Citlivý protokol na detekciu SARS-CoV-2 v prostredí odpadových vôd
Vírusovým pandémiám sa v budúcnosti nebude možné vyhnúť a pandémia SARS-CoV-2 je toho len príkladom. Preto je dôležité vyvinúť citlivý systém dohľadu schopný monitorovať prítomnosť potenciálnych patogénnych činiteľov. Prostredie splaškových a odpadových vôd sa ukázalo ako vhodný cieľ pre takýto druh analýzy. V tejto štúdii bol ako prvý skonštruovaný modelový vírusový systém obsahujúci fragment genómu SARS-CoV-2 kódujúci Spike proteín. Enkapsulovaná napodobňujúca S RNA (ESRM) sa použila na naočkovanie vzoriek odpadovej vody, aby sa vyhodnotilo opätovné oživenie vírusových častíc pomocou štyroch rôznych metód koncentrácie/extrakcie vírusovej RNA. Účinnosť jednotlivých prístupov bola hodnotená použitím kvantitatívnej reverznej transkripčnej PCR (qRT-PCR) a jednokrokovej jednoskúmavkovej nested kvantitatívnej reverznej transkripčnej PCR (OSN-qRT-PCR).
Ústav molekulárnej biológie SAV, v. v. i .
Riešitelia: M. Rusková, M. Bučková, A. Puškárová, D. Pangallo (za ÚMB SAV, v. v. i.
Projekt: SAS - MOST (Taiwan) Joint Research Projects; MOST 108-2221-E-006-160-MY3; Water/wastewater epidemiology: Development of robust and reliable molecular detection systems for surveillance of disease outbreaks (PathogenTracker).
-
RUSKOVÁ, Magdaléna - BUČKOVÁ, Mária - ACHS, Adam - PUŠKÁROVÁ, Andrea - WU, J.H. - KUCHTA, T. - ŠUBR, Zdeno W. - PANGALLO, Domenico**. Useful molecular tools for facing next pandemic events: Effective sample preparation and improved RT-PCR for highly sensitive detection of SARS-CoV-2 in wastewater environment. In International Journal of Hygiene and Environmental Health, 2022, vol. 245, art. no. 114017. (2021: 7.401 - IF, Q1 - JCR, 1.474 - SJR, Q1 - SJR). ISSN 1438-4639. Dostupné na: https://doi.org/10.1016/j.ijheh.2022.114017