Témy doktorandského štúdia
Ústav zoológie SAV, v. v. i.
Názov témy
Expresia a funkcia neuropeptidov a ich receptorov u kliešťov
Program DŠ
molekulárna biológia
Meno školiteľa/-ky
Ing. Ladislav Roller, PhD.
Kontakt:
Prijímajúca škola
Univerzita Komenského v Bratislave
Stručná anotácia
Zameriame sa na identifikáciu a analýzu expresie a funkcie peptidov a ich receptorov vo vektoroch nebezpečných patogénov, v kliešťoch Ixodes ricinus a I. scapularis. Regulačné peptidy sú rozmanitou skupinou molekúl, ktoré u hmyzu a stavovcov kontrolujú dôležité fyziologické procesy ako homeostatickú koncentráciu vody a iónov, metabolizmus, príjem potravy a rozmnožovanie. Ich úlohy sú u kliešťov takmer úplne neznáme. K odhaleniu signálnych dráh peptidov v kliešťoch použijeme bioinformatické metódy, cDNA klonovanie, qRT-PCR, in situ hybridizáciu, imunohistochemické farbenie. Taktiež funkčne charakterizujeme kandidátne receptory peptidov. Elektrofyziologické techniky a video analýzy použijeme k zisteniu ich účinkov vzbrané orgány kliešťa in vitro, a zmeny v produkcii a aktivite tráviacich enzýmov v extraktoch čreva budeme analyzovať pomocou qPCR či Western blotov. Funkcie signálnych dráh pre tieto neuropeptidy budeme skúmať pomocou RNA interferencie, ktorou potlačíme expresiu ich receptorov.
Cieľ: Identifikovať regulačné peptidy kliešťa a objasniť ich funkcie. K tomuto cieľu prispejeme: - identifikáciou buniek a regulačných molekúl, ktoré tieto bunky produkujú; - identifikáciou cieľových tkanív; analýzou expresie neuropeptidov a ich receptorov počas ontogenézy; - sledovaním účinkov neuropeptidov na trávenie krvi a prípadne na reprodukciu a vývin pomocou RNAi a in vitro funkčných testov.
Cieľ: Identifikovať regulačné peptidy kliešťa a objasniť ich funkcie. K tomuto cieľu prispejeme: - identifikáciou buniek a regulačných molekúl, ktoré tieto bunky produkujú; - identifikáciou cieľových tkanív; analýzou expresie neuropeptidov a ich receptorov počas ontogenézy; - sledovaním účinkov neuropeptidov na trávenie krvi a prípadne na reprodukciu a vývin pomocou RNAi a in vitro funkčných testov.