (tPA), ktorej rizikom je možná hemoragická transformácia. V nasledujúcom desaťročí
je predpokladaný progresívny nárast počtu prípadov CMP, a to až o jednu tretinu. V súvislosti s pandémiou
koronavírusu SARS-CoV-2 môže byť toto číslo ešte vyššie. Potreba ďalších podporných a regeneratívnych terapií
sa tak stáva ešte aktuálnejšou.
V klinickej praxi sa na zmiernenie dopadov CMP stále častejšie využíva metóda vzdialeného kondicionovania
(RIC). Podstatou RIC je endogénna stimulácia mechanizmov vedúcich k neuroprotekcii a to ischémiou vzdialeného
orgánu či končatiny. Aj napriek mnohým benefitom, závažným limitujúcim faktorom tejto terapie je načasovanie,
dávka, ale aj faktory ako vek, pohlavie a metabolické disfunkcie pacienta.
Účinným nástrojom regeneratívnej medicíny sa javí byť aj bunková terapia. Kvôli otázkam bezpečnosti sa však
liečbe CMP venuje menej ako 1% z klinických štúdií. Pozitívne účinky transplantácie sú, okrem buniek štepu,
pripisované hlavne mikroprostrediu, ktoré bunky vytvárajú sekréciou. Využitím sekretómu je tak eliminované riziko
spojené s transplantáciou živých a potenciálne pluripotentných buniek. Ďalším benefitom v otázkach bezpečnosti
bunkovej terapie je fakt, že parakrinná aktivita je zdokumentovaná aj u väčšiny diferencovaných typov buniek,
vrátane buniek krvnej cirkulácie.
Náš experimentálny prístup predstavuje kombináciu oboch hore uvedených stratégií- využíva parakrinnú aktivitu
krvných elementov, ktoré boli endogénne stimulované RIC. Výsledkom je derivácia sekretómu, ktorý na modeli
ischémie mozgu disponuje významným neuroprotektívnym efektom. Ďalším nevyhnutným krokom pre priblíženie
tejto atraktívnej stratégie potrebám klinickej praxe je charakterizácia sekretómu a jeho bioaktívnych vlastností. |
Skúmanie povrchu a obsahu pečeňových extracelulárnych vezikúl na identifikáciu cirkulujúceho biomarkera NAFLD
Uncovering the surfaceome and cargo of hepatic extracellular vesicles to identify circulating NAFLD biomarker
Skúmanie regulačných mechanizmov migrácie neuroblastov v rostrálnej migračnej dráhe potkana in vitro
Investigation of regulatory mechanisms of neuroblast migration in the rat rostral migratory stream in vitro
| Doba trvania: |
1.7.2024 - 30.6.2025 |
| Program: |
Iné projekty |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Žideková Monika PhD. |
| Anotácia: | Projekt sa zaoberá migráciou neuroblastov zo subventrikulárnej zóny laterálnych komôr prostredníctvom rostrálnej migračnej dráhy (RMS) do bulbus olfactorius (BO) v mozgu dospelých potkanov. Proces migrácie je kľúčový pre integráciu nových neurónov do nervových okruhov BO. Na regulácii migrácie neuroblastov v RMS sa podieľajú astrocyty a endotelové bunky krvných ciev, ktoré regulujú migráciu prostredníctvom neurotrofínu BDNF. Migráciu neuroblastov v RMS ovplyvňuje aj sérotonín (5-HT), no mechanizmus jeho účinku zatiaľ nie je známy. Keďže v inej neurogénnej oblasti – v hipokampe bolo zistené synergické pôsobenie BDNF a 5-HT na postnatálnu neurogenézu, cieľom projektu je skúmať, či 5-HT ovplyvňuje migráciu neuroblastov v RMS synergicky s BDNF, alebo nezávisle od BDNF. Zisťovať to budeme pomocou in vitro metodiky zameranej na migráciu neuroblastov využívajúcej explantáty z RMS, za pridania antagonistov receptorov pre BDNF a pre sérotonín do kultivačného média. |
Sledovanie vplyvu stromálnej zložky nádorového mikroprostredia na liečbu karcinómu prsníka v organoidovom modeli
Evaluation of the role of tumor microenvironment stromal component in breast cancer treatment outcome using an organoid model
| Doba trvania: |
1.1.2022 - 31.12.2025 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Ing. Buríková Monika PhD. |
| Anotácia: | Výskum rakoviny prsníka bol donedávna orientovaný hlavne na bunkové línie a animálne modely. V súčasnosti
ich však nahrádzajú primokultúry vo forme organoidov – 3D štruktúr, ktoré oveľa presnejšie rekapitulujú tkanivo
na molekulárnej, histologickej a klinickej úrovni. V našom projekte sa zameriame na interakcie medzi primárnymi
nádorovými bunkami vo forme organoidov s bunkami nádorového mikroprostredia – mezenchýmovými
stromálnymi bunkami (MSC). Cieľom projektu je identifikácia potenciálnych molekulárnych cieľov prispievajúcich
k zhoršenej odpovedi na liečbu karcinómu prsníka. Založením biobanky z pacientskych tkanív získame vysoko
relevantný nástroj na skúmanie vplyvu mikroprostredia na molekulárne vlastnosti nádoru a na vznik rezistencie,
ktorá je významným klinickým problémom. Získané výsledky by mali viesť k lepšiemu pochopeniu fyziológie
nádoru a mechanizmov ovplyvňujúcich odpoveď na liečbu. Tieto nástroje by nám v budúcnosti mohli pomôcť
optimalizovať a personalizovať terapiu u konkrétnych pacientov. |
Stanovenie genotoxicity indukovanej 5G žiarením a štúdium fytochemikálií ako modulátorov radiáciou indukovaného poškodenia DNA a rakoviny
Evaluation of 5G radiation induced genotoxicity and assessment of phytochemicals as modulator of radiation induced DNA damage and cancer
| Doba trvania: |
1.1.2023 - 31.12.2026 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Gulati Sachin PhD. |
| Anotácia: | Štúdie zaoberajúce sa expozíciou k rádiofrekvenčnému žiareniu (RFR) z mobilnej komunikácie a následnej
indukcie reaktívnych foriem kyslíka, poškodenia DNA a rakoviny ponúkajú kontroverzné výsledky. Tieto dáta
však nie sú priamo porovnateľné, pretože sa uskutočnili pri rôznych parametroch expozície, ktoré sa ukázali ako
kritické pre vznik účinkov RF. Navrhujeme vyhodnotenie genotoxických účinkov RFR používaných v signáloch
5G. Genotoxicita a oxidačný stres sa vyhodnotia vhodnou kombináciou sledovaných parametrov. Dlhodobá
expozícia signálom 5G pri indukcii malígnej transformácie buniek sa vyhodnotí pomocou myší SCID.
Fytochemikálie ako extrakt z rastliny Gingko biloba a kurkumín budú hodnotené v kombinácii so signálmi 5G a
vysokými dávkami gama-žiarenia používanými v rádioterapii, s cieľom overiť ich rádioprotektívny vplyv na
poškodenie DNA, oxidačný stres a vznik malignít. |
Stanovenie poškodenia DNA a genetickej nestability v bunkách rádiológov vystavených nízkym dávkam ionizujúceho žiarenia
Assessment of DNA damage and genetic instability in hospital workers occupationally exposed to low doses of ionizing radiation
| Doba trvania: |
1.1.2023 - 31.12.2026 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Košík Pavol PhD. |
| Anotácia: | Vysoké dávky ionizujúceho žiarenia (IR) indukujú poškodenie DNA a genetickú nestabilitu súvisiace s rôznymi
typmi nádorov. Avšak, dôsledky opakovanej a dlhotrvajúcej expozície ľudí nízkymi dávkami IR, ktoré sú typické
pre diagnostické lekárske prostredie, nie sú dostatočne preskúmané. Naše predbežné výsledky naznačujú
zvýšené poškodenie DNA a genetickú nestabilitu u slovenských rádiológov. Cieľom projektu je potvrdenie týchto
predbežných výsledkov u rozšírenej skupiny rádiológov (medicínskych pracovníkov) použitím komplexného
panelu najmodernejších techník, ktoré by nahradili klinicky relevantné ochranné opatrenia. Použijeme „gold
standard“ cytogenetické metódy obohatené o Metafer fluorescenčnú mikroskopiu a FISH. Získané výsledky
budeme korelovať s kumulatívnou dávkou IR a klinickými údajmi rádiologických pracovníkov vrátane prekonania
COVID-19 a očkovania. Odhadneme riziko rakoviny u rádiológov. Budeme skúmať perzistenciu a genetickú
nestabilitu po prekonaní COVID-19 pomocou FISH. |
Stresom indukovaná translokácia črevnej mikrobioty v regulácii zápalovej odpovede - pohlavné rozdiely u hlodavcov
Stress-induced translocation of the intestinal microbiota in the regulation of the inflammatory response - sex differences in rodents
| Doba trvania: |
1.1.2022 - 31.12.2025 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Ing. Vargovič Peter PhD. |
| Anotácia: | Chronický stres spôsobuje narušenie vzájomnej komunikácie neuroendokrinného a imunitného systému čo významne participuje pri rozvoji ochorení súvisiacich s chronickým zápalom. V tomto ohľade zohráva dôležitú úlohu črevná mikrobiota ktorá ovplyvňuje oba tieto systémy. Ochorenia súvisiace so stresom vykazujú značné pohlavné rozdiely ako dôsledok nervových, endokrinných, imunitných rozdielov, ale aj zmien v mikrobiote. Stres zvyšuje translokáciu črevnej mikrobioty do krvného obehu, tkanív a orgánov čím ovplyvňuje aktivitu imunitných buniek a ich zápalovú aktivitu. Cieľom projektu je popísať rozdiely medzi samcami a samicami myší v stresom-indukovanej translokácii črevných baktérii a jej úlohu v komunikácii neuroendokrinného a imunitného systému predovšetkým v regulácii zápalovej odpoved |
Subpopulácie imunitných buniek a apoptóza v odpovedi na infekciu vírusom chrípky A
The immune cell subsets and apoptosis in response to influenza A virus
| Doba trvania: |
1.1.2024 - 31.12.2027 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
doc. RNDr. Betáková Tatiana DrSc. |
| Anotácia: | Vírusy chrípky A spôsobujú sezónne epidémie, ktoré majú signifikantný vplyv na globálne zdravie. Každoročne
sa u 3-5 miliónov ľudí vyvinie závažné respiračné ochorenie a 290,000-650,000 ľudí infekciu neprežije. Imunitné
bunky ako T bunky, makrofágy, neutrofily a pod. majú oveľa významnejšiu úlohu v patogenéze vírusovej infekcie
ako sa doteraz myslelo. Povrchové receptory a Fas-FasL signalizácia môžu ovplyvňovať vývoj a funkciu
imunitných buniek a produkciu rôznych cytokínov. Úloha proteínu NS1 v regulácii imunitnej odpovedi nie je zatiaľ
úplne objasnená. Cieľom predkladaného projektu je: a) študovať vývoj subpopulácií imunitných buniek v
primárnom (pľúcach) a sekundárnom (iné orgány) mieste infekcie; b) zistiť úlohu apoptózy imunitných buniek a
c) objasniť úlohu proteínu NS1 vo vývoji subpopulácií imunitných buniek a v spustení apoptózy v týchto bunkách
po letálnej infekcii vírusom chrípky. |
Syntéza, fyzikálno-chemické a biologické vlastnosti prekurzorov na báze glykokonjugátov, N-heterocyklov a derivátov polysacharidov ako potenciálnych antikarcinogénnych a antivirotických liečiv
Synthesis, physicochemical, biological properties of glycoconjugates, N-heterocycle-based precursors and polysaccharide derivatives as potential anticancer and antiviral agents
| Doba trvania: |
1.1.2022 - 31.12.2025 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Horváthová Eva PhD. |
| Anotácia: | Projekt je zameraný na analýzu molekulovej štruktúry, ako aj fotochemické, antioxidačné, cytotoxické,
antiproliferačné a antivirotické účinky nových syntetických derivátov sacharidov (sacharidy heparínového a chitozánového typu s imidazolínovými skupinami, imino-aromatické deriváty chinazolinónov a ich komplexy s prechodnými kovmi). NMR spektroskopia bude hlavnou experimentálnou metódou pri analýze štruktúry novozosyntetizovaných glykokonjugátov a polysacharidov, okrem nej sa použijú tiež HRMS, UV-VIS,
FTIR,SEC-MALS a AFM ako aj metódy teoretickej chémie (DFT; optimalizácia geometrie, výpočet NMR
parametrov). Deriváty sacharidov budú pripravené novými syntetickými postupmi, pri ktorých sa využije katalýza iónmi kovov, vplyv mikrovlnného poľa a ultrazvuku. Okrem fotochemických a antioxidačných vlastností sa biologická aktivita pripravených látok bude testovať aj z hľadiska ich genotoxicity, cytotoxicity, interakcií s molekulou DNA (štiepenie, interkalácia) a antivirotických vlastností. |
Štipendiá pre excelentných PhD. študentov a študentky (R1) - Mechanizmy spájajúce CAIX-súvisiace hypoxické nádorové mikroprostredie a obezitu s progresiou rakoviny pankreasu vo vzťahu k imunitnej odpovedi
Fellowships for excellent PhD students (R1) - Mechanisms linking CAIX-associated hypoxic tumor microenvironment and obesity to pancreatic cancer progression in relation to immune response
| Doba trvania: |
1.1.2024 - 31.12.2027 |
| Program: |
Plán obnovy EÚ |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Ščasná Katarína |
Štipendiá pre excelentných PhD. študentov a študentky (R1) - Úloha laktátu v kontrole energetického metabolizmu
Fellowships for excellent PhD students (R1) - Role of lactate in the control of energy metabolism
Štipendiá pre excelentných PhD. študentov a študentky (R1) - Zhodnotenie imunitných kontrolných bodov v B-bunkových malignitách
Fellowships for excellent PhD students (R1) - Evaluation of immune checkpoints in B-cell malignancies
Štúdia efektorových proteínov v patogenite a ich využitie v diagnostike Rickettsióz
Study of effector proteins in pathogenicity and their use in the diagnosis of Rickettsiosis
| Doba trvania: |
1.1.2024 - 31.12.2027 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Quevedo Diaz Marco PhD. |
| Anotácia: | Rickettsia je rod nepohyblivých, gram-negatívnych, nespórovitých, vysoko pleomorfných baktérií, ktoré
spôsobujú závažné epidemické ricketsiózy. Skupina škvrnitej horúčky, prechodná skupina a skupina týfusu sú
členmi rodu Rickettsia. Patogénne druhy Rickettsiae si vyvinuli mechanizmy na zabránenie intracelulárnej
detekcii a eliminácii patogénov v hostiteľských bunkách. Počas infekcie vstupuje do hostiteľskej bunky
podskupina faktorov bakteriálnej virulencie, „efektorové proteíny“, kde fungujú tak, že modulujú procesy
hostiteľskej bunky a následne vedú k bakteriálnej patogenéze. Bakteriálne efektorové proteíny sú translokované
do hostiteľskej bunky pomocou špecializovaných sekrečných systémov. Cieľom tohto návrhu je identifikácia a
charakterizácia efektorových proteínov vybraných patogénnych rickettsií v infikovaných makrofágoch a ich
využitie pri diagnostike rickettsióz. |
Štúdium biologických markerov a kurkumínu na diagnostiku a liečbu glioblastómu
Study of biological markers and curcumin for diagnosis and treatment of glioblastoma
| Doba trvania: |
1.9.2024 - 31.8.2026 |
| Program: |
Plán obnovy EÚ |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Košík Pavol PhD. |
| Anotácia: | Glioblastóm je najagresívnejšia forma mozgového nádoru pochádzajúca z gliových buniek s maximálnou dĺžkou života 15 mesiacov. Napriek zavedeniu viacerých sľubných terapeutických modalít je klinický výsledok pacientov s glioblastómom bezútešný. Preto identifikácia a validácia alternatívnych a doplnkových diagnostických techník predstavuje naliehavú a nesplnenú klinickú potrebu. Kvapalná biopsia sa v poslednej dobe považuje za neinvazívny alternatívny postup pre biopsiu tkaniva. Na tento účel plánujeme študovať odlišnú expresiu kandidátnych miRNA v plazme periférnej krvi pred, počas a po skončení rádioterapii a/alebo chemoterapie. Zároveň analyzujeme frekvenciu chromozomálnych aberácií a mikrojadier v lymfocytoch periférnej krvi. Kurkumín ako výživový doplnok podáme pacientom s glioblastómom po ukončení liečby a pomocou špecifických kognitívnych testov vyhodnotíme zlepšenie ich kognitívnych funkcií. |
Štúdium diverzity a interakcií mikrobiómu kliešťov Ixodes ricinus s vírusom kliešťovej encefalitídy
Study of diversity and interactions of Ixodes ricinus tick microbiome with the tick-borne encephalitis virus
| Doba trvania: |
1.1.2023 - 31.12.2026 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Koči Juraj PhD. |
| Anotácia: | Štruktúra mikrobiálnych spoločenstiev v organizmoch je častokrát formovaná interakciami medzi jednotlivými mikroorganizmami. Mikrobióm kliešťa Ixodes ricinus, jedného z najdôležitejších vektorov pôvodcov závažných chorôb v Európe, vo významnej miere ovplyvňuje kolonizáciu a prežívanie niektorých klinicky významných baktérií. Avšak informácie o úlohe celkového mikrobiómu kliešťa Ixodes ricinus pri prenose vírusov stále chýbajú. Cieľom tohto projektu bude (i) určiť spektrum mikrobiálnych druhov v kliešťoch infikovaných vírusom kliešťovej encefalitídy (TBEV) (ii) charakterizovať interakcie medzi TBEV a vybranými mikroorganizmani v experimentálne koinfikovaných kliešťoch a (iii) objasniť úlohu imunitných dráh v kliešťoch infikovaných TBEV. Cenné výsledky získané prostredníctvom inovatívneho prístupu prispejú k pochopeniu komplexných vzťahov medzi mikrobiálnym spoločenstvom, imunitou a vírusom, ktoré určujú vektorovú kompetenciu kliešťov. |
Štúdium genotoxických zmien indukovaných magnetickou rezonanciou v ľudských lymfocytoch
Study of genotoxic effects from magnetic resonance imaging in human lymphocytes
| Doba trvania: |
1.1.2023 - 31.12.2026 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Zastko Lucián PhD. |
| Anotácia: | Magnetická rezonancia (MR) je v dnešnej dobe považovaná za integrálny neinvazívny diagnostický zobrazovací
nástroj. Statické a časovo premenlivé gradientové magnetické pole v kombinácii s rádiofrekvenčným poľom
umožňuje MR vynikajúci kontrast tkanív. Nedávne štúdie o potenciálnych genotoxických účinkoch, indukovaných
rutinným 1.5 T MR skenovaním srdca v lymfocytoch, vyvolali bezpečnostné obavy. Genomická nestabilita
indukovaná MR skenovaním však bola doteraz skúmaná len niekoľkými metódami a otázny je aj vzťah zisteného
k reálnej situácii, keď sú bunky exponované v ľudskom tele. Cieľom našej štúdie je zistiť, či je štandardná 1.5 T
MR schopná indukovať genotoxicitu – pomocou gama H2AX/53BP1 DNA opravných fokusov, kométového testu,
analýzy mikrojadier, chromozomálnych aberácií, apoptózy a ROS indukcie v ľudských lymfocytoch in vitro,
umiestnených v tkanivovom ekvivalentom fantóme ľudského tela. Identifikácia genotoxických účinkov MR môže
viesť k možnosti do určitej miery upraviť jej diagnostické využitie. |
Štúdium génovej nestability v bunkách leukemických pacientov a chemoterapeuticky-rezistentných preleukemických kmenových buniek pocas remisie ako prevencia relapsu
Study of genetic instability in cells from leukemic patients and chemotherapy-resistant preleukemic stem cells at remission for prevention of relapses
| Doba trvania: |
1.1.2022 - 31.12.2025 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Jakl Lukáš PhD. |
| Anotácia: | Leukémia je najčastejšia malignita u detí. Je známe, že niektoré chromozómové translokácie vedú k
preleukemickým fúznym génom (PFG) v hematopoetických kmeňových/progenitorových bunkách (HSPC), ktoré
sú asociované s leukémiou. Translokácie vznikajú ako výsledok nesprávnej opravy DNA dvojvláknových zlomov
(DSB). Výsledky predchádzajúcej štúdie ukazujú, že je možná korelácia medzi prítomnosťou PFG a zvýšenou
hladinou endogénnych DNA opravných fokusov. Našim cieľom je objasniť, či pacienti s najčastejšími PFG majú
vyššiu úroveň gH2AX/53BP1 DNA opravných fokusov pomocou fluorescenčnej detekcie. Predpokladáme, že
niektoré preleukemické bunky, ktoré prežijú chemoterapiu, by mohli byť zdrojom relapsu ochorenia. Našim
druhým cieľom je charakterizovať prítomnosť PFG v subpopuláciách HSPC u leukemických pacientov po
úspešnej liečbe v remisii. Je nevyhnutné identifikovať subpopuláciu preleukemických kmeňových buniek
zodpovednú za relaps ochorenia pre potenciálnu imunoterapiu, ktorá by zabránila vzniku relapsu. |
Štúdium interakcií HCMV virokínov zapojených do imunologickej synapsy pre vývoj nového imunoterapeutického konceptu založeného na vírusových trikoch.
The study of HCMV virokine interactions underlying regulation of the immunological synapse for the development of a novel immunotherapeutic concept based on viral tricks
| Doba trvania: |
1.1.2022 - 31.12.2025 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Nemčovičová Ivana PhD. |
| Anotácia: | Molekulárne interakcie, regulujúce imunitnú odpoveď, prebiehajúce na rozhraní medzi T bunkami a bunkami prezentujúcimi antigén, nazývame imunologická synapsa. Ak sú tieto interakcie dysregulované, hostiteľ je náchylný na prienik patogénov alebo progresiu nádoru v jednom extréme alebo autoimunitné ochorenie v druhom extréme. Liečba zameraná na reguláciu týchto interakcií vyniesla imunoterapiu na vrchol súčasnej liečby rakoviny. Naším novým konceptom imunoterapie je ale zamerať sa na interakcie molekúl regulujúce imunologickú synapsu, ktorými cytomegalovírus potláča imunitnú odpoveď a získané znalosti využiť pri vývoji nových bioterapeutík. V rámci cieľov projektu budeme skúmať HCMV virokíny, ktoré pôsobia na NK a T bunky a ako tieto fungujú v zdravom aj chorom stave. Cieľom je poskytnúť podrobný obraz o ich molekulárnej architektúre a funkcii, ktoré budú slúžiť ako podklad na molekulárnej úrovni pre racionálny dizajn bioimunoterapeutík. Projekt je logickým pokračovaním našej spoločnej vedeckej iniciatívy. |
Štúdium inverzného vzťahu medzi karbonickými anhydrázami CA IX a CA IV a jeho významu pre nádorový fenotyp
Study of inverse relationship between carbonic anhydrases CA IX and CA IV and its significance for tumor phenotype
| Doba trvania: |
1.1.2024 - 31.12.2027 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Takáčová Martina PhD. |
| Anotácia: | Karbonické anhydrázy (CA) sú základnými zložkami fyziologických procesov spojených s acidobázickou rovnováhou a transportom iónov v zdravých aj nádorových tkanivách. Niektoré izoformy CA (napr. CA IV) sú v nádorových tkanivách znížené v porovnaní s ich zdravými náprotivkami, zatiaľ čo hladiny iných izoforiem, napr. CA IX, sú zvýšené v rôznych typoch nádorov primárne v dôsledku hypoxie. Kým CA IV je dôležitá pri regulácii pH a absorpcii bikarbonátu v obličkách a hrubom čreve, tak CA IX hrá kľúčovú úlohu pri adaptácii nádorových buniek na hypoxiu a acidózu a prostredníctvom ovplyvnenia migrácie, invázie a tvorby metastáz prispieva k progresii nádorov. Prostredníctvom in silico analýzy sme odhalili inverznú expresiu medzi CA IV a CA IX, ktorej regulácia a význam zostávajú nejasné. V tomto projekte sa zameriame na odhalenie molekulárnych mechanizmov zodpovedných za inverzný vzťah medzi CA IX a CA IV a objasnenie jeho významu pre nádorový fenotyp. Okrem toho budeme analyzovať klinický význam spomínanej zámeny. |
Štúdium možností a limitácií implementácie moderných genetických analýz v klinických diagnostických postupoch u pacientov bez jasnej a jednoznačnej klinickej diagnózy
Study of the possibilities and limitations of the implementation of modern genetic analyses in clinical diagnostic procedures in patients without a clear and unambiguous clinical diagnosis
| Doba trvania: |
1.1.2024 - 31.12.2027 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Zaťková Andrea PhD. |
| Anotácia: | Projekt je zameraný na pacientov so zriedkavými až individuálnymi geneticky podmieneným ochoreniami, u
ktorých doterajšie postupy neviedli k stanoveniu diagnózy. Hlavným vedeckým cieľom projektu je analyzovať a
charakterizovať potenciál prechodu od analýz exómu (WES), ktoré už sú súčasťou diagnostickej praxe, na
analýzu celého genómu (WGS), ktorá pokrýva aj nekódujúce časti genómu a dáva možnosť detailnejšie
analyzovať takmer všetky druhy genetickej variability. Pomocou WGS zanalyzujeme DNA pacientov s cieľom
odhaliť genetickú príčinu/y ich ochorenia. Na analýzu variantov a ich vyhodnocovanie použijeme hlavne
bioinformatické nástroje, ktoré boli vyvinuté na spolupracujúcom pracovisku. Očakávame odhalenie nových
variantov v už známych génoch, ako aj v nových kandidátnych génov zapojených do patofyziológie zriedkavých ochorení. Tieto nové zistenia možno rozvíjať v rámci budúcich projektov základného výskumu. Náš prístup tzv. personalizovanej medicíny tiež môže prispieť k voľbe adekvátnej terapie pre pacientov. |
Štúdium vplyvu črevného mikrobiómu na liečbu a prognózu pacientov s testikulárnymi nádormi z germinatívnych buniek.
Impact of the gut microbiome on the treatment and prognosis of patients with testicular germ cell tumors.
| Doba trvania: |
1.1.2024 - 31.12.2027 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
doc. RNDr. Čierniková Soňa PhD. |
| Anotácia: | Testikulárne nádory z germinatívnych buniek (GCT) sú najčastejším typom onkologického ochorenia u mladých mužov vo veku 20-40 rokov a zároveň predstavujú model kurabilnej malignity. Napriek excelentnej prognóze, dokonca aj pri metastatickom ochorení, dochádza u niektorých pacientov k recidíve a zomierajú v dôsledku progresie ochorenia. Pribúdajúce dáta naznačujú, že črevný mikrobióm má pleiotropný účinok na rôzne aspekty normálnych, ako aj patologických procesov v organizme, vrátane rozvoja rakoviny. Cieľom tejto štúdie je charakterizovať črevný mikrobióm v animálnom modeli myšacích xenograftov a u pacientov s GCT a korelovať mikrobiálne zloženie s charakteristikami pacienta/nádoru, výsledkami liečby a toxicitou po podávanej terapii. Získané poznatky by mohli byť dôležité pri plánovaní následných intervenčných štúdií, zameraných na moduláciu mikrobiómu s cieľom zlepšiť terapeutickú odpoveď a znížiť toxicitu súvisiacu s liečbou u pacientov s GCT. |
Terapeutická úloha selektívnej inhibície cholínesteráz v srdcovom zlyhávaní
Therapeutic role of selective ChE inhibition in heart failure
| Doba trvania: |
1.7.2023 - 30.6.2027 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Zahradníková, ml. Alexandra PhD. |
| Anotácia: | Srdcové zlyhávanie (SZ) je chronické progresívne ochorenie, ktoré predstavuje celosvetovo významnú záťaž pre zdravotnú starostlivosť. Napriek pokroku v manažmente SZ, ku ktorému došlo za posledných niekoľko desaťročí, zostáva mortalita pacientov so SZ vysoká. V poslednej dobe narastá množstvo dôkazov o tom, že znížená cholínergická signalizácia môže byť vhodným terapeutickým prístupom a sú navrhnuté viaceré veľké klinické štúdie na vyhodnotenie dlhodobých účinkov inhibítorov cholínesteráz (ChE) (ChEI) v rôznych štádiách SZ. Informácie o ChE v srdci sú však veľmi chabé. Naše predbežné výsledky potvrdzujú prítomnosť oboch známych ChE, acetylcholínesterázy (AChE) a butyrylcholínesterázy (BChE), v srdci, avšak s odlišnou lokalizáciou a rôznymi úlohami v regulácii srdcových funkcií. V navrhovanom projekte sa zameriame na vyhodnotenie úlohy AChE a BChE v etiopatogenéze SZ indukovaného v myši transverzálnou aortálnou konstrikciou. Použijeme dva modely: geneticky modifikované myši, v ktorých je inaktivovaná AChE alebo BChE a farmakologickú intervenciu so špecifickým ChEI, vrátane donepezilu (AChEI), isoOMPA (BChEI), rivastigmínu (systémový AChEI a BChEI) a pyridostigmínu (periférny AChEI a BChEI). Okrem toho máme v úmysle charakterizovať zdroj kardioprotektívneho acetylcholínu. Geneticky modifikovaný kmeň myší s prakticky žiadnou aktivitou AChE v kostrovom svale bude použitý na skúmanie novej hypotézy, ktorá navrhuje, že acetylcholín je po inhibícii/inaktivácii ChE schopný difundovať z kostrového svalu do vzdialenejších tkanív, vrátane srdca, kde pôsobí toxicky. Priestorovú transkriptomiku použijeme na rozlíšenie medzi neuronálnym a neneuronálnym srdcovým acetylcholínom, ako aj na sledovanie priestorových zmien v prestavbe srdca pri SZ a po liečbe. Výsledky projektu by mali poskytnúť dôležité informácie o protektívnych mechanizmoch cholínergického systému v etiopatogenéze SZ a terapeutickom využití ChEI. |
Testovanie efektívnosti výpočtov polygénového rizikového skóre z celogenómových sekvenačných dát a hodnotenie vzorov dedičnosti pri polygénových ochoreniach
Testing the effectiveness of polygenic risk score calculations from whole genome sequencing data and evaluation of hereditary patterns of polygenic diseases
| Doba trvania: |
1.1.2023 - 31.12.2025 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
doc. RNDr. Radvánszky Ján PhD. |
| Anotácia: | Hodnotenie genomického rizika pre komplexné ochorenia pomocou polygénových rizikových skóre (PRS) individuálnych pacientov predstavuje celosvetovo vysoko aktuálnu otázku v oblasti genomiky človeka. Projekt nadväzuje na naše pilotné štúdie, v ktorých sme sa snažili na našom pracovisku zaviesť a štandardizovať celogenómové sekvenačné analýzy (WGS) a využívanie PRS výpočtov pre rôzne komplexné ochorenia. V aktuálne predkladanom projekte plánujeme rozšíriť náš súbor WGS dát o ďalšie vzorky pacientov, ich rodinných príslušníkov, ako aj populačných kontrol. Za modelové ochorenie sme zvolili ulceróznu kolitídu. Plánom je dosiahnuť štatisticky významnejšie výsledky v otázkach, ktoré otvorili naše pilotné štúdie. Cieľom projektu pritom bude stanoviť efekt rôznych premenných na PRS výpočty, študovať možnosť rozdelenia ochoreniu špecifických genomických rizík na genomické riziká špecifické pre individuálne biologické dráhy, ako aj sledovanie vzorov dedičnosti rizikových aliel a PRS hodnôt v postihuntých rodinách. |
Translézna syntéza DNA ako možný mechanizmus rezistencie voči cisplatine pri testikulárnych nádoroch zo zárodočných buniek
Translational DNA synthesis as a possible mechanism of cisplatin resistance in testicular germ cell tumors
| Doba trvania: |
1.7.2024 - 31.12.2025 |
| Program: |
PostdokGrant |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Holíčková Andrea PhD. |
| Anotácia: | Testikulárne nádory zo zárodočných buniek (TGCTs) predstavujú jednu z najlepšie liečiteľných malignít
chemoterapiou na báze cisplatiny (CDDP). Predpokladá sa, že táto výnimočná liečiteľnosť je spôsobená zníženou
kapacitou opravy DNA v zárodočných bunkách a zriedkavo mutovaným génom TP53, ktorý zodpovedá za adekvátnu
signálnu transdukciu apoptózy. Približne 5 % pacientov s týmto ochorením však zomiera v dôsledku
chemorezistencie na konvenčnú liečbu a pre týchto pacientov v súčasnosti neexistuje terapeutická alternatíva. Keďže
TGCTs sú najčastejším malígnym ochorením postihujúcim mladých mužov, ich chemorezistencia predstavuje akútny
problém.
Je dokázané, že medzi primárne farmakologické ciele CDDP patrí DNA, kde indukuje viacero rôznych poškodení.
Existujú tiež predpoklady, že CDDP môže vyvolávať poškodenie DNA aj sekundárne, čo len rozširuje škálu typov
poškodení, ktoré môže spôsobiť. Zvýšená kapacita opravy DNA sa pokladá za jeden z hlavných mechanizmov
chemorezistencie nádorových buniek. Menej diskutovaná je však skutočnosť, že k rezistencii môže prispievať tiež
zvýšená tolerancia poškodenia DNA prostredníctvom transléznej syntézy DNA (TLS), pričom tento mechanizmus
doposiaľ v TGCTs preštudovaný nebol. Nedávna štúdia odhalila, že nádory pacientov s TGCTs rezistentných voči
chemoterapii na báze CDDP majú často amplifikáciu krátkeho ramienka chromozómu tri, v ktorej sa okrem iného
nachádza aj gén RAD18. Tento gén je kľúčovým regulátorom prepínania z normálnej replikácie DNA na TLS. Naše
predbežné dáta naznačujú, že bunkové línie TGCTs rezistentné voči CDDP majú v porovnaní s citlivými bunkovými
líniami zvýšenú expresiu génu RAD18, ako aj iných génov faktorov TLS. Zámerom predkladaného projektu je preto
preveriť, či inhibícia TLS dokáže senzibilizovať rezistentné bunkové línie TGCTs voči CDDP. Ak by sa nám to podarilo
potvrdiť, projekt by prispel k hlbšiemu porozumeniu mechanizmov chemorezistencie TGCTs a otvoril dvere skúmaniu
nových terapeutických stratégií pre rezistentných pacientov. |
Účasť hypoxiou indukovanej karboanhydrázy IX na interakcii nádorových buniek a krvných buniek počas metastatického šírenia
Involvement of hypoxia-induced carbonic anhydrase IX in tumor cells-blood cells interaction during metastatic dissemination
Účinky GLP-1 analógu na sclerosis multiplex
Effects of GLP-1 Analog on Multiple Sclerosis
| Doba trvania: |
1.7.2022 - 30.6.2026 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
doc. MUDr. Imrich Richard DrSc. |
| Anotácia: | Primárnym cieľom našej štúdie je vyhodnotenie účinkov liečby agonistom GLP-1 na poškodenie axónov a
neurodegeneráci u. Ako primárne premenné budú slúžiť anualizované zmeny objemov mozgu / šedej hmoty a
plazmatických hladín neurofilamentu L. Sekundárnym cieľom je preskúmať účinky liečby agonistami GLP -1 na inzulínovú rezistenciu a kognitívne funkcie pri SM. Inzulínová rezistencia sa bude hodnotiť pomocou indexov inzulínovej citlivosti na základe orálneho glukózo -
tolerančného testu a kognitívne funkcie sa budú testovať pomocou Symbol Digit Modalities (SDMT) a Stroopovho
testu. V štúdii sa tiež vykonajú ďalšie analýzy a funkčné testy vrátane neinvazívneho hodnotenia endotelovej
funkcie. V súčasnosti nie sú známe klinicky relevantné účinky GLP -1 analógov na progresiu SM. Napriek určitému pokroku vo vývoji nových spôsobov liečby SM v posledných rokoch zostáva problémom terapia a predchádzanie trvalému zdravotnému postihnutiu u pacientov so SM. Výsledky štúdie môžu poskytnúť základ pre potenciálnu terapiu analógmi GLP-1 na liečbu pacientov so SM s cieľom spomaliť proces neurodegenerácie a zabrániť alebo oddialiť rozvoj komorbidít spojených s inzulínovou rezistenciou (hlavne kardiovaskulárnymi ochoreniami a cukrovkou 2. typu). |
Účinky meďnatého komplexu LL-344B3 na rakovinové bunky pľúc
Effects of copper complex LL-344B3 on lung cancer cells
Účinky pravidelného cvičenia na bunkové a molekulárne procesy asociované so starnutím: multi-orgánový integratívny prístup.
Effects of regular exercise training on molecular, cellular and whole body processes associated with ageing: : Multi-organ integrative approach
Účinok patologických mutácií a posttranslačných modifikácií na funkcie mitochondriálnej procesujúcej peptidázy nevyhnutnej pre transport do mitochondrií
The effect of pathologic mutations and post-translational modifications on the functions of mitochondrial processing peptidase essential for transport to mitochondria
Účinok telesného cvičenia a výživy na črevný mikrobióm a kvalitu života vyliečených onkologických pacientov
The Effect of Physical exercise and Nutrition on Gut Microbiome and Quality of Life in childhood cancer survivors
Úloha bunkových lipidov v životnom cykle vírusu lymfocytovej choriomeningitídy
The role of cellular lipids in lymphocytic choriomeningitis virus life cycle
| Doba trvania: |
1.1.2023 - 31.12.2026 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Ing. Tomášková Jana PhD. |
| Anotácia: | Bunkové lipidy zohrávajú kľúčovú úlohu v každej fáze životného cyklu vírusu. Tieto interakcie siahajú od väzby vírusu na plazmatickú membránu hostiteľskej bunky až po uvoľnenie nových infekčných viriónov do extracelulárneho priestoru. Hoci modulácia metabolizmu lipidov patrí medzi všeobecné replikačné stratégie, vírusy používajú rôzne mechanizmy na využívanie týchto dôležitých bunkových dráh.
Cieľom navrhovaného projektu je preto objasniť tieto procesy počas infekcie vírusom lymfocytovej choriomeningitídy (LCMV), modelovým zástupcom čeľade Arenaviridae. Zameriame sa na zmeny v anabolických a katabolických dráhach lipidov vyvolané infekciou LCMV a ich úlohu v životnom cykle vírusu. Objavenie nových interakcií medzi vírusom a bunkovými lipidmi poskytne nielen neoceniteľné poznatky o molekulárnych mechanizmoch vírusovej patogenézy, ale tiež prispeje k identifikácii nových cieľov pre vývoj antivírusových liečiv.
|
Úloha GPR180 v regulácii funkcie beta buniek pankreasu a patogenéze diabetu
The role of GPR180 in regulation of pancreatic beta cell function and pathogenesis of diabetes
Úloha imunitného systému pri progresii NAFLD a identifikácia potenciálnych imunologických biomarkerov
The role of immune system in NAFLD progression and identification of potential immunological biomarkers
| Doba trvania: |
1.8.2024 - 30.6.2026 |
| Program: |
Plán obnovy EÚ |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Vince Kážmérová Zuzana PhD. |
| Anotácia: | 1. Excelentnosť
Nealkoholová tuková choroba pečene (NAFLD) predstavuje významný problém verejného zdravotníctva s narastajúcim počtom pacientov na celom svete (globálna prevalencia presahuje 30 %) (1). Patologické stavy sa líšia v jednotlivých štádiách NAFLD, od relatívne benígnej stukovatenej pečene (NAFL) až po agresívnejšiu formu ochorenia - steatohepatitídu (NASH), ktorá je charakterizovaná zápalom a narastajúcou fibrózou pečene. V neskorších štádiách dochádza k rozvoju cirhózy pečene s funkčným poškodením alebo rozvojom hepatocelulárneho karcinómu (HCC) (2).
Nedávne preklinické a klinické štúdie potvrdzujú kľúčovú úlohu imunitných buniek v progresii NAFLD. Tkanivové makrofágy, ako sú Kupfferove bunky (KCs) a od monocytov odvodené makrofágy, sú hlavné vrodené imunitné bunky zapojené do progresie ochorenia, a to od NAFL cez NASH až po HCC. Okrem toho viaceré imunologické štúdie preukázali, že ich špecifická polarizácia prispieva k progresii NAFLD (3). Zatiaľ čo vrodené imunitné bunky sú zodpovedné za iniciáciu poškodenia pečene, adaptívne imunitné bunky charakterizované zvýšenou translokáciou lymfocytov do pečene zohrávajú kľúčovú úlohu pri chronickom zápale vedúcom k poškodeniu pečene (4, 5). Tieto procesy spolu navzájom intenzívne interagujú a vytvárajú integrovanú imunitnú sieť zohrávajúcu kľúčovú úlohu v patofyziológii NAFLD (3), avšak ďalší výskum je stále potrebný.
Identifikácia kľúčových zápalových mediátorov a jednotlivých podtypov aktivovaných imunitných buniek by mohla významne prispieť k objaveniu prediktívnych biomarkerov progresie NAFLD smerom k NASH alebo cirhóze pečene.
Hlavným cieľom projektu je preto vyvinúť nový „in vitro“ bunkový systém (kokultúra hepatocytov a imunitných buniek), ktorý napodobní zjednodušenú verziu interakcií buniek v pečeni zapojených do progresie NAFLD a patogenézy NASH. Na hodnotenie a pochopenie procesov vrodenej a adaptívnej imunitnej odpovede bude vytvorená in vitro kultúra v prostredí simulujúcom podmienky nutričného preťaženia špecifického pre patogenézu NAFL a NASH. Súčasne monitorovanie a odhalenie špecifických podskupín aktivovaných imunitných buniek by mohlo viesť k identifikácii nových imunologických biomarkerov progresie NAFLD.
2. Dopad
Krátkodobý dopad FLIMB projektu
Model interakcie hepatálnych a imunitných buniek bude slúžiť ako nový „in vitro“ nástroj na výskum, ktorý poskytne nový pohľad na pochopenie kľúčových imunologických procesov zapojených do progresie NAFLD. Zároveň budú objasnené aj pokročilé znalosti o prepojeniach medzi progresiou NAFLD a zápalom.
Dlhodobý dopad FLIMB projektu
Identifikácia imunologických faktorov zodpovedných za iniciáciu poškodenia pečene alebo zhoršenie chronického zápalu by mohla byť v budúcnosti využitá ako potenciálne imunologické biomarkery využívané v diagnostike tohto ochorenia.
Diagnostika NAFLD predstavuje významný problém pri manažmente pacientov. Nedostatok špecifických, citlivých a neinvazívnych diagnostických nástrojov komplikuje určenie závažnosti ochorenia, stratifikáciu pacientov na základe progresie ochorenia a bráni včasnej intervencii. Identifikácia nových biomarkerov môže pomôcť lekárom rozlíšiť jednotlivé štádiá ochorenia a identifikovať pacientov s rizikom progresie NAFLD od tých so samotnou steatózou.
Niektoré z identifikovaných imunologických narkerov by mohli byť v budúcnosti využité na vývoj liekov v kontexte prevencie alebo liečbe NAFLD. FLIMB bude úzko prepojený so schváleným a financovaným výskumným projektom BMC (SRDA-22-0310, vedený L. Balazovou), ktorý je zameraný na identifikáciu biomarkerov NAFLD v extracelulárnych vezikulách (EV).
3. Implementácia
Projekt FLIMB zahŕňa tri hlavné pracovné balíky (WP), ktoré sú logicky a chronologicky prepojené a pozostávajú z niekoľkých cieľov:
WP 1: Vývoj nového „in vitro“ modelu interakcie hepatálnych a imunitných buniek
• Cieľ 1: Zabehnutie kultivácie hepatocytov a stelatových buniek (HSC)
• Cieľ 2: Zabehnutie kultivácie Kupfferových buniek (KCs) a monocyto-odvodzovaných makrofágov (MoMs)
• Cieľ 3: Optimalizácia kokultivačných techník potrebných na vývoj modelu interakcie buniek
WP 2: Hodnotenie imunitnej odpovede v modeli hepatálnych a imunitných buniek pri nutričnom preťažení
• Cieľ 1: Simulácia podmienok nutričného preťaženia
• Cieľ 2: Imunofenotypizácia KCs a MoMs a hodnotenie vrodenej imunitnej odpovede
• Cieľ 3: Hodnotenie adaptívnej imunitnej odpovede (kokultivácia s PBMCs) v bunkovom modeli
WP 3: Identifikácia nových imunologických biomarkerov progresie NAFLD
• Cieľ 1: Izolácia PBMCs zo vzoriek krvi zdravých a NAFLD pacientov
• Cieľ 2: Imunofenotypizácia a porovnanie PBMCs medzi zdravými a NAFLD pacientmi
• Cieľ 3: Identifikácia biomarkerov v obsahu pečeňových extracelulárnych vezikúl (EV)
Diseminácia výsledkov:
• Aktívna účasť na kongresoch
• Publikácie (open access, recenzované)
• Ročné správy
Inštitúcia, kde bude projekt realizovaný, má potrebné technické, materiálne a personálne vybavenie (napr. BD FACS Aria II SORP UV, laserový konfokálny fluorescenčný systém TCS SP2 AOBS). Projekt sa uskutoční v laboratóriu Dr. Balazovej (BMC), ktorá už pred tým preukázala silné vedecké zázemie v oblasti výskumu energetického metabolizmu a metabolických ochorení, ako aj v spolupráci s klinikmi (Dr. Med. Daniela Staníková, PhD., Oddelenie pediatrie, Lekárska fakulta Univerzity Komenského a Národný ústav detských chorôb, Bratislava, Slovensko), ktorí nám poskytnú vzorky krvi od pacientov s NAFLD. Súčasne ja ako hlavný riešiteľ projektu mám silné vedecké zázemie v oblasti imunológie, zápalu, vývoja bunkových kultivačných systémov, ako aj pokročilých laboratórnych techník potrebných na monitorovanie imunitnej odpovede.
Referencie:
1. Riazi K, Azhari H, Charette JH, Underwood FE, King JA, Afshar EE, et al. The prevalence and incidence of NAFLD worldwide: a systematic review and meta-analysis. Lancet Gastroenterol Hepatol (2022) 7(9):851–61. doi: 10.1016/S2468-1253(22)00165-0.
2. Friedman SL, Neuschwander-Tetri BA, Rinella M, Sanyal AJ. Mechanisms of nafld development and therapeutic strategies. Nat Med (2018) 24(7):908–22. doi: 10.1038/s41591-018-0104-9.
3. Peiseler M, Schwabe R, Hampe J, Kubes P, Heikenwalder M, Tacke F. Immune mechanisms linking metabolic injury to inflammation and fibrosis in fatty liver disease - novel insights into cellular communication circuits. J Hepatol (2022) 77(4):1136–60. doi: 10.1016/j.jhep.2022.06.012.
4. Marra F, Tacke F. Roles for chemokines in liver disease. Gastroenterology (2014) 147(3):577–94.e1. doi: 10.1053/j.gastro.2014.06.043.
5. Shetty S, Lalor PF, Adams DH. Liver sinusoidal endothelial cells {{/amp]]mdash; gatekeepers of hepatic immunity. Nat Rev Gastroenterol Hepatol (2018) 15(9):555–67. doi: 10.1038/s41575-018-0020-y.
|
Úloha intrakolonálneho sírovodíka a butyrátu v rozvoji hypertenzie u obéznych potkanov
The role of intracolonic hydrogen sulfide and butyrate in the development of hypertension in obese rats
Úloha metabolizmu kovov v replikácii a prežívaní Coxiella burnetii
The role of metal metabolism in the replication and survival of Coxiella burnetii
| Doba trvania: |
1.1.2024 - 31.12.2027 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Ing. Škultéty Ľudovít DrSc. |
| Anotácia: | Coxiella burnetii je intracelulárny bakteriálny patogén spôsobujúci klinické infekcie ľudí a zvierat, ktoré môžu
významne ovplyvniť verejné zdravie. Po vstupe do hostiteľskej bunky sa C. burnetii replikuje vo vakuolách
podobným fagolyzozómom. Počas infekcie C. burnetii vykazuje tropizmus pre rôzne tkanivá, čo naznačuje, že
fyziológia patogénu súvisí s metabolizmom kovov. Nedávno sa ale preukázalo, že železo môže mať obmedzenú
úlohu v regulácii virulencie C. burnetii. Nie je však známe, ako získava molekulárne železo a aký oxidačný stav
železa má baktéria k dispozícii. Primárnym cieľom tohto projektu je preto poskytnúť nový pohľad na reguláciu
metabolizmu kovov, najmä železa, zinku, mangánu, medi a iných enzymatických a metabolických kofaktorov pri
infekcii. Projekt bude zároveň sledovať odpoveď makrofágov/neutrofilov na infekciu a odhalí malé molekuly,
ktoré bude možné použiť na vývoj nových diagnostík alebo terapeutík. |
Úloha mikrobiómu u hematoonkologických pacientov podstupujúcich vysokodávkovanú chemoterapiu s transplantáciou krvotvorných kmeňových buniek.
The emerging role of the microbiome in hematologic cancer patients receiving high-dose chemotherapy with hematopoietic stem cell transplantation.
| Doba trvania: |
1.1.2022 - 31.12.2025 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
doc. RNDr. Čierniková Soňa PhD. |
| Anotácia: | V súčasnosti narastá záujem o štúdium mikrobiómu v protinádorovej terapii. Transplantácia krvotvorných kmeňových buniek (TKB) sa vďaka svojmu terapeutickému potenciálu zaradila medzi rutinne využívané liečebné modality hematoonkologických malignít. Na eradikáciu nádorových buniek sa pacientom pred transplantáciou podáva prípravný režim, ktorého súčasťou je vysokodávkovaná chemoterapia alebo rádioterapia. Obe liečebné modality poškodzujú slizničnú bariéru a devastujúcim spôsobom narúšajú črevnú biodiverzitu. Cieľom predkladaného projektu je snaha o objasnenie obojsmerného vplyvu črevného mikrobiómu a faktorov, ktoré ho ovplyvňujú na klinické parametre pacientov podstupujúcich vysokodávkovanú chemoterapiu s TKB, predovšetkým pacientov s autológnou TKB. Korelácia medzi zmenami v zložení mikrobiálnej komunity, metabolickými a imunologickými dráhami a klinickým stavom môže viesť k odhaleniu mikrobiálnych biomarkerov na identifikáciu pacientov s rizikom výraznej toxicity liečby a posttransplantačných komplikácií. |
Úloha poškodenia DNA a opravy v odpovedi nádorov urogenitálneho traktu na chemoterapiu na báze cisplatiny
Role of DNA damage and repair in response of urogenital cancers to cisplatin-based chemotherapy
| Doba trvania: |
1.1.2023 - 31.12.2026 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Chovanec Miroslav PhD. |
| Anotácia: | Testikulárne nádory zo zárodočných buniek (TGCT) postihujú najčastejšie mužov v tretej dekáde života, zatiaľ čo malignity močového mechúra (BC) dominantne mužov v siedmej dekáde života. Základom liečby oboch malignít je cisplatina (CDDP), pričom vrodená alebo získaná rezistencia na toto liečivo zhoršujú celkovú prognózu TGCT a BC pacientov. Cieľom predkladaného grantu je skúmať mechanizmy odpovede oboch malignít na CDDP a hľadať prípadné korelácie medzi poškodením a opravou DNA a prežitím TGCT a BC pacientov, pretože sa domnievame sa, že pacienti nedostatočne odpovedajúci na liečbu prostredníctvom CDDP majú aberantné hladiny endogénneho a CDDP indukovaného poškodenia DNA, ako aj mechanizmov opravy DNA. |
Úloha proteínov DNA opravy v génovej represii
The role of DNA repair proteins in gene repression
Úloha zlúčenín síry v rozvoji metabolických ochorení
The role of sulfur species in the development of metabolic diseases
Validácia FTA kariet uchovávajúcich nukleové kyseliny biosafety level 3 patogénov (West Nile virus) v experimentálnych podmienkach
Validation of FTA cards containing nucleic acids of biosafety level 3 pathogens (West Nile virus) under experimental conditions
Viroidy - unikátne subvírusové patogény rastlín, ich diverzita a interakcie s hostiteľom
Viroids - unique subviral plant pathogens, their diversity and host interactions
| Doba trvania: |
1.7.2023 - 30.6.2027 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
doc. Ing. Glasa Miroslav DrSc. |
| Anotácia: | Viroidy sú krátke jednovláknové cirkulárne RNA infikujúce rastliny, ktoré na rozdiel od vírusov nekódujú žiadne vlastné proteíny. Napriek svojej štruktúrnej jednoduchosti sú viroidy schopné sa v rastlinných hostiteľoch replikovať, etablovať a vyvolávať veľmi závažné symptómy vedúce, v prípade poľnohospodárskych plodín, k významným ekonomickým stratám. Poznatky o druhovom zastúpení viroidov a ich diverzite na Slovensku chýbajú, pričom v ostatných rokoch sme vo svetovom meradle konfrontovaní nárastom zmienok o nových a novo sa objavujúcich viroidových druhoch a ich divergentných variantov. Cieľom projektu je priniesť aktuálny pohľad na výskyt viroidových infekcií na našom území, identifikáciu pôvodcov a ich molekulárnu epidemiológiu. Metagenomická analýza virómu rastlín využitím masívneho paralelného a štandardného sekvenovania umožní charakterizáciu genómov vírusov a viroidov, možnú identifikáciu zmiešaných infekcií a hĺbku polymorfizmu vnútroizolátovej diverzity. Získané poznatky sa využijú na vývoj a optimalizáciu nástrojov umožňujúcich špecifickú detekciu viroidov v následných epidemiologických štúdiách (hostiteľský okruh, dynamika populácií v rôznych agroekologických kontextoch ...). Pomocou pripravených infekčných pospiviroidových klonov a riadenej kontrolovanej infekcie experimentálnych rastlín budeme sledovať etiológiu ochorenia, molekulárne faktory hostiteľskej špecificity a úlohu kľúčových mutácií v patogenéze viroidov. Pochopenie faktorov vplývajúcich na diverzifikáciu a evolúciu virodov umožní komplexný pohľad na ich patosystém a v širšom meradle prispeje k prijímaniu efektívnych preventívnych fytosanitárnych opatrení. Modifikovaným viroidovým vektorom zhodnotíme aj potenciál využitia viroidom indukovaného utlmovania génovej expresie (VdIGS) vo funkčnej genomike rastlín. |
Vplyv aripiprazolu a obohateného prostredia na morfologicko-funkčné zmeny v hipokampe a správanie v animálnom modeli posttraumatickej stresovej poruchy
Influence of aripiprazole and enriched environment on morphological-functional changes in the hippocampus and behavior in animal model of the post-traumatic stress disorder
| Doba trvania: |
1.1.2023 - 31.12.2025 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Osacká Jana PhD. |
| Anotácia: | Posttraumatická stresová porucha (PTSD) sa môže vyvinúť v dôsledku vystavenia organizmu silnej traumatizujúcej udalosti (stresu). Jej vznik súvisí s narušením morfologicko-funkčných charakteristík hipokampu a hipokampálnej neurogenézy. PTSD je spojená so zmenšeným objemom hipokampu a zníženou
neurogenézou, pričom príčiny týchto zmien nie sú úplne objasnené. Terapia PTSD zahŕňa psychoterapiu a medikamentóznu liečbu. Dostupné údaje naznačujú, že u jedincov s PTSD môžu mať pozitívny vplyv na „normalizáciu“ hipokampu a zvýšenie neurogenézy aj antipsychotiká, obohatené prostredie, prípadne ich
kombinácia. Cieľom predloženého projektu je určiť, či aripiprazol a obohatené prostredie v animálnom modeli
PTSD pozitívne ovplynia narušenú funkciu hipokampu a neurogenézu. Funkčnosť hipokampu posúdime behaviorálnymi testami, úroveň neurogenézy a aktivitu predmetných oblastí mozgu sledovaním zmien špecifických markerov. |
Vplyv blokovania angiotenzínových receptorov typu 1 na vylepšenie neurogénnej dysfunkcie močového mechúra po závažnej traume miechy.
Effect of type 1 angiotensin receptor blockade on the amelioration of neurogenic bladder dysfunction after severe spinal cord trauma.
| Doba trvania: |
1.7.2024 - 31.12.2025 |
| Program: |
PostdokGrant |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Snopková Jana PhD. |
| Anotácia: | Výskum poškodenia miechy smeruje predovšetkým k vývoju klinicky akceptovanej terapie zameranej na vylepšenie motorických schopností, avšak strata hybnosti je sprevádzaná aj inými autonómnymi systémovými poruchami. Medzi najzávažnejšie komplikácie, ktoré často vedú k opakovaným hospitalizáciám pacientov a majú veľký negatívny dopad na kvalitu ich života, patrí neurogénna dysfunkcia močového mechúra. Jedným z potenciálnych adeptov farmakologickej intervencie v tejto oblasti je renín angiotenzínový systém, ktorého regulácia na úrovni angiotenzínových receptorov môže prispieť k výraznej redukcii týchto ťažkostí. V predloženom projekte sa, preto zameriavame na komplexnú analýzu mechanizmov ovplyvnených blokovaním angiotenzínových receptorov typu 1, ktoré by mohli prispieť k vylepšeniu mikcie po traume miechy, a to ako na úrovni aferentnej inervácie močového mechúra, tak aj na úrovni kontroly mikcie z vyšších nervových centier. |
Vplyv NG2 pozitívnej populácie buniek na rozsah poranenia a funkčnej obnovy po úraze miechy
The effect of NG2 positive cell population on extent of damage and functional recovery following spinalal cord injury
| Doba trvania: |
1.1.2024 - 31.12.2026 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
MUDr. Kuchárová Karolína PhD. |
| Anotácia: | Cieľom predloženého projektu je ovplyvniť molekulárne a bunkové mechanizmy, ktoré produkciou NG2 proteoglykánu (NG2) bránia funkčnej obnove miechy po jej poranení. Úraz stimuluje produkciu NG2 v progenitoroch oligodendroglie, v pericytoch, fibroblastoch a zápalových bunkách. Kedy, kde a ktoré NG2+ typy buniek reagujú na poranenie miechy a jej farmakologické ovplyvňovanie zatiaľ nie je známe. Za účelom objasnenia úlohy NG2+ buniek po poranení miechy, sa v experimentoch porovnajú dva terapeutické prístupy a to 1) neuroregeneračne úspešná (avšak invazívna, intratekálna) liečba s chondroitinázou ABC a 2) orálna aplikácia antifibrotika. Odpoveď týchto funkčne rôznorodých typov NG2+ buniek na liečbu bude hodnotená bunkovo-špecifickými a funkčnými technikami. Predpokladáme, že projekt odkryje typy NG2+ buniek zúčastňujúcich sa na tvorbe jazvy, a naznačí, či môže menej invazívne a viac selektívne ovplyvnenie NG2+ fibroblastov ochrániť neuróny a zlepšiť funkčnú obnovu tkaniva po traumatickom poranení miechy. |
Vplyv stimulácie AT2 receptorov na revaskularizáciu vážne poranenej miechy
The effect of the AT2 receptor stimulation on revascularization of severe injured spinal cord
Vplyv výživových doplnkov na oxidačný stres vo folikulárnej tekutine u neplodných žien
Effect of Dietary Supplements on Follicular Fluid in Female Infertility: Mitigating Oxidative Stress
| Doba trvania: |
1.1.2024 - 31.12.2027 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Kozics Katarína PhD. |
| Anotácia: | Neplodnosť, inak nazvaná aj sterilita, sa stáva čoraz väčším problémom dnešnej spoločnosti. Vyskytuje sa tak u
mužov, ako aj u žien. Jednou z príčin neplodnosti je aj oxidačný stres. Vplyv oxidačného stresu u neplodných
mužov je potvrdeným rizikovým faktorom, ktorý je čiastočne eliminovaný suplementáciou antioxidantami. U žien
zatiaľ takáto intervencia neexistuje. V tomto projekte sa chceme zamerať na oxidačný stres, ktorý je jeden z
možných faktorov ovplyvňujúcich úspešnosť asistovanej reprodukcie (ART) u žien. Cieľom predkladaného
projektu je stanovenie vplyvu antioxidačného účinku výživových doplnkov na oxidačný stres vo folikulárnej
tekutine u neplodných žien. Okrem toho sa projekt zameriava na identifikovanie potenciálnych biomarkerov vo
folikulárnej tekutine, ktoré majú súvis s oxidačným stresom a tým pádom aj na úspešnosť ART. |
Vrodené antivírusové obranné reakcie vybraných buniek ľudskej kože voči vírusu kliešťovej encefalitídy a ich modulácia bioaktívnymi látkami v slinách kliešťov.
Innate antiviral defense responses of selected human skin cells to tick-borne encephalitis virus and their modulation by bioactive substances in tick saliva
| Doba trvania: |
1.1.2022 - 31.12.2025 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Štibrániová Iveta PhD. |
| Anotácia: | Kliešte a nimi prenášané vírusy (tick-borne viruses, TBVs) sú mimoriadnym medicínskym problémom. Spolu s hostiteľom tvoria interaktívny trojuholník, v ktorom je koža hostiteľa miestom ich prvého kontaktu. Napriek efektívnej bariérovej funkcii je koža stále hlavnou bránou pre vstup patogénov prenášaných kliešťami (vrátane vírusov), ktorá im umožňuje rozsiahle množenie a šírenie do ďalších orgánov. Prenos vírusov uhryznutím kliešťom nie je mechanickým procesom, ale je podporovaný slinami kliešťa. Kožné bunky, vrátane keratinocytov, sú schopné detegovať a brániť sa proti vírusom aj vďaka mechanizmom vrodenej antivírusovej ochrany. Definovanie prostredia na rozhraní kliešť-hostiteľ, ktoré je pre TBVs nepriaznivé, by mohlo otvoriť možnosť vytvorenia novej univerzálnej vakcíny proti TBVs |
Vyhľadávanie nových génových variantov syndrómových porúch sluchu pomocou celoexómového sekvenovania
Identification of novel genetic variants in syndromic hearing loss by whole exome sequencing
| Doba trvania: |
1.7.2021 - 30.6.2025 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Gašperíková Daniela DrSc. |
| Anotácia: | Porucha sluchu je najčastejšou a geneticky najheterogénnejšou poruchou zmyslových orgánov u človeka. Asi v 30 % dedičné poruchy sluchu nie sú izolované, ale spájajú sa s malformáciami a funkčnými poruchami ďalších orgánov. Takýchto syndrómov je známych vyše 400, mnohé majú klinicky závažný až letálny dopad na postihnutého jedinca. Cieľom projektu je vyhľadávanie pacientov a identifikácia nových a zriedkavých genetických príčin syndrómových foriem porúch sluchu metódami sekvenovania novej generácie (celoexómového a celogenómové sekvenovanie). Z našej DNA banky senzorineurálnej hluchoty a pokračujúcim klinickým a terénnym náborom pacientov vyselektujeme probandov s podozrením na syndrómovú poruchu sluchu. U týchto pacientov a v ich rodinách budeme prioritne analyzovať všetky kódujúce úseky ľudského genómu (exóm) a výstupy podrobíme bioinformatickej analýze. Identifikované varianty budeme kategorizovať podľa platných medzinárodných odporúčaní. Kosegregačnou analýzou overíme kauzálny vzťah kandidátnych variantov k sledovanej poruche. Pri nových génových variantoch a variantoch s nejasným významom vykonáme zodpovedajúce funkčné štúdie na potvrdenie ich patogenity a objasnenie základných molekulárnych mechanizmov, ktoré vedú k poruche sluchu a
ďalším klinickým prejavom. Pre nové a vzácne génové varianty podrobne zdokumentujeme klinický fenotyp a
zavedieme vhodnú metódu cielenej DNA diagnostiky. Výsledky projektu umožnia včasný záchyt syndrómových
porúch sluchu ešte pred rozvojom typickej symptomatológie, odhalia genetické pozadie pri atypickom fenotype a pomôžu identifikovať nové genetické príčiny týchto zriedkavých dedičných ochorení. Projekt tak prinesie nové, vysoko relevantné teoretické poznatky o etiopatogenéze syndrómových foriem porúch sluchu, s priamym a bezprostredným využitím v klinickej praxi.
|
Výskum klinických a genetických aspektov ketotických hypoglykémií u detí
Research of clinical and genetic aspects of ketotic hypoglycemia in children
Výskum nových molekulárnych regulačných mechanizmov vybraných biologicky aktívnych 4-pyranónov vo vzťahu k ich perspektívnej využiteľnosti v humánnej onkológii
Investigation of new molecular regulatory mechanisms of selected biologically active 4H-pyran-4-ones in relation to their prospective applicability in human oncology
| Doba trvania: |
1.1.2024 - 31.12.2026 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Macejová Dana PhD. |
| Anotácia: | Zdrojom biologicky aktívnych látok ako bazálnych zložiek farmaceutických prípravkov sú buď prírodné suroviny minerálneho, rastlinného alebo živočíšneho pôvodu alebo syntetické zlúčeniny. Existuje i ďalší zdroj, ktorý je kombináciou predchádzajúcich, keď látka prírodného charakteru slúži ako základná surovina na prípravu širokého spektra nových syntetických zlúčenín. 4-pyranóny sú z chemického hľadiska heterocyklické zlúčeniny obsahujúce kyslík. Ľahko sa degradujú na netoxické produkty, schopné zaradiť sa do kolobehu biogénnych prvkov v prírode. Chemická štruktúra 4-pyranónov má niekoľko reakčných centier, ktoré umožňujú prípravu veľkého počtu rôznorodých biologicky aktívnych zlúčenín. Medzi dôležitých predstaviteľov 4-pyranónov patrí 5-hydroxy-2-hydroxymetyl-4-pyranón. Cieľom predkladaného projektu je štúdium úlohy syntetizovaných nových derivátov bazálnej zlúčeniny 5-hydroxy-2-hydroxymetyl-4-pyranónu v procesoch vedúcich k indukcii apoptózy a inhibície proliferácie a migrácie invazívnych nádorových buniek. |
Výskum proteínových interakcií pri neurologických ochoreniach spojených s ATAD3A
The study of protein-protein interactions in ATAD3A-related neurological disorders
| Doba trvania: |
1.7.2024 - 31.12.2025 |
| Program: |
PostdokGrant |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Hromníková Dominika PhD. |
| Anotácia: | Ľudský ATAD3A (the ATPase family AAA domain-containing protein 3) je mitochondriálny transmembránový proteín, ktorý sa na organelovej úrovni vo zvýšenej miere nachádza v miestach kontaktu s endoplazmatickým retikulom . Tieto miesta sú známe ako MAMs, membrány spojené s mitochondriami. Ide o multifunkčné platformy, ktoré v bunkách zabezpečujú homeostázu, od syntézy cholesterolu, cez prenosu Ca2 + iónov až po indukciu autofágie a reguláciu tvorby metastáz.
Mutácie v ATAD3A géne sú spájané so širokým spektrom klinických prejavov, od perinatálne letálnych foriem až po menej závažné neurodegeneratívne ochorenia, a to v závislosti od typu mutácie. Na bunkách od pacientov (fibroblastoch) so stredne ťažkou formou identifikovaných v našom laboratóriu budeme študovať, ako u nich nájdené mutácie ovplyvňujú funkciu proteínu ATAD3A. Pokúsime sa zistiť, ako mutácie v tomto géne ovplyvňujú interakciu medzi ATAD3A a jeho partnermi. Na základe lokalizácie mutácií v ATAD3A sa zameriame na partnerov nachádzajúcich sa v matrixe mitochondrií (TFAM), v mitochondriálnej membráne (MFN2, AMBRA1, VDAC1) a v endoplazmatickom retikulu (PERK, σ1R ). Pochopenie kľúčovej úlohy ATAD3A pri regulácii mechanizmov súvisiacich s mitochondriami, pochopenie ako mutovaný gén ATAD3A ovplyvňuje homeostázu bunky cez MAMy a jej dôsledky na rôzne choroby, z ATAD3A robia sľubnú oblasť výskumu mitochondriálnych a závažných metabolických ochorení, a tým aj terapeutický cieľ.
|
Využitie CAM modelu na štúdium interakcií nádorového mikroprostredia
Utilisation of a CAM model to study tumour microenvironment interactions
| Doba trvania: |
1.7.2024 - 30.6.2025 |
| Program: |
Iné projekty |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Čumová Andrea PhD. |
| Anotácia: | Vo výskume rakoviny prsníka boli donedávna používané hlavne 2D nádorové bunkové línie. V súčasnosti ich nahrádzajú primokultúry vo forme organoidov, 3D štruktúr, ktoré vernejšie reprezentujú tkanivo na molekulárnej, histologickej a klinickej úrovni. V tomto projekte sa zameriam na interakcie medzi organoidmi a bunkami nádorového mikroprostredia – mezenchýmovými stromálnymi bunkami (MSCs) izolovanými z tukového tkaniva. Originálnosť projektu spočíva v použití netradičného experimentálneho modelu chorioalantoickej membrány (CAM) embrya prepelice japonskej, ktorá tvorí primárny respiračný a exkrečný orgán embrya. V porovnaní s cicavčími modelmi CAM model ponúka etické aj technické výhody, ako je ľahšia implantácia a pozorovanie nádorov a metastáz v porovnaní s cicavčími modelmi. Dôležité sú aj nižšie finančné náklady experimentov a kratší čas ich realizácie. Model CAM simuluje klinické príznaky rastu karcinómov, progresiu a tvorbu metastáz, čo by mohlo pomôcť objasniť biologické mechanizmy týchto procesov. |
Využitie nanomedicíny v boji proti rakovine pankreasu prostredníctvom zacielenia nádorovo- asociovanej karbonickej anhydrázy IX
Nanomedical approach to fight pancreatic cancer via targeting tumor-associated carbonic anhydrase IX
Využitie prírodných rastlinných olejov a extraktov pre potravinové obaly
Application of natural plants oils and extracts for foodpackaging
| Doba trvania: |
1.7.2024 - 30.6.2027 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Kozics Katarína PhD. |
| Anotácia: | Už dlhé roky sa veľká pozornosť venuje obalovým materiálom. Obal je vitálnou zložkou potravinového produktu,
ovocia alebo zeleniny, nakoľko má za cieľ chrániť samotný produkt od vonkajších vplyvov pri transporte či
skladovaní, má zabezpečiť čo najdlhšiu čerstvosť potraviny a zároveň slúži na prilákanie zákazníka. Vlastnosti
obalov sa neustále zdokonaľujú a smerujú k takzvaným aktívnym obalom. Najnovšie obaly opakovane
uzatvárateľné, udržateľné, ekologické, prispôsobené na mieru a vyrobené z rôznych materiálov (PET, PP, PS,
papieroviny, MaterBi PLA) spĺňajú technické požiadavky. Našim cieľom je však vylepšiť biotechnologické
parametre tak, aby boli inhibované devastačné/hnilobné procesy ovocia a zeleniny. Nosnou zložkou vyvíjaného
obalového materiálu bude kompostovateľné a biodegradovateľné polyméry PLA/PHB. Bioaktívnu zložku
predstavujú rastlinné oleje, esenciálne oleje, rastlinné extrakty získané z odpadového priemyslu zo spracovania
ovocia alebo z rastlín. Na prípravu obalového materiálu sa využije technológia elektrostatického zvlákňovania.
Pripravený materiál je nanovlákenná membrána, ktorá zabezpečí dostatočnú priestupnosť plynov a pár. Aplikáciou
bioaktívnych zložiek s antimikrobiálnymi vlastnosťami do nosnej biologicky odbúrateľnej polymérnej matrice
očakávame predlženú životnosť potraviny a jej bezpečnosť pre spotrebiteľa. |
Vývoj nanosystémov na báze albumínu a dendriméru proti vírusu kliešťovej encefalitídy
Development of albumin and dendrimer-based nanosystems against tick-borne encephalitis virus
| Doba trvania: |
1.9.2024 - 30.6.2028 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Koči Juraj PhD. |
| Anotácia: | Kliešťová encefalitída je klinicky významné arbovírusové ochorenie s potenciálne agresívnymi neurologickými
následkami. Napriek dostupnému a účinnému očkovaniu sa počet prípadov TBE u ľudí za posledné tri desaťročia
zvýšil. Až v 30 % symptomatických prípadov môže infekcia TBEV prejsť do chronickej a perzistujúcej encefalitídy.
Žiaľ, pre chronických pacientov s oslabujúcou formou ochorenia nie je dostupná žiadna liečba proti TBEV. Jednou
z najsľubnejších cieľových molekúl pre vývoj terapeutík proti TBEV je doména III vírusového obalového proteínu E.
Doména III je exponovaná výlučne na povrchu viriónu a podieľa sa na prichytení vírusu a vstupe do bunky.
Nanoprotilátky ťavy (Nb) a malé blokujúce peptidy (bP) zamerané na DIII ponúkajú elegantné nástroje na
blokovanie vstupu vírusu vďaka svojej veľkosti a nízkym výrobným nákladom. Nb a bP však neprechádzajú
hematoencefalickou bariérou (BBB), vysoko selektívnou bariérou, ktorá bráni bežným terapeutikám prechádzať z
krvi do mozgu. Túto vlastnosť by bolo možné zlepšiť ich konjugáciou s biokompatibilnými nanonosičmi a BBB-
homing peptidom (napr. angiopep-2). Zámerom projektu je vytvoriť nanosystémy založené na dendriméri PAMAM
a ľudskom sérovom albumíne, ktoré budú značené navádzacím peptidom ako aj Nb alebo bP, ktoré blokujú TBEV.
Cieľom projektu je aj hodnotenie stability, bezpečnosti a biodistribúcie nanosystémov in vitro a in vivo. Kvôli
nedostatku reportérových TBEV in vivo plánujeme vytvoriť reportérový system, ktorý by uľahčil monitoring in vivo
schopnosti nanosystému prechádzať cez BBB a neutralizovať vírus v CNS. Veríme, že nanosystémy vyvinuté a
dôkladne vyhodnotené v tomto projekte by mohli byť využité v klinickom testovaní anti-TBEV terapeutík. |
Vývoj unikátneho TiMg kompozitného zubného implantátu
Development of unique TiMg composite dental implant
| Doba trvania: |
1.7.2021 - 30.6.2025 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Takáčová Martina PhD. |
| Anotácia: | Vďaka dobrej dostupnosti a bezproblémovej prevádzke na dlhé obdobia bez nutnosti dodatočného zásahu dentistu sa zubné implantáty (DI) stávajú vyhľadávaným riešením. Titán (Ti) a zliatiny Ti sú historicky najbežnejšie používanými materiálmi na výrobu DI. Aj keď sa DI z Ti a Ti zliatin používajú s vysokou mierou úspešnosti, stále ostávajú nedostatočne vyriešené ich dva hlavné nedostatky: i) tzv. „stress-shielding“ efekt t.j. mechanická nekompatibilita a ii) ich nedostatočná povrchová bioaktivita. To vedie ku potrebe hľadania nových riešení, prístupov a koncepcií materiálov, a následne ku pokroku a väčšej konkurencii v danej oblasti.
Hlavným cieľom navrhovaného projektu je vývoj inovatívneho biomedicínskeho DI vyrobeného z jedinečného čiastočne biodegradovateľného kompozitného materiálu na báze Ti - horčík (Mg). Nový DI minimalizuje hlavné nevýhody súčasných DI, pričom si však zachováva mechanické vlastnosti a únavovú odolnosť súčasných DI na báze Ti. Výhodná kombinácia mechanických a biologických vlastností nového DI spočíva v jeho špeciálnom dizajne, ktorý využíva výhody Ti17Mg, materiálu, z ktorého bude DI vyrobený. Ti17Mg je partnermi projektu vyvinutý experimentálny materiál vyrobený práškovou metalurgiou, ktorý selektívne využíva výhody oboch biokovov. V rámci projektu bude navrhnutý a optimalizovaný nový DI, tak aby využíval potenciál a špecifické
vlastnosti Ti17Mg. Funkčnosť DI sa bude systematicky a komplexne hodnotiť v prostredí, ktoré simuluje reálne podmienky v ľudskom tele a to vrátane mechanických, únavových a koróznych testov, a biologických skúšok in vitro a in vivo s použitím bunkových kultúr, malých a veľkých zvieracích modelov. Všetky testy sa uskutočnia v súlade s príslušnými ISO špecifikáciami.
Očakáva sa, že na konci projektu bude k dispozícii nový inovatívny DI s vysokou pridanou hodnotou pripravený na testovanie v ľudskom tele. Očakáva sa, že na konci projektu bude dosiahnutý TRL6. |
Význam dopamín produkujúcich neurónov pre neuromotorický vývin a sociálne interakcie
Significance of dopaminergic neurons for neuromotor development and social interactions
Záruka bezpečnosti krvi a krvných derivátov vo vzťahu k ochoreniam prenášaných komármi v ére glabálnej zmeny
Warranty of blood safety towards mosquito-borne viruses infections in the era of global change
Zavedenie zariadenia cytogenetickej biodozimetrie na Ústave experimentálnej onkológie, Biomedicínske centrum SAV
Establishing a Cytogenetic Biodosimetry Facility at Cancer Research Institute of Biomedical Research Centre of Slovak Academy of Science
| Doba trvania: |
1.1.2023 - 31.12.2025 |
| Program: |
Plán obnovy EÚ |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Vinnikov Volodymyr PhD. |
| Anotácia: | Radiačná biodozimetria cytogenetickou analýzou je široko používaná v radiačnej ochrane a medicínskom manažmente radiačných nehôd. Avšak túto robustnú rádiobiologickú techniku možno použiť aj na hodnotenie účinkov žiarenia u pacientov s rádioterapiou. Cieľom projektu je poskytnúť dôkladne kalibrovanú a overenú metodiku merania absorbovanej dávky žiarenia cytogenetickými biomarkermi, vhodnú pre rádiobiologický experimentálny výskum a klinické aplikácie v rôznych scenároch radiačnej záťaže. Plán projektu obsahuje 3 úlohy:
(1) Dávkové reakcie budú konštruované in vitro pre výťažok chromozomálnych aberácií a interfázovú bunkovú smrť, indukovanú v ľudských krvných lymfocytoch 6 MeV fotónmi klinického lineárneho urýchľovača. Výsledná kalibračná krivka bude zostavená v súlade s ISO 19238 a IAEA Manuálom o cytogenetickej biodozimetrii a validovaná v dvojito zaslepenom biodozimetrickom cvičení s in vitro ožiarením a tiež prostredníctvom odhadov biologickej dávky u pacientov s rakovinou po ich prvej rádioterapeutickej frakcii.
(2) Cytogenetická dávková odozva in vitro bude študovaná v rozsahu radiačnej dávky 0,05 – 1,0 Gy s cieľom zlepšiť rozlíšenie kalibračnej krivky pri nízkych úrovniach radiačnej záťaže. Bude vyvinutý a testovaný algoritmus na štatistické spracovanie cytogenetických dát pomocou Bayesovskej analýzy pre biodozimetriu nízkych dávok žiarenia prostredníctvom prehodnotenia biologických dávok na kohorte profesionálne exponovaných osôb (rádiológov).
(3) V experimente s ožarovaním vzoriek krvi vo fantóme ekvivalentnom ľudskému tkanivu sa vyvinie nový kalibračný prístup pre pokročilú cytogenetickú biodozimetriu medicínskej lokalizovanej expozície. Vplyv dávky a objemu na výsledok poškodenia chromozómov v ľudských lymfocytoch za takýchto podmienok bude kvantifikovaný a formalizovaný. Na potvrdenie takéhoto prístupu sa získajú biodozimetrické odhady dávky a objemu u pacientov podstupujúcich čiastočné ožarovanie na lekárske účely a porovnajú sa so skutočnými dávkami žiarenia.
Ako očakávaný výstup projektu bude v BMC SAV zavedená a implementovaná vylepšená metodika cytogenetickej biodozimetrie, ktorá zvýši presnosť a účinnosť hodnotenia genotoxických a cytotoxických účinkov u ľudí v rôznych scenároch medicínskeho ožiarenia. |
Získanie pravdivých informácií o kliešťoch.
Getting the right info on ticks.
| Doba trvania: |
1.7.2023 - 30.6.2027 |
| Program: |
APVV |
| Zodpovedný riešiteľ: |
Mgr. Špitalská Eva PhD. |
| Anotácia: | Napriek faktu, že kliešť obyčajný, Ixodes ricinus je predmetom štúdií minimálne storočie, ostáva množstvo nezodpovedaných otázok týkajúcich sa ekológie tohto druhu. Viaceré aspekty základnej biológie a fenológie druhu sú stále nepreskúmané. Globálne zmeny v životnom prostredí vrátane klimatických zmien, zmeny charakteru krajiny a urbanizácie sa podieľajú nielen na zmenách v distribúcii kliešťov, ale ovplyvňujú aj bionómiu a sezónnu aktivitu kliešťov. Pijak lužný, Dermacentor reticulatus sa meniacim sa podmienkam rýchlo prispôsobuje a jeho areál rozšírenia sa zväčšuje. Je potrebné podrobne preskúmať oblasti, kde sa tieto kliešte vyskytujú (prírodné aj mestské biotopy), keďže ich areál výskytu sa v priebehu posledných desaťročí zmenil. Hustota kliešťov infikovaných patogénnymi agens je hlavným rizikovým faktorom pre ľudí, ktorí sú v danej oblasti vystavení kliešťom. V navrhovanom projekte bude sledovaná aktivita kliešťov číhajúcich na hostiteľa pomocou metódy „kliešťových záhradiek“, ale aj prostredníctvom zberu kliešťov z vegetácie metódou vlajkovania. Pomocou metodiky „kliešťových záhradiek“ budeme sledovať aj životný cyklus kliešťov a sezónnu aktivitu jednotlivých vývojových štádií, ako aj ich prežívanie. Keďže tieto dva druhy kliešťov sú považované za epidemiologicky najvýznamnejšie, zameriame sa aj na prevalenciu a výskyt kliešťov infikovaných patogénnymi agens nielen v prípade nenacicaných kliešťov, ale aj kliešťov cicajúcich na zvieratách. V dôsledku meniacich sa podmienok, budeme sledovať aj prenikanie a výskyt nepôvodných druhov kliešťov na Slovensku, keďže tieto druhy kliešťov môžu do našej oblasti zanášať nové patogény. Informácie získané výskumným tímom počas plnenia cieľov projektu, ako aj počas predchádzajúcich štúdií budú použité pri vývoji mobilnej aplikácie na identifikáciu kliešťov a vytvorení webovej stránky, ktorá prinesie benefity širokej verejnosti ako aj odborníkom na vyhodnotenie rizika infekcie patogénmi prenášanými kliešťami. |
Zlepšenie prejavov starnutia pravidelným cvičením: multi-orgánový integratívny prístup k molekulovej, metabolickej a štrukturálnej adaptácii na cvičenie
Ameliorating Effects of Aging by Physical Exercise: Molecular, Metabolic and Structural Adaptations, Multi-Organ Integrative Approach
Zvládanie psychosociálnych stresových situácií u pacientov s depresívnou poruchou v závislosti od veku a odkrývanie zúčastnených mechanizmov
Coping with psychosocial stress situations in patients with depressive disorder in relation to age and unravelling the mechanisms involved
| Doba trvania: |
1.1.2023 - 31.12.2026 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
prof. PharmDr. Ježová Daniela DrSc. |
| Anotácia: | Hlavným cieľom projektu je odhaliť rozdiely v neuroendokrinných zmenách dôležitých pre zvládanie stresových situácií u adolescentov a dospelých pacientov s depresívnou poruchou v porovnaní so zdravými jedincami.
Dôraz sa bude klásť na odhalenie neurobiologickej podstaty vplyvu sociálnej bolesti a kognitívneho deficitu na
rozvoj a priebeh depresívnej poruchy. Ďalším dôležitým cieľom je odhaliť nové endokrinné a imunitné koreláty a
zmeny mozgovej plasticity, ktoré súvisia s depresívnou poruchou. Očakávané nálezy môžu napomôcť k
identifikácii nových potenciálnych terapeutických cieľov a umožniť adekvátnu terapeutickú intervenciu s ohľadom
na vek pacienta. Projekt má translačný charakter nakoľko prepája klinický a predklinický výskum. Predpokladané
originálne výsledky významne rozšíria súčasné poznatky o patofyziológii depresie a zvládaní stresových situácii.
Prispejú tiež k lepšej prevencii a cieleným prístupom k liečbe depresívnej poruchy vo vzťahu k veku.
|
Zvýšenie endokanabinoidnej signalizácie ako perspektívny terč pre liečbu psychických porúch podmienených stresom
Enhancement of endocannabinoid signaling as a promising target for the treatment of stress-related psychiatric disorders
| Doba trvania: |
1.1.2022 - 31.12.2025 |
| Program: |
VEGA |
| Zodpovedný riešiteľ: |
RNDr. Hlaváčová Nataša PhD. |
| Anotácia: | Projekt je zameraný na skúmanie vplyvu farmakologickej modulácie endokanabinoidného (eCB) systému v rozvoji porúch správania vyvolaných chronickým stresom a identifikáciu zúčastnených neurobiologických mechanizmov. Experimentálne prístupy budú postavené na animálnych modeloch stresu a farmakologickom zvýšení eCB signalizácie. Využijú sa nové originálne liečivá s duálnym mechanizmom pôsobenia zacieleným na eCB a endovaniloidný systém resp. cyklooxygenázu-2. Ich účinky na správanie potkanov po akútnom a opakovanom podávaní budú hodnotené v batérii behaviorálnych testov. Predpokladáme, že tieto liečivá zabránia rozvoju psychopatologických zmien v dôsledku chronickej stresovej záťaže. Pozornosť bude venovaná pohlavným rozdielom a vývinovému štádiu jedinca s dôrazom na adolescenciu a dospelosť. Očakávame potvrdenie predpokladov, že zvýšenie eCB signalizácie prostredníctvom liečiv s duálnym mechanizmom účinku predstavuje nové smery pre farmakoterapiu psychických porúch, predovšetkým úzkostných a afektívnych porúch. |
Celkový počet projektov: 169
Databáza národných projektov