Centrum biológie rastlín a biodiverzity SAV, v. v. i.
Názov témy
Molekulárna analýza úlohy synaptotagmínov v ontogenéze suchozemských rastlín
Program DŠ
Fyziológia rastlín
Rok prijímania
2025
Meno školiteľa/-ky
doc. RNDr. Ján Jásik, DrSc.
Kontakt:
Prijímajúca škola
Prírodovedecká fakulta UK
Stručná anotácia
Rastlinné synaptotagmíny (SYTs) sa podobajú na živočíšne, ktoré sú známe ako vápnikové senzory v živočíšnych neurónoch. Dominantný AtSYT1 sa v modelovom organizme Arábkovka Thalova podieľa na odpovediach voči rôznym environmentálnym stresom. Úloha ostatných členov rodiny je veľmi málo preskúmaná. Špecifická expresia AtSYT génov, ktorú sme zistili v predchádzajúcich štúdiách, naznačuje, že tieto gény sú zapojené aj do regulácie vývinu pletív. Zameriame sa predovšetkým na AtSYT5 gén a všestrannou analýzou jeho mutantov a dvojitých mutantov s ostatnými AtSYTs chceme zistiť v akých vývinových programoch vyšších rastlín sú AtSYT proteíny zapojené. V projekte budeme tiež študovať homologické gény v machu Physcomitrium patens. Využijeme jedinečné výhody, ktoré ponúka tento modelový organizmus pre štúdium vývinu rastlín. Podrobne budeme charakterizovať časovo priestorovú expresiu a funkciu PpSYT homológov a vnútrobunkovú dynamiku PpSYT proteínov počas jednotlivých vývinových štádií organizmu. Pre konštrukciu línií s GUS a GFP próbami použijeme homologickú rekombináciu a pomocou CRISPR/Cas9 techník vytvoríme línie s deaktivovanými génmi. Súčasnými prístupmi reverznej genetiky, bunkovej biológie a biochémie budeme analyzovať funkcie PpSYT génov v priebehu celej ontogenézy rastliny. Projekt prispeje k poznaniu úlohy SYT génov vo vývine vyšších a nižších rastlín a k pochopeniu fylogenézy rastlinných SYT génov.