Témy doktorandského štúdia
Biomedicínske centrum SAV, v. v. i.
Názov témy
Štúdium účinku patogénnych mutácií na aktivitu ryanodínového receptora pomocou alosterických modelov vrátkovania
Program DŠ
biofyzika
Meno školiteľa/-ky
Ing. Miloslav Karhánek, PhD.
Kontakt:
Prijímajúca škola
Prírodovedecká fakulta UPJŠ
Stručná anotácia
Ryanodínové receptory (RyR) sú iónové kanály, ktoré zabezpečujú spriahnutie excitácie s kontrakciou v kostrovom (RyR1) aj srdcovom svale (RyR2). Mutácie narušujú reguláciu RyR iónmi Ca2+a Mg2+ a tak spôsobujú závažné genetické ochorenia. Cieľom je pomocou alosterických modelov vrátkovania objasniť vplyv vybraných patogénnych mutácií na reguláciu aktivity RyR iónmi Ca2+a Mg2+. Metódy: programovanie v C++, optimalizácia modelov, Markovovské procesy, reakčno-difúzne diferenciálne rovnice.