Biomedicínske centrum SAV, v. v. i.
Názov témy
Multiomická analýza zmien v nádorovom mikroprostredí u pacientov s pevnými nádormi stratifikovanými na základe prítomnosti karbonickej anhydrázy IX
Program DŠ
molekulárna biológia
Rok prijímania
2025
Meno školiteľa/-ky
RNDr. Monika Baráthová, PhD.
Kontakt:
Prijímajúca škola
Prírodovedecká fakulta UK
Stručná anotácia
Nové prístupy v diagnostike a liečbe nádorových ochorení sú dlhé desaťročia v centre vedeckého záujmu. Multiomické analýzy predstavujú v súčasnosti vysokovýkonnú metódu skríningu na efektívne a rýchle odhaľovanie podrobných biologických informácií o nádorovom ochorení. Výsledky takýchto analýz poskytujú informácie o nových biomarkeroch vedúcich k progresii ochorenia a poskytujú zároveň prehľad o zmenách v biologických procesoch medzi zdravým a nádorových tkanivom. Nádorové mikroprostredie (TME) významnou mierou ovplyvňuje nielen progresiu nádorov, ale aj odpoveď na terapiu. Jedným z dôležitých proteínov TME je membránovo asociovaný, hypoxiou-indukovaný enzým karbonická anhydráza IX (CA IX), ktorý prispieva k acidifikácii extracelulárneho mikroprostredia a k adaptácii nádorových buniek na hypoxický stres.
Cieľom práce bude analýza transkriptómu nádorov pozitívne testovaných na prítomnosť proteínu CA IX v porovnaní s transkriptómom z korešpondujúceho nenádorového tkaniva. Vybrané molekuly budú overované prostredníctvom funkčných analýz v in vitro modeloch nádorových bunkových kultúr a kokultivačných sféroidov.
Cieľom práce bude analýza transkriptómu nádorov pozitívne testovaných na prítomnosť proteínu CA IX v porovnaní s transkriptómom z korešpondujúceho nenádorového tkaniva. Vybrané molekuly budú overované prostredníctvom funkčných analýz v in vitro modeloch nádorových bunkových kultúr a kokultivačných sféroidov.