Centrum biológie rastlín a biodiverzity SAV, v. v. i.
Názov témy
Rozlúštenie záhady vnútrobunkového mananu prostredníctvom nových glykobiologických výskumných nástrojov
Program DŠ
Fyziológia rastlín
Rok prijímania
2025
Meno školiteľa/-ky
Mgr. Jozef Mravec, PhD.
Kontakt:
Prijímajúca škola
Prírodovedecká fakulta UK
Stručná anotácia
Rastlinné polysacharidy sa tradične delia na polysacharidy so zásobnou funkciou (škrob) a tie, ktoré majú štrukturálnu funkciu pri tvorbe bunkovej steny (celulóza, hemicelulózy a pektíny). Nové dáta poukazujú na možnosť, že takéto rozdelenie je príliš zjednodušujúce. Napríklad jeden z hlavných komponentov bunkovej steny manan, čo je polymér manózy spojenej β-1-4 väzbou, sa u niektorých rastlín akumuluje vo vnútrobunkových štruktúrach, ktoré by mohli mať podobnú funkciu ako škrobové zrná, prípadne inú doposiaľ neznámu funkciu. Zdá sa, že tento jav je typický hlavne pre jednoklíčnolistové rastliny. Úlohou tejto doktorandskej práce bude použiť rôzne pokročilé výskumné metódy na štúdium a bližšie spoznanie funkcie takéhoto vnútrobunkového mananu a porovnať jedno- a dvojklíčnolistové rastliny. Hlavné ciele tohto projektu budú: (i) Uskutočniť detailnú charakterizáciu manan-obsahujúcich subcelulárnych štruktúr použitím najnovších zobrazovacích metód. (ii) Izolovať vnútrobunkový manan u vybraných rastlín a uskutočniť jeho profilovanie prostredníctvom monoklonálnych protilátok a novovytvorených prób, akými sú napríklad DNA aptaméry. (iii) Izolovať a fenotypovo charakterizovať mutanta modelového organizmu pre traviny - mrvice (Brachypodium distachyon), ktorý bude mať vyradený gén kódujúci manan syntázu (CSLA). Očakávame, že výsledky tejto práce prinesú lepšie pochopenie biologickej funkcie mananu u rastlín a zlepšenia potenciálu jeho využívania ako nutrične zaujímavej vlákniny.