Facebook Instagram Twitter RSS Feed PodBean Back to top on side

Informačná stránka organizácie SAV

Témy doktorandského štúdia

Biomedicínske centrum SAV, v. v. i.

Názov témy
Štúdium účinku patogénnych mutácií na alosterickú reguláciu ryanodínového receptora pomocou molekulových simulácií
Program DŠ
biofyzika
Meno školiteľa/-ky
Ing. Miloslav Karhánek, PhD.
Kontakt:
Prijímajúca škola
Prírodovedecká fakulta UPJŠ
Stručná anotácia
Ryanodínové receptory (RyR) sú iónové kanály, ktoré zabezpečujú spriahnutie excitácie s kontrakciou v kostrovom (RyR1) aj srdcovom svale (RyR2). Mutácie narušujú reguláciu RyR iónmi Ca2+a Mg2+ a tak spôsobujú závažné genetické ochorenia. Cieľom je pomocou molekulárnych simulácií objasniť vplyv vybraných patogénnych mutácií na alosterické dráhy medzi väzbovými miestami regulačných ligandov (Ca2+, Mg2+, ATP, xantíny) a vrátkovacím mechanizmom v póre RyR. Metódy: štruktúrna biológia, programy NAMD alebo GROMACS.