Aktuality

DNA je mimoriadne dlhá molekula a rovnako ako akýkoľvek dlhý kus špagátu sa môže v bunkách zauzliť a zamotať. Ak chceme pochopiť, ako tieto uzly vznikajú a ako ich enzýmy nazývané topoizomerázy odstraňujú, potrebujeme presne určiť, ako je DNA poprepletaná. Vedeckému tímu, ktorého členom bol aj Dušan Račko z Ústavu polymérov SAV, v. v. i., sa po prvý raz podarilo určiť štruktúru jednotlivých, komplexných usporiadaní DNA priamo z buniek s nanometrovou presnosťou.

„Dosiahli sme to vývojom pokročilých nástrojov na analýzu obrazových dát, ktoré dokážu za niekoľko sekúnd to, čo predtým trvalo celé hodiny ručnej práce,“ približuje D. Račko. Molekulové simulácie zároveň pomáhajú pochopiť, ako DNA interaguje s povrchom mica v AFM experimentoch. Vďaka vývoju sofistikovaných modelov môžeme generovať tisíce molekulových štruktúr na trénovanie budúcich AI systémov – čím sa približujeme k detailnému zobrazeniu a porozumeniu topológie komplexných štruktúr DNA.

Kontakt: Dušan Račko, Ústav polymérov SAV, v. v. i., dusan.racko@savba.sk

Zdroj a foto: Ústav polymérov SAV, v. v. i.